第九章.微生物生态.ppt
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1、第八章第八章 微生物生态微生物生态微生物的生态的内容微生物的生态的内容 前言第一节 微生物在自然界中的分布与菌种 资源的开发第二节 微生物与环境间的关系第三节 微生物与自然物质循环第四节 微生物与环境保护前 言一、生态学的概念 生态学是一门研究生命系统与环境系统间相互作用规律的科学二、什么是微生物生态学 微生物生态学是生态学的一个分支,它的研究对象是微生物群体与其周围生物和非生物环境条件间相互作用的规律。生命科学研究领域中,从宏观到微观一般可分10个层次:生物圈(biosphere)、生态系统(ecosystem)、群落(community)、种群(population)、个体(individ
2、ual)、器官(organ)、组织(tissue)、细胞(cell)、细胞器(organelle)、分子(molecule),其中前4个客观层次都是生态学的研究范围。第一节第一节 微生物在自然界中的分布微生物在自然界中的分布一、土壤圈及其微生物一、土壤圈及其微生物(一一)土壤是微生物生活的良好环境土壤是微生物生活的良好环境(1)土壤的矿物质成分,提供微生物需要的矿质养料;)土壤的矿物质成分,提供微生物需要的矿质养料;(2)土壤中的动植物残体,以及耕作土壤中有机肥料,)土壤中的动植物残体,以及耕作土壤中有机肥料,源源不断地供给微生物碳素养料和氮素养料;源源不断地供给微生物碳素养料和氮素养料;(3
3、)土壤的持水性为微生物提供水分条件;)土壤的持水性为微生物提供水分条件;(4)土壤的孔隙性和土壤水分多少,直接影响土壤的)土壤的孔隙性和土壤水分多少,直接影响土壤的通气条件。通气条件。(5)土壤的)土壤的pH范围在范围在3.510.5之间,多数在之间,多数在5.58.5之之间,这是大多数微生物活动最适宜的间,这是大多数微生物活动最适宜的pH;(6)土壤的保温性,比地面空气温度变化小,也为微土壤的保温性,比地面空气温度变化小,也为微生物的生长提供了良好的条件。生物的生长提供了良好的条件。同一土体由于微环境的通气、水分、营养等状况都存在着差异,致使不同微生物呈立体分布。每克肥土中通常含有几亿至几十
4、亿个微生物,贫瘠土壤每克也有几百万至几千万个微生物。(1)细菌数量:7090%;种类:主要为腐生,少数自养分布:表层最多,随土层加深减少,厌氧菌反之。(2)放线菌数量:530%(3)真菌(4)藻类(5)原生动物(二)土壤中微生物的分布表表9 92 2 农田土壤上层农田土壤上层1515cmcm处微生物数量和生物量处微生物数量和生物量微微 生生 物物土壤中的数量土壤中的数量(个个/g)g)生物量(生物量(g/mg/m2 2)细菌细菌放线菌放线菌真菌真菌藻类藻类原生动物原生动物9.8109.8107 72.0102.0106 61.2101.2102 22.5202.5204 43.0103.010
5、4 416016016016020020032328 8土壤中微生物的数量:按种类递减土壤中微生物的数量:按种类递减 细菌细菌细菌细菌放线菌放线菌放线菌放线菌霉菌霉菌霉菌霉菌酵母菌酵母菌酵母菌酵母菌藻类藻类藻类藻类原生动物原生动物原生动物原生动物 10 108 810107 7 10 106 6 10 105 5 10 104 4 10 103 3个个个个/g g采取土样时一般要刮开表土采取土样时一般要刮开表土23cm后采样。后采样。二、微生物在水中的分布水具有微生物生命活动适宜的温度、水具有微生物生命活动适宜的温度、pHpH、氧气等,水体中也具备微氧气等,水体中也具备微生物生长繁殖的其他条件
6、,因此成为微生物栖息的又一天然场所。生物生长繁殖的其他条件,因此成为微生物栖息的又一天然场所。(一一)水体中微生物的来源水体中微生物的来源 土壤、空气、动植物尸体、人和动物的排泻物、工业及生活污水。土壤、空气、动植物尸体、人和动物的排泻物、工业及生活污水。(二二)种类种类 水中存在的微生物水中存在的微生物90%90%为革兰氏阴性菌,主要有弧菌、假单胞菌、黄为革兰氏阴性菌,主要有弧菌、假单胞菌、黄杆菌等。鞘细菌及有柄附生细菌也常见于水体中。杆菌等。鞘细菌及有柄附生细菌也常见于水体中。(三三)微生物在水体中的分布微生物在水体中的分布 表现为水平分布和垂直分布的规律。此外,相同水域的不同浓度微生表现
7、为水平分布和垂直分布的规律。此外,相同水域的不同浓度微生物的含量及分布也不同。物的含量及分布也不同。(四四)水体中的病原微生物水体中的病原微生物通过水体传播的病原微生物主要有沙门氏菌属、志贺氏菌属、霍乱弧通过水体传播的病原微生物主要有沙门氏菌属、志贺氏菌属、霍乱弧菌等。因此,做好水的卫生学检查至关重要。菌等。因此,做好水的卫生学检查至关重要。影响水体微生物分布的因素影响水体微生物分布的因素 有机物含量有机物含量温度温度 水的深度水的深度 日光与水体的溶解氧量日光与水体的溶解氧量 海洋微生物具有耐压、嗜冷和低营养要求的特点。海洋微生物具有耐压、嗜冷和低营养要求的特点。淡水的淡水的pHpH值变幅从
8、值变幅从3.73.7到到10.510.5,多数为,多数为6.5-8.56.5-8.5,因而适合于多数水生微生物的生长。因而适合于多数水生微生物的生长。淡水中的微生物淡水中的微生物细菌总数不得超过细菌总数不得超过 :100100个个/毫升毫升 饮用水消毒常用方法:加入液态氯或次氯酸盐饮用水消毒常用方法:加入液态氯或次氯酸盐大肠菌群指数不得超过大肠菌群指数不得超过 :3 3个个/升升 我国相关法规对饮用水微生物指标的规定我国相关法规对饮用水微生物指标的规定三、微生物在空气中的分布:1空气是传播微生物的重要介质 空气本身缺乏微生物生活所必需的营养物,日光对微生物也具有很强的杀菌作用,另外空气一般是干
9、燥的,因此空气不是微生物生活的良好环境。2空气中微生物的种类和数量 空气中的微生物主要来源于带有微生物菌体及孢子的灰尘,这类微生物大多数是腐生性的,还来源于人和动物,它们大多数是通过呼吸道排出的,其中也包含有病原微生物,悬浮在大气中。空气中微生物的分布随环境条件及微生物的抵抗力不同而呈现不同的分布规律。空气中存在较多的、存活时间较长的是各种真菌、放线菌的孢子及细菌芽胞。空气中微生物的数目决定于尘埃的总量。表表9 93 3不同地点空气中的微生物数量不同地点空气中的微生物数量地地 点点微生物数量(个微生物数量(个/3 3空空气)气)北极北极(北纬北纬80)80)0 0海洋上空海洋上空1-21-2市
10、区公园市区公园200200城市公园城市公园5,0005,000宿宿 舍舍2,0002,000畜畜 舍舍1,000,000-2,000,0001,000,000-2,000,000四、极端环境中的微生物四、极端环境中的微生物 不利于一般生物生长的特殊环境称为极端环境。主要有极端高温、低温、高盐、高压、高酸、高碱等。例如火山与温泉、极地或高山冰川、盐湖、深海底层等。1 1高温环境中的微生物高温环境中的微生物 高热环境高热环境-高温环境喷发的火山、地热蒸汽、沸腾或过热的温泉以及高温堆肥、热水器和取暖用热水循环系统等是常见的天然或人工的高温环境。不同微生物对高温的适应能力见表94,高温型微生物 中以细
11、菌居多,只有少数真菌。如嗜热脂肪芽孢杆菌、酸热芽孢杆菌(acidocalda rius)等。表表94 各类群各类群生长的上限温度生长的上限温度类类 群群上限温度上限温度()()真核微生物真核微生物原生动物原生动物藻类藻类真菌真菌565655-6055-6060-6260-62原核微生物盐原核微生物盐盐细菌盐细菌光合细菌光合细菌无机化能细菌无机化能细菌异养细菌异养细菌70-7370-7370-7370-739090 9090嗜热机制嗜热机制-嗜热菌之所以耐热,主要是其结构及生理上具有一定特点。近年来,对其嗜热机制进行了分子水平的研究,可归纳为以下4种假说。(1 1)类脂的敏感作用)类脂的敏感作用
12、 嗜热菌细胞质膜的化学成分,随环境温度的升高不仅类脂总含量增加,而且细胞中的高熔点饱和脂肪酸也增加,即长链饱和脂肪酸增加,而不饱和脂肪酸减少。因此,嗜热菌在高温下能维持膜的功能,能较好地生存。(2 2)重要代谢产物的迅速再合成)重要代谢产物的迅速再合成 嗜热菌中tRNAr的周转率大于中温菌的周转率,核酸中的GC含量也比中温菌高。(3 3)大分子的热稳定性)大分子的热稳定性-嗜热菌的酶和蛋白质比中温菌的酶和蛋白质具有较高的热稳定性。(4 4)蛋白质合成系统的热稳定性)蛋白质合成系统的热稳定性-嗜热菌的核糖体比中温菌的核糖体抗热性高。2 2高盐环境中的微生物高盐环境中的微生物 高盐环境高盐环境-盐
13、湖、盐池和盐腌制的食品等是常见的高盐环境。通常把能在含盐量高于的环境中生长的微生物称为极端嗜盐菌,常见的种类有盐细菌属和盐球菌属(表9-5)。耐盐机理:嗜盐菌具有能适应高盐环境的细菌结构和离子浓度。嗜 盐菌有选择性地吸收K排出Na的能力,细胞内的高浓度K既可以防止原生质脱水,又能维持酶和蛋白质等的活性;有嗜盐的酶;光合盐杆菌的细胞质膜上含有菌视紫素,能利用光能造成膜内外H的浓度梯度并藉以产生ATP和向细胞外排出Na。对高盐浓度的适应性 酶的嗜盐性紫膜的H+泵作用和排盐作用表表9-5 9-5 微生物的不同嗜盐类群微生物的不同嗜盐类群嗜嗜 盐盐 类类 群群最适生长盐浓最适生长盐浓(NaC1)NaC
14、1)实实 例例非嗜盐微生物非嗜盐微生物0.2mol/L0.2mol/L淡水微生物淡水微生物弱嗜盐微生物弱嗜盐微生物0.2-0.5mol/L0.2-0.5mol/L大多数海洋微生物大多数海洋微生物中等嗜盐微生中等嗜盐微生物物0.5-2.5mol/L0.5-2.5mol/L某些细菌和藻类某些细菌和藻类极端嗜盐微生极端嗜盐微生物物2.5-5.2mol/L2.5-5.2mol/L盐杆菌和盐球菌盐杆菌和盐球菌耐盐微生物耐盐微生物耐受范围耐受范围0.2-2.50.2-2.5mol/Lmol/L金黄色葡萄球菌和其他葡萄球菌,耐盐酵金黄色葡萄球菌和其他葡萄球菌,耐盐酵母菌等母菌等3 3高压环境中的微生物高压环
15、境中的微生物 自然界的高压环境主要存在于深海中,多数海洋底部的压力在100个大气压以上,最深处约为1100个大气压。研究表明从常压环境中分离的多数微生物在200-600个大气压的高压环境 中将受到抑制或死亡,高压条件主要抑制常压微生物细胞蛋白质合成、质膜上物质和能量的传递及酶的代谢活性。高压环境中生长的主要是细菌,如分离自深海淤泥的耐压假单胞菌,生长十分迟缓,代时为33天。3类嗜压菌及其生长静水压(大气压数)类型类型最低生长压最低生长压最适生长压最适生长压最高生长压最高生长压耐压菌耐压菌未测未测1-1001-100500500嗜压菌嗜压菌1 1400-500400-500700700极端嗜压菌
16、极端嗜压菌400400700-800700-800103510354.嗜冷微生物(psychrophiles)5.嗜酸微生物(acidophiles)6.嗜碱微生物(alkalinophiles)7.嗜酸微生物(acidophiles)8.抗辐射微生物其他极端环境的微生物五、工农业产品上的微生物五、工农业产品上的微生物工业产品上的霉腐工业产品上的霉腐 大量的工业产品都是直接或间接用动植物作原料制成大量的工业产品都是直接或间接用动植物作原料制成的的,例如木制品、纤维制品、革裘制品、橡胶制品、卷烟、化例如木制品、纤维制品、革裘制品、橡胶制品、卷烟、化妆品、中成药等。妆品、中成药等。食品上的微生物食
17、品上的微生物 粮、油、肉、蛋、奶、蔬菜和水果等各类食品含有丰粮、油、肉、蛋、奶、蔬菜和水果等各类食品含有丰富的营养成分,因而是微生物生长富的营养成分,因而是微生物生长 繁殖的天然营养基质。繁殖的天然营养基质。1 1粮食上的微生物粮食上的微生物 2 2肉类上的微生物:假单胞杆菌肉类上的微生物:假单胞杆菌,大肠杆菌大肠杆菌,球菌球菌,肠球菌肠球菌 3 3鱼类上的微生物鱼类上的微生物 :水体中的微生物类群:水体中的微生物类群 4 4乳制品中的微生物乳制品中的微生物 六、生物体内外的正常菌群:六、生物体内外的正常菌群:正常菌群:生活在健康动物各部位,数量大、种类较稳正常菌群:生活在健康动物各部位,数量
18、大、种类较稳正常菌群:生活在健康动物各部位,数量大、种类较稳正常菌群:生活在健康动物各部位,数量大、种类较稳定且一般是有益无害的微生物。定且一般是有益无害的微生物。定且一般是有益无害的微生物。定且一般是有益无害的微生物。正常菌群与人体的关系:一般能维持平衡,菌群内部正常菌群与人体的关系:一般能维持平衡,菌群内部正常菌群与人体的关系:一般能维持平衡,菌群内部正常菌群与人体的关系:一般能维持平衡,菌群内部的各种微生物之间,也是相互制约而维持相对稳定。的各种微生物之间,也是相互制约而维持相对稳定。的各种微生物之间,也是相互制约而维持相对稳定。的各种微生物之间,也是相互制约而维持相对稳定。变化情况:变
19、化情况:变化情况:变化情况:正常菌群是相对的、可变的、有条件的。正常菌群是相对的、可变的、有条件的。v机体防御机能减弱时,一部分正常菌群会成机体防御机能减弱时,一部分正常菌群会成为病原微生物;为病原微生物;v正常菌群在非正常部位时也可引起疾病;正常菌群在非正常部位时也可引起疾病;v由于外界因素的影响,破坏了各种微生物之由于外界因素的影响,破坏了各种微生物之间的相互制约关系,正常菌群也会引起疾病间的相互制约关系,正常菌群也会引起疾病(菌群失调症)。(菌群失调症)。人体不同部位的正常菌群人体不同部位的正常菌群 部位部位 主要微生物主要微生物 皮肤皮肤 葡萄球菌属、八叠球菌葡萄球菌属、八叠球菌、JK
20、JK群棒状杆菌、群棒状杆菌、绿脓绿脓 杆菌、痤疮丙酸杆菌、厌氧革兰阳性球菌、青杆菌、痤疮丙酸杆菌、厌氧革兰阳性球菌、青 霉菌属等霉菌属等 。口腔口腔 表皮葡萄球菌表皮葡萄球菌、型溶血或不溶血链球菌、型溶血或不溶血链球菌、肺炎球菌、肠球菌属、奈瑟球菌属、他莫拉菌肺炎球菌、肠球菌属、奈瑟球菌属、他莫拉菌 大肠杆菌、嗜血杆菌属、乳杆菌、类白喉杆菌大肠杆菌、嗜血杆菌属、乳杆菌、类白喉杆菌 真杆菌属、梭杆菌属、类杆菌属、厌氧革兰真杆菌属、梭杆菌属、类杆菌属、厌氧革兰 阳性和阴性球菌、白色念珠菌等。阳性和阴性球菌、白色念珠菌等。眼结膜眼结膜 表皮葡萄球菌、表皮葡萄球菌、JKJK群棒状杆菌、丙酸杆菌属等群棒
21、状杆菌、丙酸杆菌属等人体不同部位的正常菌群人体不同部位的正常菌群部位部位 主要微生物主要微生物鼻咽腔鼻咽腔 葡萄球菌属、葡萄球菌属、型和型和型溶血链球菌、肺炎型溶血链球菌、肺炎 球菌、奈瑟球菌属、嗜血杆菌属、大肠杆菌球菌、奈瑟球菌属、嗜血杆菌属、大肠杆菌 属、变形杆菌属、厌氧球菌、白色念珠菌等。属、变形杆菌属、厌氧球菌、白色念珠菌等。肠道肠道 大肠杆菌、产气杆菌、变形杆菌属、绿脓杆大肠杆菌、产气杆菌、变形杆菌属、绿脓杆 菌、葡萄球菌属、八叠球菌、肠球菌属、产菌、葡萄球菌属、八叠球菌、肠球菌属、产 气荚膜杆菌、类杆菌属、双岐杆菌、真杆菌气荚膜杆菌、类杆菌属、双岐杆菌、真杆菌 属、梭杆菌属、消化球
22、菌、消化链球菌、白属、梭杆菌属、消化球菌、消化链球菌、白 色念珠菌、艾柯病毒、腺病毒等。色念珠菌、艾柯病毒、腺病毒等。正常菌群对宿主新陈代谢、营养物质转化和消化正常菌群对宿主新陈代谢、营养物质转化和消化吸收都具有重要作用,是保持人体生态平衡和内环吸收都具有重要作用,是保持人体生态平衡和内环境的稳定有重要因素。境的稳定有重要因素。许多因素都能引起上述生态失调,如宿主患病、许多因素都能引起上述生态失调,如宿主患病、医疗措施影响、外来菌侵袭及抗菌药物使用等,结医疗措施影响、外来菌侵袭及抗菌药物使用等,结果引起内源性感染果引起内源性感染Endogenous infectionEndogenous in
23、fection,又称机又称机会感染会感染Opportunistic infectionOpportunistic infection。原来存在于肠道、原来存在于肠道、口、咽等部位的正常菌群在其他易感部位造成感染。口、咽等部位的正常菌群在其他易感部位造成感染。如大肠杆菌由结肠转移至呼吸道引起肺炎。这种情如大肠杆菌由结肠转移至呼吸道引起肺炎。这种情况在宿主免疫功能缺陷时尤为常见。况在宿主免疫功能缺陷时尤为常见。其它生物体无菌动物(germ-freeanimal):体内外检查不到任何正常菌群的动物悉生生物(gnotobiotics):已经人为接种某已知纯种微生物的无菌动物扩展:菌种资源的开发扩展:菌
24、种资源的开发菌种筛选的一般原则和基本步骤:菌种筛选的一般原则和基本步骤:v采集菌样:采集菌样:采集菌样:采集菌样:了解目标菌分布情况、首选样品是土壤了解目标菌分布情况、首选样品是土壤了解目标菌分布情况、首选样品是土壤了解目标菌分布情况、首选样品是土壤v富集培养:富集培养:富集培养:富集培养:利用选择性培养基的原理,向所采土样中加利用选择性培养基的原理,向所采土样中加利用选择性培养基的原理,向所采土样中加利用选择性培养基的原理,向所采土样中加入某些特殊营养物,并创造一些有利于待分离对象生长入某些特殊营养物,并创造一些有利于待分离对象生长入某些特殊营养物,并创造一些有利于待分离对象生长入某些特殊营
25、养物,并创造一些有利于待分离对象生长的条件,使样品中少量的能分解利用该营养物的微生物的条件,使样品中少量的能分解利用该营养物的微生物的条件,使样品中少量的能分解利用该营养物的微生物的条件,使样品中少量的能分解利用该营养物的微生物大量繁殖,以提高其在群体中的比例,使之便于分离。大量繁殖,以提高其在群体中的比例,使之便于分离。大量繁殖,以提高其在群体中的比例,使之便于分离。大量繁殖,以提高其在群体中的比例,使之便于分离。v纯种分离:纯种分离:纯种分离:纯种分离:见第八章第五节见第八章第五节见第八章第五节见第八章第五节“菌种的衰退、复壮与保藏菌种的衰退、复壮与保藏菌种的衰退、复壮与保藏菌种的衰退、复
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