生物选修3基因工程的基本操作程序上课用.ppt
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1、 1.2 1.2 基因工程的基本操作程序 能够发光的热带能够发光的热带鱼鱼基因工程的基本操作程序(1 1)目的基因的获取(2 2)(3 3)将目的基因导入受体细胞(4 4)目的基因的检测与鉴定基因基因表达载体表达载体的构建的构建基因工程的基本操作程序:基因工程的基本操作程序:一:目的基因的获取一:目的基因的获取 获取目的基因是实施基因工程的获取目的基因是实施基因工程的第第一步一步。目的基因:主要是指能编码蛋白目的基因:主要是指能编码蛋白质的基因。例如:质的基因。例如:与生物抗逆性相关的基与生物抗逆性相关的基与生物抗逆性相关的基与生物抗逆性相关的基因、与优良品质相关的基因等。因、与优良品质相关的
2、基因等。因、与优良品质相关的基因等。因、与优良品质相关的基因等。获取目的基因的方法:获取目的基因的方法:1.从从基因文库基因文库中提取中提取2.利用利用PCR技术扩增技术扩增基因组文库基因组文库部分基因文库部分基因文库 3.化学方法人工合成化学方法人工合成1.1.什么叫基因文库?什么叫基因文库?将含有某种生物不同基因的许多DNADNA片断,导入到受体菌的群体中储存,各个受体菌分别含有这种生物的不同基因,称为基因文库。基因组文库:用限制酶切割一种生物的全部DNA,可以得到大量的DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转化到细菌中去,让受体菌不停分裂。这样,每个受体菌包含有特定的基因组DNA
3、片段,整个受体菌群体就包含这种生物的全部基因称为基因组文库。2 2、部分基因文库:、部分基因文库:部分基因文库:只包含了一种生物的一部分基因,这种基因文库叫做部分基因文库,例:cDNAcDNA文库。用某种生物发育的某个时期的mRNAmRNA为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成cDNAcDNA,与常用载体噬菌体或质粒载体连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段cDNAcDNA,并能繁殖扩增,这个受体菌群体就叫做这种生物的cDNAcDNA文库。基因组文库的构建模式图通过对受体菌的培养而储存基因基因组DNA文库cDNA文库基因组基因组DNADNA文库与文库与cDNAcDNA文库的比较文库的比较cDNA
4、文库和基因组文库的比较文库类型cDNA文库基因组文库文库大小小大基因中启动子无有基因组中内含子 无有基因多少某种生物的部分基因某种生物的全部基因物种间的基因交流可以部分基因可以补:原核细胞的基因结构补:原核细胞的基因结构非编码区非编码区编码区编码区上游 编码区下游 与RNA聚合酶结合位点启动子终止子 RNA聚合酶能够识别调控序列中的结合位点,并与其结合。转录开始后,RNA聚合酶沿DNA分子移动,并以DNA分子的一条链为模板合成RNA。转录完毕后,RNA链释放出来,紧接着RNA聚合酶也从DNA模板链上脱落下来。不能转录为信使不能转录为信使RNARNA,不能,不能 编码蛋白质。编码蛋白质。:能转录
5、相应的信使能转录相应的信使RNARNA,能,能 编码蛋白质编码蛋白质 编码区非编码区原核细胞的 基因结构有调控遗传信息表达的核有调控遗传信息表达的核 苷酸序列,在该序列中,苷酸序列,在该序列中,最重要的是位于编码区上最重要的是位于编码区上 游的游的RNARNA聚合酶结合位点。聚合酶结合位点。非编码区非编码区编码区编码区上游 编码区下游 启动子终止子真核细胞的基因结构编码区非编码区非编码区与RNA聚合酶结合位点内含子 外显子 能够编码蛋白质的序列叫做外显子能够编码蛋白质的序列叫做外显子 不能够编码蛋白质的序列叫做内含子不能够编码蛋白质的序列叫做内含子启动子终止子编码区上游 编码区下游 内含子内含
6、子:外显子外显子:结构基因外显子内含子转录、加工修饰mRNA结构基因外显子内含子转录、加工修饰mRNA真核细胞的 基因结构编码区非编码区非编码区:外显子:能编码蛋白质的序列内含子:不能编码蛋白质的序列 有调控作用的核苷酸序列,包括位于编码区上游的RNA 聚合酶结合位点。非编码序列:包括非编码区和内含子原核细胞原核细胞真核细胞真核细胞不同点不同点编码区是编码区是_的的编码区是间隔的、编码区是间隔的、_的的相同点相同点都由能够编码蛋白质的都由能够编码蛋白质的_ _ _ 和具有和具有调控作用的调控作用的_ 区组成的区组成的原核细胞与真核细胞的基因结构比较思考编码相同数目氨基酸的蛋白质,原核细胞与编码
7、相同数目氨基酸的蛋白质,原核细胞与真核细胞基因结构一样长吗?真核细胞基因结构一样长吗?连续连续不连续不连续编码区编码区非编码非编码如何从基因文库中得到所需要的基因?如何从基因文库中得到所需要的基因?依据:目的基因的有关信息依据:目的基因的有关信息 如:根据基因的核苷酸序列如:根据基因的核苷酸序列 基因的功能基因的功能 基因在染色体上的位置基因在染色体上的位置 基因的转录产物基因的转录产物mRNA 基因翻译产物蛋白质等特性基因翻译产物蛋白质等特性(1 1)从基因组文库中获取:)从基因组文库中获取:限制酶限制酶供体细胞中的供体细胞中的DNADNA许多许多DNADNA片段片段运载体运载体与载体连接与
8、载体连接受体细胞受体细胞产生特定性状产生特定性状导入导入外源外源DNADNA扩增扩增目的基因目的基因分离分离 以目的基因转录成的信使RNARNA为模板,再反转录酶的催化下反转录成互补的单链DNADNA,然后在DNADNA聚合酶的作用下合成双链DNADNA,即cDNAcDNA,从而获得所需的基因。(2 2)从部分基因文库中获取(例cDNAcDNA文库的构建方法)(3 3)根据已知的氨基酸序列人工合成)根据已知的氨基酸序列人工合成)根据已知的氨基酸序列人工合成)根据已知的氨基酸序列人工合成DNADNA法法法法 :根据已知蛋白根据已知蛋白根据已知蛋白根据已知蛋白质的氨基酸序列,质的氨基酸序列,质的氨
9、基酸序列,质的氨基酸序列,推测出相应的信使推测出相应的信使推测出相应的信使推测出相应的信使RNARNA序列,然后按序列,然后按序列,然后按序列,然后按照碱基互补配对原照碱基互补配对原照碱基互补配对原照碱基互补配对原则,推测出它的结则,推测出它的结则,推测出它的结则,推测出它的结构基因的核苷酸序构基因的核苷酸序构基因的核苷酸序构基因的核苷酸序列,再通过化学方列,再通过化学方列,再通过化学方列,再通过化学方法,以单核苷酸为法,以单核苷酸为法,以单核苷酸为法,以单核苷酸为原料合成目的基因。原料合成目的基因。原料合成目的基因。原料合成目的基因。蛋白质的氨基酸序列蛋白质的氨基酸序列mRNAmRNAmRN
10、AmRNA的核苷酸序列的核苷酸序列的核苷酸序列的核苷酸序列结构基因的核苷酸序列结构基因的核苷酸序列结构基因的核苷酸序列结构基因的核苷酸序列推测推测推测推测目的基因目的基因化学合成化学合成上述三种目的基因提取的方法有何优缺点?上述三种目的基因提取的方法有何优缺点?优点优点缺点缺点从基因组文库中获取从部分基因文库中获取根据已知氨基根据已知氨基酸合成酸合成DNADNA法法操作简便操作简便广泛使用广泛使用工作量大,盲目,专一性工作量大,盲目,专一性差,分离出来的有时并非差,分离出来的有时并非一个基因一个基因专一性强专一性强操作过程麻烦,操作过程麻烦,mRNAmRNA很不很不稳定,要求的技术条件较稳定,
11、要求的技术条件较高高专一性最强专一性最强仅限于合成核苷酸对较少仅限于合成核苷酸对较少的简单基因,适用范围小的简单基因,适用范围小4.利用PCR技术扩增目的基因 称多聚酶链式反应穆里斯等人于1988年发明的。PCR是一项在生物体外复制特定DNA片段的核酸合成技术。利用利用PCR技术扩增目的基因技术扩增目的基因1234522557294时间(min)温度()PCR反应PCR反应条件PCR过程PCR的特点适温延伸3高温变性1低温退火2重复13步2530轮目的DNA片段扩增100万倍以上DNADNA双螺旋双螺旋DNADNA单链单链与引物复性与引物复性D DN NA A变变性性形形成成2 2条条单单链链
12、子链延伸子链延伸DNADNA加倍加倍模板DNA95PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点50引物1引物2DNA引物PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点引物1引物2DNA引物72Taq酶Taq酶Taq DNA聚合酶(thermus aquaticus)酶酶活活性性(%)温度温度()40 50 60 70 80 90 100100 80 60 40 20PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点72第1轮结束第2轮开始PCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点955072TaqTaqTaqTaqPCR的基本原理PCR反应条件PCR过程PCR的特点7
13、2第2轮结束PCR的基本反应步骤变性90-95C延伸70-75C复性复性55-60CPCRPCR总结总结:变性:加热至9095双链DNA解链成为单链DNA复性:冷却至5560部分引物与模板的单链DNA的特定互补部位相配对和结合延伸:加热至7075以目的基因为模板,合成互补的新DNA链变性复性延伸 概念:PCR全称为_,是一项 在生物_复制_的核酸合成技术。前提条件:_;原料:_、_、_、_。原理:_方式:以方式:以_方式扩增,即方式扩增,即_ _ _(n n为扩增为扩增循环的次数)循环的次数)结果:聚合酶链式反应体外特定DNA片段DNA复制已知基因的核苷酸序列四种脱氧核苷酸DNA引物热稳定DN
14、A聚合酶指数指数2 2n n使目的基因的片段在短时间内成百万倍地扩增使目的基因的片段在短时间内成百万倍地扩增模板DNAPCR技术扩增与DNA复制的比较PCRPCR技术技术DNADNA复制复制相相同同点点原理原理原料原料条件条件不不同同点点解旋解旋方式方式场所场所酶酶结果结果碱基互补配对四种脱氧核苷酸模板、能量、酶DNA在高温下变性解旋解旋酶催化体外复制细胞核内热稳定的DNA聚合酶细胞内的DNA聚合酶大量的DNA片段形成整个DNA分子人工合成(基因比较小)DNA合成仪从基因文库中获取从基因文库中获取利用利用PCRPCR技术扩增技术扩增利用化学方法人工合成利用化学方法人工合成归纳:获取目的基因的方
15、法归纳:获取目的基因的方法 用一定的用一定的_切割切割 质粒,使其出现一个切质粒,使其出现一个切 口,露出口,露出_。用用_切断目切断目 的基因,使其产生的基因,使其产生_ _ _。将切下的目的基因片段插入质粒的将切下的目的基因片段插入质粒的_处,处,再加入适量再加入适量_,形成了一个重组,形成了一个重组 DNADNA分子(重组质粒)分子(重组质粒)限制酶黏性末端黏性末端同一种限制酶同一种限制酶相同的黏性末端相同的黏性末端切口切口DNADNA连接酶连接酶1.过程:二基因表达载体构建 核心质粒质粒DNADNA分子分子限制酶处理一个切口一个切口两个黏性末端两个黏性末端两个切口两个切口获得目的基因获
16、得目的基因DNADNA连接酶连接酶重组重组DNADNA分子(重组质粒)分子(重组质粒)同一种过程过程:2.构建基因表达载体的目的(1)使目的基因在受体细胞中稳定存在并可以遗传给下一代;(2)使目的基因能够表达和发挥作用。科学家在培育抗虫棉时,经历了多次失败,科学家在培育抗虫棉时,经历了多次失败,才获得成功。才获得成功。起初把苏云金芽孢杆菌的起初把苏云金芽孢杆菌的抗虫基因抗虫基因插入载插入载体质粒中,然后导入棉花的受精卵中,结果抗体质粒中,然后导入棉花的受精卵中,结果抗虫基因在棉花体内没有表达。虫基因在棉花体内没有表达。然后在插入抗虫基因的质粒中插入然后在插入抗虫基因的质粒中插入启动子启动子(抗
17、虫基因首端抗虫基因首端),导入棉花受精卵,长成的棉,导入棉花受精卵,长成的棉花植株还是没有抗虫能力。科学家又在有启动花植株还是没有抗虫能力。科学家又在有启动子、抗虫基因的质粒中插入子、抗虫基因的质粒中插入终止子终止子(抗虫基因末抗虫基因末端端),导入棉花受精卵,结果成长的植株,有了,导入棉花受精卵,结果成长的植株,有了抗虫能力。抗虫能力。资 料:思考:作为基因工程表达载体,只需含有目的基因就可以完成任务吗?为什么?(P15)不可以。因为目的基因在表达载体中得到表达并发挥作用,还需要有其他控制元件,如启动子、终止子和标记基因等。必须构建上述元件的主要理由是:(1)生物之间进行基因交流,只有使用受
18、体生物自身基因的启动子才能比较有利于基因的表达;(2)通过cDNA文库获得的目的基因没有启动子,只将编码序列导入受体生物中无法转录;(3)目的基因是否导入受体生物中需要有筛选标记;(4)为了增强目的基因的表达水平,往往还要增加一些其他调控元件,如增强子(增强基因启动子工作效率的顺式作用序列,能够在相对于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)上都发挥作用。)等;(5)有时需要确定目的基因表达的产物存在于细胞的什么部位,往往要加上可以标识存在部位的基因(或做成目的基因与标识基因的融合基因),如绿色荧光蛋白基因等。3.3.基因表达载体的组成:基因表达载体的组成:它们有什么作用?a、目的基因b、启动
19、子c、终止子d、标记基因调节基 因操纵基 因结构基因RNA聚合酶半乳糖苷酶 酶酶 RNA聚合酶启动子RNA聚合酶启动子启动子:位于基因首端的一段特殊的DNA片断,它是RNA聚合酶识别和结合的部位,有了它才能驱动基因转录出mRNA,最终获得蛋白质。思考思考1 1:表达载体为什么一定要有启动子?表达载体为什么一定要有启动子?(1 1)生物之间进行基因交流,只有使用受体生物自身基因的启动子才能有利于基因的表达;(2 2)通过cDNAcDNA文库获得的目的基因没有启动子,只将编码序列导入受体细胞无法转录。思考思考2:终止子的作用是什么?终止子的作用是什么?终止子是位于基因尾端的一段特殊的DNADNA片
20、断,能终止mRNAmRNA的转录。是为了鉴别受体细胞中是否含有目的基因,从而将有目的基因的细胞筛选出来。思考3:标记基因有什么作用?载体载体与与表达载体表达载体的区别:二者都有标记基因和复制原点两部分的区别:二者都有标记基因和复制原点两部分DNADNA片段。表达载体在载体基础上增加了目的基因、启动子、终止片段。表达载体在载体基础上增加了目的基因、启动子、终止子三部分结构。子三部分结构。注意用到的工具酶:用到的工具酶:既用到限制酶切割载体,又用到既用到限制酶切割载体,又用到DNADNA连连接酶将目的基因和载体拼接,两种酶作用的化学键都是磷接酶将目的基因和载体拼接,两种酶作用的化学键都是磷酸二酯键
21、。酸二酯键。启动子、终止子启动子、终止子对于目的基因表达必不可少。对于目的基因表达必不可少。目的基因不能单独进入受体细胞,目的基因不能单独进入受体细胞,必需以表达载体的方必需以表达载体的方式携带进去。式携带进去。基因工程技术路线三、将目的基因导入受体细胞常用的受体细胞:常用的受体细胞:常用的受体细胞:常用的受体细胞:有大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌、酵母菌和动植有大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌、酵母菌和动植有大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌、酵母菌和动植有大肠杆菌、枯草杆菌、土壤农杆菌、酵母菌和动植物细胞等。物细胞等。物细胞等。物细胞等。将目的基因导入受体细胞的原理:将目的基因导入受体细胞的原理
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