生物化学与分子生物学 第13章 损伤、修复和重组.ppt
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1、第四章第四章 DNA损伤、修复损伤、修复与重组与重组 DNAdamage、repairandrecombinationDNA通过半保留复制的机制保证代谢上的稳通过半保留复制的机制保证代谢上的稳定性。但稳定是相对的,从进化的角度上看,定性。但稳定是相对的,从进化的角度上看,DNA是处于不断的变异和发展之中。是处于不断的变异和发展之中。造成造成DNA变异的因素主要有:变异的因素主要有:突变突变(mutation)基因重组基因重组(gene recombination)染色体畸变染色体畸变第一节第一节 突变突变突变突变(mutation):DNA碱基序列水平上发生的永久碱基序列水平上发生的永久性的、
2、可遗传的变异。性的、可遗传的变异。一、突变的类型一、突变的类型根据突变发生的原因:根据突变发生的原因:u自发突变自发突变(spontaneous):):由于外界环境的自然由于外界环境的自然作用或生物体内生理生化变化而诱发的突变作用或生物体内生理生化变化而诱发的突变(碱基错(碱基错配(复制)、碱基之间的互变异构、碱基脱氨基、脱嘌呤配(复制)、碱基之间的互变异构、碱基脱氨基、脱嘌呤或脱嘧啶、活性氧引起的诱变)或脱嘧啶、活性氧引起的诱变)u人工诱变人工诱变(Induced mutations):由于人工特设的诱发由于人工特设的诱发因素而引起的突变。因素而引起的突变。根据突变的机理:根据突变的机理:v
3、碱基对的置换(碱基对的置换(substitution)或点突变(或点突变(point mutation):):一个单一碱基的改变。一个单一碱基的改变。转换转换(transition):):DNA分子中的嘌呤为另一分子中的嘌呤为另一种种 嘌呤或嘧啶被另一种嘧啶取代而引起的突变;嘌呤或嘧啶被另一种嘧啶取代而引起的突变;颠换颠换(transversion):):DNA分子中嘌呤被嘧分子中嘌呤被嘧啶所取代或嘧啶被嘌呤所取代而引起的突变;啶所取代或嘧啶被嘌呤所取代而引起的突变;transitionPyPyPuPutransversionPyPu点突变的效应:点突变的效应:无义突变(无义突变(nonsen
4、se):使氨基酸密码子转变为终止密码使氨基酸密码子转变为终止密码子(子(UGA、UAG、UAA)的突变的突变.错义突变(错义突变(missense):三联体密码子发生突变导致蛋白三联体密码子发生突变导致蛋白质中原来的氨基酸被另一氨基酸取代质中原来的氨基酸被另一氨基酸取代同义突变(同义突变(samesense):虽然三联体密码子发生突变,虽然三联体密码子发生突变,但仍然编码同一种但仍然编码同一种AA。v插入或缺失突变(插入或缺失突变(insertions/deletions):DNA分子中插入或缺失一个或少数几个核苷酸分子中插入或缺失一个或少数几个核苷酸突变效应:突变效应:插入或缺失几个氨基酸插
5、入或缺失几个氨基酸:移码突变(移码突变(frameshift):DNA分子中插入或缺分子中插入或缺失非失非3n个核苷酸,使整个阅读框改变而引起的突个核苷酸,使整个阅读框改变而引起的突变。变。1.2physicalandchemicalmutagens1.2.1physicalmutagens包括包括X-、-、-、-、UV 1.2.1.1 direct functions:ionizing radiation(电离射线电离射线):使):使DNA失去电子,失去电子,引起引起DNA发生广泛的化学变化;发生广泛的化学变化;nonionizing radiation(非电离射线非电离射线):引起原子振引
6、起原子振动或促使电子进入较高能级,导致形成新的化学键。动或促使电子进入较高能级,导致形成新的化学键。如如UV可使可使DNA形成胸腺嘧啶二聚体。形成胸腺嘧啶二聚体。二、导致诱变的理化因素及其作用机制二、导致诱变的理化因素及其作用机制(一)物理诱变剂(一)物理诱变剂(physical mutagens)包括包括X-、-、-、-、UV 1、直接作用:、直接作用:u电离射线电离射线(ionizing radiation)使)使DNA失去失去电子,引起电子,引起DNA发生广泛的化学变化;发生广泛的化学变化;u非电离射线非电离射线(non)引起原子振动或促使电)引起原子振动或促使电子进入较高能级,导致形成
7、新的化学键。子进入较高能级,导致形成新的化学键。如如UV可使可使DNA形成胸腺嘧啶二聚体形成胸腺嘧啶二聚体2、间接作用:辐射首先作用于遗传物质以外的物质,、间接作用:辐射首先作用于遗传物质以外的物质,使这些物质发生变化,然后由这些变化的物质再作使这些物质发生变化,然后由这些变化的物质再作用于遗传物质,引起一系列的遗传学效应。用于遗传物质,引起一系列的遗传学效应。Deamination-oxidationU.V.CU AU.V.H2O H+OH-C C A(二)化学诱变因素(二)化学诱变因素(chemical)碱基类似物(碱基类似物(baseanalog)碱基修饰剂(碱基修饰剂(basemodi
8、fier)嵌入染料(嵌入染料(intercalatingdye)碱基类似物(碱基类似物(baseanalogs)5-BrU:T类似物类似物BrBr转换转换5BrU的酮式和烯醇式具有不同的配对特性的酮式和烯醇式具有不同的配对特性AT5-BrU(k)G5-BrU(e)CmispairingmispairingTA5-BrU(k)GC5-BrU(e)AGGAReplicationerrorIncorporationerror5-BrU(k)5-BrU(e)2氨基嘌呤的不同配对特性氨基嘌呤的不同配对特性AP:A类似物,类似物,ATGCGCAT亚硝酸(亚硝酸(Nitrous acid,NA):):脱氨基
9、作用;脱氨基作用;ACGICU=AX=CdeaminationHNO2羟胺(羟胺(NH2OH,HA):特殊的点突变诱变剂,特殊的点突变诱变剂,使使CHC(4羟胺胞嘧啶羟胺胞嘧啶)A,结果诱发结果诱发GCAT的转换的转换碱基修饰剂(碱基修饰剂(basemodifier)ATGCGCAT烷化剂(烷化剂(alkylating agents):一类带有一类带有单单/多个不稳定的烷基,可将烷基加入到核酸上多个不稳定的烷基,可将烷基加入到核酸上各种位点的亲电化学试剂。各种位点的亲电化学试剂。EMS(Ethylmethanesulfonate)已基甲烷磺酸已基甲烷磺酸CH3-S-O-CH2CH3OOMMS(
10、methylmethanesulfonate)甲烷磺酸甲酯甲烷磺酸甲酯CH3-S-O-CH3OOSM(SulfurMustardsgas)硫芥)硫芥HSCH2CH2ClCH2CH2ClAO(AcridineOrange)吖啶橙吖啶橙扁平分子扁平分子EB(EthidiumBromide)溴化乙锭溴化乙锭-ATTTTTCG-TAAAAAGC-ATTTCG-TAAAGC-TAOT-ATEBTTTTCG-TA分子插入分子插入AOEB-ATTTCG-TAAAGC-ATXTTTTCG-TAXAAAAGC-X AAAAGC-吖啶染料:美国癌症研究所以吖啶分子为基础,吖啶染料:美国癌症研究所以吖啶分子为基础,
11、人工合成的一类诱变剂。人工合成的一类诱变剂。嵌入染料(嵌入染料(intercalatingdye)AT5-BrU(k)G5-BrU(e)CAG5-BrU(k)定向诱变(定向诱变(targettedmutagenesis):碱基碱基类似物类似物/碱基衍化物代替正常碱基配对后,未碱基衍化物代替正常碱基配对后,未被修复机制纠正,导致子代将错就错地复制下被修复机制纠正,导致子代将错就错地复制下去。去。三、定向诱变和不定向诱变三、定向诱变和不定向诱变不定向诱变(不定向诱变(untargetted mutagenesis):大部大部分突变都可以作为分突变都可以作为DNA修复机制的底物,进修复机制的底物,进
12、行精确修复。但有时不能用这些精确的修复行精确修复。但有时不能用这些精确的修复系统时,就会采用系统时,就会采用转移损伤转移损伤DNA合成合成(transition DNA synthesis),这是一类),这是一类会带来差错的修复。会带来差错的修复。q 遗传信息发生错误的原因:遗传信息发生错误的原因:一些理化因子作用于一些理化因子作用于DNA,改变碱基结构;改变碱基结构;DNA在复制过程中发生错配;在复制过程中发生错配;DNA重组;重组;外源基因的整合。外源基因的整合。保证遗传稳定的机制保证遗传稳定的机制-DNA修复修复第二节第二节.DNA修复(修复(DNArepairing)DNA的修复(的修
13、复(DNA repairing):):是细是细胞对胞对DNA受损伤后的一种反应,这种反受损伤后的一种反应,这种反应可能使应可能使DNA结构恢复原样,重新能执结构恢复原样,重新能执行它原来的功能;但有时并非能完全消行它原来的功能;但有时并非能完全消除除DNA的损伤,只是使细胞能够耐受这的损伤,只是使细胞能够耐受这DNA的损伤而能继续生存。的损伤而能继续生存。DNA的改变包括两类:的改变包括两类:单个碱基的改变单个碱基的改变Single base changes:双螺旋结构的异常扭曲双螺旋结构的异常扭曲Structuraldistortion非诱导修复非诱导修复诱导修复诱导修复DNA修复修复直接修
14、复直接修复切除修复切除修复重组修复重组修复错配修复错配修复光复活修复光复活修复烷基的转移烷基的转移单链断裂的重接单链断裂的重接避免差错修复避免差错修复易错修复易错修复phR471aa1、直接修复(、直接修复(directrepair)光复活修复(光复活修复(photoreactivation)-TT-AA-TT-AA-TT-AA-TT-AA-Beforereplication400nmBluelight&photo-reactivationenzyme)可见光激活可见光激活光复活修复只能修复嘧啶二聚体光复活修复只能修复嘧啶二聚体.ThepyrimidinedimerblocksDNArepli
15、cation高等哺乳动物该功能退化了。高等哺乳动物该功能退化了。例:对细菌紫外诱变或杀灭时尽量保持暗环境例:对细菌紫外诱变或杀灭时尽量保持暗环境切口的重接切口的重接:DNA连接酶(连接酶(ligase)修复。修复。烷基的转移烷基的转移:O6甲基甲基-G-甲基转移酶(甲基转移酶(MGMT),单加氧酶单加氧酶(依赖于依赖于-酮戊二酸和戊二酸和Fe2+)(AlkB)2、切除修复(、切除修复(excisionrepair)碱基切除修复(碱基切除修复(Base excision repair)U和烷基化的碱基可被糖苷酶(glycosylases)并直接从DNA上切除BeforeReplication,暗
16、修复核苷酸的切除修复(Nucleotide excision repairsystems)切除包括损伤碱基的一段序列short-patchrepair(12nt)long-patchrepair(1500)9000ntEnzymes:核酸内切酶核酸内切酶核酸外切酶核酸外切酶DNA聚合酶聚合酶DNA连接酶连接酶TheUvrsystem3-65223(3-4)5-73、重组修复(、重组修复(recombinationrepair)实质:并非修复,而是实质:并非修复,而是“稀释稀释”。DNApolymeraseligaseMCE(mismatchcorrectenzyme)3subunitsmutH
17、,L,Sdamgenem6A甲基化酶甲基化酶Scanning新生链中错配碱基新生链中错配碱基识别新生链中非识别新生链中非m6A的的GATC序列序列酶切含错配碱基的新生酶切含错配碱基的新生DNA区段区段4、错配修复(、错配修复(mismatchrepair)应急反应应急反应(SOS):由:由DNA损伤或抑制复制的处理损伤或抑制复制的处理所引起的一系列复杂的诱导效应。所引起的一系列复杂的诱导效应。SOS诱导的修复作用:诱导的修复作用:A.errorfreerepair(避免差错修复(避免差错修复):):修复过程中修复过程中错配碱基通常被切除,修复后错配碱基通常被切除,修复后DNA恢复正常。恢复正常
18、。B.error-pronerepair(易错修复(易错修复):):DNA受到严重受到严重损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种损伤、细胞处于危急状态时所诱导的一种DNA修复修复方式,修复结果只是能维持基因组的完整性,提高方式,修复结果只是能维持基因组的完整性,提高细胞的生成率,但留下的错误较多,故又称为错误细胞的生成率,但留下的错误较多,故又称为错误倾向修复倾向修复.5、诱导修复和应急反应诱导修复和应急反应Jean WeagleE.coliE.colialive 8010Mut.90%10%DamagedDNAof-phageberepairedmoreinE.coli ASOSrepairi
19、nE.colihavetobeinducedbyU.V.(A)HighfrequencymutationbySOSrepair(Error-prone)ABLexA可抑制许多基因的表达,包括修复、可抑制许多基因的表达,包括修复、recA和和lexA。RecA激活启动了激活启动了LexA的降解,进而诱导了许多基因的表达的降解,进而诱导了许多基因的表达DNAdamaged300XsignalRecA cleaves LexA SOSU.V.damageDNASignal(S.S.DNAtail/5NtS.S.DNA)机制机制RecA的功能的功能:与与S.S.DNA结合活性结合活性对少数蛋白的对少数
20、蛋白的proteinase活性活性DNA重组活性重组活性当当DNA正常复制正常复制时时(无复制受阻,无(无复制受阻,无DNA损伤,无损伤,无TTdimer)RecA不表现不表现proteinase活性活性当当DNA复制受阻复制受阻/DNAdamaged能量大量消耗能量大量消耗细胞内原少量表达的细胞内原少量表达的RecA与与S.S.DNA结合结合激活激活RecA的的proteinase活性活性修复损伤修复损伤LexA降解降解RecA高效表达高效表达300XSOSopen当当DNA复制复制度过难关度过难关后后SOSrepair是一种是一种error-prone极强的修复机制极强的修复机制是进化中形
21、成的是进化中形成的“竭尽全力,治病救人竭尽全力,治病救人”的措的措施(正常状态下,施(正常状态下,SOS是关闭的)是关闭的)RecA很快消失很快消失lexAgeneonSOSoff6、DNA损伤修复的重要性损伤修复的重要性人类人类遗传性疾病遗传性疾病已经发现已经发现4000多种,其中不少多种,其中不少与与DNA修复缺陷修复缺陷有关,这些有关,这些DNA修复缺陷细胞表现修复缺陷细胞表现为为对辐射和致癌剂的敏感性增加对辐射和致癌剂的敏感性增加;着色性干皮病着色性干皮病(xeroderma pigmentosum):第一个被发现的第一个被发现的DNA修复缺陷遗传病,患者皮肤和修复缺陷遗传病,患者皮肤
22、和眼睛对阳光特别是眼睛对阳光特别是UV十分敏感,暴光部位皮肤干燥十分敏感,暴光部位皮肤干燥脱屑、色素沉着、容易溃疡、皮肤癌发病率高,常脱屑、色素沉着、容易溃疡、皮肤癌发病率高,常伴有神经系统障碍,智力低下等。病人的伴有神经系统障碍,智力低下等。病人的细胞对嘧细胞对嘧啶二聚体和烷基化的清除能力降低啶二聚体和烷基化的清除能力降低。遗传性非息肉结肠癌遗传性非息肉结肠癌(HNPCC)是由于是由于DNA错配修复有缺陷错配修复有缺陷而造成的(其中一而造成的(其中一种错配修复酶突变丢失)。该遗传病表种错配修复酶突变丢失)。该遗传病表现为:家族成员是癌症高发群,许多成现为:家族成员是癌症高发群,许多成员患结肠
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