生物化学实验原理与方法.ppt
《生物化学实验原理与方法.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《生物化学实验原理与方法.ppt(150页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、生物化学实验原理与方法12/28/202212/28/2022SWAUSWAUn n第一章:生物化学物质的制备n n第二章:离心技术n n第三章:层析技术n n第四章:电泳技术n n第五章:基因克隆技术n n第六章:PCR技术n n第七章:生物芯片技术12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第一章:生化物质的制备 n n生化物质通常是指动物、植物和微生物进行新陈代谢时产生的蛋白质生化物质通常是指动物、植物和微生物进行新陈代谢时产生的蛋白质(包括酶)和核酸等有机化合物。这些大分子物质在生物体内具有各(包括酶)和核酸等有机化合物。这些大分子物质在生物体内具有各种生理活性,这些活性的
2、产生与其结构有着密切关系,因此,分离此种生理活性,这些活性的产生与其结构有着密切关系,因此,分离此类物质不能用一般的化学分离方法,而是采用比较特殊的方法。这些类物质不能用一般的化学分离方法,而是采用比较特殊的方法。这些方法与一般的化学分离方法相比,有下列几个方法与一般的化学分离方法相比,有下列几个特点特点:n n1 1、生物材料组成非常复杂生物材料组成非常复杂。其中包括数百种甚至数千种化合物,并。其中包括数百种甚至数千种化合物,并且在分离过程中,这些化合物仍在发生代谢变化,如蛋白质和核酸的且在分离过程中,这些化合物仍在发生代谢变化,如蛋白质和核酸的水解。水解。n n2 2、有些化合物的、有些化
3、合物的含量极微含量极微,如激素等。,如激素等。n n3 3、许多具有生物活性的物质一旦离开活体,、许多具有生物活性的物质一旦离开活体,很易变变性破坏很易变变性破坏,因此,因此常选用比较温和的条件进行制备。常选用比较温和的条件进行制备。n n4 4、生化分离制备几乎都在、生化分离制备几乎都在溶液溶液中进行,中进行,影响因素很多影响因素很多,实验方法经,实验方法经验性较强。验性较强。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第一节:生物材料的选择n n选择生物材料的原则选择生物材料的原则:有效成分含量多,稳定性好;来源:有效成分含量多,稳定性好;来源丰富,保持新鲜;提取方法简单;有综
4、合利用价值等。丰富,保持新鲜;提取方法简单;有综合利用价值等。n n生物材料一般可以分为生物材料一般可以分为两大类两大类:天然生物材料和人工生物:天然生物材料和人工生物材料。材料。n n天然生物材料天然生物材料一般是指在自然界易采集的、目的物含量较一般是指在自然界易采集的、目的物含量较高的生物个体、器官或组织。高的生物个体、器官或组织。n n人工生物材料人工生物材料又分为三种:又分为三种:1 1、新品种材料新品种材料 2 2、组织培养材料、组织培养材料 3 3、生物产品与生物制品材料、生物产品与生物制品材料12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第二 节:细胞及组织的破碎n n
5、细胞及组织破碎的方法多种多样,根据实验目的和材料的不同可以采用不同的细胞及组织破碎的方法多种多样,根据实验目的和材料的不同可以采用不同的 细胞破细胞破碎方法,细胞破碎方法大致可以分为四类:碎方法,细胞破碎方法大致可以分为四类:n n机械破碎机械破碎:研磨法;组织捣碎法;超声波法;压榨法;冻融法研磨法;组织捣碎法;超声波法;压榨法;冻融法n n溶胀和自溶溶胀和自溶 溶胀:细胞膜为天然的半透膜,在低渗溶液如低浓度的稀盐溶液中,由于存在渗透压溶胀:细胞膜为天然的半透膜,在低渗溶液如低浓度的稀盐溶液中,由于存在渗透压差,溶剂分子大量进入细胞,引起细胞膜发生胀破的现象。差,溶剂分子大量进入细胞,引起细胞
6、膜发生胀破的现象。自溶:细胞结构在本身所具有的各种水解酶如蛋白酶和酯酶等作用,发生溶解的现象。自溶:细胞结构在本身所具有的各种水解酶如蛋白酶和酯酶等作用,发生溶解的现象。n n化学处理化学处理 用脂溶性的溶剂(如丙酮、氯仿、甲苯)或表面活性剂(用脂溶性的溶剂(如丙酮、氯仿、甲苯)或表面活性剂(SDSSDS)处理细胞时,可以把)处理细胞时,可以把细胞壁、细胞膜的结构部分溶解,进而使细胞释放出各种酶类物质,并导致整个细胞细胞壁、细胞膜的结构部分溶解,进而使细胞释放出各种酶类物质,并导致整个细胞破碎。破碎。n n生物酶降解生物酶降解 生物酶有降解细菌细胞壁的功能,在用此法处理细胞时,先是细胞壁降解,
7、随之而来生物酶有降解细菌细胞壁的功能,在用此法处理细胞时,先是细胞壁降解,随之而来的是因渗透压差引起的细胞膜破裂,最后导致细胞完全破碎。的是因渗透压差引起的细胞膜破裂,最后导致细胞完全破碎。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第三节:生物分子的提取n n提取是在分离纯化前期,将样品研磨,把被破碎的细胞置于一定的溶剂(提提取是在分离纯化前期,将样品研磨,把被破碎的细胞置于一定的溶剂(提取液)中,使某一类分子目的物释放到提取液中的过程。取液)中,使某一类分子目的物释放到提取液中的过程。提取液应具备的条提取液应具备的条件件:对有效成分溶解度大,破坏作用小;对杂质溶解度小或不溶解;
8、来源广对有效成分溶解度大,破坏作用小;对杂质溶解度小或不溶解;来源广泛、价格低廉、操作安全等泛、价格低廉、操作安全等。n n生物分子可以分为生物大分子和生物小分子。生物小分子的结构由较强的共生物分子可以分为生物大分子和生物小分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定;生物大分子中除共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,故需价键决定;生物大分子中除共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,故需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。因此,这两类生物分子的温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。因此,这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。提取液成分和操作条件差别很大。n n1 1、生物小
9、分子的提取生物小分子的提取n n2 2、生物大分子的提取生物大分子的提取 蛋白质和酶的提取蛋白质和酶的提取 核酸的提取核酸的提取12/28/202212/28/2022SWAUSWAU溶剂提取法n n原理原理:利用溶剂的利用溶剂的溶解作用溶解作用把所需物质从细胞中转移出来把所需物质从细胞中转移出来n n影响溶剂提取效率的因素(影响溶解度的的因素)影响溶剂提取效率的因素(影响溶解度的的因素)1 1、溶剂的性质溶剂的性质:(根据相似相溶原理):(根据相似相溶原理)2 2、离子强度离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度
10、的影响不同,如高离子强度下对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-DNA-核蛋白溶解度增核蛋白溶解度增加,而低离子强度下加,而低离子强度下RNA-RNA-核蛋白溶解度增加;绝大多数蛋白质和酶,核蛋白溶解度增加;绝大多数蛋白质和酶,在稀盐溶液中溶解度增加在稀盐溶液中溶解度增加(盐溶盐溶)。)。3 3、PHPH值值:溶剂的:溶剂的PHPH值影响溶质分子的解离状态,离子状态的物质,值影响溶质分子的解离状态,离子状态的物质,不能是阳离子还是阴离子都易溶于水,而非离子状态的物质易溶于有不能是阳离子还是阴离子都易溶于水,而非离子状态的物质易溶于有机溶剂。机溶剂。4 4、温度温度:温度的升高可以增
11、加物质的溶解度。:温度的升高可以增加物质的溶解度。5 5、去垢剂去垢剂:去垢剂是一类既有亲水基又有疏水基的物质,可以分为:去垢剂是一类既有亲水基又有疏水基的物质,可以分为阴离子、阳离子和中性去垢剂等,如阴离子、阳离子和中性去垢剂等,如SDSSDS,Tween20Tween20,Triton X-100Triton X-100。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第四节:生物大分子的浓缩n n1 1、沉淀法沉淀法:在提取液中加入适量的中性盐或有机溶剂,使有效的成分变为沉在提取液中加入适量的中性盐或有机溶剂,使有效的成分变为沉淀,经过离心或过滤收集的沉淀物,加少量缓冲液溶解后,
12、在经离心出去不淀,经过离心或过滤收集的沉淀物,加少量缓冲液溶解后,在经离心出去不溶物,获得的上清液通过透析或凝胶过滤脱盐。溶物,获得的上清液通过透析或凝胶过滤脱盐。盐析法;有机溶剂沉淀法;等电点沉淀法;非离子多聚体沉淀法;生成盐复盐析法;有机溶剂沉淀法;等电点沉淀法;非离子多聚体沉淀法;生成盐复合物沉淀法;热变性沉淀法;酸碱变性沉淀法等合物沉淀法;热变性沉淀法;酸碱变性沉淀法等 。n n2 2、吸附法吸附法:将干葡聚糖凝胶加入提取液中,由于凝胶吸水,提取液的体积可:将干葡聚糖凝胶加入提取液中,由于凝胶吸水,提取液的体积可缩小三倍左右。缩小三倍左右。n n3 3、超过滤法超过滤法:把提取液装入过
13、滤装置,在空气或氮气的压力下,使小分子物:把提取液装入过滤装置,在空气或氮气的压力下,使小分子物质通过半透膜,大分子物质留在膜内。质通过半透膜,大分子物质留在膜内。n n4 4、透析浓缩法透析浓缩法n n5 5、减压蒸馏浓缩法减压蒸馏浓缩法:将提取液装入减压蒸馏装置中,在减压真空状态下进行:将提取液装入减压蒸馏装置中,在减压真空状态下进行蒸馏。蒸馏。n n6 6、冰冻干燥法冰冻干燥法12/28/202212/28/2022SWAUSWAU一、硫酸氨盐析法n n原理原理:根基蛋白质在稀盐溶液中:根基蛋白质在稀盐溶液中溶解度溶解度会随着盐浓度的增会随着盐浓度的增高而上升(盐溶),但当盐浓度增高到一
14、定数值时,其溶高而上升(盐溶),但当盐浓度增高到一定数值时,其溶解度又逐渐下降,直至蛋白质析出,。解度又逐渐下降,直至蛋白质析出,。盐析盐析的发生在于盐的发生在于盐浓度增高到一定数值时,使水活度降低,进而导致蛋白质浓度增高到一定数值时,使水活度降低,进而导致蛋白质分子表面电荷逐渐被中和,水化膜逐渐被破坏,最终引起分子表面电荷逐渐被中和,水化膜逐渐被破坏,最终引起蛋白质分子之间相互聚集并从溶液中析出。蛋白质分子之间相互聚集并从溶液中析出。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU影响蛋白质盐析的因素影响蛋白质盐析的因素 、蛋白质浓度蛋白质浓度对盐析的影响:蛋白质浓度过大,盐析时对盐
15、析的影响:蛋白质浓度过大,盐析时发生共沉现象,分离效果不好;蛋白质浓度太稀,耗盐量发生共沉现象,分离效果不好;蛋白质浓度太稀,耗盐量过大,蛋白质回收率也低。一般为过大,蛋白质回收率也低。一般为2.5%-3.0%2.5%-3.0%的蛋白质浓的蛋白质浓度较适中。度较适中。n n、离子强度和离子类型离子强度和离子类型对盐析的影响:离子强度越大,对盐析的影响:离子强度越大,蛋白质的溶解度越低,越容易产生盐析现象;离子半径小蛋白质的溶解度越低,越容易产生盐析现象;离子半径小而价数高的离子在盐析方面影响较强,离子半径大而价数而价数高的离子在盐析方面影响较强,离子半径大而价数低的离子对盐析影响弱。低的离子对
16、盐析影响弱。n n、对盐析的影响:蛋白质所带净电荷越多,溶解度对盐析的影响:蛋白质所带净电荷越多,溶解度越大;在净电荷为零时,溶解度最低。一般将值调到越大;在净电荷为零时,溶解度最低。一般将值调到蛋白质等电点附近,这样有利于盐析。蛋白质等电点附近,这样有利于盐析。n n、温度温度对盐析的影响:在低离子强度或水中在一定范围对盐析的影响:在低离子强度或水中在一定范围内蛋白质的溶解度随着温度的升高而增加;但在高盐溶液内蛋白质的溶解度随着温度的升高而增加;但在高盐溶液中,温度的升高有时反而下降。一般情况下在中,温度的升高有时反而下降。一般情况下在 操操作。作。12/28/202212/28/2022S
17、WAUSWAU二、有机溶剂沉淀法n n原理原理:有机溶剂对许多溶于水的小分子生化物质以及核酸、:有机溶剂对许多溶于水的小分子生化物质以及核酸、多糖、蛋白质等生物大分子都能发生沉淀作用。有机溶剂多糖、蛋白质等生物大分子都能发生沉淀作用。有机溶剂的沉淀作用主要是的沉淀作用主要是降低溶液的介电常数降低溶液的介电常数从而从而增强分子之增强分子之间的相互作用,使其溶解度降低间的相互作用,使其溶解度降低。对于具有表面水层的生。对于具有表面水层的生物大分子来说,有机溶剂可物大分子来说,有机溶剂可破坏溶质分子表面的水膜,破坏溶质分子表面的水膜,使使这些大分子脱水而相互聚集析出。不同溶质要求不同浓度这些大分子脱
18、水而相互聚集析出。不同溶质要求不同浓度的有机溶剂,因此可用有机溶剂进行分步沉淀。的有机溶剂,因此可用有机溶剂进行分步沉淀。n n优点优点:有机溶剂沉淀法分辨能力比盐析法高,沉淀不用脱:有机溶剂沉淀法分辨能力比盐析法高,沉淀不用脱盐,过滤比较容易。盐,过滤比较容易。n n缺点缺点:对某些具有生物活性的大分子,容易引起变性失活,:对某些具有生物活性的大分子,容易引起变性失活,操作常在低温下进行;分离效果差,共沉作用大;离子强操作常在低温下进行;分离效果差,共沉作用大;离子强度及离子种类对其也有影响。度及离子种类对其也有影响。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU三、透析浓缩法n
19、n原理原理:天然或人工半透膜只允许小分子通过而阻碍大分子:天然或人工半透膜只允许小分子通过而阻碍大分子通过。当膜的两侧存在小分子通过。当膜的两侧存在小分子浓度梯度差浓度梯度差时,小分子就从时,小分子就从高浓度一侧向低浓度一侧扩散,直至达到平衡,如果能不高浓度一侧向低浓度一侧扩散,直至达到平衡,如果能不断去除扩散出来的小分子,从而达到分离纯化的目的。断去除扩散出来的小分子,从而达到分离纯化的目的。n n影响透析的因素影响透析的因素 1 1、半透膜的通透性半透膜的通透性:半透膜的通透性取决于膜孔径的大:半透膜的通透性取决于膜孔径的大小,在能阻碍大分子扩散的前提下,孔径越大,透析速度小,在能阻碍大分
20、子扩散的前提下,孔径越大,透析速度越快。越快。2 2、透析外液的更换透析外液的更换 3 3、温度温度:温度越高,透析速度越快。:温度越高,透析速度越快。4 4、压力压力:用跨膜的压力梯度可加速大分子的分离速度。:用跨膜的压力梯度可加速大分子的分离速度。5 5、溶剂溶剂12/28/202212/28/2022SWAUSWAU12/28/202212/28/2022SWAUSWAU四、等电点沉淀法n n原理:利用两性电解质在等电点处溶解度最小的性质。不同的两性电解质其等电点不同,其在电中性时溶解度不相同。因而等电点沉淀法可用于某些两性电解质的分离如氨基酸、蛋白质、核苷酸等,为了增加沉淀效果,往往在
21、等电点时再加上其他沉淀因素,所以幻灯片 2等电点沉淀法一般不单独使用,常和盐析法、有机溶剂沉淀法一起使用,以提高其沉淀能力。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第二章:离心技术 第一节、离心技术的原理第一节、离心技术的原理 当物体围绕一中心轴做圆周运动时,运动当物体围绕一中心轴做圆周运动时,运动物体就受到离心力的作用。旋转速度越高,运物体就受到离心力的作用。旋转速度越高,运动物体所受到的离心力越大。如果装有悬浮液动物体所受到的离心力越大。如果装有悬浮液或高分子溶液的容器进行高速水平旋转,强大或高分子溶液的容器进行高速水平旋转,强大的离心力作用于溶剂中的悬浮颗粒或高分子,的离
22、心力作用于溶剂中的悬浮颗粒或高分子,会使其沿着离心力的方向运动而逐渐背离中心会使其沿着离心力的方向运动而逐渐背离中心轴。在轴。在相同转速相同转速条件下,容器中不同大小的悬条件下,容器中不同大小的悬浮颗粒或高分子溶质会以不同的浮颗粒或高分子溶质会以不同的速率沉降速率沉降。经。经过一定时间的离心操作,就有可能实现不同悬过一定时间的离心操作,就有可能实现不同悬浮颗粒或高分子溶质的有效分离。浮颗粒或高分子溶质的有效分离。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第二节、影响离心沉降速率的因素 球型颗粒在自然沉降过程中:球型颗粒在自然沉降过程中:摩擦力摩擦力F1=6F1=6r rpdr/d
23、tpdr/dt 浮力浮力F2=(F2=(p p-mm )V)Vg g V=4/3 V=4/3 r rP P2 2 球形颗粒的自然沉降速率:球形颗粒的自然沉降速率:dr/dtdr/dt=2 2r rp p2 2(p p-mm)g/9)g/9 在离心力作用下,非球形颗粒的沉降速率在离心力作用下,非球形颗粒的沉降速率:dr/dtdr/dt=2 2r rp p2 2(p p-mm)w w2 2 r/9/9 (f/f0)(f/f0)影响沉降速率的主要因素:颗粒半径影响沉降速率的主要因素:颗粒半径r rp p的大小;颗粒形状;颗粒与悬浮的密度差的大小;颗粒形状;颗粒与悬浮的密度差(p p-mm );一定温
24、度下悬浮介质的黏度系数;一定温度下悬浮介质的黏度系数;离心加速度;离心加速度w w2 2r。在确定的条件下,沉降速率主要取决于在确定的条件下,沉降速率主要取决于离心机的转速离心机的转速。12/28/202212/28/2022SWAUSWAU第三节、沉降系数 dr/dt=2rp p2(p p-m)w2 r/9 9(f/f0(f/f0)s=2rp p2(p p-m)/9 9(f/f0(f/f0)dr/dtsw2 r S为沉降系数为沉降系数,表示单位离心力场下的沉降速,表示单位离心力场下的沉降速率即通过单位离心力场所需的时间,因此单位率即通过单位离心力场所需的时间,因此单位为秒。为秒。12/28/
25、202212/28/2022SWAUSWAU沉降系数的作用:沉降系数的作用:1 1、描述颗粒的大小描述颗粒的大小 2 2、预计沉降时间预计沉降时间 对已知对已知S S值的物质,可预计在离心管中的沉降所需时间。值的物质,可预计在离心管中的沉降所需时间。3 3、测定物质的分子量测定物质的分子量 根据根据SvedbergSvedberg公式可计算出分子量。公式可计算出分子量。M=RTS20,w/D20,w(1-V)R R-气体常数,等于气体常数,等于1.9871.987卡卡/度度.摩尔摩尔 T T热力学温度热力学温度 S S20,w20,w-标准状况下粒子的沉降系数标准状况下粒子的沉降系数 D D2
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 生物化学 实验 原理 方法
限制150内