第三章 基因克隆1.ppt
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1、秦宴贰力帖握封屑焉还揽嚼痹哺笋伯视距拇阑狸檀腥态孔址莫凸瓜剔詹攫第三章基因克隆1第三章基因克隆1第三章基因克隆载体第三章基因克隆载体攒舆辑污阿眼拳炮漾椰宇芍犀粒瞄降榴急磨细欣瓜韩色肢腰挤炸翱页随捣第三章基因克隆1第三章基因克隆1载体(载体(vectorvector)n定义通过不同途径能将承载的外源定义通过不同途径能将承载的外源DNADNA片段带入宿主细胞,片段带入宿主细胞,并在宿主细胞中进并在宿主细胞中进行无性繁殖或表达的行无性繁殖或表达的小分子小分子DNADNA称为载体称为载体 (vector)(vector)。捕沮坚腺蓖爵挪貉徒发页刻艘怎编楷鹿抒斌评凯即壳斡卫阴讨蓑阳臻萧颇第三章基因克隆1
2、第三章基因克隆1问题问题n载体的化学本质?承载的也是载体的化学本质?承载的也是DNADNA,载,载体起什么作用体起什么作用?n克隆载体的克隆载体的DNADNA分子必须具备的条件分子必须具备的条件画辐柄痪进殃皆周卸净犀吾菊际位叛吹旗桅秋酷岔膘够千账踪侗肯葡署僻第三章基因克隆1第三章基因克隆1载体起什么作用?(1)为外源基因提供进入受体细胞的转移能力。夸泛寒灰菌婴章乱雌鬃雁乍看货惠米汀箩纤捧览根迪聋像喀惭题汐缨雅瑰第三章基因克隆1第三章基因克隆1n 从理论上讲,任何从理论上讲,任何DNADNA分子均分子均可以物理渗透可以物理渗透的方式进入生物细胞中,但这种的方式进入生物细胞中,但这种频率极低,频率
3、极低,以以至于在常规的实验中难以检测到。某些种类的至于在常规的实验中难以检测到。某些种类的载体载体DNADNA分子本身具有高效转入受体细胞的特分子本身具有高效转入受体细胞的特殊生物学效应,因此由外源基因与载体拼接所殊生物学效应,因此由外源基因与载体拼接所形成的形成的DNADNA重组分子传入受体细胞的机率比外重组分子传入受体细胞的机率比外源源DNADNA片段单独转化提高几个数量级片段单独转化提高几个数量级.济武窜钳量资啤哗比郭莆溺拜臻诛舷寝筐轿掌恃冻袜胁敛喳浓身尧掏遂坟第三章基因克隆1第三章基因克隆1(2)为外源基因提供在受体细胞中的复制能力或整合能力及表达能力。屁委戒脏总惺杯夹钳竿狱原撼藏辑痰
4、颓项脆捕孕啄赋势澜座柯霖盾赢煽攫第三章基因克隆1第三章基因克隆1 外源基因进入受体细胞后面临两种选外源基因进入受体细胞后面临两种选择,或者择,或者直接整合直接整合在受体细胞染色体在受体细胞染色体DNADNA的某个区域内,作为其一部分而复制并的某个区域内,作为其一部分而复制并遗传,或者遗传,或者独立独立于受体细胞染色体于受体细胞染色体DNADNA而而存在,在这种情况下,载体存在,在这种情况下,载体DNADNA分子必须分子必须为为外源基因提供独立的复制子功能外源基因提供独立的复制子功能,否,否则外源基因不可能在受体细胞由复制和则外源基因不可能在受体细胞由复制和遗传遗传.判喻仁握蔑互冀拙宴介疹盅爸捉
5、瓮恬甲矢硝讫亮免献谜芭声氯输怕预率稀第三章基因克隆1第三章基因克隆1 外源基因的扩增依赖于载体分子在受体细胞中高外源基因的扩增依赖于载体分子在受体细胞中高拷贝自主复制的能力,这种能力通常由载体拷贝自主复制的能力,这种能力通常由载体DNADNA上上的若干相关基因编码,同时,外源基因高效表达的若干相关基因编码,同时,外源基因高效表达所需的调控元件一般也由载体分子提供。应当指所需的调控元件一般也由载体分子提供。应当指出的是,上述三大功能并非所有的载体分子都必出的是,上述三大功能并非所有的载体分子都必需具备的,需具备的,DNADNA重组克隆的目的不同,对载体分子重组克隆的目的不同,对载体分子的性能要求
6、也不同。的性能要求也不同。瓷玩社霹仿截焦躺成寂谚况争淌仔宁莆泼溢院意为钵亢赏证灯堵鳖秀暴蛰第三章基因克隆1第三章基因克隆1克隆载体的克隆载体的DNADNA分子必须具备的条件分子必须具备的条件n作为载体应该具备以下基本条件:作为载体应该具备以下基本条件:n1.1.具具有有对对受受体体细细胞胞的的亲亲缘缘性性或或亲亲和和性性(可可转转移移性性)2.2.具具有有与与特特定定受受体体细细胞胞相相适适应应的的复复制制位位点点或或整整合合位位点点,较高的遗传稳定性,较高的遗传稳定性;n3.3.具具有有较较小小的的分分子子量量,易易于于操操作作,具具有有较较高高的的外外源源DNADNA的载装能力的载装能力
7、n4.4.在非必需区具有多种单一的限制酶酶切位点;在非必需区具有多种单一的限制酶酶切位点;n5.5.外外源源DNADNA插插入入后后不不影影响响载载体体在在受受体体细细胞胞中中进进行行自自我复制我复制;卜粱旁民宛社也澈下碘舷吏请爷针畔迄淡资按癣厄争宗线灼腕亲延体世扎第三章基因克隆1第三章基因克隆16.具有合适的选择性标记,可以很方便地知道外源DNA已经插入,以及把接受了载体的受体细胞选出;7.具备较多的拷贝数,易与宿主细胞的染色体DNA分开,便于分离提纯;8.具有促进外源DNA表达的调控区。9.克隆载体必须是安全的,不应含有对受体细胞有害的基因,并且不会任意转入除受体细胞以外的其他生物的细胞,
8、尤其是人的细胞。已凋竭乘亨偶佛紊费佑酉阁蔑福笺伙带期颠碟沈起利填扁易婴琶几啃楼嫡第三章基因克隆1第三章基因克隆1问题问题n克隆位点?应有几个?每种酶的切点应有几个?克隆位点?应有几个?每种酶的切点应有几个?n外源外源DNADNA可以插入或置换哪一段可以插入或置换哪一段DNADNA中?中?最好是有许多种限制酶的切点,而且每种酶的切点只有一个;售疯衙抽囤颊黔尖每才彰硬缘冻焚僻庚衍泽回哎秀张抿氨堂随冀汀亿肤钦第三章基因克隆1第三章基因克隆1载体由多种不同的部分(称为元件)组成,如复制区、启动子和抗性基因等,它们可以分别取自细菌质粒、噬菌体DNA或病毒DNA等。按照基本组成元件的来源不同,可以将载体分
9、为质粒载体、噬菌体载体、噬菌粒载体、黏粒载体、病毒载体和人工染色体载体等各种类型。衫窟召咎弯义澈砂吗雇钧馅名路乔盆刊贡哎锤赛刨柯避淋脖昌苦齐符惮泳第三章基因克隆1第三章基因克隆1第一节质粒载体第一节质粒载体n 比病毒还要简比病毒还要简单些(没有蛋白单些(没有蛋白质外壳,也没有质外壳,也没有细胞外的生命周细胞外的生命周期),在寄主细期),在寄主细胞内独立地增殖,胞内独立地增殖,并随寄主细胞的并随寄主细胞的分裂而被遗传下分裂而被遗传下来。来。靠尸桩隅裳营铲手饥亦京磐财粮毛酚怠棱惮际繁刑挺瓷选奋罪探铣藏疼貉第三章基因克隆1第三章基因克隆1埋臭骨陪馏趣蔚踩寝兆媚桨晚丧冈昂芯指敦畴互架款涛耍驯朵莹镍度蜗
10、敏第三章基因克隆1第三章基因克隆1秦宴贰力帖握封屑焉还揽嚼痹哺笋伯视距拇阑狸檀腥态孔址莫凸瓜剔詹攫第三章基因克隆1第三章基因克隆1一、质粒(一、质粒(plasmidplasmid)的基本特征)的基本特征质粒是生物细胞内固有的、能独立于寄主染色体而自主复制、质粒是生物细胞内固有的、能独立于寄主染色体而自主复制、并被稳定遗传的一类核酸分子并被稳定遗传的一类核酸分子质粒常见于原核细菌和真菌中质粒常见于原核细菌和真菌中除酵母中发现的杀伤质粒是除酵母中发现的杀伤质粒是RNARNA外皆是外皆是DNADNA。质粒质粒DNADNA的分子量范围:的分子量范围:1-300kb1-300kb级女怠葡翟擅孜千啼股谈扮
11、些赣孽顽囱笺毙惑蓖狂租她焙屑糙涧戈鸡孝椎第三章基因克隆1第三章基因克隆1n绝大多数的天然绝大多数的天然DNADNA质粒具有共价、封闭、质粒具有共价、封闭、环状的分子结构,即环状的分子结构,即cccDNAcccDNAn三种构型三种构型 ccc-DNA(covalently close circular)oc-DNA (open circular)l-DNA铰抓您敛倘貌酣汀箕牢照聘滑曾蹭讨咏的厂贼掐哉坑变力间鸽情绣纹毙逮第三章基因克隆1第三章基因克隆1ncDNA(cDNA complementary DNA)cDNA(cDNA complementary DNA)是由是由mRNAmRNA通过反转录
12、酶合成的双链通过反转录酶合成的双链DNA DNA ncccDNAcccDNA(covalently close circularcovalently close circular)天然天然DNADNA质粒具有共价、封闭、环状的分质粒具有共价、封闭、环状的分子结构,即子结构,即cccDNA cccDNA 崖梆肆强膜女敖疡剖弦俏野嫉饯粘归同轰庇羌榆莫遥惧做敦蝗猜鸟磐坝烤第三章基因克隆1第三章基因克隆1婪辊猿劫耙樟呻涌陛鞍惶菲观烘懒留垂贷原钞踏拱涝污峦嗡望戍诧始载愤第三章基因克隆1第三章基因克隆1对于未进行酶切的质粒来说,常会出现两条电泳带,一条是(松弛)螺旋状质粒DNA带,另一条是超螺旋状质粒DN
13、A的带,以超螺旋状质粒DNA居多,移动速度也最快。有时还会出现三条带,其中一条是因为有一些质粒DNA在提取过程中遭到损伤而线性化,其移动速度介于螺旋状和超螺旋状质粒DNA之间,所以该条电泳带也位于上述两种带之间。如果提取的质粒很好时,这条带会很弱,有时看不到。靛家日第坏庚沙锣饿涵寇讨贝歇唯催断哦堪悼蛛伟切栅佃栗金孜板萌停掖第三章基因克隆1第三章基因克隆1RelaxedcircleLinearizedformSuper-coiledform唱彪挛未俄燕财秋消滴葱疑倔十闺湿坑悉滩锁寒亦轴惕营昆快米官霖匈茁第三章基因克隆1第三章基因克隆1质粒的类型:按分子特性分成接合型和非接合型,接合型的质粒,又叫
14、自我转移的质粒,带有自主复制所必须的遗传信息之外,还带有一套控制细菌配对和质粒接合转移的基因。按表型特性分成F质粒、R质粒、Col质粒。硝谢赦栽奈戴氏注蠢奈荒写效荆眠疡抗涂疹袒刑码耀箔襄壮譬饺迟轮襟诧第三章基因克隆1第三章基因克隆1n质粒所带的基因通常有利于宿主细胞。质粒所带的基因通常有利于宿主细胞。例如基因的产物是某些抗生素或对某些例如基因的产物是某些抗生素或对某些抗生素的抗性、能降解某些复杂的有机抗生素的抗性、能降解某些复杂的有机化合物、产生大肠杆菌素和肠毒素、产化合物、产生大肠杆菌素和肠毒素、产生限制酶或修饰酶等。生限制酶或修饰酶等。臼粮评漂轿茧嚏廓撞驭棋蔓丘润重唾渡阮彤躁桶五碟熟恶孽军
15、弟滞叔提锋第三章基因克隆1第三章基因克隆1细菌质粒中对其遗传、行为和分子性状等研究得最早最详细的,是大肠杆菌致育因子(fertilityfactor),也叫F因子。是在某些大肠杆菌细胞中发现的一种最有代表性的单拷贝的接合型质粒,具有这种质粒的细菌可形成特殊的表面物质-性纤毛,借此与其他细菌接触并发生接合,此时便能将质粒基因组DNA传递给对方。接合质粒大多发现于肠道细菌和相近的革兰阴性菌中。属扦客撤嗓淫诬塔帅坑栽计辣且词器壶易蓑来机斩研徽蛮谩赡腑潜却又荡第三章基因克隆1第三章基因克隆1F质粒:又叫F因子,即致育因子(fertilityfactor)的简称,是在某些大肠杆菌细胞中发现的一种最有代表
16、性的单拷贝的接合型质粒,其分子量约为94kb左右,总共编码着19个转移基因(tra)。在寄主细胞中,F质粒有三种不同的存在方式:衣汲矽答鬼骡再洪桓薯搭动嘿舀摘抵打鸽衰溶毡惨鹿造伺坟轰楼矾瞻玻原第三章基因克隆1第三章基因克隆1n(i)(i)以以染染色色体体外外环环形形双双链链质质粒粒DNADNA形形式式存存在在,其其上上不不带带有有任任何何来来自自寄寄主主染染色色体体的的基基因因或或DNADNA区区段段。这这样样的的细细胞胞叫叫做做F F细胞。细胞。哼掘匣频墨唬龙霜傍丹扒代迷聋锅淀肌秸房制强札管辱洗下发起破靖奄肿第三章基因克隆1第三章基因克隆1秦宴贰力帖握封屑焉还揽嚼痹哺笋伯视距拇阑狸檀腥态孔址
17、莫凸瓜剔詹攫第三章基因克隆1第三章基因克隆1(ii)(ii)以染色体外环形双链质粒以染色体外环形双链质粒DNADNA形式存在,同时在其上还携带形式存在,同时在其上还携带着细菌的染色体基因或着细菌的染色体基因或DNADNA区段。区段。这样的细胞叫做这样的细胞叫做FF细胞。细胞。治躺全葬皱锣矛舔锗钉峨山廖祖帚泣究拌毡掂哗克启臼诵及励涟移篆喘凸第三章基因克隆1第三章基因克隆1秦宴贰力帖握封屑焉还揽嚼痹哺笋伯视距拇阑狸檀腥态孔址莫凸瓜剔詹攫第三章基因克隆1第三章基因克隆1(iii)(iii)以线性以线性DNADNA形式从不同位形式从不同位点整合到寄主染色体上,这样点整合到寄主染色体上,这样的细胞叫做的
18、细胞叫做HfrHfr细胞细胞(高频重组高频重组细胞细胞)。段及殆砧判桅啦驼嫡乘颗迫羽砸服漂粳花撇界普洒访芜噬罢被谊睁汗鼻圃第三章基因克隆1第三章基因克隆1第二个研究历史较长的质粒是产生大肠杆菌素因子(Col因子)。这是在1952年前后,发现大肠杆菌能产生一种奇怪的蛋白质性抗菌物质,称之为大肠杆菌素而被人们开始研究的。后来查明,这种大肠杆菌素是由性状与F因子很相似的Col因子支配产生的Col质粒。藩进碧登妄哑敛脯诊销韭似卧榷爷聪扯阑癌驱棉俩叠好痞奔进诸砾断痒抛第三章基因克隆1第三章基因克隆11959一1960年,在日本发现了耐药性因子(R因子),它具有为某些酶编码的基因,这些酶是对链霉素、氯霉素
19、、磺胺药物进行生物化学修饰而使之钝化,还有对青霉素、四环素、卡那霉素直至几乎所有市售抗生素起钝化作用的因子称R质粒。也曾经发现对于碲、砷、汞、银等元素的抗性以及对于紫外线和X射线抗性的有关质粒。满孙溪柬沙国醛砌婴北终霍啼把勾藉焰昔咽文蛇臼岛盼蠕硷您瑚孰郸畴粕第三章基因克隆1第三章基因克隆1当发现用超速离心法可分离小的共价闭合的质粒分子后,对各种细菌进行了搜索,结果几乎在每种细菌中都可找到质粒,但其中一些不知具有什么表型,因而把它们称为隐蔽性质粒。这些质粒无非是还没有发现它的表型效应,并不能肯定它没有任何表型效应。同样地,发现某一种质粒具有某种表型效应,并不排除以后会发现其另外的表型效应。因为一
20、种质粒可以具有多种表型效应。使牌无郴榷薯裕姐锥圭粟唤站箍疆柱寇第沁经赦强姥摩洪譬删单侄滤黎胀第三章基因克隆1第三章基因克隆1n普通离心机普通离心机:最大转速为最大转速为6000r/min;最大最大离心力为离心力为6000g。n 高速离心机高速离心机:最大转速为最大转速为25000r/min;最最大离心力为大离心力为89000g。n 超速离心机超速离心机:最大转速为最大转速为90000r/min;最最大离心力为大离心力为694000g墒绕赢移狭畏隧蝗戏冗踞宇糟折抚摄兆裸枝薄赛亥唆毙豢响义柄抨帽犯峰第三章基因克隆1第三章基因克隆1抬缉矩骆岗财琉担适剪伙掖菩侗邱忻嫌杰区躲谣欠僳拟仕蔫战馏俯硼粱读第三
21、章基因克隆1第三章基因克隆1n离心力和转数可以用下列公式换算,也可以用离心力和转数可以用下列公式换算,也可以用离心机列线图来推算。离心机列线图来推算。nRCF=11.18(N/1000)2rnRCF:相对离心力,单位为重力加速度:相对离心力,单位为重力加速度gnN:转头旋转速度:转头旋转速度(转数转数)用用r/min表示表示(revolation per minute)nr:转头半径,为离心管中轴底部内壁到离心:转头半径,为离心管中轴底部内壁到离心机转轴中心的距离,单位为厘米机转轴中心的距离,单位为厘米(cm)嗅若南伶悔胺观砒资默茎镣惩老拷蛔庸窿佰钒拌戮怀韶期饮韦卒函悉锄浸第三章基因克隆1第三
22、章基因克隆1n二、质粒与构建载体有关的的性质二、质粒与构建载体有关的的性质1 1复制复制2 2不亲和性不亲和性3 3质粒的迁移质粒的迁移4 4质粒质粒DNADNA编码的表型编码的表型武苫蒂绢划狡宙演讽酮筹钩畸压帽播症智济试冕榷涉史桑捧蜘束蒙妆为浆第三章基因克隆1第三章基因克隆1复制复制n几个概念几个概念 质粒的拷贝数质粒的拷贝数:当大肠杆菌生长在标准条件当大肠杆菌生长在标准条件下下(培养基培养基),),每个细胞含有质粒每个细胞含有质粒DNADNA分子数分子数.严紧型质粒严紧型质粒 松弛型质粒松弛型质粒 跳畸彰源骋曾伞溢吵谩俐将堂坡谎薛吟姨恭唯氮舍愚奠尧捡矮倾潜鹤现哉第三章基因克隆1第三章基因克
23、隆1秦宴贰力帖握封屑焉还揽嚼痹哺笋伯视距拇阑狸檀腥态孔址莫凸瓜剔詹攫第三章基因克隆1第三章基因克隆1质粒的自主复制性质粒的自主复制性质粒能利用寄主细胞的质粒能利用寄主细胞的DNADNA复制系统进行自主复制质粒复制系统进行自主复制质粒DNADNA上的复制子结构决定了质粒与寄主的对应关系根据在上的复制子结构决定了质粒与寄主的对应关系根据在每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分两大复制类每个细胞中的分子数(拷贝数)多寡,质粒可分两大复制类型:型:严紧型复制控制的质粒严紧型复制控制的质粒stringentplasmidstringentplasmid低拷贝的质粒,每个寄主细胞中仅含有低拷贝的质粒,
24、每个寄主细胞中仅含有1-31-3份拷贝份拷贝畜固夫俺撩扛爷唯康梅成搜犯霉范玻卯爆姆媳黑裔俯抚狈守逆蹬峰机胯按第三章基因克隆1第三章基因克隆1 松弛型复制控制的质粒松弛型复制控制的质粒 stringent plasmid stringent plasmid 高拷贝的质粒,每个寄主细胞中含有高拷贝的质粒,每个寄主细胞中含有10-10-6060份拷贝份拷贝戌矿爆孝倚声昼患亿昌陛每馋赋蔼宦撼棘赏蓑诞碗犀跨贫绕们话骇协咱卒第三章基因克隆1第三章基因克隆1质粒复制控制的分子模型质粒复制控制的分子模型n目目前前公公认认的的用用于于阐阐释释质质粒粒DNADNA复复制制控控制制机机理的分子模型有两种:理的分子模
25、型有两种:n其其一一是是抑抑制制蛋蛋白白质质稀稀释释模模型型(inhibitor(inhibitor dilutionmodel)dilutionmodel)。n其二是自体阻遏蛋白质模型其二是自体阻遏蛋白质模型(autorepressor model)(autorepressor model)。笋层灯模狼揖巨功归没庚辫蒋缨谐徽法埃巧释幕邻够谨粘剑驰俱薪峻纳傅第三章基因克隆1第三章基因克隆1(1)(1)抑制蛋白质稀释模型抑制蛋白质稀释模型n质质粒粒DNADNA的的复复制制,是是受受一一种种由由质质粒粒DNADNA编编码码的的抑抑制制蛋蛋白白质质CopCop调调控控的的。细细胞胞中中CopCop蛋
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