遗传密码蛋白质合成以及转运PPT课件.ppt
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1、关于遗传密码蛋白质的合成及转运第一张,PPT共六十九页,创作于2022年6月遗传密码遗传密码(genetic code):(genetic code):DNA DNA(或(或RNARNA)中的核苷)中的核苷酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系称酸序列与蛋白质中氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码。为遗传密码。密码子密码子(codon)(codon):mRNAmRNA上每上每3 3个相邻的核苷酸编码蛋个相邻的核苷酸编码蛋白质多肽链中的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为白质多肽链中的一个氨基酸,这三个核苷酸就称为一个密码子或三联体一个密码子或三联体(triplet)(triplet)密码。密码。第
2、二张,PPT共六十九页,创作于2022年6月第一节第一节 遗传密码的破译遗传密码的破译l19541954年年GamovGamov确认核酸分子中三个碱基决定一个氨基酸。确认核酸分子中三个碱基决定一个氨基酸。l19611961年年CrickCrick等用遗传学方法等用遗传学方法,通过研究通过研究T4T4噬菌体噬菌体 IIII位点的位点的两个基因变异,证实三联体密码子学说是正确的,并且两个基因变异,证实三联体密码子学说是正确的,并且三联三联体密码是体密码是:非重叠、连续的、无标点的非重叠、连续的、无标点的。缺失或插入核苷酸引起三联体密码的改变缺失或插入核苷酸引起三联体密码的改变CAT CAT CAT
3、 CAT CAT CATCAT CAC ATC ATC ATC ATCCAT CAC AXT CAT CAT CAT CAX TXC ATX CAT CAT CAT-1-1,+1+3第三张,PPT共六十九页,创作于2022年6月 1.1.19611961年美国的年美国的NirenbergNirenberg等人以等人以均聚物均聚物为模板指导多肽为模板指导多肽的合成的合成,寻找到了破译遗传密码的途径。利用多核苷酸磷寻找到了破译遗传密码的途径。利用多核苷酸磷酸化酶合成一条由酸化酶合成一条由相同核苷酸相同核苷酸组成的多核苷酸链,用它组成的多核苷酸链,用它作模板,利用大肠杆菌体外蛋白质合成系统。作模板,
4、利用大肠杆菌体外蛋白质合成系统。以均聚物为模板指导多肽的合以均聚物为模板指导多肽的合Poly C Poly C 为模板,产生的多肽链为为模板,产生的多肽链为Poly ProPoly ProPoly U Poly U 为模板,产生的多肽链为为模板,产生的多肽链为Poly PhePoly PhePoly A Poly A 为模板,产生的多肽链为为模板,产生的多肽链为Poly LysPoly Lys 证明三联体密码的三个著名实验证明三联体密码的三个著名实验第四张,PPT共六十九页,创作于2022年6月2.2.核糖体结合技术核糖体结合技术 1964 1964年年NirenbergNirenberg等人
5、首先合成一个已知序列的核苷酸三等人首先合成一个已知序列的核苷酸三聚体,然后与大肠杆菌核糖体和氨酰聚体,然后与大肠杆菌核糖体和氨酰tRNAtRNA一起温育。由此确一起温育。由此确定与已知核苷酸三聚体结合的定与已知核苷酸三聚体结合的tRNAtRNA上连接的是那一种氨基上连接的是那一种氨基酸。酸。该实验确定了该实验确定了5050多种多种三联体密码,对于几三联体密码,对于几种密码编码同一个氨种密码编码同一个氨基酸提供了直接的、基酸提供了直接的、最好的证据最好的证据第五张,PPT共六十九页,创作于2022年6月3.3.以特定的共聚物为模板指导多肽的合成以特定的共聚物为模板指导多肽的合成1964年,年,K
6、horanaKhorana以共聚物即含有重复序列的多聚核苷酸以共聚物即含有重复序列的多聚核苷酸指导多肽的合成,加快了破译遗传密码的步伐。指导多肽的合成,加快了破译遗传密码的步伐。以多聚二核苷酸作模板可合成由以多聚二核苷酸作模板可合成由2 2个氨基酸组成个氨基酸组成 的多肽的多肽 ,如以如以Poly UG Poly UG 为模板为模板 UGU GUG UGU UGU GUG UGU 合成产物为合成产物为Poly Lys-Val Poly Lys-Val 。以多聚三核苷酸作为模板,可得三种氨基酸组成以多聚三核苷酸作为模板,可得三种氨基酸组成 的多肽的多肽 UCG UCG UCG 。Phe Phe
7、Phe Ser Ser Ser Leu Leu Leu到到1966年,经过年,经过5年的努力年的努力全部破译了全部破译了20种种aa的密码的密码第六张,PPT共六十九页,创作于2022年6月Established the chemical structure of tRNADevised methods to synthesize RNAs with definedsequencesEstablished the in vitro system for revealing the genetic codes第七张,PPT共六十九页,创作于2022年6月遗传密码字典遗传密码字典UACGUCAGU
8、CAG第二位第二位 第一位第一位(5)第三位第三位(3)UCAGUCAGUCAG第八张,PPT共六十九页,创作于2022年6月第二节第二节 遗传密码的基本特性遗传密码的基本特性1 1、密码是、密码是无标点符号无标点符号的、且相邻密码子的、且相邻密码子互不重叠互不重叠。2 2、密码的简并性:由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象称为简并、密码的简并性:由一种以上密码子编码同一个氨基酸的现象称为简并性(性(degeneracydegeneracy),对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子),对应于同一氨基酸的密码子称为同义密码子(Synonymous codon)(Synonymous codon
9、)。密码的简并性可以减少有害突变。密码的简并性可以减少有害突变 3 3、密码的摆动性(变偶性):密码的专一性主要是由第一第二个碱、密码的摆动性(变偶性):密码的专一性主要是由第一第二个碱基所决定,基所决定,tRNAtRNA上的反密码子与上的反密码子与mRNAmRNA密码子配对时,密码子的第一、密码子配对时,密码子的第一、二位碱基是严格的,第三位碱基可以有一定的变动。二位碱基是严格的,第三位碱基可以有一定的变动。CrickCrick称这一为称这一为变偶性(变偶性(wobblewobble).4 4、密码的通用性和变异性、密码的通用性和变异性5 5、6464组密码子中,组密码子中,AUGAUG既是
10、既是MetMet的密码,又是起始密码;有三组密码不的密码,又是起始密码;有三组密码不编码任何氨基酸,而是多肽链合成的终止密码子:编码任何氨基酸,而是多肽链合成的终止密码子:UAGUAG、UAAUAA、UGAUGA。6 6、密码的防错系统、密码的防错系统 第九张,PPT共六十九页,创作于2022年6月反密码子与密码子之间的碱基配对反密码子与密码子之间的碱基配对A UC G反密码子第一位碱基反密码子第一位碱基 密码子第三位碱基密码子第三位碱基GUCUAGIUCA第十张,PPT共六十九页,创作于2022年6月 次黄嘌呤核苷酸次黄嘌呤核苷酸(I I)常常出现在)常常出现在tRNAtRNA反密码子的反密
11、码子的55位,位,I I可以与可以与U U,C C和和A A形成氢形成氢键键 。带有反密码子。带有反密码子IGCIGC的的tRNAtRNAAlaAla分子可以与特分子可以与特异编码异编码AlaAla的三个密码的三个密码(GCGCU U,GCGCC C,GCGCA A)中)中的任一个结合的任一个结合第十一张,PPT共六十九页,创作于2022年6月人线粒体中变异的密码子人线粒体中变异的密码子UGA 终止信号终止信号 TrpAUA Ile Met AGA Arg 终止信号终止信号AGG Arg 终止信号终止信号密码子密码子 正常情况下编码正常情况下编码 线粒体线粒体DNA编码编码l 密码子密码子UG
12、A编码了第编码了第21种氨基酸种氨基酸硒代半胱氨酸,硒代半胱氨酸,l 密码子密码子UAG编码了第编码了第22种氨基酸种氨基酸吡咯赖氨酸。吡咯赖氨酸。第十二张,PPT共六十九页,创作于2022年6月关于密码的防错系统关于密码的防错系统密码的简并性由第三个碱基决定密码的简并性由第三个碱基决定 氨基酸的极性由第二个碱基决定氨基酸的极性由第二个碱基决定如:如:中间中间U U非极性、疏水、和有支链的非极性、疏水、和有支链的aaaa中间中间C C非极性或不带电极性侧链非极性或不带电极性侧链aaaa中间中间A or GA or G亲水的亲水的aaaa第一个第一个A A或或C C、第二个、第二个A A或或G
13、G、第三个任意、第三个任意可离解、亲水可离解、亲水侧链碱性侧链碱性aaaa前两位前两位AGAG、第三个任意、第三个任意酸性亲水侧链酸性亲水侧链aaaa结果:一个碱基变化后结果:一个碱基变化后相同相同aaaa或性质相似或性质相似aaaa,这是进,这是进化的结果化的结果第十三张,PPT共六十九页,创作于2022年6月第第3838章章 蛋白质的合成及转运蛋白质的合成及转运第十四张,PPT共六十九页,创作于2022年6月第一节第一节 蛋白质合成的分子基础蛋白质合成的分子基础蛋白质的生物合成(翻译)蛋白质的生物合成(翻译)l以氨基酸为原料以氨基酸为原料l以以mRNAmRNA为模板为模板l以以tRNAtR
14、NA为运载工具为运载工具l以核糖体为合成场所以核糖体为合成场所l起始、延长、终止各阶段蛋白因子参与起始、延长、终止各阶段蛋白因子参与l合成后加工成为有活性蛋白质合成后加工成为有活性蛋白质第十五张,PPT共六十九页,创作于2022年6月原核细胞原核细胞mRNAmRNA的结构特点的结构特点53顺反子顺反子顺反子顺反子顺反子顺反子先导区先导区末端顺序末端顺序SD区区特点特点半衰期短半衰期短许多原核生物许多原核生物mRNAmRNA以多顺反子形式存在以多顺反子形式存在AUGAUG作为起始密码;作为起始密码;AUGAUG上游上游7 71212个核苷酸处有一被称为个核苷酸处有一被称为SDSD序列序列的保守区
15、,的保守区,16S rRNA3-16S rRNA3-端反向互补而使端反向互补而使mRNAmRNA与核糖体结合。与核糖体结合。AUG UAA AUG UAA AUG UAA AUG UAA AUG UAA AUG UAA 读码框架读码框架核糖体识别位点核糖体识别位点一、一、mRNAmRNA是蛋白质合成的模板是蛋白质合成的模板 mRNA(messenger RNA)mRNA(messenger RNA)是蛋白质生物合成过程中直接是蛋白质生物合成过程中直接指令氨基酸掺入的模板。指令氨基酸掺入的模板。AGGAGGU第十六张,PPT共六十九页,创作于2022年6月真核细胞真核细胞mRNAmRNA的结构特
16、点的结构特点5“帽子帽子”PolyA 3 顺反子顺反子m7G-5ppp-N-3 pAAAAAAA-OH读码框架读码框架核糖体识别位点核糖体识别位点AUG UAAAUG UAA 真核生物的真核生物的18S rRNA18S rRNA与原核生物的与原核生物的16S rRNA16S rRNA在其在其33末端有很大的同源性。末端有很大的同源性。由于由于18S rRNA18S rRNA缺少缺少CCUCCCCUCC序列序列(与与mRNAmRNA上的上的SDSD序列互补序列互补),),因此真核生物因此真核生物mRNAmRNA可能并不存在可能并不存在SDSD序列序列。大多数真核生物。大多数真核生物mRNAmRN
17、A起始密码子起始密码子AUGAUG附近附近“上下文上下文”为为CCACCCCACCAUGAUGG G。在帽子结构上形成的。在帽子结构上形成的40S40S亚基起始复合物向亚基起始复合物向33方向移动时方向移动时,如发如发现现AUGAUG密码子处于这样的密码子处于这样的“上下文上下文”中中,就不再向前移动就不再向前移动,而是与而是与60S60S亚基结合成亚基结合成为完整的核糖体为完整的核糖体,于是从于是从AUGAUG上开始合成蛋白质。上开始合成蛋白质。第十七张,PPT共六十九页,创作于2022年6月tRNAtRNA(transfer ribonucleic asidtransfer ribonuc
18、leic asid)在蛋白质合成中起重要作用,它不但为每个三联)在蛋白质合成中起重要作用,它不但为每个三联体密码子译成氨基酸提供接合体,还为准确无误地将活化氨基酸运送到核糖体中体密码子译成氨基酸提供接合体,还为准确无误地将活化氨基酸运送到核糖体中mRNAmRNA模板模板上。上。1、tRNA的结构特征的结构特征2、tRNA的功能的功能 (1)tRNA的接头的接头(adaptor)作用作用 3-端上的氨基酸接受位点端上的氨基酸接受位点 识别氨酰识别氨酰-tRNA合成酶的位点合成酶的位点 反密码子位点反密码子位点 (2)tRNA的突变与校正基因的突变与校正基因 (回复突变,回复突变,reverse
19、mutation)二、二、t RNA转运活化的氨基酸至转运活化的氨基酸至mRNA模板上模板上第十八张,PPT共六十九页,创作于2022年6月核糖体(核糖体(ribosome)是由)是由rRNA(ribosomal ribonucleic acid)和多种蛋白质结合而成的一种)和多种蛋白质结合而成的一种大的核糖核蛋白颗粒,蛋白质肽键的合成就是在大的核糖核蛋白颗粒,蛋白质肽键的合成就是在这种核糖体上进行的。这种核糖体上进行的。2、核糖体的功能核糖体的功能1、核糖体的结构和组成、核糖体的结构和组成三、核糖体是蛋白质合成的工场三、核糖体是蛋白质合成的工场第十九张,PPT共六十九页,创作于2022年6月
20、核核糖糖体体的的组组成成34 protein21 protein23S RNA 5S RNA16S RNA50S subunit70S ribosome30S subunit原核生物核糖体结构示意图原核生物核糖体结构示意图30S subunit50S subunit原核生物核原核生物核糖体的组成糖体的组成第二十张,PPT共六十九页,创作于2022年6月16S rRNA 16S rRNA 的二级结构的二级结构第二十一张,PPT共六十九页,创作于2022年6月多核糖体多核糖体第二十二张,PPT共六十九页,创作于2022年6月原核细胞原核细胞70S核糖体的核糖体的A位、位、P位及位及mRNA结合部位
21、示意图结合部位示意图30S30S与与mRNA结合部位结合部位P P位位位位(结合结合肽基的部位肽基的部位肽酰基位肽酰基位点)点)A A位位位位(结合结合AA-tRNA的部位的部位氨酰基位点)氨酰基位点)50S50S5 5 3 3 mRNA第二十三张,PPT共六十九页,创作于2022年6月第二节第二节 蛋白质合成的步骤蛋白质合成的步骤氨基酸的活化与转运氨基酸的活化与转运肽链合成的起始肽链合成的起始肽链的延长肽链的延长肽链合成的终止肽链合成的终止第二十四张,PPT共六十九页,创作于2022年6月氨氨基基酸酸的的活活化化氨基酸氨基酸ATP+氨酰腺苷酸氨酰腺苷酸E-AMPPPi第一步第一步AMP第二步
22、第二步E3-氨酰氨酰-tRNA 一、氨基酸的活化与转运一、氨基酸的活化与转运第二十五张,PPT共六十九页,创作于2022年6月氨酰氨酰-tRNA-tRNA合成酶特点合成酶特点专一性:专一性:1 1)对对氨氨基基酸酸有有极极高高的的专专一一性性,每每种种氨氨基基酸酸都都有有专专一一的的酶酶,只作用于只作用于L-L-氨基酸,不作用于氨基酸,不作用于D-D-氨基酸。氨基酸。2 2)对)对tRNA tRNA 具有极高专一性。具有极高专一性。校对作用:校对作用:氨酰氨酰-tRNA-tRNA合成酶的水解部位可以水解错误活化的合成酶的水解部位可以水解错误活化的氨基酸。氨基酸。第二十六张,PPT共六十九页,创
23、作于2022年6月二、肽链合成的起始二、肽链合成的起始所需的条件:所需的条件:l游离的核糖体大小亚基游离的核糖体大小亚基lmRNA 5mRNA 5端的起始信号端的起始信号l起始起始tRNAtRNAtRNAtRNAi imetmet (原核生物原核生物fmet-tRNAfmet-tRNAi ifmetfmet)lGTPGTPl三种可溶性起始因子三种可溶性起始因子(IF)(IF)第二十七张,PPT共六十九页,创作于2022年6月N-甲酰甲硫氨酰甲酰甲硫氨酰-tRNAiMet的形成的形成CHOCHO-HN-CH-COO-tRNA-HN-CH-COO-tRNA CH CH2 2 CH CH2 2 S
24、S COO-COO-+H H2 2N-CH-COO-tRNAN-CH-COO-tRNA CH CH2 2 CH CH2 2 S S COO-COO-Met-tRNAiMetfMet-tRNAtfMetN N1010-CHO-FH-CHO-FH4 4FHFH4 4转甲酰酶转甲酰酶第二十八张,PPT共六十九页,创作于2022年6月三种起始因子三种起始因子IFIF1 1IFIF2 2 IFIF3 3与与IFIF2 2一起促进一起促进fmet-tRNAfmet-tRNAi ifmetfmet 与与mRNAmRNA及及30S30S小亚基结合小亚基结合与与IFIF1 1一起促进一起促进fmet-tRNAf
25、met-tRNAi ifmetfmet 与与mRNAmRNA及及30S30S小亚基结合小亚基结合有有GTPGTP酶活性酶活性(起始时消耗起始时消耗1GTP)1GTP)特异识别特异识别fmet-tRNAfmet-tRNAi ifmetfmet形成形成fmet-tRNAfmet-tRNAi ifmetfmet-IF-IF2 2-GTP-GTP终止时:促使核糖体解离终止时:促使核糖体解离(真核生物起始因子(真核生物起始因子eIF有有911种)种)第二十九张,PPT共六十九页,创作于2022年6月30S30S起始复合物形成起始复合物形成1.1.核糖体亚基的拆离核糖体亚基的拆离2.mRNA2.mRNA在
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