酶的分子修饰.ppt
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1、第五讲第五讲 酶分子修饰酶分子修饰第五讲第五讲 酶分子修饰酶分子修饰o教学目标:教学目标:了解有关酶分子修饰的重要应用以及酶分子的物理修饰作用了解有关酶分子修饰的重要应用以及酶分子的物理修饰作用理解蛋白酶化学修饰的方法和意义理解蛋白酶化学修饰的方法和意义掌握酶分子化学修饰的形式、目的、原理与特点掌握酶分子化学修饰的形式、目的、原理与特点 o教学重点:教学重点:酶分子化学修饰的方法和意义、酶分子化学修饰的形式酶分子化学修饰的方法和意义、酶分子化学修饰的形式o教学难点:教学难点:化学修饰的原理与特点化学修饰的原理与特点第五讲第五讲 酶分子修饰酶分子修饰5.15.1、酶分子修饰的定义及其意义、酶分子
2、修饰的定义及其意义5.25.2、酶分子修饰方法、酶分子修饰方法 5.35.3、酶修饰后的性质变化、酶修饰后的性质变化 5.45.4、酶的分子定向进化、酶的分子定向进化分析酶在工业生产中应用受到极大限制的原因?分析酶在工业生产中应用受到极大限制的原因?l热稳定性差热稳定性差l活力低活力低l耐受耐受pHpH范围窄范围窄l分子量过大分子量过大l成本高成本高l来源有限来源有限l有异体反应有异体反应o酶的应用受到了很大限制促使科研工作者必须不断地开展新的酶的应用受到了很大限制促使科研工作者必须不断地开展新的研究,用化学或分子生物学方法研究,用化学或分子生物学方法对酶分子进行改造对酶分子进行改造,以,以满
3、足各满足各种反应条件对酶的需求种反应条件对酶的需求,克服天然酶的缺陷克服天然酶的缺陷。o随着各个学科及相关技术的发展,特别对酶结构随着各个学科及相关技术的发展,特别对酶结构与功能的深入与功能的深入了解了解、基因工程及固定化技术的普、基因工程及固定化技术的普及,酶的分子改造工程进入及,酶的分子改造工程进入实用实用阶段。阶段。o总体来说酶的分子工程分两部分:总体来说酶的分子工程分两部分:分子生物学水平分子生物学水平:即用基因工程方法对即用基因工程方法对DNADNA进行分进行分子改造,以获得化学结构更合理的酶蛋白;子改造,以获得化学结构更合理的酶蛋白;对天然酶分子进行改造对天然酶分子进行改造:包括酶
4、一级结构中氨基酸包括酶一级结构中氨基酸置换、肽链切割、氨基酸侧链修饰等置换、肽链切割、氨基酸侧链修饰等。5.15.1、酶分子修饰的定义及其意义、酶分子修饰的定义及其意义o1、定义:、定义:通过通过各种方法各种方法使使酶分子的结构酶分子的结构发生发生某些改变某些改变,从而从而改变酶的某些特性和功能改变酶的某些特性和功能的技术过程。的技术过程。即在体外将酶分子通过即在体外将酶分子通过人工的方法人工的方法与一些化学基团(物质),与一些化学基团(物质),特别是特别是具有生物相容性的物质具有生物相容性的物质,进行,进行共价连接共价连接,从而改变酶的结构,从而改变酶的结构和性质。和性质。讨论讨论:自然界中
5、存在酶分子改造修饰吗?自然界中存在酶分子改造修饰吗?酶原激活酶原激活可逆共价调节可逆共价调节l胃蛋白酶原、胰蛋白酶原、胰凝乳蛋白酶原胃蛋白酶原、胰蛋白酶原、胰凝乳蛋白酶原 l磷酸化磷酸化酶酶a与磷酸化与磷酸化酶酶b互互变变 2 2、酶分子修饰的意义、酶分子修饰的意义u增强酶的增强酶的稳定性(稳定性(stability)u提高酶的提高酶的活力(活力(activity)u降低或消除酶的降低或消除酶的抗原性(抗原性(immunological property)u研究和了解酶分子中主链、侧链、组成单位、金属离子研究和了解酶分子中主链、侧链、组成单位、金属离子和各种物理因素对酶分子空间构象(和各种物理
6、因素对酶分子空间构象(structure)的影响)的影响3 3、酶分子修饰的基本要求和条件、酶分子修饰的基本要求和条件(1 1)对酶性质的了解:)对酶性质的了解:酶的稳定性:热稳定性、酸碱稳定性、抑制剂等酶的稳定性:热稳定性、酸碱稳定性、抑制剂等酶活性中心的状况:活性中心基团、辅因子以及分子大小、性状、亚基数酶活性中心的状况:活性中心基团、辅因子以及分子大小、性状、亚基数(2 2)对修饰剂的要求:)对修饰剂的要求:良好的生物相容性和水溶性良好的生物相容性和水溶性修饰剂的相对分子质量(较大)、修饰剂链的长度对蛋白质的吸附性修饰剂的相对分子质量(较大)、修饰剂链的长度对蛋白质的吸附性修饰剂上反应基
7、团的数目及位置修饰剂上反应基团的数目及位置修饰剂上反应基团的活化方法与条件修饰剂上反应基团的活化方法与条件(3 3)对酶反应条件的选择:)对酶反应条件的选择:反应体系中酶与修饰剂的分子比例反应体系中酶与修饰剂的分子比例反应体系中的溶剂性质、盐浓度和反应体系中的溶剂性质、盐浓度和pHpH条件条件反应温度及时间反应温度及时间5.25.2、酶分子的修饰方法、酶分子的修饰方法 o物理修饰:物理修饰:不改变酶的组成单位及其基团的修饰,即酶分子中的不改变酶的组成单位及其基团的修饰,即酶分子中的共价键不发生改变共价键不发生改变,只是在,只是在物理因素(高温、高压、物理因素(高温、高压、高盐、极端高盐、极端p
8、HpH值)作用下,副键发生某些变化和重排值)作用下,副键发生某些变化和重排。o化学修饰:化学修饰:广义广义:指凡涉及共价部分或部分共价键的形成或破坏的指凡涉及共价部分或部分共价键的形成或破坏的转变。转变。狭义狭义:指在指在较温和的条件下较温和的条件下以以可控可控的方式使一种蛋白质的方式使一种蛋白质与某些化学试剂起特异反应,从而引起单个氨基酸残与某些化学试剂起特异反应,从而引起单个氨基酸残基或其功能基团发生基或其功能基团发生共价共价的化学变化。的化学变化。一、影响酶分子化学修饰的主要因素一、影响酶分子化学修饰的主要因素o1 1、酶蛋白功能基团的反应性、酶蛋白功能基团的反应性蛋白质功能基团所处的环
9、境蛋白质功能基团所处的环境会强烈地影响它的物理和会强烈地影响它的物理和化学性质化学性质蛋白质分子的表面特点蛋白质分子的表面特点也影响化学试剂的接近也影响化学试剂的接近 因此,有必要考察因此,有必要考察局部衡区局部衡区对功能基和修饰剂的影响。对功能基和修饰剂的影响。由于功能基的反应性是通过它的由于功能基的反应性是通过它的亲核性亲核性来测量的,应来测量的,应当当强调强调pKapKa和影响和影响pKapKa的因素的因素。o2 2、修饰剂的反应性、修饰剂的反应性 1 1、影响酶蛋白功能基团的反应性因素、影响酶蛋白功能基团的反应性因素微区的极性微区的极性基团间的氢键基团间的氢键静电效应静电效应位阻效应位
10、阻效应其它其它电荷转移、共价键形成、金属螯合、旋转自由度电荷转移、共价键形成、金属螯合、旋转自由度微区的极性微区的极性o微区的极性微区的极性是决定基团解离状态的关键因素之一。是决定基团解离状态的关键因素之一。极性对整个反应速度影响与极性对整个反应速度影响与反应的类型反应的类型有密切关系。有密切关系。u从整体看来,局部极性的改变对从整体看来,局部极性的改变对色氨酸、甲硫氨酸色氨酸、甲硫氨酸和和胱氨酸胱氨酸反应性的影响较小反应性的影响较小u对对氨基氨基和和组氨酸组氨酸反应性的影响较大反应性的影响较大u对对酪氨酸、半胱氨酸酪氨酸、半胱氨酸和和羧基羧基的反应性影响最大的反应性影响最大基团间的氢键作用基
11、团间的氢键作用o在蛋白质的酚基在蛋白质的酚基-羧基相互作用中,羧基的羧基相互作用中,羧基的pKapKa应比正应比正常值低,而酚基的常值低,而酚基的pKapKa高于正常值。高于正常值。+H+静电效应静电效应o用高分辨率的核磁共振用高分辨率的核磁共振组氨酸残基组氨酸残基的电离行为的电离行为进行研究表明,不同蛋白质中的进行研究表明,不同蛋白质中的组氨酸残基组氨酸残基的的pKapKa是不同的;是不同的;o原因可能在于原因可能在于带电基团相互静电作用的影响带电基团相互静电作用的影响。位阻效应位阻效应o烷基烷基在空间上紧靠功能基,会使修饰剂不能与功能在空间上紧靠功能基,会使修饰剂不能与功能基接触,出现基接
12、触,出现位阻效应位阻效应。对对枯草杆菌蛋白酶枯草杆菌蛋白酶BPNBPN的的X X射线衍射研究指出:射线衍射研究指出:1010个个酪氨酸残基均在蛋白质分子表面酪氨酸残基均在蛋白质分子表面,而且苯酚的羟基,而且苯酚的羟基几乎在所有情况下都几乎在所有情况下都没有形成氢键没有形成氢键。对它进行。对它进行彻底彻底硝化和碘化硝化和碘化后,后,1010个酪氨酸中只有个酪氨酸中只有8 8个被修饰个被修饰。若。若没有没有X X射线衍射研究结果,很可能解释为至少有射线衍射研究结果,很可能解释为至少有2 2个个酪氨酸残基酪氨酸残基被包埋在分子内部被包埋在分子内部,但实际情况并不是,但实际情况并不是这样的,这种情况很
13、可能是空间障碍引起的。这样的,这种情况很可能是空间障碍引起的。旋转自由度旋转自由度o加快修饰反应速度的一个重要原因是限制了构象加快修饰反应速度的一个重要原因是限制了构象的总数的总数(即即限制了旋转自由度限制了旋转自由度),这种限制可能是,这种限制可能是由于上述提及的几类由于上述提及的几类相互作用相互作用引起的。引起的。酚酸的酯化速度酚酸的酯化速度:在苯环上引入几个甲基,特别是在同一碳原子上引入2个甲基,则限制了基团的自由旋转,因而使酚酸的酯化速度常数提高了108倍以上。2 2、影响修饰剂反应性的因素、影响修饰剂反应性的因素选择吸附选择吸附静电相互作用静电相互作用位阻因素位阻因素催化因素催化因素
14、选择吸附选择吸附化学修饰前,修饰剂是根据各自的特点化学修饰前,修饰剂是根据各自的特点选择性地选择性地吸附吸附在低极性区或高极性区,有时可以根据对速在低极性区或高极性区,有时可以根据对速度的饱和效应,检测出度的饱和效应,检测出蛋白质蛋白质-修饰剂复合物修饰剂复合物的形的形成。成。正像正像酶酶-底物复合物底物复合物那样,蛋白质修饰剂复合物形那样,蛋白质修饰剂复合物形成后,修饰过程的速度就加强了,这种速度的加成后,修饰过程的速度就加强了,这种速度的加强,部分是由于选择性吸附的结果。强,部分是由于选择性吸附的结果。静电相互作用静电相互作用o带电的修饰剂能被选择性地吸引到蛋白质表面带相带电的修饰剂能被选
15、择性地吸引到蛋白质表面带相反电荷的部位,反电荷的部位,静电相互作用静电相互作用可使修饰剂向多功能可使修饰剂向多功能部位中的一个残基定位或向双功能基的一侧定位。部位中的一个残基定位或向双功能基的一侧定位。修饰剂的静电取向也是影响其反应性的一个因素。修饰剂的静电取向也是影响其反应性的一个因素。碘乙酸碘乙酸和和碘乙酰胺碘乙酰胺烷基化速度和烷基化部位差异烷基化速度和烷基化部位差异o此外,此外,静电排斥力静电排斥力能抑制修饰作用。能抑制修饰作用。位阻因素位阻因素o蛋白质表面的位阻因素或者底物、辅因子、抑制剂蛋白质表面的位阻因素或者底物、辅因子、抑制剂所产生的所产生的位阻因素位阻因素都可能阻止修饰剂与功能
16、基的正都可能阻止修饰剂与功能基的正常反应。但修饰的结果却能提供有关蛋白质表面的常反应。但修饰的结果却能提供有关蛋白质表面的有用信息。有用信息。用用a溴代丁酸溴代丁酸可烷基化可烷基化核糖核酸酶核糖核酸酶第第l2号组氨酸,号组氨酸,而且反应进行很快;而且反应进行很快;若用若用a溴代戊酸溴代戊酸作修饰剂,则很难进行反应;作修饰剂,则很难进行反应;若用若用a溴代己酸溴代己酸作修饰剂,则不能发生烷化反应。作修饰剂,则不能发生烷化反应。催化因素催化因素o修饰部位的其他功能基,如果是产生一般的修饰部位的其他功能基,如果是产生一般的酸碱催酸碱催化作用化作用,则也能影响修饰反应。不同的修饰剂,其,则也能影响修饰
17、反应。不同的修饰剂,其反应速度和反应部位有明显差异。反应速度和反应部位有明显差异。对硝基苯乙酸盐对硝基苯乙酸盐和和苯乙酸盐苯乙酸盐对对胰凝乳蛋白酶胰凝乳蛋白酶的活性的活性丝氨酸的丝氨酸的乙酰化乙酰化属于同一机理,但苯乙酸盐的反应属于同一机理,但苯乙酸盐的反应性差,这在较大程度上与酶的酸碱催化有关。性差,这在较大程度上与酶的酸碱催化有关。氟磷酸盐氟磷酸盐与与氯磷酸盐氯磷酸盐相比,对相比,对丝氨酸酶丝氨酸酶有非常高的有非常高的反应性,这可能与一般酸碱催化除去氟原子有关。反应性,这可能与一般酸碱催化除去氟原子有关。3 3、修饰反应专一性的控制、修饰反应专一性的控制u(1)(1)试剂的选择试剂的选择
18、u(2)(2)反应条件的选择反应条件的选择u(3)(3)反应的专一性反应的专一性(1)(1)试剂的选择试剂的选择 一般来说,选择蛋白质修饰剂要考虑以下问题:一般来说,选择蛋白质修饰剂要考虑以下问题:l修饰反应要完成到什么程度修饰反应要完成到什么程度l对个别氨基酸是否专一对个别氨基酸是否专一l在反应条件下,修饰反应有没有限度在反应条件下,修饰反应有没有限度l修饰后蛋白质的构象是否基本保持不变修饰后蛋白质的构象是否基本保持不变l是否需要分离修饰后的衍生物是否需要分离修饰后的衍生物l反应是否可逆反应是否可逆l是否适合于建立快速、方便的分析方法是否适合于建立快速、方便的分析方法o蛋白质的蛋白质的空间结
19、构空间结构和试剂的和试剂的空间结构空间结构之间的之间的相互相互影响影响也能加强修饰反应速度和反应的专一性。也能加强修饰反应速度和反应的专一性。对对核糖核酸酶核糖核酸酶A A第第119119号号组氨酸和组氨酸和第第l2l2号号组氨酸的组氨酸的修饰,使用不同的试剂,这两个残基的反应速度修饰,使用不同的试剂,这两个残基的反应速度就不同。就不同。烷基化反应在烷基化反应在第第l2l2号号组氨酸;羧甲基化组氨酸;羧甲基化反应反应选择性修饰第选择性修饰第119119号组氨酸号组氨酸。o一般来说,一般来说,试剂的体积小一些为宜试剂的体积小一些为宜,这样既能保,这样既能保证修饰反应顺利进行,又可减少因空间障碍而
20、破证修饰反应顺利进行,又可减少因空间障碍而破坏蛋白质分子严密结构的危险。坏蛋白质分子严密结构的危险。(2)(2)反应条件的选择反应条件的选择 蛋白质与修饰剂作用所要求的反应条件,除允许能顺利进蛋白质与修饰剂作用所要求的反应条件,除允许能顺利进行外,还必须满足以下要求:行外,还必须满足以下要求:o一是不造成蛋白质的不可逆变性(一是不造成蛋白质的不可逆变性(做对照实验做对照实验););o二是有利于专一性修饰蛋白质(二是有利于专一性修饰蛋白质(反应的温度、反应的温度、pHpH、反应介、反应介质、缓冲液质、缓冲液)。)。氯离子氯离子能够抑制能够抑制碳酸酐酶的酯酶碳酸酐酶的酯酶活力,所以修饰反应缓冲活力
21、,所以修饰反应缓冲液中不能含有氯离子;液中不能含有氯离子;磷酸盐磷酸盐是某些酶的竞争抑制剂,该离子的结合可能会封闭是某些酶的竞争抑制剂,该离子的结合可能会封闭修饰部位;修饰部位;钙离子钙离子对对-淀粉酶的激活作用。淀粉酶的激活作用。(3)(3)反应的专一性反应的专一性利用蛋白质分子中某些基团的特殊性:利用蛋白质分子中某些基团的特殊性:o二异丙基氟磷酸酯二异丙基氟磷酸酯(DEP)能与能与胰凝乳蛋白酶的活性丝氨酸胰凝乳蛋白酶的活性丝氨酸作用迅速导致酶失活,但作用迅速导致酶失活,但DEP在同样条件下却不能与在同样条件下却不能与胰凝胰凝乳蛋白酶原乳蛋白酶原及一些简单的模拟化合物作用;及一些简单的模拟化
22、合物作用;选择不同的反应选择不同的反应pH值:值:o蛋白质分子中各功能基的解离常数蛋白质分子中各功能基的解离常数(pKa)是不同的。如用是不同的。如用溴溴(碘碘)代乙酸代乙酸(或其酰胺或其酰胺)对蛋白质进行修饰时:对蛋白质进行修饰时:当反应当反应pH值为值为6时,只专一与时,只专一与组氨酸的咪唑基组氨酸的咪唑基作用;作用;当反应当反应pH值为值为3时,则专一与时,则专一与甲硫氨酸侧链甲硫氨酸侧链作用。作用。反应的专一性反应的专一性利用某些产物的不稳定性:利用某些产物的不稳定性:在高在高pHpH值下,用值下,用二硫化碳、二硫化碳、O O一甲基异脲和亚氨酸一甲基异脲和亚氨酸等可将等可将氨氨基转变成
23、脲和胍的衍生物基转变成脲和胍的衍生物。虽然。虽然巯基巯基也能与上述试剂作用,也能与上述试剂作用,但因但因pHpH值高,与巯基形成的产物可被迅速分解。值高,与巯基形成的产物可被迅速分解。亲和标记:亲和标记:o实现专一性修饰的重要途径,亲和标记试剂除了实现专一性修饰的重要途径,亲和标记试剂除了能与蛋白能与蛋白质作用质作用外,还要求外,还要求试剂的结构和与蛋白质作用的底物或抑试剂的结构和与蛋白质作用的底物或抑制剂相似制剂相似。o在作用前试剂是先以在作用前试剂是先以非共价键非共价键形式结合到蛋白质的活性部形式结合到蛋白质的活性部位上,然后再发生位上,然后再发生化学作用化学作用,将试剂置于活性部位基团上
24、。,将试剂置于活性部位基团上。对甲基苯磺酰氟对甲基苯磺酰氟能作用于能作用于胰凝乳蛋白酶的活性丝氨酸胰凝乳蛋白酶的活性丝氨酸。反应的专一性反应的专一性差别标记:差别标记:o在在底物或抑制剂底物或抑制剂存在下进行化学修饰时,由于它们存在下进行化学修饰时,由于它们保护着蛋白保护着蛋白质的活性部位基团质的活性部位基团,使这些基团不能与试剂作用,然后将过量,使这些基团不能与试剂作用,然后将过量的底物或抑制剂除去,所得到的部分修饰的蛋白质的底物或抑制剂除去,所得到的部分修饰的蛋白质再与含同位再与含同位素标记的同样试剂作用素标记的同样试剂作用,结果只有原来被底物或抑制剂保护的,结果只有原来被底物或抑制剂保护
25、的基团是带放射性同位素标记的。用这一方法可直接得到蛋白质基团是带放射性同位素标记的。用这一方法可直接得到蛋白质发挥功能作用的发挥功能作用的必需基团必需基团;利用蛋白质状态的差异:利用蛋白质状态的差异:o有时在结晶状态下进行反应,可以提高修饰的专一性。有时在结晶状态下进行反应,可以提高修饰的专一性。核糖核酸酶核糖核酸酶在在晶体状态下晶体状态下进行进行羧甲基化羧甲基化时,反应主要集中在第时,反应主要集中在第119号组氨酸上,对第号组氨酸上,对第12号组氨酸修饰很少,两者之比为号组氨酸修饰很少,两者之比为60:1;但;但在水溶液在水溶液中进行同样的修饰,两者之比为中进行同样的修饰,两者之比为15:1
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