蛋白质生物合成【生物化学ppt课件】.ppt
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1、严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成生物化学与分子生物学教研室生物化学与分子生物学教研室 刘刘 先先 俊俊背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。一、概一、概 述述 以以RNARNA中的中的mRNAmRNA为模板,将为模板,将mRNAmRNA的碱基的碱基所组成的遗传密码转变为蛋白质分子中氨基所组成的遗传密码转变为蛋白质分子中氨基酸的排列顺序,称为蛋白质的生物合成,也酸的排列顺序,称为蛋白质的生物合成,也称
2、为翻译(称为翻译(translationtranslation)。)。简言之,就是简言之,就是生物体以生物体以mRNAmRNA为模板合成蛋白质的过程。为模板合成蛋白质的过程。翻译过程中核酸的作用翻译过程中核酸的作用:背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。二、蛋白质生物合成体系二、蛋白质生物合成体系基本原料:基本原料:2020种编码氨基酸种编码氨基酸模板:模板:mRNAmRNA适配器:适配
3、器:tRNAtRNA装配机:核蛋白体装配机:核蛋白体主要酶和蛋白质因子:氨基酰主要酶和蛋白质因子:氨基酰-tRNA-tRNA合成合成酶、转肽酶、起始因子、延长因子、释放酶、转肽酶、起始因子、延长因子、释放因子等因子等能源物质:能源物质:ATPATP、GTPGTP无机离子:无机离子:Mg2+Mg2+、K+K+背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。(一)(一)mRNAmRNA是遗传信息的携带者是遗传信息的携带者mRNAmRNA来源、生物遗传信息储存于来源、生物遗传信息储存于DNADNA mRNA mRNA分子中的
4、碱基排列序列决定了蛋白分子中的碱基排列序列决定了蛋白质分子中的氨基酸排列顺序。质分子中的氨基酸排列顺序。mRNAmRNA中相邻的中相邻的3 3个碱基代表一个氨基酸,三个相个碱基代表一个氨基酸,三个相邻的碱基称为一组密码(邻的碱基称为一组密码(codencoden),或称三联),或称三联体密码。体密码。6464组密码组成遗传密码表:组密码组成遗传密码表:起始密码:起始密码:1 1组(组(AUGAUG),兼作),兼作MetMet的密码的密码终止密码:终止密码:3 3组(组(UAAUAA、UGAUGA、UAGUAG)6161组密码编码组密码编码2020种种-氨基酸氨基酸背景环境分析严格执行突发事件上
5、报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。遗遗 传传 密密 码码 表表密码的第1位碱基(5端)密 码 的 第 二 位 碱 基 密码的第3位碱基(3端)UCAGUUUU苯丙氨酸 UUC苯丙氨酸 UUA亮氨酸UUG亮氨酸 UCU 丝氨酸 UCC 丝氨酸 UGA 丝氨酸 UCG 丝氨酸 UAU 酪氨酸 UAC 酪氨酸 UAA终止密码UAG终止密码 UGU半胱氨酸 UGC半胱氨酸UGA终止密码UGG 色氨酸 UCAG CCUU 亮氨酸CUC 亮氨酸CUA 亮氨酸 CUG 亮氨酸 CCU 脯氨酸CCC 脯氨酸CCA 脯氨酸CCG 脯氨酸 CAU 组氨酸
6、CAC 组氨酸CAA谷胺酰胺CAG谷胺酰胺 CGU 精氨酸 CGC 精氨酸 CGA 精氨酸 CGG 精氨酸 UCA G A AUU异亮氨酸AUC异亮氨酸AUA异亮氨酸AUG甲硫氨酸 (兼起始密码)ACU 苏氨酸ACC 苏氨酸ACA 苏氨酸ACG 苏氨酸 AAU天冬酰胺 AAC天冬酰胺AAA赖氨酸AAG 赖氨酸 AGU 丝氨酸AGC 丝氨酸AGA 精氨酸AGG 精氨酸 UCAG G GUU 缬氨酸GUC 缬氨酸GUA 缬氨酸GUG 缬氨酸 GCU 丙氨酸GCC 丙氨酸GCA 丙氨酸GCG 丙氨酸 GAU天冬氨酸GAC天冬氨酸GAA谷氨酸 GAG 谷氨酸 GGU 甘氨酸GGC 甘氨酸GGA 甘氨酸
7、GGG 甘氨酸 UCAG 背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。mRNA的基本结构的基本结构Start of genetic messageCapEndTail5-端非翻译区端非翻译区 5 3 3-端非翻译区端非翻译区 开放阅读框架开放阅读框架 从从mRNA 5-端端起起始始密密码码子子AUG到到3-端端终终止止密密码码子子之之间间的的核核苷苷酸酸序序列列,称称为为开开放放阅阅读读框框架架(open reading frame,ORF)。背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做
8、到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。原核生物的多顺反子原核生物的多顺反子真核生物的单顺反子真核生物的单顺反子非编码序列非编码序列核蛋白体结合位点核蛋白体结合位点起始密码子起始密码子终止密码子终止密码子编码序列编码序列PPP5 3 蛋白质蛋白质PPPmG-5 3 蛋白质蛋白质AAA 背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。遗传密码的特点:遗传密码的特点:1 1连续性(连续性(commalesscommaless)编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码子
9、及密码子的各碱基之间码连续阅读,密码子及密码子的各碱基之间既无间隔也无交叉。既无间隔也无交叉。5.5.A U GA U G G C AG C A G U AG U A C A UC A U U A AU A A 3 3AlaValHisMet终止密码终止密码背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。基因损伤引起基因损伤引起mRNAmRNA阅读框架内的碱基发生阅读框架内的碱基发生插入或缺失,可能导致框移突变插入或缺失,可能导致框移突变(frameshift(frameshift mutation)mutation)
10、。缬缬 脯脯 苏苏 天冬天冬缬缬 丙丙 酪酪 甘甘缬缬 丙丙 丝丝 精精背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。2.2.方向性方向性(sideness)(sideness)翻译时遗传密码的阅读方向是翻译时遗传密码的阅读方向是5353,即,即读码从读码从mRNAmRNA的起始密码子的起始密码子AUGAUG开始,按开始,按5353的方向逐一阅读,直至终止密码子。的方向逐一阅读,直至终止密码子。NC肽链延伸方向肽链延伸方向53读码方向读码方向背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及
11、时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。3 3简并性(简并性(degeneracydegeneracy)在在遗遗传传密密码码表表中中,共共有有6464组组密密码码(4 43 3)。其其中中,3 3组组作作为为翻翻译译的的终终止止密密码码(UAAUAA、UAGUAG和和 UGAUGA);AUGAUG兼兼 作作 翻翻 译译 的的 起起 始始 密密 码码(AUGAUG是是蛋蛋氨氨酸酸的的密密码码),其其余余6161组组密密码码(包包括括AUGAUG作作为为亮亮氨氨酸酸的的密密码码)共共同同编编码码2020种种-氨氨基基酸酸。因因此此,必必然然有有一一种种氨氨基基酸酸由由多多组组密密码码编编码
12、码的的现现象象,称称为为密密码码的的简简并并性性。实实际际上上,除除色色氨氨酸酸与与蛋蛋氨氨酸酸(由由一一个个密密码码编编码码)外外,其其余余氨氨基基酸酸均均由由两两个个或或两两个个以以上上的的密码编码(密码编码(2 26 6个)。个)。背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。各种氨基酸的密码子数目各种氨基酸的密码子数目背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。4 4通用性(通用性(universaluniversal):无无论论
13、原原核核生生物物如如病病毒毒、细细菌菌等等和和真真核核生生物物包包括括人人类类都都共共用用一一套套遗遗传传密密码码即即三三联联体体密码。只是不同生物对密码子具有偏爱性。密码。只是不同生物对密码子具有偏爱性。背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。(二)(二)tRNAtRNA是搬运氨基酸的工具是搬运氨基酸的工具1.tRNA1.tRNA的结构的结构 背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。tRNAtRNA分子中与蛋白质合成有关的位点
14、:分子中与蛋白质合成有关的位点:1 1)氨基酸结合位点;)氨基酸结合位点;2 2)氨酰)氨酰-tRNA-tRNA合成酶识别位点;合成酶识别位点;3 3)核糖体识别位点;)核糖体识别位点;4 4)反密码位点:)反密码位点:反反密密码码与与密密码码结结合合时时方方向向相相反反。即即反反密密码码的的第第1 1、2 2、3 3位位碱碱基基分分别别与与密密码码的的第第3 3、2 2、1 1位位碱碱基基配配对。对。背景环境分析严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现
15、、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。反密码与密码配对时,反密码的第反密码与密码配对时,反密码的第2 2、3 3位碱基分位碱基分别与密码的第别与密码的第2 2、1 1位碱基配对时严格遵循碱基配对规位碱基配对时严格遵循碱基配对规则(即则(即A A与与U U、G G与与C C配对),而反密码的第配对),而反密码的第1 1位碱基与位碱基与密码的第密码的第3 3位碱基配对时不严格遵循碱基配对规则,位碱基配对时不严格遵循碱基配对规则,后者成为摆动配对或不稳定配对(后者成为摆动配对或不稳定配对(wobble base wobble base pairpair)。)。严格执行突发事件上报制度、校外活动报
16、批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。摆动配对情况摆动配对情况 通过摆动配对,使得携带有同种氨基通过摆动配对,使得携带有同种氨基酸的不同酸的不同tRNAtRNA分子可分别结合在几种同义密分子可分别结合在几种同义密码上。如反密码为码上。如反密码为IGCIGC的丙氨酰的丙氨酰-tRNA-tRNA,可分,可分别结合到同义密码别结合到同义密码GCUGCU、GCCGCC、GCAGCA上(上(GCUGCU、GCCGCC、GCAGCA均为编码丙氨酸的密码)。摆动配均为编码丙氨酸的密码)。摆动配对的存在对于保持生物物种的稳定具有重要对的存在对于保持生物物种的稳定具有重要意
17、义。意义。反密码的第反密码的第1 1位碱基位碱基G GC CA AU UI I密码的第密码的第3 3位碱基位碱基U U或或C C G GU UA A或或G GA A、U U或或C C严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。tRNAtRNA是氨基酸与遗传密码间的适配器是氨基酸与遗传密码间的适配器严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。2.2.氨酰氨酰-tRNA-tRNA 各种氨基酸和对应的各种氨基酸和对应的tRNAtRNA结合后形成结合后形成的氨基酰的氨
18、基酰-tRNA-tRNA表示为:表示为:氨基酸的三字母缩写氨基酸的三字母缩写-tRNA-tRNA氨基酸的三字母缩写氨基酸的三字母缩写 例如:例如:丙氨酰丙氨酰-tRNA-tRNA:Ala-tRNAAla-tRNAAlaAla精氨酰精氨酰-tRNA-tRNA:Arg-tRNAArg-tRNAArgArg甲硫氨酰甲硫氨酰-tRNA-tRNA:Met-tRNA Met-tRNAMetMet起始者甲硫氨酰起始者甲硫氨酰-tRNA-tRNA:Met-tRNAi Met-tRNAiMetMet延长延长甲硫氨酰甲硫氨酰-tRNA-tRNA:Met-tRNAe Met-tRNAeMetMet严格执行突发事件上
19、报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。在在生生物物体体内内,一一种种tRNAtRNA只只能能与与一一种种氨氨基基酸酸结结合合(即即一一种种tRNAtRNA只只能能搬搬运运一一种种氨氨基基酸酸),而而一一种种氨氨基基酸酸可可与与一一种种以以上上的的tRNAtRNA分分子子结结合合,所所以以,tRNAtRNA的的种种类类(80(80种种以以上上)比比氨氨基酸(基酸(2020种)多。种)多。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。(三三)核糖体是蛋白质生物合成的场所核糖体是
20、蛋白质生物合成的场所 核核糖糖体体是是肽肽链链合合成成的的“装装配配机机”。胞质中核糖体种类:胞质中核糖体种类:游离的核糖体游离的核糖体-合成细胞固有蛋白合成细胞固有蛋白 与粗面内质网结合的核糖体与粗面内质网结合的核糖体 -合成带有信号肽的分泌性蛋白质合成带有信号肽的分泌性蛋白质 核核糖糖体体由由大大、小小亚亚基基组组成成,其其组组成成成成份份包括包括rRNArRNA和蛋白质。和蛋白质。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。原核生物真核生物核蛋白体小亚基大亚基核蛋白体小亚基大亚基S值70S30S50S80S40S60Sr
21、RNA16S-rRNA23S-rRNA5S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5.8S-rRNA5S-rRNA蛋白质rpS 21种rpL 36种rpS 33种rpL 49种 不同细胞核蛋白体的组成不同细胞核蛋白体的组成严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。在在核核糖糖体体上上,与与蛋蛋白白质质生生物物合合成成有有关关的的主主要要结构有:结构有:1 1有容纳有容纳mRNAmRNA的部位;的部位;2 2有有结结合合氨氨酰酰-tRNA-tRNA的的部部位位,称称为为氨氨酰酰基基部部位位,简简称称A A位位;有有结结合合肽
22、肽酰酰-tRNA-tRNA的的部部位位,称称为为肽肽酰酰基基部部位位,简称简称P P位;位;3.3.有结合蛋白质因子的部位;有结合蛋白质因子的部位;4 4有有转转肽肽基基酶酶(transpeptidasetranspeptidase)存存在在,可可催催化化肽肽键的形成;键的形成;5.5.具有延长因子依赖的具有延长因子依赖的GTPGTP酶活性。酶活性。A A位和位和P P位呈紧密相邻,每个部位的宽度正好位呈紧密相邻,每个部位的宽度正好相当于相当于mRNAmRNA上一个遗传密码的宽度。上一个遗传密码的宽度。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类
23、违纪行为或突发事件。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。mRNAmRNA与核糖体的结合与核糖体的结合 原核生物核糖体的小亚基的原核生物核糖体的小亚基的rRNArRNA(16S16S)的)的33末端有一富含嘧啶的区段末端有一富含嘧啶的区段,可与,可与mRNAmRNA分子的起始部位的一段富含嘌呤分子的起始部位的一段富含嘌呤的区段互补结合,使的区段互补结合,使mRNAmRNA结合至核糖体上。结合至核糖体上。mRNA
24、mRNA分子中的这段富含嘌呤的区段称为分子中的这段富含嘌呤的区段称为S-DS-D序列(序列(Shine-Dalgarno sequenceShine-Dalgarno sequence)(通常为通常为GGAGGU)GGAGGU)。S-DS-D序列位于序列位于mRNAmRNA的的55端紧接起端紧接起始信号的上游。始信号的上游。严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。原核生物原核生物mRNAmRNA的的S-DS-D序列及其与序列及其与16SrRNA16SrRNA的结合的结合严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制
25、度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。三、蛋白质生物合成过程三、蛋白质生物合成过程 蛋白质的生物合成过程包括:蛋白质的生物合成过程包括:氨基酸的活化与转运氨基酸的活化与转运活化氨基酸在核糖体上形成多肽链。后者活化氨基酸在核糖体上形成多肽链。后者是蛋白质生物合成的中心环节,又称核糖体是蛋白质生物合成的中心环节,又称核糖体循环。循环。翻译后加工翻译后加工 严格执行突发事件上报制度、校外活动报批制度等相关规章制度。做到及时发现、制止、汇报并处理各类违纪行为或突发事件。氨基酸与氨基酸与tRNAtRNA的结合需要氨酰的结合需要氨酰tRNAtRNA合成酶合成酶催化,并需要消耗催化,并需
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