《核酸的生物化学》PPT课件.ppt
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1、核酸的生物化学核酸的生物化学李金明 卫生部临床检验中心核酸核酸(Nucleic acid)?l愚蠢的分子愚蠢的分子?l核苷酸的简单排列核苷酸的简单排列蛋白质的丰富多彩蛋白质的丰富多彩A是是B的的DNAl这这里里B不是生物体不是生物体lA不是不是DNAl这这句句话话想想说说的是的是:A是是B的本的本质质、精精华华核酸研究的历史核酸研究的历史核酸研究的历史核酸研究的历史 不久,科塞不久,科塞尔尔(Albrecht Kossel)发现发现“核素核素”是蛋白和核是蛋白和核酸的复合物,并明确了核酸各酸的复合物,并明确了核酸各组组成成分的比例成成分的比例(核酸化学核酸化学领领域的域的第一第一缕缕曙光曙光)
2、Friedrich Miescher Albrecht Kossel(获获1910年诺贝尔生理学医学奖年诺贝尔生理学医学奖)1869 米舍尔(米舍尔(Friedrich Miescher 从脓球分离出细胞核,从脓球分离出细胞核,不受蛋白酶分解,磷含量高,不受蛋白酶分解,磷含量高,命名为命名为“核素核素”(nuclein)核酸研究的历史核酸研究的历史1911 科塞科塞尔尔的学生莱文的学生莱文(P.A.T.Levine)证证明明核酸中所含的糖由核酸中所含的糖由5个碳原子所个碳原子所组组成,命名成,命名为为核糖核糖阐阐明了胸腺明了胸腺组织组织和酵母中分离到和酵母中分离到的核酸的不同的核酸的不同,前者
3、前者为为脱氧核糖核酸脱氧核糖核酸(DNA),后者后者为为核糖核酸(核糖核酸(RNA)。)。核酸研究的历史核酸研究的历史1934 莱文莱文发现发现核酸可被分解成含有一个核酸可被分解成含有一个嘌嘌 呤或呤或嘧啶嘧啶、一个核糖或脱氧核糖和一个磷酸、一个核糖或脱氧核糖和一个磷酸的片段,的片段,这样这样的的组组合叫合叫“核苷酸核苷酸”。他们根据当时比较粗糙的分析认为,他们根据当时比较粗糙的分析认为,4种碱基种碱基 在核酸中的量相等,从而错误地推导出核酸的基在核酸中的量相等,从而错误地推导出核酸的基本结构是由本结构是由4个含不同碱基的核苷酸连接成四核个含不同碱基的核苷酸连接成四核苷酸,以此为基础聚合成核酸
4、,这就是较著名的苷酸,以此为基础聚合成核酸,这就是较著名的“四核苷酸假说四核苷酸假说”。核酸研究的历史核酸研究的历史 1944 美国微生物学美国微生物学家埃弗里(家埃弗里(O.T.Avery)等的)等的肺炎肺炎球菌转化实验球菌转化实验 O.T.AVERY核酸研究的历史核酸研究的历史Erwin Chargaff1950 查伽夫(查伽夫(Erwin Chargaff)et al-Chargaff法则法则 核酸研究的历史核酸研究的历史1952 赫尔希和蔡斯赫尔希和蔡斯(HERSHEY,CHASE)-噬菌体标记噬菌体标记实验实验 Alfred Hershey and Martha Chase核酸研究的
5、历史核酸研究的历史l1953 沃森和克里克沃森和克里克(WATSON,CRICK)-DNA双螺旋双螺旋Francis Crick and James Watson(获获1962年诺贝尔生理学医学奖年诺贝尔生理学医学奖)Maurice Hugh Frederick WilkinsRosalind Franklin为什么是这两个年轻人为什么是这两个年轻人?l沃森:生物学,研究噬菌体l克里克:物理学、化学l不是因为勤奋(成绩平平),而是因为其独有的想像力。沃森和克里克却是“站在巨人的脚趾上”-布拉格在为双螺旋写序时,戏称他们。我之所以能够看得更远,是因为我站在巨人的肩膀上。-牛顿“因为他们连跑上巨人
6、的肩膀上功夫都没花”核酸研究的历史核酸研究的历史l1955 托德托德(Alexander Robertus Todd)用用磷酸三酯法合成了二磷酸三酯法合成了二核苷酸核苷酸TpT 这是人工合成这是人工合成DNA大大分子的前奏分子的前奏Alexander Robertus Todd(获获1957年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖)核酸研究的历史核酸研究的历史 1960年代中期年代中期 桑格桑格(Sanger)的的DNA测序法测序法 Frederick Sanger(获获1958和和1980年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖)核酸研究的历史核酸研究的历史1972 伯格伯格(Paul Berg)重组重组DNA技术
7、技术 引起人肿瘤的猴病毒基因与引起人肿瘤的猴病毒基因与噬菌体噬菌体lambda的重组的重组 1973 博耶(博耶(Herbert Boyer)和科)和科恩(恩(Stanley Cohen)-使用重使用重组组DNA技术首次得到了重组技术首次得到了重组DNA微生物微生物(基因工程技术基因工程技术)Paul Berg (获获1980年诺贝尔化学奖年诺贝尔化学奖)Herbert Boyer and Stanley Cohen核酸研究的历史核酸研究的历史1983 穆利斯(穆利斯(Kary Mullis)PCR技术技术核酸研究的历史核酸研究的历史l1990 Human Genome Project 后基因
8、组时代后基因组时代-基因组学基因组学l功能基因组学功能基因组学 研究的核心问题有:基研究的核心问题有:基因组的多样性(因组的多样性(SNP、药物基因组学药物基因组学);基因);基因组的表达及其时空调节组的表达及其时空调节(基因芯片、蛋白质组基因芯片、蛋白质组学等学等);模式生物基因);模式生物基因组研究(组研究(基因剔除基因剔除)等)等后基因组时代后基因组时代-基因组学基因组学l结构基因组学结构基因组学 结构基因组学,是由结构生物学与功结构基因组学,是由结构生物学与功能基因组学紧密结合所产生的,其科能基因组学紧密结合所产生的,其科学目标就是要规模化地测定蛋白质、学目标就是要规模化地测定蛋白质、
9、RNA及其它生物大分子的三维结构。及其它生物大分子的三维结构。核酸的种类核酸的种类 DEOXYRIBONUCLEIC ACID(DNA)RIBONUCLEIC ACID(RNA)ribosome RNA(rRNA)transfer RNA(tRNA)messenger RNA(mRNA)核酸的分布核酸的分布 DNA RNA 核(核(%)98 90核酸的含量核酸的含量lDNA恒定恒定lRNA与细胞生长状态有与细胞生长状态有关关核酸的功能核酸的功能lDNA-遗传遗传lRNA-参与蛋白质合成参与蛋白质合成核酸的分子组成核酸的分子组成l元素组成元素组成 C H O N P(恒定,(恒定,910%)l基
10、本结构单位基本结构单位核苷酸核苷酸 n核苷酸(核苷酸(nucleotide)核酸核酸多聚核苷酸(多聚核苷酸(polynucleotides)磷酸磷酸核苷(核苷(nucleoside)戊糖戊糖-ribose(R)deoxyribose(dR)碱基碱基 A G U C A G T CDNA、RNA组成异同组成异同RNADNA 戊糖戊糖核糖脱氧核糖Adenine(A)Adenine(A)碱基碱基 Cytosine(C)Cytosine(C)Uracil(U)Thymine(T)Guanine(G)Guanine(G)链的数量链的数量常为单链双链 热稳定性热稳定性?不稳定稳定AdenineAdenin
11、eCytosineCytosineGuanineGuanineThymineThymine核糖和磷酸核糖和磷酸DeoxyribosePhosphoric AcidO核苷、核苷酸核苷、核苷酸其它核苷酸其它核苷酸:NAD(辅酶辅酶I)、FAD(黄素腺嘌黄素腺嘌呤二核苷酸呤二核苷酸)、cAMP、cGMP、5-FU、6-MPl2、3、5NMP(一磷酸核苷一磷酸核苷),3、5dNMP,主要是主要是5NMP、dNMP,DNARNA组成组成l NTPdNTP NDPdNDP 多磷酸核苷酸,能多磷酸核苷酸,能量代谢量代谢l环核苷酸环核苷酸 cAMP、cGMP 第二信使第二信使lNADNADP FADFMN 辅
12、酶,生物氧化辅酶,生物氧化l抗代谢药物抗代谢药物 6MP,5-FU核酸的分子结构核酸的分子结构核酸的一级结构核酸的一级结构5 end3 end核苷酸的连接核苷酸的连接3,5磷酸二酯键磷酸二酯键表示法表示法 pCpCpA pC-C-A 5-CCA-3DNA的分子结构的分子结构lDNA的碱基组成(的碱基组成(CHARGAFF法则)法则)有种属特异性有种属特异性 无组织、器官特异性无组织、器官特异性 不受年龄、营养和环境的影响不受年龄、营养和环境的影响 不论种属、组织来源,所有不论种属、组织来源,所有DNA分子分子 A T、G C A/T G/C 1 A+G T+CDNA 的分子结构的分子结构Hyd
13、rogen BondsCytosineAdenineThymineGuanineDeoxyribose(Sugar molecule)Phosphoric Acid(Phosphate molecule)DNA的二级结构的二级结构双螺旋结构双螺旋结构lWatson,Crick(1953)在在Chargaff法则及法则及Wilkins,Franklin的的X线衍射工作基础上提出线衍射工作基础上提出DNA的的double helix结构模型结构模型lDNA分子由相互平行、走向相反、碱基互补的两条分子由相互平行、走向相反、碱基互补的两条脱氧核糖核苷酸链围绕同一中心轴,盘绕成双螺旋脱氧核糖核苷酸链围绕
14、同一中心轴,盘绕成双螺旋结构,螺旋的一侧为大沟,另一侧为小沟。结构,螺旋的一侧为大沟,另一侧为小沟。l 磷酸磷酸脱氧核糖形成的长链骨架在外,碱基在内,脱氧核糖形成的长链骨架在外,碱基在内,两平行链对应碱基间以氢键相连;对应碱基总是两平行链对应碱基间以氢键相连;对应碱基总是A=T、G=C配对(配对(base pairing)或互补,形成或互补,形成稳定联系。稳定联系。l 各碱基平面垂直或基本垂直于双螺旋中心轴,链内各碱基平面垂直或基本垂直于双螺旋中心轴,链内碱基间形成纵向碱基间形成纵向Vander Waals力与长轴平行,使双力与长轴平行,使双螺旋更稳定。螺旋更稳定。l 相临碱基对间距离为相临碱
15、基对间距离为0.34nm,每周螺距为每周螺距为3.4nm(10bp),d为为 2nm(B型)型)DNA double helix类型类型 helix type bp/turn rotation/bp vertical rise/bp helical d A 11 +34.7 2.56A 23A B 10 +34.0 3.38A 19A C 9.33 +38.6 3.32A 19A Z 12 -30.0 5.71A 18ADNA的高级结构的高级结构l超螺旋超螺旋 如线粒体如线粒体DNAl细菌质粒细菌质粒DNAl病毒病毒DNA DNA的高级结构的高级结构l 核小体结构核小体结构:由:由DNA和组和
16、组蛋白共同构成蛋白共同构成 2 (H2AH2B H3 H4)/DNA(146bp)=核心颗粒核心颗粒l超螺线管超螺线管染色质染色质:由:由核心颗粒与连接区构成的核心颗粒与连接区构成的核小体彼此串联,成串珠核小体彼此串联,成串珠状,再进一步卷曲,形成状,再进一步卷曲,形成超螺线管结构。超螺线管结构。RNA的分子结构的分子结构lRNA的种类:的种类:tRNA、rRNA、mRNAlRNA的碱基组成:的碱基组成:A U G C 稀有碱基(假稀有碱基(假尿嘧啶、甲基化碱基)尿嘧啶、甲基化碱基)lRNA的一级结构:核苷酸序列的一级结构:核苷酸序列 3,5磷酸二磷酸二酯键连接酯键连接lRNA高级结构高级结构
17、 tRNA的结构的结构 一级结构一级结构 7090 nt 二级结构二级结构 三叶草形状:三叶草形状:特点(特点(1)氨基酸臂:)氨基酸臂:3CCA-OH结构可与活化的氨基酸结合。结构可与活化的氨基酸结合。(2)DHU环(二氢尿嘧啶)。环(二氢尿嘧啶)。(3)反密码环:可与)反密码环:可与mRNA中三中三联体构成反密码子,在蛋白合成中联体构成反密码子,在蛋白合成中起解读密码子,将对应氨基酸引入起解读密码子,将对应氨基酸引入合成位点的作用。(合成位点的作用。(4)T 环:环:含胸腺嘧啶核苷和假尿嘧啶核苷为含胸腺嘧啶核苷和假尿嘧啶核苷为特征。(特征。(5)额外环:是)额外环:是tRNA分类分类的标志
18、的标志 三级结构三级结构 倒倒“L”形形ACCDHU环环T 环环反密码环反密码环5额外环额外环mRNA的的结构结构l3-poly A(30200),为,为mRNA的的“尾尾”l5-7甲基鸟苷三磷酸,为甲基鸟苷三磷酸,为mRNA的的“帽帽”l分子中有编码区和非编码区。中间为密码子分子中有编码区和非编码区。中间为密码子 Codon。这些三联体密码子决定蛋白质的一级。这些三联体密码子决定蛋白质的一级结构结构核酸的理化性质:核酸的理化性质:含量和分子大小含量和分子大小l细胞中核酸含量依种属及组织而定,如酵母含细胞中核酸含量依种属及组织而定,如酵母含0.1%,肌肉组织及细菌含,肌肉组织及细菌含0.5%1
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