第二十一章基因诊断与基因治疗3618.docx
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1、第二十一章 基因诊断与基因治疗基因诊断与与基因治疗疗能够在比比较短的时时间从理论论设想变为为现实,主主要是由于于分子生物物学的理论论及技术方方法,特别别是重组DDNA技术术的迅速发发展,使人人们可以在在实验室构构建各种载载体、克隆隆及分析目目标基因。所所以对疾病病能够深入入至分子水水平的研究究,并已取取得了重大大的进展。因因此在200世纪700年代末诞诞生了基因因诊断(ggene diaggnosiis);随后于于19900年美国实实施了第一一个基因治治疗(geene ttheraapy)的的临床试验验方案。可可见,基因因诊断和基基因治疗是是现代分子子生物学的的理论和技技术与医学学相结合的的范
2、例。第一节 基因诊断一. 基因诊断的的含义传统对疾病病的诊断主主要是以疾疾病的表型型改变为依依据,如患患者的症状状、血尿各各项指标的的变化,或或物理检查查的异常结结果,然而而表型的改改变在许多多情况下不不是特异的的,而且是是在疾病发发生的一定定时间后才才出现,因因此常不能能及时作出出明确的诊诊断。现知知各种表型型的改变是是由基因异异常造成的的,也就是是说基因的的改变是引引起疾病的的根本原因因。基因诊诊断是指采采用分子生生物学的技技术方法来来分析受检检者的某一一特定基因因的结构(DDNA水平平)或功能能(RNAA水平)是是否异常,以以此来对相相应的疾病病进行诊断断。基因诊诊断有时也也称为分子子诊
3、断或DDNA诊断断(DNAA diaagnossis)。基因因诊断是病病因的诊断断,既特异异又灵敏,可可以揭示尚尚未出现症症状时与疾疾病相关的的基因状态态,从而可可以对表型型正常的携携带者及某某种疾病的的易感者作作出诊断和和预测,特特别对确定定有遗传疾疾病家族史史的个体或或产前的胎胎儿是否携携带致病基基因的检测测具有指导导意义。二. 基因诊断的的原理及方方法(一)基因因诊断的原原理疾病的发生生不仅与基基因结构的的变异有关关,而且与与其表达功功能异常有有关。基因因诊断的基基本原理就就是检测相相关基因的的结构及其其表达功能能特别是RRNA产物物是否正常常。由于DDNA的突突变、缺失失、插入、倒倒位
4、和基因因融合等均均可造成相相关基因结结构变异,因因此,可以以直接检测测上述的变变化或利用用连锁方法法进行分析析,这就是是DNA诊诊断。对表达产物物mRNAA质和量变变化的分析析为RNAA诊断(RRNA ddiagnnosiss)。(二)基因因诊断的方方法 基基因诊断是是以核酸分分子杂交(nuclleic acidd mollecullar hhybriidizaationn)和和聚合酶链链反应(PPCR)为核心发发展起来的的多种方法法,同时配配合DNAA序列分析析,近年新新兴的基因因芯片可能能会发展成成为一种很很有用的基基因诊断方方法。1. DNA诊断断常用检测致致病基因结结构异常的的方法有下
5、下列几种。 斑点杂杂交:根据据待测DNNA 样本本与标记的的DNA探探针杂交的的图谱,可可以判断目目标基因或或相关的DDNA片段段是否存在在,根据杂杂交点的强强度可以了了解待测基基因的数量量。 等位基基因特异的的寡核苷酸酸探针(aallelle-sppeciffic ooligoonuclleotiide pprobee, ASSO prrobe)杂交:是一种检测基因点突变的方法,根据点突变位点上下游核苷酸序列,人工合成约19个核苷酸长度的片段,突变的碱基位于当中,经放射性核素或地高辛标记后可作为探针,在严格杂交条件下,只有该点突变的DNA样本,才出现杂交点,即使只有一个碱基不配对,也不可能形
6、成杂交点。一般尚合成正常基因同一序列,同一大小的寡核苷酸片段作为正常探针。如果受检的DNA样本只能与突变ASO探针,不与正常ASO探针杂交,说明受检二条染色体上的基因都发生这种突变,为突变纯合子;如果既能与突变ASO探针又能与正常ASO探针杂交,说明一条染色体上的基因发生突变,另一条染色体上为正常基因,为这种突变基因的杂合子;如果只能与正常ASO探针杂交,不能与突变ASO杂交,说明受检者不存在该种突变基因,如图21-1所示。若与PCRR方法联合合应用,即即PCR/ASO探探针杂交法法(PCRR/ASOO proobe hhybriidizaationn),是一种种检测基因因点突变的的简便方法法
7、,先用PPCR方法法扩增突变变点上下游游的序列,扩扩增产物再再与ASOO探针杂交交,可明确确诊断突变变的纯合子子和杂合子子。此法对对一些已知知突变类型型的遗传病病,如地中中海贫血、苯苯丙酮尿症症等纯合子子和杂合子子的诊断很很方便。也也可分析癌癌基因如HH-rass和抑癌基基因如p553的点突突变。 单链构构象多态性性(sinngle straand cconfoormattion polyymorpphismm, SSSCP)分析相相同长度的的单链DNNA因其序序列不同,甚甚至单个碱碱基不同,所所形成的构构象不尽相相同,在非非变性聚丙丙烯酰胺凝凝胶电泳时时速度就不不同,若单单链DNAA用放射性
8、性核素标记记,显影后后即可区分分电泳条带带。一般先先设计引物物对突变点点所在外显显子进行扩扩增,PCCR产物经经变性成单单链后进行行电泳分析析。PCRR/SSCCP方法,能能快速、灵灵敏、有效效地检测DDNA突变变点,如图图21-22,此法可可用检测点点突变的遗遗传疾病,如如苯丙酮尿尿症、血友友病等,以以及点突变变的癌基因因和抑癌基基因。限制性性内切酶图图谱(reestriictioon maap)分析,如如果DNAA突变后改改变了某一一核酸限制制性内切酶酶的识别位位点,使原原来某一识识别位点消消失,或形形成了新的的识别位点点,那么相相应限制性性内切酶片片段的长度度和数目会会发生改变变。一般基
9、基因组DNNA经该种种限制性内内切酶水解解,再做SSouthhern印印迹,根据据杂交片段段的图谱,可可诊断该点点突变,如如图21-3所示。如如果用PCCR扩增该该突变点的的外显子,PPCR产物物经该种酶酶消化后,进进行琼脂糖糖电泳,溴溴乙锭染色色后可直接接观察片段段的大小及及数目。此此法可用于于检测有些些限制性内内切酶识别别位点消失失的遗传疾疾病,如镰镰状细胞贫贫血。或基基因缺失的的疾病如地中海贫贫血症,单单纯性生长长激素缺乏乏症等。 限制性性片段长度度多态性(rrestrrictiion ffragmment lenggth ppolymmorphhism ,RFLLP)遗传连锁分析人群中
10、个体间DNA的序列存在差异,据估计每100-200个核苷酸中便有1个发生突变,这种现象称为DNA多态性。有些DNA多态性可改变某一限制性内切酶的识别位点,因而产生了DNA限制性片段长度多态性。RFLP按孟德尔方式遗传,在某一特定的家庭中,如果某一致病基因与特定的多态性片段连锁,可以遗传给子代,因此这一多态性片段可作为遗传标记,来判断该家庭成员或胎儿的基因组中是否携带该致病基因,见图21-4,此法可用于诊断甲型血友病、苯丙酮尿症、享延顿舞蹈病等。 DNAA序列分析析对致病有有关的DNNA片段进进行序列测测定,是诊诊断基因异异常(已知知和未知)最最直接和准准确的方法法。2. RNA诊断断RNA诊断
11、断主要是分分析基因的的表达功能能,检测转转录物的质质和量,以以判断基因因转录效率率的高低,以以及转录物物的大小。RNA印印迹(Noortheern bblot)RRNA印迹迹是检测基基因是否表表达,表达达产物mRRNA的大大小的可靠靠方法,根根据杂交条条带的强度度,可以判判断基因表表达的效率率。RT-PPCR是一一种检测基基因表达产产物mRNNA灵敏的的方法,若若与荧光定定量PCRR结合可对对RT-PPCR产物物量进行准准确测定。三. 基因诊断的的应用(一)遗传传疾病现知遗传疾疾病有数千千种,但多多数遗传疾疾病属少见见病例,有有些遗传疾疾病在不同同民族,不不同地区的的人群中发发病率不同同,例如
12、镰镰状细胞贫贫血(siicklee celll annemiaa),非洲洲黑色人种种发病率高高,而囊性性纤维化症症(cysstic fibrrosiss)常见于于美国白色色人种,这这二种遗传传疾病在我我国为罕见见病例。中中国较常见见的遗传疾疾病有地中中海贫血、甲甲型血友病病、乙型血血友病、苯苯丙酮尿症症、杜氏肌肌营养不良良症(DMMD)、葡葡萄糖-66磷酸脱氢氢酶(G-6PD)缺缺乏症、唐唐氏综合症症(Dowwns syyndroome)等等。根据不同遗遗传疾病的的分子基础础,可采用用不同的技技术方法进进行诊断,不不但可对有有症状患者者进行检测测,而且对对遗传疾病病家族中未未发病的成成员乃至胎
13、胎儿甚至胚胚胎着床前前(preeimpllantaationn)进行诊诊断是否携携带有异常常基因,这这对婚育具具有指导意意义。地中海贫血血(地贫)是是世界上最最常见和发发生率最高高的一种单单基因遗传传疾病(mmonoggenicc disseasee),由于于一种或几几种珠蛋白白合成障碍碍导致类与类珠蛋白白不平衡造造成的,临临床以贫血血、黄疸、肝肝脾肿大及及特殊外貌貌为特征,地地贫最常见见的有两类类:地贫和地贫。地贫(-thallasseemiass)的的分子基础础主要为珠蛋白基基因缺失,也也有部分病病例是由于于碱基突变变造成的。可可采用限制制性内切酶酶图谱方法法检测珠蛋白基基因的缺失失。人珠
14、蛋白白基因簇位位于16号号染色体,长长度29 kb,包包含7个连连锁的类基因或或假基因。基因(1及2编码序列相同,仅非编码序列稍有差别,产物相同),该基因簇上有2个EcoRI识别位点,经EcoRI酶解,进行Southern印迹,用标记的基因片段作探针,得到一条23 kb的杂交条带,BamHI识别位点有4个,但只有14 kb片段能与mRNA基因探针杂交,见图21-5。Hb Baarts胎儿水水肿综合征征:由于该该病患儿二二条16号号染色体的的4个珠蛋白基基因均缺失失,不能合合成链,胎儿儿全身水肿肿、肝脾肿肿大、四肢肢短小,常常于妊娠330400周死亡或或早产后半半小时内死死亡。样本本DNA经经限
15、制性内内切酶图谱谱分析不能能显示珠蛋白基基因区带,RRNA诊断断也测定不不出有珠蛋白基基因的mRRNA。缺失型HBBH病:由由于一条116号染色色体上的两两个珠蛋白基基因均缺失失,另一条条16号染染色体上则则缺失一个个珠蛋白基基因,并缺缺失3.77 kb长度度的DNAA片段(右右侧缺失型型)或4.2 kb片段段(左侧缺缺失型),DDNA诊断断只产生119 kb长度度的EcooRI片段段,或100kb BBamHII片段。标准型地地贫:一条条16号染染色体上22个珠蛋白基基因全部缺缺失。而另另一条166号染色体体上具有22个正常的的珠蛋白基基因,DNNA诊断结结果,EccoRI和和BamHII都
16、出现与与正常一样样的23 kb或114 kbb的条带,但但杂交条带带的放射性性自显影较较正常人浅浅。地贫(-thallasseemiass)的的基因诊断断:地贫的分分子基础不不同于地贫,珠蛋白基基因通常并并不缺失,而而是由于基基因点突变变或个别碱碱基的插入入或缺失。每每一民族和和人群珠蛋白基基因点突变变部位不尽尽相同,都都有特定的的类型谱。(二)感染染性疾病 过过去对感染染性疾病(infeectioous ddiseaases)的诊断,一一是直接分分离检查病病原体,或或者对患者者血清学或或生物化学学的分析。有有些病原体体不容易分分离,有些些需经过长长期培养才才能获得。血血清学对病病原体抗体体的
17、检测虽虽然很方便便,但是病病原体感染染人体后需需要间隔一一段时间后后才出现抗抗体,并且且血清学检检查只能确确定是否接接触过该种种病原体,但但不能确定定是否有现现行感染,对对潜伏病原原体的检查查有困难。 对对感染性疾疾病的基因因诊断具有有快速、灵灵敏、特异异等优点。880年代建建立的PCCR技术已已广泛应用用于对病原原体的检测测。一般根根据各病原原体特异和和保守的序序列设计引引物,有的的还合成AASO探针针,对病原原体的DNNA可用PPCR技术术直接检查查,而对RRNA病毒毒,则采用用RT-PPCR。现现在市场已已经有许多多种病原体体的测定药药盒供应,每每一盒包含含扩增某种种病原体的的特异引物物
18、,所需的的酶以及配配妥的各种种反应试剂剂,并附有有可行的操操作方法步步骤。1. 病毒性感染染:多种病毒性性感染都可可采用基因因诊断检测测相应的病病原体,如如甲型、乙乙型、丙型型和丁型肝肝炎病毒,人人免疫缺陷陷病毒、可可萨奇病毒毒、脊髓灰灰质类病毒毒、腺病毒毒、EB病病毒、疱疹疹病毒、人人巨细胞病病毒、乳头头状病毒等。最最近新发现现的SARRS冠状病病毒,在基基因组(RRNA)序序列确定后后,便很快快建立了RRT-PCCR的基因因诊断法。2. 细菌性感染染:可应用基因因诊断检测测多种致病病性的细菌菌,如结核核分枝杆菌菌、痢疾性性大肠杆菌菌、霍乱弧弧菌、淋球球菌、绿脓脓杆菌等。3. 寄生虫:恶性疟
19、原虫虫、克鲁斯斯锥虫、利利什曼原虫虫、血吸虫虫、弓形虫虫等都有有基因诊断断的方法4. 其它:如衣衣原体、支支原体、真真菌性感染染也均用基基因诊断。(三)恶性性肿瘤分析一些原原癌基因的的点突变、插插入突变、基基因扩增、染染色体易位位和抑癌基基因的丢失失或突变,可可以了解恶恶性肿瘤的的分子机制制,有助于于对恶性肿肿瘤的诊断断,对肿瘤瘤治疗及预预后有指导导意义。(四)法医医学中的应应用对生物个体体识别和亲亲子鉴定传传统的方法法有血型、血血清蛋白型型、红细胞胞酶型和白白细胞膜抗抗原(HLLA)等,但但这些方法法都存在着着一些不确确定的因素素。近年来来对人基因因结构的深深入研究发发现,有些些具有个体体特
20、征的遗遗传标记可可用于个体体识别和亲亲子鉴定。1. DNNA指纹分分析(DNNA finggerprrintiing)近年研究发发现,人类类基因组中中许多位点点存在着一一种可变串串联重复序序列(vaariabble nnumbeer off tanndem repeeat,VNTRR)。这这种VNTTR主要存存在于基因因的非编码码区,重复复序列是头头对尾串联联排列着。人人类某些VNTRR是由200-50个个重复单位位组成,每每个单位含含15-1100 bbp,DNA的长长度为1kkb至5kb,较较普通卫星星DNA(约约100 kb)小小,所以称称为小卫星星DNA(miniisateellitt
21、e DNNA)。经研究究发现VNNTR有高高度的多态态性,在人人群中的分分布表现高高度的个体体特异性,甚甚至同一个个体同源染染色体的等等位VNTTR的重复复单位数也也不同,等等位基因按按孟德尔方方式遗传。VNTR区的重复单位数目不同,所以该区的DNA长度不同。但每一位点VNTR的核心序列却有高度的保守性,因此可认为VNTR是一种判断个体的遗传标记。1985年年, Jeeffreeys根据据VNTRR的特点,选选择某些核核心序列作作为探针,并并选用核心心序列无切切割位点的的限制性内内切酶如HHinf11,对DNAA样品进行行酶解,然然后作Sooutheern印迹迹。图谱显显示不同个个体具有不不同
22、条带,如如同人的指指纹具有高高度的个体体特异性一一样,因此此把这种SSouthhern印印迹图称作作DNA指纹图图谱(DNNA fiingerrprinnt),如如图21-6所示。实实验证明,除除同卵双生生子有相同同的图谱外外,两个人人不可能有有完全相同同的图谱,所所以这种方方法对个体体识别,亲亲子鉴定,嫌嫌疑罪犯的的判断准确确可靠。图图21-77是引自文文献报道的的结果。可可是Souurtheern印迹迹技术操作作繁琐,所所需时间长长,需要DDNA量较较大,若DDNA降解解还会影响响对结果的的判断。所所以,Jeeffreeys又根根据每一VVNTR区区翼侧保守守序列设计计引物,用用PCR方法
23、法对该区进进行扩增,因因VNTRR长度不同同,所以产产物经琼脂脂糖凝胶电电泳,染色色后,根据据条带的不不同,可以以判断结果果。这种方方法既方便便又省时,对对部分酶解解DNA也适适用,对单单根毛发,血血斑,皮屑屑和精迹都都可进行分分析。但有有些VNTTR重复片片断较长,PCR难以扩增。2 短串联重复复(shoort ttandeem reepeatt,STRR)多态性分分析 900年代初,发发现人基因因组中存在在着数量众众多的STTR, SSTR的重重复单元较较短,核心心序列含22-4 bbp,DNA片段段长度为1100-5500 bbp,故称称为微卫星星DNA (miccrosaatellli
24、te DNA).与VNTTR相同, 有不少少的微卫星星DNA存在在着个体间间重复单元元数目不同同的多态性性, 所以以是一种应应用价值很很高的遗传传标记。又又因为微卫卫星DNAA 较短,易易进行PCCR操作,也也能适用于于降解的DDNA分析析。目前,STR-PCR技术在法医学中的应用已占主导地位。VNTR和和STR除除在法医学学中的应用用外,还用用于遗传作作图, 基基因定位及及遗传疾病病的诊断等等。第二节 基因治疗一. 基因治疗的的慨念(一)基因因治疗的定定义从基因角度度可以理解解为对缺陷陷的基因进进行修复或或将正常有有功能的基基因置换或或增补缺陷陷基因的方方法。若从从治疗角度度可以广义义地说是
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