生物化学分析鉴定方法.ppt
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1、第三章第三章生物化学分析鉴定方法生物化学分析鉴定方法2 2蛋白质蛋白质n本章内容概要及要求:本章内容概要及要求:第一节:蛋白质的分析鉴定第一节:蛋白质的分析鉴定一、蛋白质理化性质测定一、蛋白质理化性质测定(一)蛋白质含量测定(一)蛋白质含量测定(二)蛋白质相对分子量及等电点测定(二)蛋白质相对分子量及等电点测定(三)蛋白质纯度测定(三)蛋白质纯度测定二、蛋白质鉴定二、蛋白质鉴定(一)蛋白质免疫印迹(一)蛋白质免疫印迹(Western-Blotting)(二)蛋白质序列分析(二)蛋白质序列分析(三)蛋白质结晶(三)蛋白质结晶三、三、同工酶测定同工酶测定四、四、酶学分析在临床诊断上的应用酶学分析在
2、临床诊断上的应用第五节第五节 酶活性测定最适条件的选择酶活性测定最适条件的选择在在蛋蛋白白质质分分离离纯纯化化过过程程中中,需需要要对对蛋蛋白白质质的的含含量量和和纯纯度度不不断断进进行行检检测测,通通过过优优化化纯纯化化方方法法获获得得高高含含量量、高高纯纯度度的的蛋蛋白白质质产产品品,为为蛋蛋白白质质的的结结构构、功功能能分分析析及及产产品品开开发提供材料。发提供材料。为为了了鉴鉴定定某某种种微微量量蛋蛋白白质质在在样样品品中中的的存存在在,常常采采用用蛋蛋白白质质免免疫疫印印迹迹的的方方法法,利利用用抗原抗体的特异性来鉴定。抗原抗体的特异性来鉴定。此此外外,还还可可测测定定蛋蛋白白质质的
3、的氨氨基基酸酸序序列列,对其生物学功能进行鉴定等。对其生物学功能进行鉴定等。一、蛋白质理化性质测定一、蛋白质理化性质测定(一)蛋白质含量测定(一)蛋白质含量测定(1)凯氏定氮:是最经典的蛋白质含量测定方法。)凯氏定氮:是最经典的蛋白质含量测定方法。氮素含量除16,或乘6.25即为蛋白质含量。适于较纯,粗蛋白值偏高。此法操作比较复杂,目前已不常用。(2)双缩脲法:快速不需十分精确。)双缩脲法:快速不需十分精确。原理:原理:两分子双缩脲与碱性硫酸铜作用,生成紫红色络合物,540nm波长最大吸收,值大小与蛋白质浓度成正比。含有两个或两个以上肽键肽键的化合物,能发生同样的反应,肽键的反应,肽键越多颜色
4、越深特点特点:受蛋白质特异性影响小应用:应用:蛋白质定量测定;测定蛋白质水解程度,测定范围在测定范围在mg/mL作用作用(3)福林)福林-酚法(酚法(Lowry):多年被选为蛋白质标准测定方法。):多年被选为蛋白质标准测定方法。原理:原理:蛋白质与双缩脲试剂形成络合物后,蛋白质中的酪氨酸,色氨酸及半胱氨酸会使磷钼酸一磷钨酸还原生产蓝色物质,在650nm最大吸收,与蛋白质浓度成正比。特点:特点:灵敏度比双缩脲法提高提高10倍左右倍左右,缺点是试剂的配制较为困难,费时间较长,很多物质对此法有干扰,比较适合于较纯蛋白的含量测定。(一)蛋白质含量测定(一)蛋白质含量测定(4)紫外吸收法:此法简便快速。
5、)紫外吸收法:此法简便快速。通过测定样品的紫外吸收值,根据经验公式或标准曲线也可以测定蛋白质含量。此法测定简单,而且不破坏样品,样品测定后可以再利用,缺点是样品中的核酸,高浓度缓冲液等具有紫外吸收的物质会干扰测定,引起实验误差。A、280nm和和260nm的吸收差法:的吸收差法:蛋白质在280nm波长有最大吸收,而核酸在260nm波长有最大吸收,对于较粗的蛋白质样品,可以利用280nm及260nm吸收差,用下列经验公式计算蛋白质浓度:蛋白质浓度蛋白质浓度(mgmL)1.45A280nm0.74A260nmB、215nm和和225nm的吸收差法:的吸收差法:蛋白质的肽键在230nm波长以下有强吸
6、收。其吸收值与蛋白质浓度成正比。对稀溶液中蛋白质浓度的测定,可用下列经验公式计算蛋白质浓度:蛋白质浓度蛋白质浓度(mgmL)0.144(A215nm一一A225nm)该法虽然灵敏度较高,但是干扰物质较多。酪氨酸的酪氨酸的 max275nm,275=1.4x103;苯丙氨酸的苯丙氨酸的 max257nm,257=2.0 x102;色氨酸的色氨酸的 max280nm,280=5.6x103;光吸收:光吸收:构成蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220nm)均有光吸收。在近紫外区(220-300nm)只有、和有吸收光的能力。(一)蛋白质含量测定(一)蛋白质含量测定(5)考马斯
7、亮蓝染色法()考马斯亮蓝染色法(Bradford):目前应用最广。):目前应用最广。原理:原理:考马斯亮蓝G-250在酸性溶液中为棕红色,最大光吸收在488nm,当它与蛋白质通过疏水作用结合后,变为蓝色,在595nm有最大吸收,大小与蛋白质浓度成正比。特点:特点:此法测定简单,只要将蛋白质样品加到染料试剂中,即可进行比色测定。其灵敏度与福林-酚法相当,测定浓度范围在0.011.0mg/mL。高浓度缓冲液、尿素、甘油、蔗糖、硫酸铵等对测定有干扰。应用:应用:该方法是目前应用最广的蛋白质测定方法之一。(6)胶体金测定法:是灵敏度最高的蛋白质测定方法。)胶体金测定法:是灵敏度最高的蛋白质测定方法。测
8、定浓度范围为ng/mL水平。胶体金本身呈洋红色,与蛋白质结合后转变为蓝色,颜色深浅与蛋白质浓度成正比,缺点是成本较高。n蛋白质理化性质测定蛋白质理化性质测定(二)蛋白质相对分子量及等电点测定(二)蛋白质相对分子量及等电点测定分子量目前常用:分子量目前常用:1、分子筛层析法:、分子筛层析法:可以测定活性多亚基蛋白质的相对分子量。2、聚丙烯酰胺凝胶电泳:、聚丙烯酰胺凝胶电泳:也可测定活性多亚基蛋白的相对分子量,但由于蛋白质的迁移率还受到分子形状、所带电荷等的影响,因此测定的分子量不够准确。3、SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳:聚丙烯酰胺凝胶电泳:测定变性蛋白质中单亚基相对分子量的最有效最常用的方法。4、
9、此外,还可以根据蛋白质特殊元素组成计算法、氨基酸序列推导法、此外,还可以根据蛋白质特殊元素组成计算法、氨基酸序列推导法、渗透压法、沉降法、质谱法等。渗透压法、沉降法、质谱法等。蛋白质等电点:蛋白质等电点:等电聚焦电泳法主要方法,等电聚焦电泳法主要方法,通过等电点沉淀可以测定蛋白质等电点的大致范围,通过蛋白质氨基酸序列以可直接预测蛋白质的等电点。生物信息法:生物信息法:http:/www.expasy.ch/(一)蛋白质含量测定(一)蛋白质含量测定(二)蛋白质相对分子量及等电点测定(二)蛋白质相对分子量及等电点测定(三)蛋白质纯度测定(三)蛋白质纯度测定1、色谱法:如、色谱法:如HPLC如果制备
10、蛋白酶,需要利用的是蛋白酶的活性,只要其中的杂质不影响酶的活性即可,此时可以利用柱层析表示其纯度,在特定条件下,层析图谱只有一个或少数几个洗脱峰,也就是达到了色谱色谱纯纯,可以满足常规的酶活分析等。如果通过结晶与再结晶的方法纯化蛋白质,则得到的蛋白质则为结晶纯结晶纯,获得的晶体可用于蛋白质三维结构分析。2、SDS-PAGE法:法:通常情况下,蛋白质的纯度采用SDS-PAGE法。凝胶经过染色脱色后,用目标蛋白质条带占整个泳道蛋白条带的百分比来表示目标蛋白的纯度。二、蛋白质鉴定二、蛋白质鉴定为了研究蛋白质的结构与功能,需要对蛋白质进行鉴定。为了研究蛋白质的结构与功能,需要对蛋白质进行鉴定。蛋白质鉴
11、定的方法有多种,比如蛋白质鉴定的方法有多种,比如1.成份测定(氨基酸组成及其含量),序列测定成份测定(氨基酸组成及其含量),序列测定2.理化特性分析(蛋白质分子量,等电点,密度,变性与复性,结晶理化特性分析(蛋白质分子量,等电点,密度,变性与复性,结晶等)、等)、3.生物活性及功能测定(比如酶活性分析,通过转基因技术进行突变生物活性及功能测定(比如酶活性分析,通过转基因技术进行突变回复等),回复等),对于一个蛋白质的鉴定,往往需要上述多种方法共同使用,相互印证,才对于一个蛋白质的鉴定,往往需要上述多种方法共同使用,相互印证,才能最终证明一个蛋白质是什么。能最终证明一个蛋白质是什么。序列测定:可
12、以一步确定某一个蛋白,但蛋白质序列测定需要高纯度的蛋序列测定:可以一步确定某一个蛋白,但蛋白质序列测定需要高纯度的蛋白,测序代价极高,因此其应用受到了较大的限制。白,测序代价极高,因此其应用受到了较大的限制。免疫活性分析(蛋白质免疫印迹):鉴定一个蛋白质,不仅弥补了传统鉴免疫活性分析(蛋白质免疫印迹):鉴定一个蛋白质,不仅弥补了传统鉴定方法需要多方印证的繁琐,而且代价相比于蛋白质测序要低的多,定方法需要多方印证的繁琐,而且代价相比于蛋白质测序要低的多,是目前使用最广泛的蛋白质鉴定方法之一。是目前使用最广泛的蛋白质鉴定方法之一。n蛋白质鉴定蛋白质鉴定(一)蛋白质免疫印迹(一)蛋白质免疫印迹(We
13、stern-Blotting)(二)蛋白质序列分析(二)蛋白质序列分析(三)蛋白质结晶(三)蛋白质结晶n蛋白质鉴定蛋白质鉴定(一)蛋白质免疫印迹(一)蛋白质免疫印迹(Western-Blotting)http:/210.38.57.228/151/re1/mei/html/jbzs/jb_index_elisa.htm免疫印迹(westernblotting)是在蛋白质电泳分离和抗原抗体检测的基础上发展起来一项检测蛋白质的技术。它将SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的高分辨力与抗原抗体反应的特异性相结合。(一)蛋白质免疫印迹(一)蛋白质免疫印迹(Western-Blotting)典型的印迹实验包括三个步
14、骤:蛋白质的电泳分离将电泳后凝胶上的蛋白质转移至固体膜上,用非特异性,非反应活性分子封闭固体膜上未吸附蛋白质区域免疫学检测。免疫印迹克服了聚丙烯酰胺凝胶电泳后直接在凝胶上进行免疫学分析的弊端,极大地提高了其利用率、分辨率和灵敏度,使其成为使用最广泛的免疫化学方法之一。(一)蛋白质免疫印迹(一)蛋白质免疫印迹(Western-Blotting)典型的印迹实验包括三个步骤具体解析:第一阶段为SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)。抗原等蛋白样品经SDS处理后带阴电荷,在聚丙烯酰酰凝胶中从阴极向阳极泳动,分子量越小,泳动速度就越快。此阶段分离效果肉眼不可见(只有在染色后才显出电泳区带)。第二阶
15、段为电转移。将在凝胶中已经分离的条带转移至硝酸纤维素膜上,选用低电压(100V)和大电流(12A),通电45min转移即可完成。此阶段分离的蛋白质条带肉眼仍不可见。第三阶段为酶免疫定位。将印有蛋白质条带的硝酸纤维素膜(相当于包被了抗原的固相载体)依次与特异性抗体和酶标第二抗体作用后,加入能形成不溶性显色物的酶反应底物,使区带染色。常用的HRP底物为3,3,二氨基联苯胺(呈棕色)和4-氯-1-萘酚(呈蓝紫色)。阳性反应的条带清晰可辨,并可根据SDS-PAGE时加入的分子量标准,确定各组分的分子量。n蛋白质鉴定蛋白质鉴定(一)蛋白质免疫印迹(一)蛋白质免疫印迹(Western-Blotting)(
16、二)蛋白质序列分析(二)蛋白质序列分析(三)蛋白质结晶(三)蛋白质结晶三、蛋白质组研究的相关技术三、蛋白质组研究的相关技术(一)研究细胞或组织内蛋白质表达模式的技术:(一)研究细胞或组织内蛋白质表达模式的技术:2-D电泳电泳1.1975年,年,Patrick OFarrel发明了二维凝胶电泳。发明了二维凝胶电泳。2.操作操作(1)等电聚焦。)等电聚焦。(2)平衡胶条。)平衡胶条。(3)第二)第二相相SDS-PAGE。3.2-D胶上蛋白质鉴定胶上蛋白质鉴定(1)早期)早期Western blot鉴定鉴定(2)Edman降解法鉴定降解法鉴定(3)肽质量指纹()肽质量指纹(peptide-mass
17、fingerprinting)技术技术 鉴定鉴定(4)蛋白质组信息学)蛋白质组信息学2D電泳Mass定序分析(三)蛋白质序列测定(三)蛋白质序列测定 肽序列分析的基本步骤:肽序列分析的基本步骤:(1)分析已纯化蛋白质氨基酸残基的组成。)分析已纯化蛋白质氨基酸残基的组成。(2)测定头尾氨基酸。)测定头尾氨基酸。(3)把肽链水解成片段,分别进行分析,得到肽图。)把肽链水解成片段,分别进行分析,得到肽图。(4)Edman降解降解 蛋白质测序发展简史蛋白质测序发展简史1.英国科学家英国科学家Sanger测序(测序(20世纪世纪50年代)。年代)。2.建立色谱技术和定量氨基酸分析技术(建立色谱技术和定量
18、氨基酸分析技术(20世纪世纪50年代)。年代)。3.Edman降解(降解(20世纪世纪70年代出现)。年代出现)。仪器自动化:液相自动测序仪和固相蛋白质自动测序仪。仪器自动化:液相自动测序仪和固相蛋白质自动测序仪。进入进入20世纪世纪80年代,气相测序技术出现并实现了仪器自动化。灵敏度显著提高,样品年代,气相测序技术出现并实现了仪器自动化。灵敏度显著提高,样品量只需量只需10pmol以下,一次连续测定的顺序甚至可超过以下,一次连续测定的顺序甚至可超过80个残基。样品处理远比固相方法简个残基。样品处理远比固相方法简单和操作方便。单和操作方便。4.20世世纪纪70年年代代,华华裔裔学学者者张张瑞瑞
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- 生物化学 分析 鉴定 方法
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