SC∕T 7238-2020 对虾偷死野田村病毒(CMNV)检测方法(水产).pdf
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1、ICS 65.020.30 41:才叫中华人民共和国水产行业标准SC/T 7238-2020 对虾偷死野田村病毒(CMNV)检测方法Detection methods for covert mortality nodavirus(CMNV)2020-08-26发布2021-01-01实施气中华人民共和国农业农村部发布本,f,j;IfI 111全同水产标Ifi化技术委以会的AClTC156)们1-1。本衍二月1,.11!单位小同水产利于研究院且向水产研究所。*f;1fI主要起草人张JJ利、112化、JiI出!&、中i小、刘l炎、梁艳、杨冰、邱击。L、李j忌。SC/T 7238-2020 SC;T
2、 7238-2020 对虾偷死野田村病毒(CMNV)检测方法1 范围本标lfI给出了对川、价死野111村病毒(CMNV)j业转21套式PCR检测、逆转;J1、介导iHdl扩增检测、TaqMan荧光);i二千1!:RT-PCR检测所甜的民剂和l材料、器材和设备,规定了操竹步骤和lii!f)IJt际J2IR本标11适川J于CMNVniJ检测和l监测./2 规范性引用文件WJ(I(J版本适用于本文例。儿是不itllWJ的11SC;T 7103 3 缩赂语4 4.1 4.2 4.3 4 4 4.5 异丙醇:分析纯。4.6 75%乙醉 见JIH*A J4.7 1IIIfl对,f1感染了CMNV4.8 阴
3、性对!H不含CMNV的4.9 空白对!悦。百rHlRNasc-rrec水作为空liJN!目。lfication),-80C仇Qf。4.10 dN丁P(各2.5mmol/U,含dATP、dTTP,dC川、P、dCTP各2.5mmol/L(19混合物,一20C保存。4.11 dNTP(各1011111101/L)含dATP、正ITP、dC川、P、dCTP各10mmol/L的混合物.-20Cj1f子。4.12 dNTP(各20mmol/U含dATP、dTTP、dCTP、IG丁P各20mmol/L,见A.2.20C似存。4.l3 M-MLV逆转及附(200U;U商盯l化试剂.-20C保存,或其他等效逆
4、转及隅。4.14 5XM-MLV逆转法肖峰缓冲液,商JJI化试剂,一20C似存,或其他等效缓冲液。4.15 1叫DNA;合同J(5U/I,U,商品化试剂,一20C保存或其他等效。NA*合附。4.16 10 X PCFi绥 J I浓荫l川化试剂,随叫DNA综合同1m供,不 含Mg21,一20C保存,或其匀效级l液。SC/T 7238-2020 4.17 MgCl,(25 mmol/U,-200C1阜存。4.18 JJl(月1吁书Ih:rl!泳级。4.19 6 X统样绥J巾被商lfJl化试剂,或其他匀效纵样缓冲液。4.20 DNA Marker,f,d,化试剂,-200C保存,或其他匀效Markc
5、r。4.21 Il!.泳核阪染料生化tIiJ剂。4.22 JOX Isothermal八mplification8urfer:附lvl化产品,有1释为lX作液II,J内介20mmol/1.Tri日HCl,50 mmol/1.Ij,jI:l,校各刀法1的工作浓度配制.-200C保存。5 器材和设备5.1 百T)liJ移液袱。5.2 冷冻74心机。5.3 涡i是振荡器。5.4 普通冰箱。5.5-800C)也低站11fi0 5.6 于非UTi.心机。5.7 PCR 仪。5.8 电泳仪。5.9 水、1;1包括I梢。5.10 紫外观察仪或凝胶I&.1:虫仪。5.11 兰JI.J荧光定垃PCR仪。6 操作
6、步骤6.1 样品采集6.11 采样对象凡纳i1J虾(UI户enat:lIsV(l川t川川11川t卢俨川川M 川阳川le川j川t户川川M川N)、圳;F.-11口1对虾(Pe川Il川J(.J川叫,叮川川矿P川川,川u.川/H川)川平和和11脊尾|止臼二过l虾(1:.7川卢阳川川川P川JC川Il川ud)气:(f&)!如li二i乏其他易!出生物参见C.20 6.1 2 采样数量采扩(数立f:1j合SC/丁7103的要求。6.1.3 采样部位对手,1向!本症状(参见C.3)的虾取IrFlml胀、胞、附!拔和11肌肉组织。x.t二ICI附床症状(1(11fF llk IFI帧胀、剑、和l怀tllJio6.
7、2 样品处理JII刀J:切收30mg.yl!组织,12于1.5时,尤RNA仰的I二P笆中。2 SC/T 7238-2020 6.3 RNA提取6.3.1 取30mg50 mg样,-,1111人O.5 mL 1 mL RNAiso Plus hl:剂,研磨,军陆立于t:5 mino!loC下,12000 r/min 离心5min。以上Yi!f液至新的无J,NA阴离心1:1.1:1。担il取过程同时设,1,:1;11性刘!自、阴性M!ff 6.3.2 1J11人1/5体以的仙Ilt介至i1iii立乳化革乳白室lllut放血5mino 6.3.3 IC 12000 r/min Ii.心15mino级
8、也收以上层水利l移至新的无RNA阴离心信1。6.3.4)111入匀体积的异口飞ilic(使J+I前预冷至一20C).1下!回你111;匀,室讯放i立10m川11门川n6.3.5 6.3.6 再r4C 7 000 r/min 7f.心5 mi I飞,小心弃上消液。五li.lu 6.3.7力11人20f.r1,JOO 释为100ng/f,L2 6.3.8可以史mjITJ6.4 Nestcd RT 浓度刷110:茧,将RNAfl;1.兀RN A附ng(I 1与i川1,稍7f.本书1的TN八。、,Jl c 比vr占舵ll A f l 6.4.2.2 如果PCR仪不具备;l!_X()JJtm,再向各科内
9、加入50t-tI 液体主i9IN 6.4.2.3 1每1述川有逆转及cDNA的PCR竹;|1人PCI,后区,以:以下程!于迸行扩增91CTJJI变性4min;94C 20日、50C20 s、72C40 s,35个循环;72C5 min,lij-lloC仙iM月1备进行产物的Lll泳。6.4.2 4 可以使用具有同等逆转示或一步法逆转S jPCI,效果的商品化试剂余进行f!f1:6.4.3 第二轮PCR扩增技!表2的要求,在冰众上配制l除丁aDNA;合f以外的大体非mIi昆物,分:投保存于一20C。在11市月1前,1J11入相应体积的Ta DNA 合隅,混匀.跤2411./反凶分装到0.2mL
10、PCR 11-,试剂汉反应1113 SC/T 7238-2020 卡?物在操作11才务必处于低温状态。分别)111入jvL 第一步反应产物为模板,)111人ljnf先根据第一步PCJ产物浓度,做10俯I000俏稀释。扩附和lr:为,95ocr虫变它|二4111in;9S0C变U20 s,520C退火30s,720C延fql 30 s,35个循环;720C延伸5mn;最后oC jl,t 0 li 备进行产物的11:泳。也可以使用同等边转*或一步法川、PCJ效果的商品千七试开1tr.ill行操作,使用一步法JI工PCRj商品化试)IJ企.1l:行RT-PCJ前,须将RNA悦板950C1WCj)j变
11、怕3min 7j迅边冰浴。表2Ncstl()RT-PCR的第二轮PCR反应预混物所需试剂1式剂1111样iif.L试j市l终浓度IOXPCR缓冲液2.5 lXPCR级11YI仪MgCI(25 mn旧1/1.)2.0 2.0 mmol/L dNTP(2.5 mmol/U 2.0 200 mol/l,号|物CMNV-n-F2(10mol/I.)1.0 O.,10 ftmol/L 寻1物CMNV-n-R2(1011101/1.)1.0 O.10mol/L kl边双双15.3 l叫IlN1在介阳J(5U/L)0.2 0.01 U/L 6.4.4 琼脂糖电泳6.4.4.1 配HilJ1.5%的琼脂粉凝!
12、除,销凝Jj企冷却l至低于600CIJ,J,按比如IJ!JII人11:泳核股染料,括:匀,fbllf:TDK脂粉I凝JJli:。6.4.4.2 1夺5VL PCJ反应产物与1Vl.6 X载样缓lll!iili6.J后)JII入JilJJJII样孔中。同时设1.DNA分子士11标I(ixJ!照。6.4.4.3 有1V/cm5 V/cm的电Fl下也泳,使DNArll负极向I似移动。当载样缓ll液中澳盼蓝指7J、剂的(川日迁移至琼JJil础凝JJ变的1/22月 处II,J作JI:也泳,将凝胶毡于紫外观察仪或凝胶成你仪下观察或拍!刊。6.4.4.4 如1*观察到顶用l大小扣,.t:IN段,对PCJ扩增
13、产物进行训IJ序。6.4.5 结果判定6.4.5.1 阳性对J!f!第一步PCJ后在69 bp和1/或第二步PCJ后在J:lbp处有科生条iHt、阴性对!lf在619 hp刷14J:lbp处均无条;j1:f=I空II对照不I.ll现任何条fii,买!J守主击*有效。6.4.5.2 检测样IfJI第一步PCJ后在619bp处有条带和1/或第二步PCJ后在413bp处有条;fl;,J二LPCJ 产物测(纺织符合IIH*II参二号序列,可归J 11 l!11样品为ncstcdJT-PCR阳性。6.4.5.3 检测样1171第一步PCR后在619bp处无条怕日第二步PCJ)R tE J3 bp处无条带
14、可!JII:FJneSl ed R丁PCR11t上。6.5 RT-LAMP检测6.5.1 反应体系自己制在扣。J:II前区,按表3fl(I!t,j在冰众L配HilJRT-LAMP检测反应体系,混匀后,分装为21L/笆,试剂及反应池合物在操作II,J务必处于低YLI状态;百J 1I.Ji立直以RNasc-frec水为校饭的空Wt!白。如l样乱,按阴性对!(、1j检样1171、阳性对!阳的次!于分且IJ)111人IL、总ti为J0 ng-100 ng Ti变怕的JNA校板。筒检样品RNA tlilJ备参见6.:3。反应体系配i!iIJl1:!,百采JlJ同等效果的商业化JT-LAMP试Jj1J余代
15、替。表3RT-LiMP反应预混物所需试剂试剂111样fL剂终浓HtIOX sothcrmal Amplific:llion lufrcr 2.;:;MgS04(100 mmol!1.)1.0 4.0 mmol/l.IktaincC5 mol/U G.O 1.2 mol/L dNTP(得20mmol/U 1.2 mmol/l.CMNV-FIP(20 Itlllol/U 2.0 1.G Itmoi/l.4 SC/T 7238-2020 表3(纹)试剂)111抖l it,1.i剂终浓l且CMNV-I日P(20/.tmol/IJ 2.0 1.6 fJ.mol/L CMNV-F3(10-I.mol/!.
16、)0.5 0.2rno1/L CMNV-):1(10/lrl10l/U 0.5 0.2mol/I.CMNV,F20 11TnOl/U 1.0 Q.g f-l_llloI/L CMNV-LlI(20mol/U 1.0 O.H Jlmo1!L M-MLV j且特,Hlj(200U/,I.)0.2 40.0 U IJ.DNA 聚合附(SU/d.)0.8 6.4 U Eva Grccn(25/ttlloJ/L)0.8 0.8 pmol/L RNasc-frcc*4.2 6.5.2 反应条件各样1117111!可实IJ,j荧光定盐PCR仪tj-I,llli择SYBR函迫.65.SOC反应60mino 6
17、.5.3 结果判定6.5.3.1 阳性对!反应产生典型IJS形扩增1111线且空IIj(,j照.f1Jjj性刘!自反应产牛二IHSJ!;扩J(IIIII主(11、l结果有效,i1jT.J进行检J!lj结果llj定G异常结果分析和问题排除方法参见|时采D。6.5.3.2 若某1i检*1:/ftl反应产生典型S7扩增1111线,91j判定i衷样品为RT-LAMP阳性。6.5.3.3 若某彷检样品反应产生类似平革的二/1s形扩地1111线,则可判定该样品为RT-LAMP阴性。6.6 qRT-PCR检测6.6.1 反应体系配制在扩增前区.校去4的要求在冰贪七配HljqRT-PCR扩增体系,淄匀后,分装
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