第五章微生物的代谢.ppt
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1、第五章第五章 微生物微生物的新陈代谢的新陈代谢新陈代谢(新陈代谢(metabolism)简称代谢,是指发生在活细胞中的各种简称代谢,是指发生在活细胞中的各种分解代谢分解代谢(catabolismcatabolism)和和合成代谢(合成代谢(anabolismanabolism)的总和的总和分解代谢分解代谢 是指复杂的有机物分子通过分解代谢酶系的是指复杂的有机物分子通过分解代谢酶系的催化,产生催化,产生简单分子、腺苷三磷酸(简单分子、腺苷三磷酸(ATPATP)形式的)形式的能量和还原力能量和还原力(或称还原当量,一般用(或称还原当量,一般用HH来表示)来表示)的作用;的作用;合成代谢合成代谢初级
2、代谢:初级代谢:营养物质转变为机体的结构物质或对营养物质转变为机体的结构物质或对机体具有生理活性作用的物质或为机体生长提供机体具有生理活性作用的物质或为机体生长提供能量的一类代谢类型。能量的一类代谢类型。次级代谢:次级代谢:存在于某些生物中并在它们的一定生存在于某些生物中并在它们的一定生长时期出现的一类代谢类型。长时期出现的一类代谢类型。第一节第一节 微生物的能量代谢微生物的能量代谢能量代谢是新陈代谢的核心问题能量代谢是新陈代谢的核心问题最初能源最初能源有机物有机物化能异养菌化能异养菌日日 光光光能营养菌光能营养菌无机物无机物化能自养菌化能自养菌通用能源通用能源(ATP)一、化能异养微生物的生
3、物氧化和产能一、化能异养微生物的生物氧化和产能 生物氧化就是发生在活细胞内的一系列产能性氧化反应生物氧化就是发生在活细胞内的一系列产能性氧化反应生物氧化的过程可分脱氢(或电子)、递氢(或生物氧化的过程可分脱氢(或电子)、递氢(或电子)和受氢(或电子)三个阶段电子)和受氢(或电子)三个阶段生物氧化的功能则有产能(生物氧化的功能则有产能(ATPATP)、产还原力)、产还原力HH和产小分子中间代谢物三种和产小分子中间代谢物三种 (有氧(有氧)呼吸呼吸生物氧化的类型:生物氧化的类型:无氧呼吸无氧呼吸 发酵发酵(一)、底物脱氢的四条主要途径(一)、底物脱氢的四条主要途径 每条途径既有脱氢、产能的功能,又
4、有产多种形式每条途径既有脱氢、产能的功能,又有产多种形式小分子中间代谢物以供合成反应作原料的功能小分子中间代谢物以供合成反应作原料的功能 HMP1.EMP途径(途径(Embdem-Meyerhof-Parnas Pathway)EMPEMP途径又称糖酵解途径(途径又称糖酵解途径(glycolysisglycolysis)或己糖)或己糖二磷酸途径(二磷酸途径(hexosediphosphatehexosediphosphate pathway pathway)可概括成两个阶段(耗能和产能)、三种产物可概括成两个阶段(耗能和产能)、三种产物(NADHNADHH H+、丙酮酸和、丙酮酸和ATPATP
5、)和)和1010个反应步骤个反应步骤 己糖激酶己糖激酶磷酸己糖异构酶磷酸己糖异构酶磷酸果糖激酶磷酸果糖激酶果糖二磷酸醛缩酶果糖二磷酸醛缩酶丙糖磷酸丙糖磷酸异构酶异构酶甘油醛甘油醛-3-磷磷酸脱氢酶酸脱氢酶磷酸甘油磷酸甘油酸激酶酸激酶磷酸甘油酸磷酸甘油酸变位酶变位酶烯醇烯醇酶酶丙酮酸激丙酮酸激酶酶磷酸二羟丙酮磷酸二羟丙酮EMP途径途径 2NADH2NADHH H+在有氧条件下可经呼吸链的氧化磷酸化反在有氧条件下可经呼吸链的氧化磷酸化反应产生应产生6ATP6ATP,在无氧条件下,则可还原丙酮酸产生乳酸或,在无氧条件下,则可还原丙酮酸产生乳酸或还原丙酮酸的脱羧产物还原丙酮酸的脱羧产物乙醛而产生乙醇乙
6、醛而产生乙醇 底物水平磷酸化底物水平磷酸化是指底物在氧化过程中产生某些比是指底物在氧化过程中产生某些比ATPATP水解时放出更水解时放出更多自由能的高能化合物中间体,这种高能化合物多自由能的高能化合物中间体,这种高能化合物可以将键能交给可以将键能交给ADPADP使之磷酸化,产生使之磷酸化,产生ATPATP。EMPEMP途径:途径:1 1,3-3-二磷酸甘油酸二磷酸甘油酸 磷酸烯醇式丙酮酸磷酸烯醇式丙酮酸生理功能与特点生理功能与特点F供应供应ATPATP形式的能量和形式的能量和NADHNADH2 2形式的还原力;形式的还原力;F连接其他几个重要代谢途径的桥梁;连接其他几个重要代谢途径的桥梁;F为
7、生物合成提供多种中间代谢物;为生物合成提供多种中间代谢物;F通过逆向反应可进行多糖合成;通过逆向反应可进行多糖合成;F整个整个EMPEMP途径的产能效率是很低的,即每一个葡萄途径的产能效率是很低的,即每一个葡萄糖分子仅净产糖分子仅净产2 2个个ATPATP。2 2、HMPHMP途径途径(hexosemonophosphatehexosemonophosphate pathway)pathway)已糖一磷酸途径,有时也称戊糖磷酸途已糖一磷酸途径,有时也称戊糖磷酸途径径.(.(碳架重排途径碳架重排途径)这是一条葡萄糖不经这是一条葡萄糖不经EMPEMP途径和途径和TCATCA途途径而得到彻底氧化,并
8、能产生大量径而得到彻底氧化,并能产生大量NADPHNADPHH H+形式的还原力和多种重要中间代谢物的代形式的还原力和多种重要中间代谢物的代谢途径。谢途径。无无氧氧参参与与HMPHMP途径途径总式总式6 ATP 12NADPH+H+呼吸链呼吸链 36ATP 35ATP6C6 6C5 5C6 6CO2HMPHMP途径的重要意义途径的重要意义 为核苷酸和核酸的生物合成提供戊糖为核苷酸和核酸的生物合成提供戊糖-磷酸;磷酸;产生大量的产生大量的NADPHNADPH2 2形式的还原剂;形式的还原剂;通过通过EMPEMP途径与本途径在果糖途径与本途径在果糖-1-1,6-6-二磷酸和甘油二磷酸和甘油醛醛-3
9、-3-磷酸处的连接来加以调剂对戊糖的需要;磷酸处的连接来加以调剂对戊糖的需要;作为自养微生物固定作为自养微生物固定COCO2 2的中介(的中介(CalvinCalvin循环);循环);由于在反应中存在着由于在反应中存在着C C3 3C C7 7的各种糖,使具有的各种糖,使具有HMPHMP途径的微生物的碳源利用范围更广;途径的微生物的碳源利用范围更广;通过本途径而产生的重要发酵产物很多,例如核通过本途径而产生的重要发酵产物很多,例如核苷酸、若干氨基酸。苷酸、若干氨基酸。3 3、EDED途径(途径(Entner-DoudoroffEntner-Doudoroff pathway pathway)又
10、称为2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡糖酸(KDPG)裂解途径。ED途径是少数缺乏完整EMP途径的微生物所具有的一种替代途径,在其他生物中还没有发现。特点是:葡萄糖只经过4步反应即可快速获得由EMP途径须经10步才能获得的丙酮酸。在在EDED途径中的关键反应是途径中的关键反应是2-2-酮酮-3-3-脱氧脱氧-6-6-磷酸磷酸葡萄糖酸葡萄糖酸的裂解的裂解 。EDED途径利用葡萄糖的反应步骤简单,产能效率途径利用葡萄糖的反应步骤简单,产能效率低(低(1 1分子葡萄糖仅产分子葡萄糖仅产1 1分子分子ATPATP,仅为,仅为EMPEMP途径之半)途径之半),反应中有一个反应中有一个6 6碳的关键中间代谢物碳
11、的关键中间代谢物KDPG KDPG(2-2-酮酮-3-3-脱氧脱氧-6-6-磷酸葡萄糖酸),磷酸葡萄糖酸),两分子丙酮酸来两分子丙酮酸来源不同。源不同。所产生的丙酮酸对微好氧菌可脱羧成乙醛,所产生的丙酮酸对微好氧菌可脱羧成乙醛,乙醛进一步被乙醛进一步被NADHNADH2 2还原为乙醇,称作还原为乙醇,称作细菌酒精发细菌酒精发酵。酵。EDED途径途径细菌酒精发酵细菌酒精发酵优点:l代谢速率高;l产物转化率高;l菌体生成量少;l代谢副产物少;l发酵温度高;l不定期供氧。缺点:l生长pH较高,易污染杂菌;l对乙醇的耐受力较低。意义:意义:EDED途途径径是是少少数数缺缺乏乏完完整整EMPEMP途途径
12、径的的微微生生物物所所具具有有的的一一种种替替代代途径;途径;通通过过与与EMPEMP途途径径、HMPHMP途途径径和和TCATCA循循环环等等代代谢谢途途径径相相连连,相相互互协协调调满满足足微微生生物物对对能能量量、还还原原力力和和不不同同中中间代谢物的需要。间代谢物的需要。4 4、三羧酸循环(、三羧酸循环(tricarboxylicacidtricarboxylicacid cycle cycle)又称又称TCATCA循环循环 它在绝大多数异养微生物的氧化性(呼吸)代谢它在绝大多数异养微生物的氧化性(呼吸)代谢中起着关键性的作用中起着关键性的作用 在原核生物例如细菌中,大多数在原核生物例
13、如细菌中,大多数TCATCA循环酶都存循环酶都存在于细胞质内。在于细胞质内。TCA循环的特点循环的特点l必须在有氧条件下进行;l产能效率极高(15ATP);l位于分解代谢和合成代谢的枢纽地位。(二)、递氢和受氢(二)、递氢和受氢 根据递氢特别是受氢过程中根据递氢特别是受氢过程中氢受体性质氢受体性质的不同,的不同,可以把生物氧化区分成可以把生物氧化区分成呼吸(有氧呼吸)、呼吸(有氧呼吸)、无氧呼无氧呼吸吸和和发酵发酵三种类型三种类型 1、呼吸(、呼吸(respiration)最普遍和最重要的生物氧化方式 其特点是底物按常规方式脱氢后,经完整的其特点是底物按常规方式脱氢后,经完整的呼吸链(又称电子
14、传递链)递氢,最终由分子氧呼吸链(又称电子传递链)递氢,最终由分子氧接受氢并产生水和释放能量。接受氢并产生水和释放能量。呼吸链呼吸链定义:定义:是指位于原核生物细胞膜上或真核生物线粒是指位于原核生物细胞膜上或真核生物线粒体膜上的、由一系列氧化还原势呈梯度差的、链体膜上的、由一系列氧化还原势呈梯度差的、链状排列的氢(或电子)传递体。状排列的氢(或电子)传递体。功能:功能:l把氢或电子从低氧化还原势的化合物处传递到高把氢或电子从低氧化还原势的化合物处传递到高氧化还原势的分子氧或其他无机、有机氧化物,氧化还原势的分子氧或其他无机、有机氧化物,并使它们还原。并使它们还原。l在氢或电子的传递过程中,在氢
15、或电子的传递过程中,通过与通过与氧化磷酸化氧化磷酸化反反应相偶联,就可产生应相偶联,就可产生ATPATP形式的能量。形式的能量。氧化磷酸化氧化磷酸化 又称又称电子传递磷酸化:电子传递磷酸化:呼吸链的递氢(或电呼吸链的递氢(或电子)和受氢过程与磷酸化反应相偶连并产生子)和受氢过程与磷酸化反应相偶连并产生ATPATP的的作用。作用。氧化磷酸化产生氧化磷酸化产生ATP的机制的机制 化学渗透学说化学渗透学说化学渗透学说(化学渗透学说(chemiosmoticchemiosmotic hypothesis hypothesis)形成质子梯度差形成质子梯度差 通过呼吸链酶系的作用,将底物分子上的质通过呼吸
16、链酶系的作用,将底物分子上的质子从膜的内侧传递至外侧,从而造成了质子在膜子从膜的内侧传递至外侧,从而造成了质子在膜的两侧分布的不均衡,的两侧分布的不均衡,这种梯度差是产生这种梯度差是产生ATPATP能量能量的来源的来源;ATP能量的产生能量的产生 可通过可通过ATPATP酶的逆反应,把质子从膜的外侧再酶的逆反应,把质子从膜的外侧再输回到内侧,结果一方面消除了质子梯度差,同输回到内侧,结果一方面消除了质子梯度差,同时就合成了时就合成了ATPATP。呼吸链的组成呼吸链的组成 组成呼吸链的氢或电子的载体,除醌类外,都组成呼吸链的氢或电子的载体,除醌类外,都是一些含有辅酶或辅基的酶。是一些含有辅酶或辅
17、基的酶。每种辅酶或辅基在氧化与还原条件下,都有其每种辅酶或辅基在氧化与还原条件下,都有其特定的吸收光谱值,因此可通过分光光度计来确定特定的吸收光谱值,因此可通过分光光度计来确定呼吸链的组分及其所处的状态。呼吸链的组分及其所处的状态。呼吸链的主要组分都是类似的,一般为NADNAD(P P)FP FP FeFeS S CoQCoQ CytCyt b b CytCyt c c CytCyt a a CytCyt a a3 3 NADNAD和和NADPNADP 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADNAD)烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPNADP)某些脱氢酶含有
18、某些脱氢酶含有NADNAD+或或NADPNADP+形式的辅酶,能形式的辅酶,能从还原性底物上移出从还原性底物上移出1 1个氢离子(质子)和个氢离子(质子)和2 2个电个电子,而变成还原态的子,而变成还原态的NADNAD(P P)H+HH+H+。FADFAD和和FMNFMN 黄素腺嘌呤二核苷酸(黄素腺嘌呤二核苷酸(FADFAD)黄素单核苷酸(黄素单核苷酸(FMNFMN)FADFAD和和FMNFMN是一类称为黄素蛋白(是一类称为黄素蛋白(FPflavoproteinFPflavoprotein)的脱氢酶的辅基的脱氢酶的辅基 FADFAD(FMN FMN)+2H =FADH+2H =FADH2 2(
19、FMNHFMNH2 2)Fe-SFe-S 铁硫蛋白(铁硫蛋白(Fe-SFe-S)这类小分子蛋白的辅基是其分子中含铁硫的这类小分子蛋白的辅基是其分子中含铁硫的中心部分;中心部分;铁硫蛋白存在于呼吸链的几种酶复合体中,铁硫蛋白存在于呼吸链的几种酶复合体中,参与膜上的参与膜上的电子传递电子传递;在呼吸链中的在呼吸链中的“2Fe+2S”2Fe+2S”中心每次仅能传递中心每次仅能传递一个电子。一个电子。泛醌(辅酶泛醌(辅酶Q Q)一类脂溶性的氢载体;一类脂溶性的氢载体;广泛存在于真核生物线粒体内膜和革兰氏阴性细菌广泛存在于真核生物线粒体内膜和革兰氏阴性细菌的细胞膜上;的细胞膜上;在呼吸链中的功能是在呼吸
20、链中的功能是传递氢传递氢;在呼吸链中,醌类的含量比其他组分多在呼吸链中,醌类的含量比其他组分多10101515倍;倍;其作用是收集来自呼吸链各种辅酶和辅基所输出的其作用是收集来自呼吸链各种辅酶和辅基所输出的氢(还原力氢(还原力HH)的作用,然后再将它们传递给细)的作用,然后再将它们传递给细胞色素系统。胞色素系统。细胞色素系统细胞色素系统 细胞色素系统位于呼吸链的后端,它们的功能是细胞色素系统位于呼吸链的后端,它们的功能是传递电子传递电子而不是传递氢;而不是传递氢;它们只从泛醌中接受电子,同时将同等数目的质它们只从泛醌中接受电子,同时将同等数目的质子推到线粒体膜(真核生物)或细胞膜(原核生子推到
21、线粒体膜(真核生物)或细胞膜(原核生物)外的溶液中;物)外的溶液中;细胞色素按其吸收光谱和氧还电位的差别可分成细胞色素按其吸收光谱和氧还电位的差别可分成多种类型,如多种类型,如cyt.acyt.a,cyt.a3cyt.a3,cyt.bcyt.b,cyt.ccyt.c和和cyt.ocyt.o等;等;它们都有它们都有血红素血红素作为辅基,而血红素则通过其分作为辅基,而血红素则通过其分子中心子中心铁原子铁原子的价电荷的变化而传递电子;的价电荷的变化而传递电子;细胞色素细胞色素a a3 3即即细胞色素氧化酶细胞色素氧化酶,它是许多微生物,它是许多微生物的末端氧化酶,能催化的末端氧化酶,能催化4 4个电
22、子还原氧的反应,从个电子还原氧的反应,从而把氧分子激活。而把氧分子激活。P/O比(比(ATPmol/Omol)表示呼吸链氧化磷酸化效率的高低。表示呼吸链氧化磷酸化效率的高低。例:例:以异柠檬酸或苹果酸为底物时,动物线粒体能由以异柠檬酸或苹果酸为底物时,动物线粒体能由2H2H产生产生3ATP3ATP,P/OP/O比为比为3 3;以琥以琥珀珀酸为底物时,其脱氢酶辅基是酸为底物时,其脱氢酶辅基是FPFP,2H2H只产生只产生2ATP2ATP,P/OP/O比为比为2 2。ATP synthase原核生物细胞膜上的呼吸链有几个主要特点原核生物细胞膜上的呼吸链有几个主要特点(1)氧还载体的取代性强:如Cy
23、t.a3可被Cyt.aa3、Cyt.o或Cyt.d所取代等;(2)氧还载体的数量可增可减,如E.coli的细胞色素就有9种以上;(3)有分支呼吸链的存在:呼吸链后端细胞色素系统中就有许多分支类型。2 2、无氧呼吸(、无氧呼吸(anaerobic respirationanaerobic respiration)又称厌氧呼吸,指一类呼吸链末端的氢受体为外源无机氧化物的生物氧化。特点是底物经常规途径脱氢后,经部分呼吸链递氢,最终由氧化态的无机物或有机物受氢,并完成氧化磷酸化产能反应。硝酸盐呼吸(硝酸盐呼吸(nitraterespirationnitraterespiration)NONO3 3-+
24、2H+2H+2e+2e-NO NO2 2-+H+H2 2O NO N2 2 又称反硝化作用(又称反硝化作用(denitrificationdenitrification)能进行硝酸盐呼吸的都是一些兼性厌氧微生物。能进行硝酸盐呼吸的都是一些兼性厌氧微生物。硝酸盐在微生物生命活动中具有两种功能硝酸盐在微生物生命活动中具有两种功能 :l一是在有氧或无氧条件下所进行的同化性硝酸盐还原作用;一是在有氧或无氧条件下所进行的同化性硝酸盐还原作用;l二是在无氧条件下,微生物利用硝酸盐作为呼吸链的最终氢二是在无氧条件下,微生物利用硝酸盐作为呼吸链的最终氢受体,受体,把它还原成亚硝酸、把它还原成亚硝酸、NONO、
25、N N2 2O O、直至、直至N N2 2的过程,称为异化的过程,称为异化性硝酸盐还原作用,也称硝酸式盐呼吸。性硝酸盐还原作用,也称硝酸式盐呼吸。硫酸盐呼吸(硫酸盐呼吸(sulfaterespirationsulfaterespiration)把经呼吸链传递的氢交给硫酸盐这类末端氢把经呼吸链传递的氢交给硫酸盐这类末端氢受体的一种厌氧呼吸。受体的一种厌氧呼吸。这是一种异化性的硫酸盐还原作用。这是一种异化性的硫酸盐还原作用。硫酸盐还原的最终产物是硫酸盐还原的最终产物是H H2 2S S,自然界中的大,自然界中的大多数多数H H2 2S S是由这一反应产生的。是由这一反应产生的。例:脱硫弧菌例:脱硫
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