发酵工程2(菌种选育)课件.ppt
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1、第一章第一章 微生物菌种选育微生物菌种选育v菌种选育菌种选育:利用微生物的遗传变异的特性,:利用微生物的遗传变异的特性,采用各种手段,改变菌种的遗传性状。采用各种手段,改变菌种的遗传性状。自然选育自然选育:根据菌种自然变异的特点进行选:根据菌种自然变异的特点进行选育的过程。育的过程。人工选育人工选育:人为方式改变微生物菌株遗传物:人为方式改变微生物菌株遗传物质选育过程,包括诱变育种、杂交育种、原质选育过程,包括诱变育种、杂交育种、原生质体融合、基因工程育种等高新技术。生质体融合、基因工程育种等高新技术。第一节第一节 菌种的来源菌种的来源 一、工业发酵常见微生物种类一、工业发酵常见微生物种类v细
2、菌细菌醋杆菌属的醋化醋杆菌、弱氧化醋杆菌醋杆菌属的醋化醋杆菌、弱氧化醋杆菌乳酸杆菌乳酸杆菌枯草杆菌枯草杆菌丙酮丁醇梭菌丙酮丁醇梭菌大肠杆菌大肠杆菌谷氨酸棒状杆菌谷氨酸棒状杆菌最最常用的工业微生物常用的工业微生物v酵母菌酵母菌酿酒酵母酿酒酵母假丝酵母属假丝酵母属v产朊假丝酵母产朊假丝酵母v解脂假丝酵母解脂假丝酵母v热带假丝酵母热带假丝酵母毕赤酵母属、汉逊酵母属毕赤酵母属、汉逊酵母属最最常用的工业微生物常用的工业微生物v霉菌霉菌曲霉属曲霉属v米曲霉米曲霉v黑曲霉黑曲霉青霉属青霉属v青霉菌:点青霉、产黄青霉青霉菌:点青霉、产黄青霉v桔青霉桔青霉根霉属根霉属v德氏根霉德氏根霉v米根霉、小麦曲根霉米根霉
3、、小麦曲根霉红曲霉属红曲霉属v紫红曲霉紫红曲霉最最常用的工业微生物常用的工业微生物v放线菌放线菌链霉菌属链霉菌属小单孢菌属小单孢菌属地中海诺卡氏菌地中海诺卡氏菌米苏里游动放线菌米苏里游动放线菌v担子菌担子菌菇类菇类多糖、橡胶物质和抗癌药物的开发。多糖、橡胶物质和抗癌药物的开发。v藻类藻类自养微生物自养微生物人类的保健食品和饲料。人类的保健食品和饲料。v担子菌担子菌菇类菇类多糖、橡胶物质和抗癌药物的开发。多糖、橡胶物质和抗癌药物的开发。v藻类藻类自养微生物自养微生物人类的保健食品和饲料。人类的保健食品和饲料。v担子菌担子菌菇类菇类多糖、橡胶物质和抗癌药物的开发。多糖、橡胶物质和抗癌药物的开发。v
4、藻类藻类自养微生物自养微生物人类的保健食品和饲料。人类的保健食品和饲料。二、工业微生物的来源二、工业微生物的来源v根根据据资资料料直直接接向向有有关关科科研研单单位位、高高等等院院校校、工厂或菌种保藏部门索取或购买;工厂或菌种保藏部门索取或购买;v从大自然中分离筛选新的微生物菌种。从大自然中分离筛选新的微生物菌种。v从一些发酵制品中分离目的菌,如从酱油中从一些发酵制品中分离目的菌,如从酱油中分离蛋白酶产生菌;从酒醪中分离淀粉酶或分离蛋白酶产生菌;从酒醪中分离淀粉酶或糖化酶产生菌。糖化酶产生菌。三、微生物菌种的选择性分离三、微生物菌种的选择性分离v菌株分离就是将一个混杂着各种微生物的样菌株分离就
5、是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开,进而得到所需微生品通过分离技术区分开,进而得到所需微生物的过程。物的过程。v工业微生物产生菌的筛选一般包括两大部分:工业微生物产生菌的筛选一般包括两大部分:一是从自然界分离所需菌株;二是把分离的一是从自然界分离所需菌株;二是把分离的菌株进一步纯化并进行代谢产物鉴别。菌株进一步纯化并进行代谢产物鉴别。v菌株的分离和筛选:采样、富集、目的菌筛菌株的分离和筛选:采样、富集、目的菌筛选等。选等。1.采样采样v以采集土壤为主以采集土壤为主。一般园田土和耕作过的沼。一般园田土和耕作过的沼泽土中,以细菌和放线菌为主;富含碳水化泽土中,以细菌和放线菌为主;富含
6、碳水化合物的土壤和沼泽地中,酵母和霉菌较多,合物的土壤和沼泽地中,酵母和霉菌较多,如一些野果生长区和果园内。如一些野果生长区和果园内。v纤维素酶产生菌纤维素酶产生菌选择枯枝落叶富含纤维素的选择枯枝落叶富含纤维素的森林土;森林土;v淀粉酶产生菌淀粉酶产生菌选择面粉厂、酒厂、糕点厂等选择面粉厂、酒厂、糕点厂等场所的土壤;场所的土壤;v蛋白酶和脂肪酶产生菌蛋白酶和脂肪酶产生菌可选择肉类加工厂附可选择肉类加工厂附近污泥等。近污泥等。从自然界筛选从自然界筛选v采采样样季季节节:以以温温度度适适中中,雨雨量量不不多多的的秋秋初初为好。为好。v采采土土方方式式:在在选选好好适适当当地地点点后后,用用小小萨萨
7、子子除除去去表表土土,取取离离地地面面5-15cm处处的的土土约约10g,盛盛入入清清洁洁的的牛牛皮皮纸纸袋袋或或塑塑料料袋袋中中,扎扎好好,标标记记,记记录录采采样样时时间间、地地点点、环环境境条条件件等等,以以备备查查考考。为为了了使使土土样样中中微微生生物物的的数数量量和和类类型型尽尽少少变变化化,宜宜将将样样品品逐逐步步分分批批寄寄回回,以便及时分离。以便及时分离。2.富集培养富集培养v富富集集培培养养可可增增加加待待分分离离菌菌的的数数量量,增增加加分分离离的的成成功功率。率。v为为了了容容易易分分离离到到所所需需的的菌菌种种,可可以以通通过过配配制制选选择择性性培养基,选择一定的培
8、养条件来控制。培养基,选择一定的培养条件来控制。v例例如如碳碳源源利利用用的的控控制制,可可选选定定糖糖、淀淀粉粉、纤纤维维素素,或或者者石石油油等等,以以其其中中的的一一种种为为唯唯一一碳碳源源,那那么么只只有有利利用用这这一一碳碳源源的的微微生生物物才才能能大大量量正正常常生生长长,而而其其它它微微生生物物就就可可能能死死亡亡或或淘淘汰汰。这这样样对对下下阶阶段段的的纯纯种种分分离就会顺利得多。离就会顺利得多。v为提高分离的效率为提高分离的效率,常以常以投其所好和取其所投其所好和取其所抗的抗的原则在培养基中添加特殊的养分或抗菌原则在培养基中添加特殊的养分或抗菌物质物质,使所需菌种的数量相对
9、增加使所需菌种的数量相对增加,这种方这种方法称为法称为增殖培养或富集培养增殖培养或富集培养,其实质是使天其实质是使天然样品中的劣势菌转变为人工环境中的优势然样品中的劣势菌转变为人工环境中的优势菌菌,便于将它们从样品中分离便于将它们从样品中分离。v例如分离放线菌时,在土壤样品悬液中加入例如分离放线菌时,在土壤样品悬液中加入数滴数滴1010的酚,可抑制霉菌和细菌的生长。的酚,可抑制霉菌和细菌的生长。富集的主要方案:富集的主要方案:q 定向培养定向培养:采用特定的有利于目的微生物富集的条件,采用特定的有利于目的微生物富集的条件,进行培养。控制营养和培养条件增加目的微生物数量,进行培养。控制营养和培养
10、条件增加目的微生物数量,也可高温高压、加入抗生素等减少非目的微生物的数量。也可高温高压、加入抗生素等减少非目的微生物的数量。目的微生物富集的一些基本方法目的微生物富集的一些基本方法富集的富集的目的:目的:q 让目的微生物在种群中占优势,使筛选变得可能。让目的微生物在种群中占优势,使筛选变得可能。定向培养的富集方法定向培养的富集方法 1.1.底物底物 2.pH2.pH条件条件 3.3.培养时间培养时间 4.4.培养温度培养温度 等等一切能提高目的微生物相对生长速一切能提高目的微生物相对生长速度的手段,培养(固体、液体;分批、度的手段,培养(固体、液体;分批、连续)后使目的微生物在种群中占优连续)
11、后使目的微生物在种群中占优势。势。菌落的选出菌落的选出 q 从产物角度出发从产物角度出发 在在培养时以产物的形成有目的的设计培养基培养时以产物的形成有目的的设计培养基利用简单、快速的鉴定方法,如抗生素利用简单、快速的鉴定方法,如抗生素 q 从形态的角度从形态的角度 菌菌落落的的外外观观形形态态,是是微微生生物物的的一一个个重重要要表表征征。如如多多糖糖产产生生菌菌在在适适当当的的培培养养基基上上生生长长,从从具具有有粘粘液液性性的的菌菌落落外外观观上就可以初步识别。上就可以初步识别。实例:碱性纤维素酶产生菌的筛选实例:碱性纤维素酶产生菌的筛选采样(造纸采样(造纸 厂)厂)80、30min处理处
12、理文献文献:产生菌为中性牙孢杆菌,产生菌为中性牙孢杆菌,嗜碱牙孢杆菌嗜碱牙孢杆菌、放线菌及霉菌、放线菌及霉菌0.0075%曲利本蓝曲利本蓝1%CMC(羧甲基纤维素),羧甲基纤维素),pH10.5、培养培养34天,选择有凹陷圈的菌落天,选择有凹陷圈的菌落从从285个土样中获得个土样中获得62株株26株为组成型株为组成型36株为诱导型株为诱导型 3.培养分离培养分离v尽尽管管通通过过增增殖殖培培养养效效果果显显著著,但但还还是是处处于于微微生生物物的的混混杂杂生生长长状状态态。因因此此还还必必须须分分离离,纯纯化化,在在固固体体培培养基平板上获得单菌落养基平板上获得单菌落。v纯种分离的方法有划线分
13、离法、稀释分离法。纯种分离的方法有划线分离法、稀释分离法。v分离的效率取决于培养基养分、分离的效率取决于培养基养分、pH、温度和、温度和加入的选择性抑制剂。加入的选择性抑制剂。v嗜中性放线菌分离培养基嗜中性放线菌分离培养基pH常在常在6.77.5,嗜,嗜酸性放线菌酸性放线菌pH降至降至4.55.0。v放线菌筛选时,可加入真菌抗生素,对放线放线菌筛选时,可加入真菌抗生素,对放线菌无作用。菌无作用。v分离放线菌分离平板通常在分离放线菌分离平板通常在2530培养。培养。嗜热菌嗜热菌4555 ,嗜冷菌,嗜冷菌410 。4.筛筛 选选v平平板板上上单单菌菌落落,通通过过菌菌落落形形态态观观察察,进进行行
14、菌菌落落鉴鉴定定,符合要求,转移到试管斜面进行纯培养。符合要求,转移到试管斜面进行纯培养。v采采用用与与生生产产相相近近的的培培养养基基和和培培养养条条件件,通通过过三三角角瓶瓶的的容容量量进进行行小小型型发发酵酵试试验验,以以求求得得适适合合于于工工业业生生产产用菌种。用菌种。5.毒性试验毒性试验v自自然然界界的的一一些些微微生生物物是是在在一一定定条条件件下下产产毒毒的的,将将其其作作为为生生产产菌菌种种应应当当十十分分当当心心,尤尤其其与与食食品品工工业业有有关关的菌种,更应慎重。的菌种,更应慎重。v据据有有的的国国家家规规定定,微微生生物物中中除除啤啤酒酒酵酵母母、脆脆壁壁酵酵母母、黑
15、黑曲曲霉霉、米米曲曲霉霉和和枯枯草草杆杆菌菌作作为为食食用用无无须须作作毒毒性性试试验验外外,其其他他微微生生物物作作为为食食用用,均均需需通通过过两两年年以以上上的的毒性试验。毒性试验。第二节第二节 菌种的选育菌种的选育一一、菌菌种种选选育育意意义义:发发酵酵产产品品的的种种类类、产产量量和和质质量量有有较较大大的的改善改善二、二、菌种选育的定义:菌种选育的定义:根根据据微微生生物物遗遗传传物物质质极极易易发发生生变变异异特特性性,用用人人工工方方法法造成变异,再经过筛选以得到人们所需菌种的过程。造成变异,再经过筛选以得到人们所需菌种的过程。三、三、常用菌种的选育方法:常用菌种的选育方法:1
16、 1)自然选育;)自然选育;2 2)诱变育种;)诱变育种;3 3)杂交育种;)杂交育种;4 4)分子育种)分子育种四、自然选育四、自然选育1.1.自然选育自然选育 在在生生产产过过程程中中,不不经经人人工工处处理理,利利用用菌菌种种的的自自然然突变而进行的菌种筛选过程。但突变的频率较低。突变而进行的菌种筛选过程。但突变的频率较低。2.2.自然突变的两种可能自然突变的两种可能 菌种衰退,生产能力下降;菌种衰退,生产能力下降;代谢更加旺盛,生产性能提高。代谢更加旺盛,生产性能提高。3.3.自然选育的方法自然选育的方法单菌落纯种分离单菌落纯种分离五、诱变育种(五、诱变育种(Mutation bree
17、ding)1.1.诱变育种的含义诱变育种的含义 应用微生物遗传和变异理论,应用微生物遗传和变异理论,用物理或用物理或化学诱变剂处理均匀分散的微生物细胞群化学诱变剂处理均匀分散的微生物细胞群,促进其突变率大幅度提高促进其突变率大幅度提高,然后采用简便、然后采用简便、快速和高效的筛选方法快速和高效的筛选方法,从中挑选少数符合从中挑选少数符合育种目的的突变株育种目的的突变株,以供生产实践或科学研以供生产实践或科学研究用。究用。v诱诱变变育育种种具具有有方方法法简简单单、快快速速和和收收效效显显著著等等特点特点,仍是目前被广泛使用的主要育种仍是目前被广泛使用的主要育种手段。手段。v当当前前发发酵酵工工
18、业业中中使使用用的的高高产产菌菌株株,几几乎乎都都是是通通过过诱诱变变育育种种而而大大大大提提高高了了生生产产性性能能的的菌菌株株。诱诱变变育育种种除除能能提提高高产产量量外外,还还可可达达到到改改善善产产品质量、扩大品种和简化生产工艺等目的品质量、扩大品种和简化生产工艺等目的。2.2.诱变育种的一般步骤诱变育种的一般步骤1)出发菌株的选择2)单细胞(或单孢子)悬液制备3)诱变剂和使用剂量的选择4)变异株的初筛5)变异株的复筛6)变异株稳定性试验7)菌种特性考察8)中试验证9)大型投产试验1 1)出发菌株的选择)出发菌株的选择 用来育种处理的起始菌株称为用来育种处理的起始菌株称为出发菌株出发菌
19、株。出发菌株的来源主要有以下三方面出发菌株的来源主要有以下三方面:自然界直接分离到的野生型菌株自然界直接分离到的野生型菌株 这些菌株的特点是它们的酶系统完整这些菌株的特点是它们的酶系统完整,染色体染色体或或DNADNA未损伤未损伤,但它们的生产性能通常很差但它们的生产性能通常很差(这正是这正是它们能在大自然中生存的原因它们能在大自然中生存的原因),),通过诱变育种通过诱变育种,它它们们正突变正突变(即产量或质量性状向好的方向改变即产量或质量性状向好的方向改变)的可的可能性大能性大。经历过生产条件考验的菌株经历过生产条件考验的菌株 这些菌株已有一定的生产性状这些菌株已有一定的生产性状,对生产环境
20、有对生产环境有较好的适应性较好的适应性,正突变的可能性也很大。正突变的可能性也很大。经历多次育种处理的菌株经历多次育种处理的菌株 这些菌株的染色体已有较大的损伤这些菌株的染色体已有较大的损伤,某些生理功某些生理功能或酶系统有缺损能或酶系统有缺损,产量性状已经达到了一定水平产量性状已经达到了一定水平,它们它们负突变负突变(即产量或质量性状向差的方向改变即产量或质量性状向差的方向改变)的的可能性很大可能性很大,可以正突变的位点已经被利用了可以正突变的位点已经被利用了,继继续诱变处理很可能导致产量下降甚至死亡。续诱变处理很可能导致产量下降甚至死亡。因此,在实际生产中,因此,在实际生产中,一般可选择一
21、般可选择或或类菌类菌株株,尤以尤以第第类类最最佳佳,因为它可以向好的方向发展。因为它可以向好的方向发展。在抗生素生产菌育种中在抗生素生产菌育种中,最好选择已通过几次最好选择已通过几次诱变并诱变并发现每次的效价都有所提高的菌株作出发菌发现每次的效价都有所提高的菌株作出发菌株株,在选择产核在选择产核苷苷酸或氨基酸的出发菌株时酸或氨基酸的出发菌株时,最好最好考虑至少能积累少量产品或其前体的菌株。考虑至少能积累少量产品或其前体的菌株。2 2)单细胞(或单孢子)悬液制备)单细胞(或单孢子)悬液制备 诱变诱变处理的菌处理的菌株株应考虑微生物的应考虑微生物的生理状态生理状态、菌菌株株的均一性的均一性和和环境
22、条件环境条件。适合用于诱变育种的适合用于诱变育种的微生物生理状态微生物生理状态:一一般要求般要求细菌和酵母细菌和酵母菌体菌体处于对数生长期处于对数生长期,并并采取一定的措施促使细胞处于同步生长。采取一定的措施促使细胞处于同步生长。对产对产孢孢子或芽子或芽孢孢的的微微生物最好采用其生物最好采用其孢孢子或芽子或芽孢,因此,孢,因此,霉菌和放线菌应处于单细胞状态,即霉菌和放线菌应处于单细胞状态,即形成孢子的时期,对孢子进行诱变形成孢子的时期,对孢子进行诱变。为什么霉菌和放线菌为什么霉菌和放线菌用用孢孢子进行诱变处理子进行诱变处理?1.1.能使分散状态细胞均匀地接触诱变剂能使分散状态细胞均匀地接触诱变
23、剂;2.2.它尽可能地避免出现表型延迟现象它尽可能地避免出现表型延迟现象 表型延迟表型延迟(Phenotypic lag)是指某一突变在是指某一突变在 DNADNA复制和细胞分裂后复制和细胞分裂后,才在细胞表型上显示才在细胞表型上显示出来出来,造成不纯的菌落造成不纯的菌落的现象的现象。出现这种现象出现这种现象的原因是诱变对象处于的原因是诱变对象处于多核时期造成的多核时期造成的。霉菌和放线菌霉菌和放线菌对数期细胞往往是多核的,很可能一个核发生突变,而另一个核未突变,若突变性状是隐性的,在当代并不表现出来,在筛选时就会被淘汰;若突变性状是显性的,那么,在当代就表现出来,但在进一步传代后,就会出现分
24、离现象,造成生产性状衰退,因此,应尽可能选择孢子或单倍体的细胞作为诱变对象。即使如此,有时也会出现表型延迟现象,这是因为诱变剂往往只作用于DNA分子的一条单链,DNA 进一步复制后,同样会出现不纯的菌落。这类表型延迟称为分离性延迟现象。菌株菌株的均一性的均一性 菌菌悬液的均一性可保证诱变剂与每个细胞悬液的均一性可保证诱变剂与每个细胞 机会均等并充分地接触机会均等并充分地接触,避免细胞团中变异菌避免细胞团中变异菌 株与非变异菌株混杂株与非变异菌株混杂,出现不纯的菌落出现不纯的菌落,给后给后 续的筛选工作续的筛选工作造造成成困困难。难。为避免细胞团出现为避免细胞团出现,可用玻璃珠振荡打散可用玻璃珠
25、振荡打散 细胞团细胞团,再用脱脂棉花或滤纸过滤再用脱脂棉花或滤纸过滤,得到分散得到分散 的菌体。的菌体。菌悬液的细胞浓度一般控制为菌悬液的细胞浓度一般控制为:真菌真菌孢孢子或酵母细胞子或酵母细胞 10106 61 10 07 7 个个/ml/ml;放线菌或细菌放线菌或细菌 10108 8个个/ml/ml。菌悬液一般用生理盐水菌悬液一般用生理盐水(0.85%(0.85%NaClNaCl)稀释。稀释。有时有时用用化学诱变剂处理时化学诱变剂处理时,需需要要0.1mol/L 0.1mol/L 磷酸缓冲液稀释磷酸缓冲液稀释,因为有些化学诱变剂处理时因为有些化学诱变剂处理时,常常常常会改变反应液的会改变反
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