生物化学第6章蛋白质结构与功能的关系.ppt
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1、第6章 蛋白质结构与功能的关系一、肌红蛋白的结构与功能一、肌红蛋白的结构与功能二、血红蛋白的结构与功能二、血红蛋白的结构与功能三、血红蛋白分子病三、血红蛋白分子病四、四、免疫系统和免疫系统和免疫球蛋白免疫球蛋白五、肌球蛋白丝、肌动蛋白丝与肌肉收缩五、肌球蛋白丝、肌动蛋白丝与肌肉收缩六、蛋白质的结构与功能进化六、蛋白质的结构与功能进化(The relation between structure and function of proteins)一、肌红蛋白的结构与功能肌红蛋白 肌肌红红蛋蛋白白(myoglobin,Mb)主主要要存存在在于于肌肌肉肉中中,是是哺哺乳乳动动物物细细胞胞主主要要是是
2、肌肌细细胞胞贮贮存存和和分分配配氧氧的的蛋蛋白白质质。肌肌红红蛋蛋白白由由一一条条多多肽肽链链和和一一个个辅辅基基血血红红素素(heme)构构成成,相相对对分分子子量量16700,含含153个个氨氨基基酸酸残残基基。除除去去血血红红素素后后仅仅剩剩下下的的肽肽链链部部分分称称为为珠珠蛋蛋白白(globin),它它和和血血红红蛋蛋白白的的、亚亚基基有有明明显显的的同同源源性性,它它们们的的构构象象和和功功能能也也极极为为相相似似。血血红红素素非非共共价价地地结结合合在在珠珠蛋蛋白的疏水空穴中。白的疏水空穴中。肌红蛋白的结构myoglobin辅基血红素 血血红红素素由由原原卟卟啉啉(protopo
3、rphyrin)中中间间结结合合一一个个Fe原原子子构构成成,原原卟卟啉啉是是由由4个个吡吡咯咯环环通通过过甲甲叉叉桥桥连连接接而而成成的的扁扁平平环环状状化化合合物物。卟卟啉啉环环中中央央结结合合Fe原原子子,Fe原原子子通通常常是是八八面面体体配配位位,应应该该有有6个个配配位位键键,其其中中4个个配配位位键键与与4个个吡吡咯咯环环的的N原原子子相相连连,另另两两个个配配位位键键分分布布在在卟卟啉啉环环的的上上下下。Fe原原子子可可以以是是二二价价的的或或三三价价的的,相相应应的的血血红红素素称称为为亚亚铁铁血血红红素素(ferroheme,heme)和和高高铁铁血血红红素素(ferrih
4、eme,hematin),相相应应的的肌肌红红蛋蛋白白称称为为亚亚铁铁肌肌红红蛋蛋白白(ferromyoglobin)和和高高铁铁肌红蛋白(肌红蛋白(ferrimyoglobin,metmyoglobin)。)。肌红蛋白的辅基血红素hemeprotoporphyrin O2与肌红蛋白的结合 血血红红素素中中的的铁铁的的第第5个个配配位位键键与与珠珠蛋蛋白白的的第第93(或或F8)位位His残残基基的的咪咪唑唑基基N结结合合,这这个个His称称为为近近侧侧His,而而O2与与Fe的的第第6个个配配位位键键结结合合。在在肌肌红红蛋蛋白白没没有有结结合合O2时时,这这个个部部位位是是空空的的。高高铁
5、铁肌肌红红蛋蛋白白不不能能与与O2结结合合,H2O分分子子代代替替O2成成为为第第6个个配体。配体。在在血血红红素素结结合合O2的的一一侧侧,还还有有一一个个His残残基基,即即第第64(或或E7)位位His残残基基,称称为为远远侧侧His。由由于于这这个个远远侧侧His的的存存在在,使使得得O2的的结结合合受受到到空空间间位位阻阻。在在氧氧合合肌肌红红蛋蛋白白中中,O2的的两两个个原原子子与与Fe不不成成一一条条直线,而是倾斜了直线,而是倾斜了30。氧合肌红蛋白中血红素铁离子的6个配体近侧近侧His远侧远侧HisCO的毒性作用 第第6个个配配位位位位置置的的空空间间位位阻阻很很重重要要。游游
6、离离在在溶溶液液中中的的铁铁卟卟啉啉结结合合CO的的能能力力比比结结合合O2强强25000倍倍,但但在在肌肌红红蛋蛋白白中中,血血红红素素对对CO的的亲亲和和力力仅仅比比对对O2的的亲亲和和力力大大250倍倍。肌肌红红蛋蛋白白(还还有有血血红红蛋蛋白白)降降低低对对CO的的亲亲和和力力,可可以以有有效效地地防防止止代代谢谢过过程程中中产产生生的的少少量量CO占占据据它它们们的的O2结结合合部部位位。尽尽管管如如此此,当当空空气气中中CO的的含含量量达达到到0.06%0.08%即即有有中中毒毒的危险,达到的危险,达到0.1%则会导致死亡。则会导致死亡。O2 2和CO与肌红蛋白血红素Fe()的结合
7、Free hemewith imidazoleMb:CO Complex Oxymyoglobin肌红蛋白的蛋白质部分的作用 通通常常情情况况下下,O2分分子子与与Fe()紧紧密密接接触触会会使使Fe()氧氧化化成成Fe(),溶溶液液中中游游离离的的亚亚铁铁血血红红素素很很容容易易被被氧氧化化成成高高铁铁血血红红素素,但但在在肌肌红红蛋蛋白白中中,由由于于血血红红素素处处于于疏疏水水环环境境中中,血血红素红素Fe()不容易被氧化。不容易被氧化。同同样样是是血血红红素素,与与不不同同的的蛋蛋白白质质结结合合后后,具具有有不不同同的的功功能能,如如在在细细胞胞色色素素C中中,血血红红素素起起可可逆
8、逆电电子子载载体体的的作作用用,过过氧氧化化氢氢酶酶中中,血血红红素素催化催化H2O2歧化成歧化成H2O和和O2。肌红蛋白血红素Fe原子的位移 肌肌红红蛋蛋白白血血红红素素在在没没有有与与O2结结合合时时,铁铁原原子子是是向向第第 5 配配位位体体方方向向(His F8)突突出出的的。当当与与O2结合时,铁原子被拉回到卟啉平面。结合时,铁原子被拉回到卟啉平面。肌红蛋白血红素Fe原子的位移肌红蛋白结合氧的定量分析肌红蛋白与肌红蛋白与O2结合的反应式为结合的反应式为其解离常数为其解离常数为K,令令Y 为肌红蛋白的氧饱和分数,即为肌红蛋白的氧饱和分数,即将将改写为改写为肌红蛋白结合氧的定量分析将将代
9、入代入得得 ,根据根据henry定律,溶于液体的任一种气体的浓度定律,溶于液体的任一种气体的浓度与液体上面的该气体的分压成正比,即与液体上面的该气体的分压成正比,即 O2=A p(O2)式中式中A 为比例系数,为比例系数,p(O2)为氧气的分压。为氧气的分压。肌红蛋白结合氧的定量分析将将代入代入得得肌红蛋白的氧结合曲线 实实验验中中 p(O2)可可以以测测得得,氧氧分分压压常常用用Torr为为单单位位。Y 值值可可用用分分光光光光度度法法测测定定,因因为为肌肌红红蛋蛋白白结结合合了了O2 时时会会引引起起吸吸收收光光谱谱的的改改变变。Y 对对 p(O2)作作图所得的曲线称为氧结合曲线。图所得的
10、曲线称为氧结合曲线。1 Torr=133 Pa=1 mmHg 肌红蛋白的氧结合曲线双曲线方程双曲线方程Hill作图 为为氧氧结结合合肌肌红红蛋蛋白白的的分分数数与与没没有有结结合合氧的肌红蛋白的分数之比。氧的肌红蛋白的分数之比。两边取对数得两边取对数得 Hill作图 以以 对对 作作图图称称为为Hill作作图图,肌肌红红蛋蛋白白的的Hill图图是是一一条条直直线线。当当 时时(50%的的肌肌红红蛋蛋白白结结合合了了氧氧),这这时时 ,这这一一点点的的斜斜率率称称为为Hill系系数数,肌肌红红蛋蛋白白的的Hill系系数数等等于于1,说明,说明O2分子彼此独立地与肌红蛋白结合分子彼此独立地与肌红蛋
11、白结合。氧与肌红蛋白结合的Hill图肌红蛋白的贮氧和输氧作用 线线粒粒体体中中氧氧浓浓度度为为010 torr,静静脉脉血血氧氧浓浓度度为为15 torr或或更更高高些些。肌肌红红蛋蛋白白的的P 50为为2 torr,所所以以在在大大多多数数情情况况下下,肌肌红红蛋蛋白白是是高高度度氧氧合合的的,是是氧氧的的贮贮存存库库。如如果果由由于于肌肌肉肉收收缩缩使使线线粒粒体体中中氧氧含含量量下下降降,它就可以立即供应氧。它就可以立即供应氧。肌红蛋白的贮氧和输氧作用 肌肌红红蛋蛋白白也也有有利利于于细细胞胞内内氧氧从从细细胞胞的的内内表表面面向向线线粒粒体体转转运运,因因为为这这种种运运转转是是顺顺浓
12、浓度度梯梯度度的的,细细胞胞内内表表面面的的氧氧浓浓度度约约为为10 torr(肌肌红红蛋蛋白白的的氧氧饱饱和和度度约约为为80%),而而线线粒粒体体内内的的氧氧浓浓度度约约为为1 torr(肌肌红红蛋蛋白白的的氧氧饱饱和和度度约约为为25%),肌肌红红蛋蛋白白可可以以从从细细胞胞内表面结合氧,而运到线粒体内表面结合氧,而运到线粒体中释放氧。中释放氧。二、血红蛋白的结构与功能血红蛋白 血血红红蛋蛋白白(hemoglobin,Hb)存存在在于于红红细细胞胞中中,它它的的主主要要功功能能是是在在血血液液中中结结合合并并转转运运氧氧气气,它它在在肺肺中中与与氧氧气气结结合合,运运输输到到全全身身各处
13、组织中,再释放出氧气。各处组织中,再释放出氧气。人体内有正常功能的血红蛋白 发育阶段血红蛋白名称链或样链链或样链亚基组成胚胎胚胎2 22 2胎儿胎儿HbF2 22 2出生到死亡出生到死亡HbA2 22 2出生到死亡出生到死亡HbA22 22 2血红蛋白的氨基酸组成 链链或或样样链链由由141个个氨氨基基酸酸残残基基组组成成,链链或或样样链链由由146个个氨氨基基酸酸残残基基组组成成,而而肌肌红红蛋蛋白白的的肽肽链链由由153个个氨氨基基酸酸残残基基组组成成,它它们们都都叫叫珠珠蛋蛋白白。同同一一类类型型不不同同希希腊腊字字母母代代表表的的链链有有个个别别氨基酸残基不同。氨基酸残基不同。血红蛋白
14、的三维结构11221122Hb的链、链和Mb链构象的相似性 血血红红蛋蛋白白链链、链链及及肌肌红红蛋蛋白白链链的的三三级级结结构构非非常常相相似似,但但这这三三种种肽肽链链的的氨氨基基酸酸序序列列有有很很大大不不同同,141个个氨氨基基酸酸残残基基位位置置中中只只有有27个个位位置置的的残残基在这三种肽链中是相同的。基在这三种肽链中是相同的。Mb Hb Hb不同物种血红蛋白氨基酸序列的比较 比比较较了了多多种种(从从七七腮腮鳗鳗到到人人)不不同同的的血血红红蛋蛋白白的的氨氨基基酸酸序序列列,证证明明序序列列中中有有9个个位位置置的的残残基基是是所所有有研研究究过过的的血血红红蛋蛋白白所所共共有
15、有的的,这这些些称称为为高高度保守的残基。度保守的残基。血血红红蛋蛋白白内内部部的的非非极极性性残残基基可可以以换换成成另另一一种种非极性残基而功能不变。非极性残基而功能不变。血红蛋白氧合时亚基的移动 血血红红蛋蛋白白分分子子中中,亚亚基基的的接接触触有有两两类类,一一类类是是1 11 1接接触触和和2 22 2接接触触,这这类类接接触触称称为为装装配配接接触触;另另一一类类是是1 12 2接接触触和和2 21 1接接触触,这这类类接接触触称称为为滑滑动动接接触触。氧氧合合时时,每每个个二二聚聚体体半半分分子子作作为为一一个个刚刚体体移移动动,这这两两个个二二聚聚体体彼彼此此滑滑动动。我我们们
16、将将其其中中一一个个二二聚聚体体看看作作不不动动,另另一一个个二二聚聚体体将将绕绕一一个设想的偏心轴个设想的偏心轴旋转旋转15,并平移,并平移0.08nm。血红蛋白氧合时亚基的移动 去氧血红蛋白去氧血红蛋白 1111的移动过程的移动过程 氧合血红蛋白氧合血红蛋白血红蛋白氧合时铁原子的移动 在在去去氧氧血血红红蛋蛋白白中中,铁铁原原子子向向近近侧侧His方方向向凸凸起起约约0.06nm。氧氧合合时时,铁铁原原子子的的体体积积缩缩小小,向向卟卟啉啉环环平平面面靠靠近近约约0.039nm,并并牵牵拉拉近近侧侧His往往血血红红素素平平面面移移动动,这这些些移移动动,传传递递到到亚亚基基的的界界面面,
17、使使得亚基间的相互得亚基间的相互位置发生变化。位置发生变化。血红蛋白氧合时铁原子的移动 血红蛋白的两种构象态 血血红红蛋蛋白白有有两两种种主主要要构构象象态态,一一种种是是T态态即即紧紧张张态态(tense state),另另一一种种是是R态态即即松松弛弛态态(relaxed state)。O2对对R态态的的亲亲和和力力明明显显地地高高于于对对T态态的的亲亲和和力力,并并且且O2的的结结合合更更稳稳定定了了R态态。缺缺氧氧时时T态态更更加加稳稳定定,因因此此T态态是是去去氧氧血血红红蛋蛋白白的的主主要要构构象象,R态态是是氧氧合合血血红红蛋蛋白白的的主主要要构构象象。T态态血血红红蛋蛋白白结结
18、合合O2后后转转变变成成R态态,并使得分子内一些盐桥断裂。,并使得分子内一些盐桥断裂。去氧血红蛋白中各亚基间的盐桥血红蛋白的别构效应 血红蛋白是一个四聚体蛋白,它与肌红蛋白血红蛋白是一个四聚体蛋白,它与肌红蛋白相比,出现了一些新的性质。血红蛋白的氧合具相比,出现了一些新的性质。血红蛋白的氧合具有正协同同促效应,即一个有正协同同促效应,即一个O2的结合促进同一分的结合促进同一分子其它亚基与子其它亚基与O2的结合。具有这种性质的蛋白质的结合。具有这种性质的蛋白质称为别构蛋白(其它蛋白质也有负协同效应的)。称为别构蛋白(其它蛋白质也有负协同效应的)。血红蛋白的协同性氧结合 假假设设O2与与Hb的的结
19、结合合是是一一种种“全全或或无无”的的方方式式,其结合反应式为其结合反应式为则解离常数则解离常数K 为为 按按照照前前面面肌肌红红蛋蛋白白结结合合O2的的定定量量分分析析的的推推导导方法,方法,Hb的氧饱和分数的氧饱和分数Y 的表达式为的表达式为血红蛋白与肌红蛋白氧合曲线的比较血红蛋白的实际氧合曲线推导氧合曲线推导氧合曲线实际氧合曲线实际氧合曲线图中的图中的n为为Hill系数系数血红蛋白推导氧合曲线误差的原因 血血红红蛋蛋白白结结合合O2并并不不是是“全全或或无无”的的,各各个个亚亚基基结结合合O2是是依依次次进进行行的的,并并且且前前面面亚亚基基结结合合了了O2对对后后面面亚亚基基与与O2的
20、的结结合合有有促促进进作作用用。实实际际测测定定的的n=2.8,若若n=1,则则无无协协同同作作用用,若若n 1则则有有正正协协同同作作用用。对对于于血血红红蛋蛋白白来来说说,当当 n=4 时时正正协协同同作作用用最最大大,即即当当1个个O2与与1个个亚亚基基结结合合后后,另另外外3个个亚亚基基也也同同时时与与O2结结合合。实实际际情情况况是是n=2.8。这这样样,Hb对对第第4个个O2的的亲和力约为与第亲和力约为与第1个个O2亲和力的亲和力的300倍。倍。血红蛋白运输氧的效率 在在肺肺泡泡中中,氧氧分分压压为为100 torr,工工作作肌肌肉肉的的毛毛细细血血管管中中约约为为20 torr,
21、血血红红蛋蛋白白在在肺肺泡泡中中Y是是0.97,在在肌肌肉肉毛毛细细血血管管中中Y是是0.25,释释放放的的O2是是两两个个Y值值之之差差,即即Y=0.72。这这个个差差值值越越大大,运运输输O2的的效效率就越高。肌红蛋白不能担当此项工作。率就越高。肌红蛋白不能担当此项工作。血红蛋白别构的异种效应 血血红红蛋蛋白白与与O2的的结结合合受受其其它它分分子子的的调调节节,如如 H+、CO2和和 2,3-二二 磷磷 酸酸 甘甘 油油 酸酸(2,3-bisphosphate glycerate,BPG)等等。虽虽然然它它们们在在蛋蛋白白质质分分子子上上的的结结合合部部位位离离血血红红素素很很远远,但但
22、这这些些分分子子极极大大地地影影响响Hb的的氧氧合合性性质质,这这是是别别构构效应中的异种效应。效应中的异种效应。2,3-二磷酸甘油酸2,3-bisphosphate glycerate,BPGBohr效应 组组织织中中代代谢谢作作用用产产生生H+和和CO2,代代谢谢越越旺旺盛盛的的组组织织,需需要要的的O2越越多多,产产生生的的H+和和CO2也也越多。越多。CO2在体内被水合成碳酸。在体内被水合成碳酸。CO2水水合合的的结结果果,使使组组织织中中pH下下降降,即即H+上上升升。O2与与血血红红蛋蛋白白的的结结合合受受pH和和CO2浓浓度度的的影影响响。去去氧氧血血红红蛋蛋白白对对H+的的亲亲
23、和和力力比比氧氧合合血血红红蛋蛋白白大大。因因此此,增增加加H+浓浓度度将将促促进进O2的的释释放。放。HbO2 H+HbH+O2Bohr效应 氧氧合合血血红红蛋蛋白白在在组组织织中中释释放放的的O2量量除除了了受受到到组组织织中中低低O2浓浓度度的的作作用用外外,还还受受组组织织中中低低pH的的影影响响。后后者者叫叫做做Bohr效效应应,因因1904年年发发现现此此现现象象的丹麦生理学家的丹麦生理学家C.Bohr而得名。而得名。产产生生Bohr效效应应的的原原因因是是血血红红蛋蛋白白中中一一些些pK值值处处于于7附附近近的的可可解解离离基基团团的的作作用用,主主要要是是His,它它们们解解离
24、离与与否否会会影影响响到到血血红红蛋蛋白白的的构构象象,从从而而影影响血红蛋白对响血红蛋白对O2的亲和力。的亲和力。Mb和在不同pH下Hb的氧合曲线CO2与Hb的结合 血红蛋白还能结合血红蛋白还能结合CO2,结合部位是结合部位是4个亚个亚基基N末端的末端的NH2,这些氨基在这些氨基在T态时都处于态时都处于盐桥中,但盐桥中,但R态时都以游离状态存在。态时都以游离状态存在。CO2的结的结合也能促进合也能促进O2的释放。的释放。BPG与Hb的结合 2,3-二二磷磷酸酸甘甘油油酸酸(BPG)是是血血红红蛋蛋白白一一个个重重要要的的别别构构效效应应剂剂(别别构构抑抑制制剂剂)。正正常常人人红红细细胞胞中
25、中约约含含有有4.5mmol/L的的BPG,约约与与血血红红蛋蛋白白等等摩摩尔尔数数。每每个个Hb分分子子(四四聚聚体体)只只有有一一个个BPG结结合合位位点点,位位于于由由4个个亚亚基基缔缔合合形形成成的的中中央央孔孔穴穴内内。高高负负电电荷荷的的BPG分分子子与与每每个个链链的的若若干干个个残残基基的的带带正正电电荷荷基基团团通通过过静静电电结结合合于于Hb分分子子上上,BPG把把两两个个链链交交联联在在一一起起。O2的的结结合合使使中中央央孔孔穴穴变变小小,使使BPG结结合合变变得得困困难难。在在没没有有BPG存存在在时时,O2的的结结合合容容易易,而而在在有有BPG存在时,存在时,O2
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