保护碱基列表精品资料.doc

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1、CR设计引物时酶切位点的保护酶寡核苷酸序列切割率2hr2 hrAc IGGTCGACCGGTCGCCGCCCGACCG 0 00 00Afl IIICACGG CCACATTG CCAATGTGGG0 0 90000IGGCGGC AGGGCGC TTGCCCAA90 90 090 90Av ICCCGGG CCGGG TCCCCGGGA50 90 90 90Bam ICGACCG CGGTCCCG CGCGACGC0 0 9025 90 90Bg ICACTG GAATCTTCGAAGATCTC0 5 259090BssH ICGCC AGCGCGCCT TGCGAA 05 0 90BstE

2、 IIGG(AT)ACCC00BstIACTCAGAACCAATGCATG AAATGAGCCATGCATTGA CTCAGACATGATTGGATCT025 2 50 90ClaICATCT GATGATC CCATCGATGGCCATCGTG0 0 0 0 090 coR GGAAC CGGAATCG CGGAATTCCGG90 90 900 90 9He IGGGCGCGGCCCT TTGCGGCGC9 909090 90 90indIICAGCTG CAAGCTTG CATG 10 0 75KpnIGGACCC GGGGTACC CGGGGTACCCCG0 90 99 0MluIGAC

3、GCGTCAGCGCG5 50Nco ICCCATGGG CAGATGCAG 500 7eICCATATGG AATGGGCCAATGGC GGGTTTCATATACCC GATTCCATAGGATTCC GATCATATGAATCC00 0 07 00 0 90Ne IGTAGC GCTCCG CAGCTAGCTAG0 10 10550NotITTGCCCA ATTCGGCGCTTTATATCGCGCATAA AAAATCGGCCGTAAACTAT AAGAAAAAGCGCCGAAAAGGAAAA0 10 025 50 10 10900Nsi ITGCATGCAGA CAATGCTTGTGA

4、GT0 090 90ac ITATAGTTATTAAC CTTAATA 0 2 90Pme ITTTAAACGGTTACC GGTTTAACC GCTTGTTTAAACGGCGCGCGG0 750 2 50 9PstIGCAGC GACTGCAGTCA ACAAACAGCATTGG AAACTGCAGCAATGATTGGAA TCGAAGATGATGCAT 1 90 9000 1 9090 0Pvu ICATCGGTCGATGATTCGCGATCGCGA0 1 00 2510Sac ICGAGCTCG110Sac ICGGC TCCCGCGGG0 00 0SlIGCGACGTCAAAGCCTG

5、CCGGCGTCGACGTTGCCTACGGGCGG ACGCGTCGACGCCACGCCCGGA010 1 50 75Sca GAGACAAAAGTACTTTT1 725 75Sma CGCCCGG CCCGGGGTCCCGGGGA 0 10 90101050Spe IGCTG GGACTATC GACTAGTCCG AGACTAGTCAG10 10 0 0909050 50SpIGCATGCC CATCATGCATG ATGCATCATGT0 0 100 550uIAACC AGGC AAAGGCTTT9090 909 90 0XbaICAGAG CTAGGC TGCTAGAGCA CTAGTCTAGCTAG 90 75750990 90ho CGAG CCCTCGAGGGCGCTCGCG0 10 100 257Xma CCCGGGG CCCCGGG CCCCGGGG TCCCCCCGGGGGA025 5 900 7590 0注释：1如果要加在序列的5端，就在酶切位点识别碱基序列（红色）的5端加上相应的碱基（黑色），相同如果要在3端加保护碱基,就在酶切位点识别碱基序列(红色)的端加上相应的碱基（黑色）。.切割率：正确识别并酶切的效率3。加保护碱基时最好选用切割率高时加的相应碱基。