超分子化学的相关概念ppt课件.ppt
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1、Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程课程特点:1、内容较新;(80年代初),而无机有机则为年代初),而无机有机则为19世纪初世纪初2、偏重材料;3、开设该课程内容院校少;(教材,教课体系教材,教课体系)4、较多内容和现在研究热点相关5、内容多,无法涉入很深Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程考试形式(闭卷)题目类型:选择填空名词解释化合物命名简答综合题无计算题,
2、重在大家对相关知识的了解,理解Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程第七章 超分子化学的相关概念 Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程参考书目:1)超分子化学超分子化学,英英 J.W.斯蒂德,斯蒂德,J.L.阿特伍德著,赵耀鹏等译,化学工业出版社,阿特伍德著,赵耀鹏等译,化学工业出版社,2006年年2)超分子化学超分子化学:概论和展望概论和展望,Jean-Mari
3、eLehn著,沈兴海等译,北京大学出版社,著,沈兴海等译,北京大学出版社,2002年年3)超分子层状结构:组装与功能超分子层状结构:组装与功能沈家骢等著,科学出版社,北京,沈家骢等著,科学出版社,北京,2004Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程基本要求:1、超分子化学的基本概念,特点以及其所包含的研究内容;2、理解超分子化学和普通化学之间的关系;3、重点理解超分子化学中的各种作用力与普通化学中存在的作用力的异同。Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱
4、机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程生命中的超分子化学的几个典型例子生命中的超分子化学的几个典型例子Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程1、DNA中碱基对氢键作用中碱基对氢键作用腺嘌呤胸腺嘧啶鸟嘌呤胞核嘧啶没没有有别别的的结结合合方方式式存存在在腺嘌呤胸腺嘧啶鸟嘌呤胞核嘧啶Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程
5、(2)膜电位人体从食物中获得的能量以三磷酸腺苷(ATP)化学键能的形式储存起来,人体能量存储和释放均和碱金属-(三磷酸腺苷)ATP酶有关H2PO4-+Mg2+G0=-35KJ/molATPADP图示ATP释放能量脱磷酸化生成ADP和磷酸二氢根,Mg2+起催化作用Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程细胞内外碱金属离子梯度细胞内外碱金属离子梯度 Na+/K+-ATP酶是一种膜传输酶,Na+/K+-ATP酶非常有效地将Na+从细胞内提取出来,传输到细胞外,同时,K+被传输到细胞内。因
6、此,细胞内流质有着高的K+浓度,而细胞外流质有着高的Na+浓度。细胞膜内外碱金属离子的不均衡分布是非常重要和必要的特征,将导致跨膜电位,神经细胞的信息传递就是利用跨细胞电位差。分离膜两侧分离膜两侧的的Na+和和Cl-得到电位差得到电位差?Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程(3)离子载体)离子载体 缬氨霉素对缬氨霉素对K K+有选择性是因为它们有选择性是因为它们能够自己折叠产生一个刚性的近似八面能够自己折叠产生一个刚性的近似八面体的羧基氧原子序列,作为受体恰好和体的羧基氧原子序
7、列,作为受体恰好和K K+大小相配。亲水的碳基氧原子和中心大小相配。亲水的碳基氧原子和中心K K+相互作用,引起亲脂的异丙基指向外相互作用,引起亲脂的异丙基指向外侧,形成一个主要由烷烃构成的外壳。侧,形成一个主要由烷烃构成的外壳。剩下的酰胺基就像拉链一样,利用分子剩下的酰胺基就像拉链一样,利用分子内氢键将壳关闭,确保内氢键将壳关闭,确保K K+通过细胞膜时,通过细胞膜时,封闭在亲脂的壳内。封闭在亲脂的壳内。Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程(4)血红蛋白吸收和运载氧)血红蛋白
8、吸收和运载氧 血红蛋白包含4个肌红蛋白单元。肌红蛋白单元包括一个称作Fe-原卟啉的铁卟啉络合物,铁中心键合O2的可逆性对生生命体系至关重要。Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程What is supramolecular chemistry?Where did it come from?Why does it deserve to be a field of study?Three Questions:Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能
9、,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Super StarsMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Super GirlsMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程7.1超分子化学的诞生与发展n7.1.1超分子化学的定义超分子化学的定义 从分子化学到超分子化学从分子化学到超分子化学(From molecular chemistry
10、to supramolecular chemistry)、化学是关于物质及其变化的一门科学,而生命是其最高且最化学是关于物质及其变化的一门科学,而生命是其最高且最复杂的表现形式;复杂的表现形式;II、以往的化学多是以共价键为基础以往的化学多是以共价键为基础,以分子为研究对象以分子为研究对象,可称为可称为分子化学分子化学 (molecular chemistry);原子原子+原子原子 分子(共价键结合)分子(共价键结合)Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程化学合成化学合成:通过化
11、学键的断裂和重生来创造新的物质。通过化学键的断裂和重生来创造新的物质。分子化学分子化学:分子是由原子或原子团通过共价键连接而成的,分分子是由原子或原子团通过共价键连接而成的,分子化学主要研究原子和原子团、化学键、化合物的合成、结子化学主要研究原子和原子团、化学键、化合物的合成、结构、性能和用途;构、性能和用途;化学创造了许多自然界本来就没有的物质,并且改造了原有的化学创造了许多自然界本来就没有的物质,并且改造了原有的物质世界,为现代文明的发展做出了重大贡献。迄今化学家物质世界,为现代文明的发展做出了重大贡献。迄今化学家们已经拥有(主要通过合成)超过们已经拥有(主要通过合成)超过2000万个化合
12、物,分子知万个化合物,分子知识的高度积累,新功能的持续研究,不可避免地向分子聚集识的高度积累,新功能的持续研究,不可避免地向分子聚集体(或称高级结构)领域迈进。体(或称高级结构)领域迈进。从分子化学到超分子化学从分子化学到超分子化学Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程超分子化学的定义超分子化学的定义 1978年,法国的J.M.Lehn教授模拟蛋白质螺旋结构的自组装体的研究内容,在一定程度上超越了大环与主客体化学而进入了所谓“分子工程”的领域,并进一步提出了超分子化学即“超越分子
13、的化学”的概念。(answer to question II:inspired from biology and built on the shoulders of traditional synthetic organic chemistry)III J.M.Lehn教授对超分子化学的定义如下:超分子化学是研究两种或两种以上的化学物种通过分子间的弱相互作用所形成的复杂有序而且具有特定功能体系的化学(answer to question I)the study on non-covalent&intermolecular forces and the structures created by
14、 these forces:“chemistry beyond the molecule”分子分子+分子分子 超分子(非共价键结合)超分子(非共价键结合)Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Lehn提出的超分子化学和分子化学的范畴 从结构和功能两方面阐述了分子化学和超分子化学之间的关系 Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程分子化学和超分子化学的对应关系分子化学和
15、超分子化学的对应关系项项 目目 分子化学分子化学超分子化学超分子化学结构单元结构单元原子或原子团原子或原子团合成子合成子(synthon)(synthon)具具有有组组装装能能力力的的分分子子构筑子构筑子(tacton)(tacton)结合力结合力共价键共价键非共价键非共价键 结构的实现结构的实现合成化学合成化学分子组装分子组装 结构结构分子结构分子结构超分子结构超分子结构 性能性能物理和化学性能物理和化学性能物物质质、能能量量和和信信息息传传输功能输功能Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度
16、的病理生理过程1、三位超分子化学研究方面的科学家获得、三位超分子化学研究方面的科学家获得1987年的年的Nobel化学奖化学奖美国的美国的C.J.Pederson、D.J.Cram教授;法国的教授;法国的J.M.Lehn教授教授.“for their development and use of molecules with structure-specific interactions of high selectivity”7.1.2超分子化学的发展史Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度
17、的病理生理过程1967年年C.J.Pedersen发表了关于发表了关于冠醚冠醚的合成和选择性络合碱金的合成和选择性络合碱金属离子的报告,揭示了分子和分子聚集体的形态对化学反应的属离子的报告,揭示了分子和分子聚集体的形态对化学反应的选择性起着重要的作用选择性起着重要的作用 Charles J.Pedersen:Crown EthersDibenzo-18-Crown-6Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Oxygen atoms donate a fraction of thei
18、r electron density to electron deficient species such as alkali cations:Li+,Na+,K+Q:Why did he get selectivity for different ions?Charles J.Pedersen:Crown EthersMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程“Spherand”-preorganized binding site Selectivity for Li+Na+K+D
19、onald J.Cram:Pre-organizationMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Donald J.Cram:Pre-organization Synthesized a huge series of increasingly complicated host-guest systems that bind molecules instead of just ions and eventually tries to emulate an enzyme catalyt
20、ic site.Introduces the idea of a“carcerand”-synthetic molecular(jail)cells.(分子外空穴主体)Primary contribution is to show how important preorganization is to binding strength.Shows the application of some hosts for practical application:resolution of racemic(外消旋)mixturesMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防
21、御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Jean-Marie LehnJMLs famous 2.2.2 Cryptand(穴醚)Materials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Jean-Marie Lehn:Self-Assembly3 Cu(I)2Molecular Self-Assembly“Super-Molecule”Double helical metal complexes formed by spontaneous organiz
22、ation of two linear polybipyridine ligands of suitable structure into a double by binding of specific metal ions displaying respectively tetrahedral Cu(I)coordinationgeometryMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Jean-Marie Lehn Introduced“Cryptands”-bicyclic ho
23、sts for binding ions Hosts with multiple binding sites Popularized the idea of self-assembly and produced some of the first good synthetic examples Broadened peoples perspectives on what supramolecular chemistry is and to what it may lead the way The flag bearer of supramolecular chemistry-in many w
24、ays he earned his Nobel Prize after the factMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程Answer to Question 3the next logical step in synthetic chemistry;understanding and interfacing with the biological world;nanotechnologyMaterials Chemistry II病原体侵入机体,消弱机体防御机能,破坏机体内
25、环境的相对稳定性,且在一定部位生长繁殖,引起不同程度的病理生理过程超分子化学是化学和多门学科的交叉领域超分子化学是化学和多门学科的交叉领域1)化学和生命学科的交叉化学和生命学科的交叉 在生物学中在生物学中,生命的最小单位是细胞生命的最小单位是细胞,而与生命现象有关的而与生命现象有关的 功能的基本单位是超分子体系功能的基本单位是超分子体系.这些超分子体系是具有多种纳米尺寸结构域的生物大分子这些超分子体系是具有多种纳米尺寸结构域的生物大分子 与含有多个纳米尺度亚基的酶构建而成与含有多个纳米尺度亚基的酶构建而成.这种体系常常具有很强的自组装性质这种体系常常具有很强的自组装性质.在超分子水平上的生物学
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