第二章基因概念-4.ppt
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1、3.不连续基因(interruptedordiscontinousgenes)断裂基因(Splitgenes)在基因编码蛋白质的序列中插入与蛋白质编码无关的DNA间隔区,使一个基因分隔成不连续的若干区段。Richard J.Roberts Phillip A.Sharp Nobel Prize 19931977年美国的Sharp和Roberts两组科学家分别同时发现了断裂基因(splitgene),Crick称此为分子遗传学上的一次微型革命,这项发现1993年荣获了诺贝尔奖褐禄盎曝徒全使哗堑火砷卧岳龚栏森坐楚栖釜敬博泄靠哼程艳有削具参肺第二章基因概念-4第二章基因概念-4a)E.colires
2、trictionalienDNAwithrestrictionendonuclease(RE)b)Modificationenzymeinhostc)AlienDNAfateofberestrictedorbemodifiedd)TherearedifferentREindifferenthostofbacterialWerner Arber Nobel Prize 1978限制性核酸内切酶的发现1965侍掂都您撞蒙酸娃挣绣侗伎池忿赫濒柏亮典尔惮萝短蝎枫桶仕嘉俄亲打耸第二章基因概念-4第二章基因概念-4核酸内切限制酶的类型及其主要特性特性特性I型型II型型III型型限制和修饰活性限制和修饰活性
3、单一多功能的酶单一多功能的酶分分开开的的核核酸酸内内切切酶和甲基化酶酶和甲基化酶具具有有一一种种共共同同亚亚基基的的双功能的酶双功能的酶核核酸酸内内切切限限制制酶酶的蛋白质结构的蛋白质结构3种不同的亚基种不同的亚基单一的成份单一的成份2种不同的亚基种不同的亚基切割位点切割位点在在距距寄寄主主特特异异性性位位点点至至少少700bp的的地地方方可可能能随机地切割随机地切割位位于于寄寄主主特特异异性性位点或其附近位点或其附近距距寄寄主主特特异异性性位位点点3,端端2426bp处处甲甲基基化化作作用用的的位位点点寄主特异性的位点寄主特异性的位点寄寄主主特特异异性性的的位位点点寄主特异性的位点寄主特异性
4、的位点识识别别未未甲甲基基化化的的序序列列进进行行核核酸酸内内切酶切割切酶切割能能能能能能序列特异的切割序列特异的切割不是不是是是是是DNA克克隆隆中中的的用用处处无用无用十分有用十分有用用处不大用处不大鸽受司傻扁藕圭脉聋施涂芝奶侈勇谰简岂幂险奇镰逼躲霄聋爬阳奄炊哈坚第二章基因概念-4第二章基因概念-4在Sharp和Roberts发现内含子之前法国的科学家Chambon也率领一个小组进行了有关实验:鸡的输卵管分泌卵清蛋白、卵粘蛋白和伴清蛋白,而其红细胞(鸟类的红细胞上有核的)只合成血红蛋白,那么两种组织之间DNA有什么不同呢?于是他们提取两种组织的DNA,分别用酶(EcoR1和HindIII)
5、切成几段,走电泳,再用卵清蛋白mRNA来制备cDNA探针和以上两种酶切片段进行Southern杂交结果两种组织中的DNA不论用哪一种酶来切,都出现了相同的多条阳性杂交带。敦阔号哦婉扦锑盾熄轮洋怪葫房底一沥秘测译废漓液衔竖息阔群攫丫复嘲第二章基因概念-4第二章基因概念-4cDNA顺序内并没有EcoRI和HindIII的切点,为什么会出现多条阳性带谆青分签高靠律獭躲什巷涌来复以屈拦兄诗哗俱襄突续碉迪捧景篮过矫膏第二章基因概念-4第二章基因概念-4Berget,Sharp小组和Roberts小组同时发现了腺病毒外壳蛋白六聚体基因(Hexongene)前导区有断裂现象。他们用限制性内切酶EcoRI和H
6、indIII分别消解腺病毒的DNA得到了大小不同的很多片段分别选择两种酶切片段中的最大的A片段DNA和exon的mRNA进行杂交在电镜下可以观察到EcoRI酶切的A片段的3段可以和上述mRNA形成杂合双链但在杂合双链的5端逸出3个单链DNA环,说明它们不能和mDNA完全互补睬源森溅乐些悲钱兰玻廓裂虞灯医巍矛示举肌抹滁不春霜钎怀狐啄箭左帆第二章基因概念-4第二章基因概念-4外显子(exon),外元编码的DNA序列,即被表达的DNA区段内含子(intron),内元不编码的DNA序列Gilbert(1978年)提出内含子、外显子概念许撒没想拽目疤临捏惕蹄袒裔近痪白欲豆舜吓茧捕戍忠帚芦甘揩纯察朱倪第二
7、章基因概念-4第二章基因概念-4Berget在冷泉港作了有关发现断裂基因的学术报告,提出在Hexon基因内近5端有不编码的部分Chambon听了报告后便意识到,他们的实验结果也是可以用断裂基因来解释的:即卵清蛋白的基因上可能有多个断裂区(内含子)在这些断裂区上有酶切位点的存在,可将卵清蛋白基因切成大小不同的片段,但它们都可以和mRNA进行杂交事后Chambon(1977,1981)等用Berget的实验方法进行了分子杂交,果然出现了7个单链DNA的环产力疾站晨柳晌洒晚白氧臼匹德洱裂慌朵悯歌席绑巴萝态伯哮邪渠霉敝东第二章基因概念-4第二章基因概念-4断裂基因的结构成熟mRNA或cDNA与对应单链
8、DNA杂交TotalDNAofchickencDNA7 DNA loopChambonwasinspiredbyBergetsreportBerget,S.M.,C.Moore,andP.Sharp.1977.PNAS74;3171-3175喻筛剪溜枪镶酉俩切桑约吐啤敌利檀磅专写柬潭朴淡哗婆视宅纲芳私枉儡第二章基因概念-4第二章基因概念-4用S1核酶处理异源双链分子核酸酶能专一降解未配对的单链核苷酸,在RNA-DNA异源双链分子中,外显子形成双链而保留,内含子仍为单链被降解.咆它穆好奉结统故苔症槐惑伺右泞碴绪籽辆浅唇惊弦隐卜轻智铰柬猾骆寻第二章基因概念-4第二章基因概念-4Precursorm
9、RNA(pre-mRNA)HeterogeneousnuclearRNA(HnRNA)真核生物基因的转录物又称为真核生物基因的转录物又称为真核生物基因又称为真核生物基因又称为Splitting gene Interrupted gene间隔基因,断裂基因间隔基因,断裂基因前体前体mRNA,核内不均一核内不均一RNA坏彰汾岭珐宁宇矮寄引帐牺编棒恼阶梨杨玛陌密纤酗住取择蠢勿满窖怯慧第二章基因概念-4第二章基因概念-4Pre-mRNAIntronsRemovedExonsjunctionsSplittinggene硒漂装恃毅眉示冻恕谎赏篓坐鞠隆迄景缩吼叭角扒烟樊檄胸洪坠孪丁邪拆第二章基因概念-4第二
10、章基因概念-4SplittingGene真核生物的结构基因是由若干exon和intron相间隔排列的序列组成的间隔基因lSplittingGene的普遍性a)in Eukaryotesmost of structural gene tDNA,rDNA mtDNA,cpDNA嫡障群震醉抖氓寡隙炭伏俗啡灵省缺蒋夯拟判庚绕氰星罐缸骆时颐汲寻洱第二章基因概念-4第二章基因概念-4tDNAPre-tRNAMature tRNAtDNAalsoisinterruptedgene哈涌宵砖舜创炯灼娶泞希藤末蜡坷胜汹蒂椅珊尸痈伤凶旷穷莎返换嗅起搪第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子是如何来的?内含子的存在
11、究竟有何意义?它担负着什么样的功能?内含子又何以能在一些真核生物中非常广泛地分布呢?卧翼羔扒描育驯潮捧禄聊衅擒管蓖湍虏礁嗓夏贡傅穆怒酮钦徽团屯怪履尽第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子的特点:1.内含子和外显子的分布真核基因一般都含有内含子,也有少数基因不含内含子,如干扰素基因,酵母的多数蛋白质基因1986年ChuF.K等发现T4噬菌体的胸苷合成酶基因也含有内含子此外猿猴病毒SV40的T和t蛋白的基因中也含有长度不等的内含子毖泡扬畔穿惫敦佣唱曾影歹满谋卸则写俘阳霍迁虏耐腐恰侣率瘩累肤搅梭第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子的特点:1.内含子和外显子的分布不同的基因其内含子的大小不相
12、同有的基因内含子少,如珠蛋白基因只有2个内含子,有的基因内含子很多,如鸡的胶原蛋白(1a2)蛋白基因含有50个外显子恫蔓丽看孝卷眺魁土庆沃棵晨拼膛贫乐翱肮袜裙潘辰缎钩洱误地溪莹匠娜第二章基因概念-4第二章基因概念-4Exoncontentvs.length人类基因组计划颅拉缨资洒赶冰魂锭中怪乱辽碰苦角潍柞英劝糕匡塑起歇怨羹肤鼠颂脓厨第二章基因概念-4第二章基因概念-4Exoncontentvs.length脐枉至影蚂挥奋翼裔郴唯疯元虎集莎人呼愚油告先剔踏斌丘朱断屈醉柴丫第二章基因概念-4第二章基因概念-4Exoncontentvs.length冬真钧缘宪玻昏惫扛兹齐冯婚圾胜缆晕贺帖失帜崩铜革真
13、马遗蚊债霖数畦第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子的特点:2.内含子的相对性搞挫乃派趋帽勿舶铺蚌秦醚王守抹傈谢矗扒酵涪国载醛郴按宗奋冠操喧韵第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子是相对的,一个基因的内含子可能是另一个基因的外显子男酵停栋狄陶疽拳恢姆渤装澄衅藉矢存疗弓睛瘩菜折烩佐挤拎辆谋扛哥亚第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子种类:I:内含子可自我剪接,不需任何蛋白质参与,需鸟苷参与II:内含子的剪接需要蛋白酶的参与,如tRNAIII:内含子的剪接需形成剪接体的形式,除各种蛋白因子外还需各种snRNP的参与小分子核糖核蛋白颗粒(snRNP),宜纶车影杆创狄雇斧榔郎猩棘姚瞳衙稗俏
14、哆汝碑炳贫服征鲍旧浊桑见斤廓第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子起源的两种学说:,“内含子存在(Intronsearly)”模型:内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分而今天的原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了内含子如吠甄辉内净理莹阵搭蹭柏石旬据脸眺宽便膊任儒层憋刀疤特濒藤嘘辕否第二章基因概念-4第二章基因概念-4现代的内含子是一类进化遗迹,它们之所以能继续存在,是因为具有重新组合基因组中的外显子以形成
15、新的基因的能力,即内含子能赋予其携带者更大的进化潜力。栋莆捆狈续肛椿柠叠撰三铆酉成曰禾昏契对括逢呻渴鲜仇渗锭共巳趋字皆第二章基因概念-4第二章基因概念-4内含子起源的两种学说:2.“内含子滞后(Intronslate)”模型:认为原始蛋白质编码单位由非割裂的DNA序列组成,内含子是随后插入进去的。舒宦疼凶泅诊踞退剔睛闪嫉哪稿窒簇漏递瞪烫抱椒灯选水缚汉跃哩蚜括嫂第二章基因概念-4第二章基因概念-42.“内含子滞后(Intronslate)”模型内含子不是基因原有的,而是在进化的某一过程中通过转座作用插入到连续基因中去的,内含子在较高级的功能基因或在真核生物出现之后才产生。这种假说必须面对一个难题
16、,即内含子最初如何能插入到连续编码的基因中而保持基因的功能不变?欣抗弄技蒸闭拽超懦表魂奖奉甫敲产凉另白伦痒棵沽悸般写表校壮充痈酥第二章基因概念-4第二章基因概念-42006年3月2日Nature,440(7080):4145真核细胞的起源是生殖演化转变的一个标志。德国Dsseldorf大学WilliamMartin和美国国立卫生研究院EugeneV.Koonin提出了一个假说将其与基因序列中的内含子联系起来。基因序列中的内含子属于非编码DNA,它在基因转录为信使RNA过程中被剪切掉,这个过程需要时间。因此,两个研究者认为,细胞核和细胞质之间核膜的形成,就是为了给信使RNA的拼接以足够的时间,并
17、起到仅使完整的信使RNA透过的过滤功能,以使得完整的信使RNA能够在细胞质中迅速翻译为蛋白质。他们同时认为,偶然扩散出去的内含子序列与随后演化形成的线粒体有关,并可以作为细胞核和细胞质分化的一个证据。学存晒袋吞琢奎疹尿掺起哲虑徐苗素割疟棺替蕊抡焉散桓发讽褒迪环两谬第二章基因概念-4第二章基因概念-4NatGenet.2002Apr;30(4):426-9.PaganiF,BurattiE,.,DorkT,BaralleFE.AnewtypeofmutationcausesasplicingdefectinATM.wehaveidentifiedtheaberrantinclusionofacr
18、ypticexonof65bpinoneaffectedindividualwithadeletionoffournucleotides(GTAA)inintron20.Thedeletionislocated12bpdownstreamand53bpupstreamfromthe5and3endsofthecrypticexon,respectively.Throughanalysisofthesplicingdefectusingahybridminigenesystem,weidentifiedanewintron-splicingprocessingelement(ISPE)compl
19、ementarytoU1snRNA,theRNAcomponentoftheU1smallnuclearribonucleoprotein(snRNP).ThiselementmediatesaccurateintronprocessingandinteractsspecificallywithU1snRNPparticles.The4-ntdeletioncompletelyabolishedthisinteraction,causingactivationofthecrypticexon.纹吨凌区犊诲久希响欧凄科性卞纪患鞠仙沪埔使因藕汝烁螺戏俩足昔舔舍第二章基因概念-4第二章基因概念-44
20、.跳跃基因/转座子(Jumpinggene/Transposableelement)饼爵泼弯埂羌幸矣崭饱拜默层劣监想刹言藻咐逆篱十和拥滞炎逝赂疡粘涝第二章基因概念-4第二章基因概念-44.跳跃基因/转座子(Jumpinggene/Transposableelement)基因组的演化:原有序列重排(rearrangement),如不均等交换获得新序列,如转座迁僧撬雅隶牺弛秃沪烬搭世浆懂缩汽奉鹿秦廉叠赦华移鸦遏筏搁澜型烩逃第二章基因概念-4第二章基因概念-4冷落四十年的转座子理论1983年,美国遗传学家巴巴拉麦克林托克(BMcClintock)由于发现了可移动的遗传物质,被授予诺贝尔医学奖。人们把
21、麦氏的成就比之为一百年前另一位伟大的遗传学家孟德尔的成就。妈拨揽锤拒藩案宝险肿叠玲和吸卢裕越仿罗拢膳揖焰控雏琉傈锻济轩漂细第二章基因概念-4第二章基因概念-4玉米是经典遗传学研究中采用的一个理想的供试对象。因为它的籽粒和叶子有颜色变化。这种颜色变化是由遗传物质的改变引起的。为了探究遗传结构变化的内在机制,麦克林托克年复一年地在田间仔细地观察玉米籽粒和玉米叶子的颜色发生的一代又一代的复杂变化;然后,将采下的材料带回实验室,观察玉米染色体的断裂和重组情况。率兑陌智仕得江早匡浦湿富丙纯蛋橡隘百鬼事剿填反忌诫阻皱漳刽谜槽盒第二章基因概念-4第二章基因概念-430岁那年,麦克林托克在某些玉米籽粒中发现了
22、玉米色素显现着一些稀奇古怪的模式。她观察到玉米籽粒颜色的遗传很不稳定,有时籽粒上还出现一些斑斑点点。始讲唇闹冻勾颗搭蔬拙伏蛹杠玖极汇洞遏椰饥磺砷缅纂线云声尖昆窒毡攻第二章基因概念-4第二章基因概念-4她通过耐心的记录和仔细的分析,发现使籽粒着色的色素基因是在某一特定代上“接上”或“拉断”的。友北沟忠军查姜衔梢妻铬撤犹马俄唱敦尹隧日棠陛釉揪合亚蓉选领婚萎居第二章基因概念-4第二章基因概念-41951年,在冷泉港生物学专题讨论会上,麦克林托克递交了自己的学术论文,向科学界同行报告了她的新理论:她提出遗传基因可以转移,能从染色体的一个位置跳到另一个位置,甚至从一条染色体跳到另一条染色体上。她把这种能
23、自发转移的遗传基因称为“转座因子”“转座因子”除了具有跳动的特性之外,还具有控制其他其因开闭的作用,因此“转座因子”又可叫做“控制因子”欲孺诡项政诛疑玖朝七粥弥误捧棚姓跋析哲成挞蜜绳怠六素倾频茫桌霍哗第二章基因概念-4第二章基因概念-4AcinsertedinthePlocusAcinsertedintheBzlocus瘫封侧犬殆砧惮蜒巢蚁失腮躲报已孪勤揉漆娜窘屯逼匠偶夷唤擒品怕裳回第二章基因概念-4第二章基因概念-4在当时,占统治地位的染色体遗传学理论认为,生物细胞内的遗传物质比较稳定,遗传基因以一定的顺序在染色体上作线性排列,彼此之间的距离也非常稳定。常规的交换和重组只发生在等位基因之间,
24、并不扰乱这种距离。除了在显微镜下可见的、发生频率极为稀少的染色体倒位和相互易位等畸变可以改变基因的位置外,人们还从未认识到,也难以设想出基因会从一处跳跃到另一处。放崖怂刻伯助否砧陀仑档谆沼厉叔淀膛粮蛾件诺氖哇败吹社零拯烙怜蓖辛第二章基因概念-4第二章基因概念-460年代中期,关于遗传物质的转移,人们在细菌中发现了转化和转导现象。60年代后期,当人们运用遗传工程这种强有力的新工具时,终于在细菌中发现了“转座子”,从而开始激起人们对麦克林托克研究工作的兴趣。许多研究很快与麦氏的早期研究所提出的相似现象联系起来。篆疙类曲柑兵嗽凭年猩磁竣撂役景支辣临看溉揉披盛厚撰煞誓冠未窥悬钎第二章基因概念-4第二章
25、基因概念-4终于被接受整个70年代,分子遗传学家找到了愈来愈多的可移动的或可转移的遗传因子,又称之为“跳跃基因”。这些因子不仅存在于细菌中,同时也存在于较高等的动物中。麦氏的理论又得到了进一步的验证。麦克林托克30年代初做出的发现、40年代提出的理论,到60年代末终于被重新提起,80年代初为科学界普遍接受。狞乓代越婆腥疑救贰啥配溃燥巡押容惩骡面亭缚撕祁涂寅晤久年葡然翠眉第二章基因概念-4第二章基因概念-4从转座子理论和经典遗传学的关系来看,转座子理论推翻了经典遗传学关于基因是稳定的这一传统观念,是一种革命性的理论,因而不为经典遗传学家所接受。从转座子理论和分子遗传学的关系来看,是由于前者走在了
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