第六章_酶化学.ppt
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1、第六章酶化学本章内容:本章内容:酶的概述酶的概述 酶的作用机制酶的作用机制 酶促动力学酶促动力学 酶的应用及发展酶的应用及发展 酶的概述酶的概述一、酶催化作用的特点一、酶催化作用的特点二、酶的化学本质及组成二、酶的化学本质及组成三、酶的命名与分类三、酶的命名与分类四、酶的结构与功能的关系四、酶的结构与功能的关系酶酶(Enzyme)的概念的概念:酶是活细胞产生的,具有催化生酶是活细胞产生的,具有催化生物反应功能的蛋白质大分子及核酸。物反应功能的蛋白质大分子及核酸。酶的概念酶的概念酶的概念酶的概念一、酶催化一、酶催化作用作用特点:特点:与一般化学催化剂相比,与一般化学催化剂相比,其共性有其共性有:
2、1 1、用量少而催化效率高;、用量少而催化效率高;2 2、不改变化学反应的平衡点;、不改变化学反应的平衡点;3 3、可降低反应的活化能:、可降低反应的活化能:(一)催化效率高:(一)催化效率高:l通常要高出非生物催化剂催化活性的通常要高出非生物催化剂催化活性的10106 6-10-101313倍。倍。2H2O22H2O +O21mol过氧化氢酶过氧化氢酶 5106molH2O21molFe+2610-4molH2O2(二)、具高度专一性(二)、具高度专一性l 一种酶只能催化一种酶只能催化一种一种或或一类一类十分相似的反应。十分相似的反应。l底物(底物(substrate substrate,S
3、)S):酶作用的物质酶作用的物质。l绝对专一性绝对专一性:只作用:只作用一种一种底物。底物。l相对专一性相对专一性:作用于:作用于一类一类底物。底物。酶作用的专一性酶作用的专一性酶酶的的专专一一性性:一一种种酶酶仅仅能能作作用用于于一一种种底底物物,或或一一类类分分子子结结构构相相似似的的物物质质,并并催催化化某某种种类类型型的的反反应应。这这种种特特性性称称为为酶酶的的专专一一性性,又又叫叫做做酶酶的的特异性或选择性。特异性或选择性。酶酶作用的作用的专一性专一性结构专结构专一性一性立体异构专一性立体异构专一性族(基团)专一性族(基团)专一性绝对专一性绝对专一性族(基团)专一性:可作用于一类或
4、一些结构很相族(基团)专一性:可作用于一类或一些结构很相似的底物。似的底物。RCOO-+R OH+H+酯酶酯酶:RCOR+H2OOOCH2OHOHOHOH15-葡萄糖葡萄糖苷酶苷酶O R+H2OOCH2OHOHOHOHOH15+ROH绝对专一性:只能作用于某一底物。绝对专一性:只能作用于某一底物。脲酶脲酶:H2NCNH2+H2OO2NH3+CO2胰蛋白酶的基团胰蛋白酶的基团专一性专一性消化道几种蛋白酶的专一性立体异构专一性立体异构专一性l酶酶只能催化一种立体异构体发生某种化只能催化一种立体异构体发生某种化学反应,而对另一种立体异构体则无作学反应,而对另一种立体异构体则无作用。用。L-L-乳酸脱
5、氢酶乳酸脱氢酶(L-lacticacid dehydrogenase)(L-lacticacid dehydrogenase)的底的底物只能是物只能是L L型乳酸,而不能是型乳酸,而不能是D D型乳酸。型乳酸。(三)、酶易失活:(三)、酶易失活:l凡使凡使prpr变性的因素都可使酶破坏变性的因素都可使酶破坏,l酶在温和条件下作用。酶在温和条件下作用。(四)(四)、酶活性受多种方式调控:酶活性受多种方式调控:l如:抑制剂、反馈抑制、酶原激活、激素等。如:抑制剂、反馈抑制、酶原激活、激素等。(五)、有些酶的活性与辅酶、辅基(五)、有些酶的活性与辅酶、辅基 及金属离子有关。除去,酶失活。及金属离子有
6、关。除去,酶失活。酶的概念酶的概念酶的概念酶的概念二、酶的化学本质二、酶的化学本质1 1、大多数酶是蛋白质大多数酶是蛋白质:元素组成与分子量元素组成与分子量 化学结构与空间结构;化学结构与空间结构;理化性质理化性质:两性性质;胶体性质;两性性质;胶体性质;变性失活;可被蛋白酶分解;结晶;测序。变性失活;可被蛋白酶分解;结晶;测序。2 2、某些某些RNARNA具有催化活性具有催化活性,将本质为将本质为RNA RNA 的酶称的酶称核酶(核酶(ribozymesribozymes)。酶的概念酶的概念酶的概念酶的概念三、酶的命名与分类三、酶的命名与分类(一)酶的命名一)酶的命名酶的命名有两种方法:系统
7、名、惯用名酶的命名有两种方法:系统名、惯用名惯用名:命名原则惯用名:命名原则根据酶催化反应的性质来命名。根据酶催化反应的性质来命名。如催化水解反应的酶如催化水解反应的酶-水解酶水解酶 催化氧化反应的酶催化氧化反应的酶-氧化酶或脱氢酶氧化酶或脱氢酶 催化转移氨基的酶催化转移氨基的酶-转氨酶转氨酶根据被作用的底物兼顾反应的性质来命名。根据被作用的底物兼顾反应的性质来命名。根据酶的来源命名。如细菌淀粉酶、胃蛋白酶。根据酶的来源命名。如细菌淀粉酶、胃蛋白酶。酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类系统名系统名:根根据据酶酶催催化化反反应应的的类类型型分分为为六六大大类类:分分别别用用1
8、 1,2 2,3 3,4 4,5 5,6 6编号编号1 1、氧氧化化还还原原酶酶类类 2 2、转转移移酶酶类类 3 3、水水解解酶酶类类 4 4、裂裂分分酶类酶类 5 5、异构酶类、异构酶类 6 6、合成酶类、合成酶类 根根据据底底物物的的性性质质和和反反应应键键的的性性质质,每每一一类类又又可可分分为若干亚类及次亚类。仍然用为若干亚类及次亚类。仍然用1 1,2 2,3 3,编号。编号。在次亚类中编号。在次亚类中编号。:系统名系统名:乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶 EC 1.1.1.27EC(Enzyme Commision)第1大类,氧化还原酶第1亚类,氧化基团CHOH第1亚亚类,H受体为NAD+该酶
9、在亚亚类中的流水编号每个酶有两个名称每个酶有两个名称:系统名、惯用名系统名、惯用名l惯用名惯用名:简单、便于使用;:简单、便于使用;l系统名系统名:明确标明酶的底物及催化:明确标明酶的底物及催化 反应的性质。反应的性质。酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类(二)酶的分类(二)酶的分类1 1、根据酶的组成分类:、根据酶的组成分类:(1 1)、单纯酶)、单纯酶(简单蛋白质):(简单蛋白质):其活性仅取决于其蛋白质结构。其活性仅取决于其蛋白质结构。如:蛋白酶、淀粉酶等。如:蛋白酶、淀粉酶等。酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类(2 2)结合酶:酶蛋白)结合酶:
10、酶蛋白+辅因子辅因子=全酶全酶 辅因子辅因子(cofactercofacter):热稳定的非蛋白小分子。热稳定的非蛋白小分子。l按分子组成:按分子组成:金属离子金属离子:Mg2+、Mn2+小分子有机物小分子有机物:NAD+、NADP+烟酰胺腺嘌呤二核苷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸按与酶的结合程度按与酶的结合程度:辅酶辅酶(coenzyme):(coenzyme):结合较结合较松松,可透析去除可透析去除;辅基辅基(prosthetic(prosthetic grupgrup):结合较结合较紧紧,透析不易除去透析不易除去。酶蛋白酶蛋白负责专一性;负责专一性
11、;辅因子辅因子负责电子、原子或基团转移。负责电子、原子或基团转移。同一辅因子可与多种不同酶蛋白结合,同一辅因子可与多种不同酶蛋白结合,显示不同催化活性。显示不同催化活性。2.2.按酶的分子特点分:按酶的分子特点分:(1 1)、单体酶:)、单体酶:一条肽链构成。一条肽链构成。(2 2)、寡聚酶:)、寡聚酶:几条到多条肽链(相同或不同)组成。几条到多条肽链(相同或不同)组成。(3 3)、多酶体系:)、多酶体系:几种酶彼此嵌合的复合体,几种酶彼此嵌合的复合体,有利于一系列反应连续进行。有利于一系列反应连续进行。(4 4)、多功能酶(串联酶):)、多功能酶(串联酶):一些多酶体系在进化过程一些多酶体系
12、在进化过程中由于基因的融合,形成由一条多肽链组成却具有不同中由于基因的融合,形成由一条多肽链组成却具有不同催化功能的酶。催化功能的酶。l 3.3.国际酶学委员会国际酶学委员会(Enzyme Commision)根据酶催化反应的类型分类根据酶催化反应的类型分类 (1 1)氧化还原酶氧化还原酶类类 (2 2)转移酶转移酶类类 (3 3)水解酶水解酶类类 (4 4)裂解酶裂解酶类类 (5 5)异构酶异构酶类类 (6 6)合成酶合成酶类类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的编号酶的编号EC EC 为为 Enzyme Enzyme CommisionCommision 酶学委员会
13、缩写酶学委员会缩写 酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类酶的命名与分类(一)酶的分类(一)酶的分类1.1.氧化还原酶类氧化还原酶类:主要是催化氢的转移或电子传递主要是催化氢的转移或电子传递或或加氧加氧的氧化还原反应。的氧化还原反应。AH2 +B(O2)供氢体供氢体受氢体受氢体A+BH2(H2O2,H2O)根据受氢体的性质,氧化还原酶类可分为:根据受氢体的性质,氧化还原酶类可分为:(1 1)脱氢酶类)脱氢酶类:催化直接从底物上脱氢的反应。:催化直接从底物上脱氢的反应。AH2+BA+BH2(需需辅酶辅酶或辅酶或辅酶)(2 2)氧化酶类)氧化酶类催化底物脱氢,氧化生成催化底物脱氢,氧化生成H
14、H2 2O O2 2:AH2+O2A+H2O2催化底物脱氢,氧化生成催化底物脱氢,氧化生成H H2 2O O:2AH2+O22A+2H2O(3 3)过氧化物酶)过氧化物酶ROO+H2O2RO+H2O+O2(其它)(其它)(4 4)加氧酶(双加氧酶和单加氧酶)加氧酶(双加氧酶和单加氧酶)O2+OHOHC=OC=OOHOH(顺,顺顺,顺-已二烯二酸)已二烯二酸)2.2.转移酶类转移酶类:催化化合物中某些基团的转移。:催化化合物中某些基团的转移。AX+BA+BX根据根据X X分成分成8 8个亚类:转移碳基、酮基或醛基、酰个亚类:转移碳基、酮基或醛基、酰基、糖基、烃基、含氮基、基、糖基、烃基、含氮基、
15、含磷基(激酶)含磷基(激酶)和含和含硫基的酶。硫基的酶。已糖激酶已糖激酶葡萄糖葡萄糖+ATP-66磷酸葡萄糖磷酸葡萄糖+ADPMg+3.水解酶类水解酶类:催化加水分解作用。催化加水分解作用。AB+H2OAOH+BH4.4.裂解酶类裂解酶类:催化非水解性地除去基团而形成双催化非水解性地除去基团而形成双键的反应或逆反应。键的反应或逆反应。CH3C=OCOOHCC键CH3C=OH+CO2 (脱羧酶、醛缩酶)CO键CH2COOHHOCHCOOHHCCOOHHOOCCH+H2O(脱水酶脱水酶)CN键COOHCHNH2CH2COOHCOOHCHHCCOOH+NH3(脱氨酶)脱氨酶)5.5.异构酶异构酶:催
16、化各种异构体之间的互变。催化各种异构体之间的互变。AB常见的有消旋和变旋、醛酮异构、顺反异构和变位酶类常见的有消旋和变旋、醛酮异构、顺反异构和变位酶类。6.合成酶类合成酶类:催化有催化有ATPATP参加的合成反应参加的合成反应。A+B+ATPAB+ADP+Pi四、四、酶的结构与功能的关系酶的结构与功能的关系一一、酶的活性中心、酶的活性中心(一)(一)酶的活性中心酶的活性中心概念:概念:活性中心:活性中心:酶分子中能同底物结合并起催化作用的酶分子中能同底物结合并起催化作用的空间部位。空间部位。羧肽酶的活性中心羧肽酶的活性中心l实验:实验:酶蛋白经酶蛋白经水解切去部分肽水解切去部分肽链后,残留部分
17、链后,残留部分仍有活性。仍有活性。l说明:说明:参与催化参与催化反应的只是其中反应的只是其中一小部分,即一小部分,即活活性中心。性中心。活性中心的实质活性中心的实质活性中心即酶分活性中心即酶分子中在三维结构子中在三维结构上相互靠近的几上相互靠近的几个个aaaa残基或其上残基或其上的某些基团。的某些基团。活性中心以外活性中心以外的部分对酶催化的部分对酶催化次要但对活性中次要但对活性中心形成提供结构心形成提供结构基础。基础。胰凝乳蛋白酶的活性中心胰凝乳蛋白酶的活性中心活性中心的功能部位:活性中心的功能部位:l结合部位结合部位:酶分子上与底物结合的部位。:酶分子上与底物结合的部位。l催化部位催化部位
18、:底物在此发生一定的化学变化。:底物在此发生一定的化学变化。(三)活性中心的特点三)活性中心的特点:1、仅为酶体积的很小部分;仅为酶体积的很小部分;2 2、具有一定的空间构象;、具有一定的空间构象;3 3、S S与与E E靠次级键结合;靠次级键结合;4 4、是由特定空间构象维持的一、是由特定空间构象维持的一个个裂隙裂隙。酶促反应机理酶促反应机理溶菌酶活性中心(四)研究酶活性中心的方法:(四)研究酶活性中心的方法:1、通过研究专一性底物判断确定通过研究专一性底物判断确定E E活性中心的结活性中心的结构;构;2 2、用化学修饰法共价修饰、用化学修饰法共价修饰E E分子的一些功能基团,分子的一些功能
19、基团,以查出哪些基团是活性必需的;以查出哪些基团是活性必需的;3 3、X-X-衍射直接探明活性中心。衍射直接探明活性中心。酶促反应机理酶促反应机理二、酶原的激活二、酶原的激活没有活性的酶的前体称为没有活性的酶的前体称为酶原酶原。酶原转变成有活性。酶原转变成有活性的酶的过程称为的酶的过程称为酶原的激活酶原的激活。这个过程实质上是。这个过程实质上是酶酶活性部位形成和暴露的过程活性部位形成和暴露的过程。在在组织细胞中,某些酶以酶原的形式存在,可组织细胞中,某些酶以酶原的形式存在,可保护分泌这种酶的组织细胞不被水解破坏保护分泌这种酶的组织细胞不被水解破坏。胰蛋白酶的激活胰蛋白酶的激活缬缬 天天 天天天
20、天天天赖赖 异异异异缬缬 甘甘组组S SS S丝丝丝丝S SS S肠激酶(激活作用)肠激酶(激活作用)肠激酶(激活作用)肠激酶(激活作用)缬缬 天天 天天天天天天赖赖异异异异甘甘 组组SS丝丝丝丝缬缬SS活性中心活性中心活性中心活性中心胰胰胰胰蛋蛋蛋蛋白白白白酶酶酶酶原原原原胰胰胰胰蛋蛋蛋蛋白白白白酶酶酶酶提问:为什么不直接以酶形式存在呢提问:为什么不直接以酶形式存在呢?答案:保护正常组织不受伤害。答案:保护正常组织不受伤害。活性部位三、三、同工酶同工酶(isoenzymeisoenzyme)能催化相同的化学反应,但在蛋白质分子的结能催化相同的化学反应,但在蛋白质分子的结构、理化性质和免疫性能
21、等方面都存在明显差异的构、理化性质和免疫性能等方面都存在明显差异的一组酶。一组酶。乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶(LDH)MHMM MMM4HMMMM3HMMHHM2H2MHHHMH3HHHHH4它们存在于生物的同一种属或同一个体的不同组织、甚至同一组织、同一细胞中;它们存在于生物的同一种属或同一个体的不同组织、甚至同一组织、同一细胞中;多为寡聚体。多为寡聚体。乳酸脱氢乳酸脱氢酶(酶(LDHLDH)l它它由四个亚基组成,其中有两种由四个亚基组成,其中有两种亚基:亚基:H H(心肌心肌型)和型)和M M(骨骼肌型);骨骼肌型);l这两种亚基以不同的比例组合,形成五种同这两种亚基以不同的比例组合,形成五种同
22、工酶:工酶:H H4 4、H H3 3M M、H H2 2M M2 2、HMHM3 3、M M4 4l它们分布于不同器官中,催化乳酸和丙酮酸它们分布于不同器官中,催化乳酸和丙酮酸之间的互变反应,但与乳酸和丙酮酸的亲和之间的互变反应,但与乳酸和丙酮酸的亲和力不同。力不同。乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶l每种组织每种组织LDHLDH同工酶谱具有特定的相对百分同工酶谱具有特定的相对百分率,若某一组织发生病变,必将释放其中率,若某一组织发生病变,必将释放其中LDHLDH同工酶到血液中,导致血清酶谱的变化,同工酶到血液中,导致血清酶谱的变化,这些变化常常是一这些变化常常是一特定疾病特定疾病或该疾病特定阶或该疾病特
23、定阶段的特征。段的特征。血清血清LDHLDH同工酶酶谱的变化规律同工酶酶谱的变化规律l心心脏脏疾疾病病 LDHLDH1 1及及LDHLDH2 2上上升升,LDHLDH3 3及及 LDHLDH4 4下降。下降。l急急性性肝肝炎炎 LDHLDH5 5明明显显升升高高,随随病病情情好好转转 而逐渐恢复正常。而逐渐恢复正常。l慢慢性性肝肝炎炎 一一般般处处于于正正常常范范围围,部部分分病例可见病例可见LDHLDH5 5有所升高。有所升高。l肝硬肝硬变变 LDHLDH5 5,LDH,LDH1 1和和LDHLDH3 3均升高。均升高。同工酶的性质同工酶的性质l由于同工酶一级结构的不同,因此分子由于同工酶一
24、级结构的不同,因此分子量量、pIpI、KmKm、物理化学性质、免疫性质、物理化学性质、免疫性质、电泳行为等方面都表现出差异。电泳行为等方面都表现出差异。l可以用电泳的方法对它们进行分离。可以用电泳的方法对它们进行分离。四、四、抗体酶抗体酶既是抗体又具有催化功能的蛋白质既是抗体又具有催化功能的蛋白质.本质是本质是免疫球蛋白免疫球蛋白(immunologlobulins)人工的方法使其获得了酶的属性,所以又称人工的方法使其获得了酶的属性,所以又称为为催化性抗体催化性抗体(catalytic antibody)。抗体蛋白的特性抗体蛋白的特性l酶酶与与抗抗体体这这两两种种蛋蛋白白质质之之间间尽尽管管功
25、功能能不不同同,但但它它们们与与各各自自的的配配基基(酶酶-底底物物、抗抗体体-抗抗原原)的的结结合合特特性性,如如结结合合方方式式、动动力力学学过过程程等等都都非非常常相相似。似。l从从2020世世纪纪6060年年代代起起,有有人人开开始始了了对对抗抗体体进进行行修修饰饰,并,并使其获得酶的属性使其获得酶的属性的研究。的研究。核酶(核酶(RibozymeRibozyme):):具催化活性的具催化活性的RNARNA。核酶的发现核酶的发现:1982 1982年年CechCech等发现四膜虫等发现四膜虫26S 26S rRNArRNA前体具有前体具有自我剪接自我剪接(self-splicing)(
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