第七章-外源基因的表达及其优化策略课件.ppt
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1、第七章第七章 外源基因的表达及其优化策略外源基因的表达及其优化策略第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 第二节外源基因在原核细胞中的表达第二节外源基因在原核细胞中的表达 第三节外源基因在真核细胞中的表达第三节外源基因在真核细胞中的表达第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素基因表达:基因表达:从从DNA分子有序地将其所承载的遗传信息分子有序地将其所承载的遗传信息,通过通过密码子密码子和反密码子和反密码子系统系统,转变由特定氨基酸顺序构成的转变由特定氨基酸顺序构成的多肽或蛋白多肽或蛋白质质分子过程,从而决定生物有机体遗传表型。分子过程,从而决定生物有机体遗传表
2、型。基因表达基因表达是指结构基因在生物体中的转录、翻译以及是指结构基因在生物体中的转录、翻译以及所有加工过程。所有加工过程。基因工程中基因工程中基因高效表达研究基因高效表达研究是指外源基因在某种细是指外源基因在某种细胞中的表达活动,即剪切下外源基因片段,拼接到另一个胞中的表达活动,即剪切下外源基因片段,拼接到另一个基因表达体系中,使其能获得原生物活性又可高产的表达基因表达体系中,使其能获得原生物活性又可高产的表达产物。产物。第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素基因表达基因表达 遗传信息从遗传信息从DNA到蛋白质的到蛋白
3、质的传递过程传递过程中心法则(中心法则(central dogma)。)。第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素克隆基因的表达克隆基因的表达 外源基因在宿主细胞中表达外源基因在宿主细胞中表达 外源基因外源基因 表达载体表达载体 重组载体重组载体 导入宿主细胞导入宿主细胞 在宿主细胞中在宿主细胞中 表达出蛋白质表达出蛋白质 提取蛋白提取蛋白 宿主细胞:宿主细胞:原核细胞或真核细胞原核细胞或真核细胞第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 影响外源基因表达的因素主要有:影响外源基因表达的因素主要有:阅读框架阅读框架 顺式作用元件顺式作用元件 翻译过程翻译过程 表达
4、体系表达体系第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 一、阅读框架对转化基因的影响一、阅读框架对转化基因的影响 什么是阅读框架什么是阅读框架(open reading frame,ORF)?二、顺式作用元件对基因表达的影响二、顺式作用元件对基因表达的影响 1.对基因转录起始的调控对基因转录起始的调控 1)启动子启动子 2)增强子增强子 3)沉默子沉默子第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 二、顺式作用元件对基因表达的影响二、顺式作用元件对基因表达的影响 2.对基因转录终止的调控对基因转录终止的调控 1)终止子终止子 2)衰减子衰减子 3.对对DNA结构的影响
5、结构的影响 1)核基质结合区:一段与核基质特异结合的核基质结合区:一段与核基质特异结合的DNA序列。序列。2)绝缘子:对一侧有作用,对另一侧没有。绝缘子:对一侧有作用,对另一侧没有。3)基因座控制区:通过改变染色质结构导致基因转录。基因座控制区:通过改变染色质结构导致基因转录。第一节影响外源基因表达的因素第一节影响外源基因表达的因素 三、翻译过程对表达的影响三、翻译过程对表达的影响 1.翻译起始对基因表达的影响翻译起始对基因表达的影响 2.密码子偏爱性对基因表达的影响密码子偏爱性对基因表达的影响 3.翻译终止对基因表达的影响翻译终止对基因表达的影响 四、表达系统对表达产物的影响四、表达系统对表
6、达产物的影响第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达 外源基因表达系统由外源基因表达系统由基因表达载体基因表达载体和相应的和相应的受体细胞受体细胞两部分组成。两部分组成。宿主细胞分为两大类:宿主细胞分为两大类:第一类为原核细胞第一类为原核细胞:大肠杆菌、枯草芽胞杆菌、链霉菌等;大肠杆菌、枯草芽胞杆菌、链霉菌等;第二类为真核细胞第二类为真核细胞:酵母、丝状真菌、哺乳动物细胞等。酵母、丝状真菌、哺乳动物细胞等。目前使用最广泛的宿主菌是大肠杆菌和酿酒酵母,已建立了许多适合它目前使用最广泛的宿主菌是大肠杆菌和酿酒酵母,已建立了许多适合它们的克隆载体和们的克隆载体和DNADNA
7、导入方法。许多外源基因已获得成功表达。导入方法。许多外源基因已获得成功表达。第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达用原核生物作宿主。用原核生物作宿主。A dividing E.coli 原核或噬菌体启动子原核或噬菌体启动子 MCS SD序列序列 终止子终止子 第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达大肠杆菌作为表达外源基因受体菌的特征大肠杆菌作为表达外源基因受体菌的特征 大肠杆菌表达外源基因的优势大肠杆菌表达外源基因的优势 全基因组测序,共有全基因组测序,共有44054405个开放型阅读框架个开放型阅读框架 基因克隆表达系统成熟完善基因克隆
8、表达系统成熟完善 繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定繁殖迅速、培养简单、操作方便、遗传稳定 被美国被美国FDAFDA批准为安全的基因工程受体生物批准为安全的基因工程受体生物第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达大肠杆菌作为表达外源基因受体菌的特征大肠杆菌作为表达外源基因受体菌的特征 大肠杆菌表达外源基因的劣势大肠杆菌表达外源基因的劣势 缺乏对真核生物蛋白质的复性功能缺乏对真核生物蛋白质的复性功能 缺乏对真核生物蛋白质的修饰加工系统缺乏对真核生物蛋白质的修饰加工系统 内源性蛋白酶降解空间构象不正确的异源蛋白内源性蛋白酶降解空间构象不正确的异源蛋白真核与原核生物结构
9、上存在差别真核与原核生物结构上存在差别第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达一、原核生物细胞表达的特点一、原核生物细胞表达的特点 1.原核生物只有原核生物只有一种一种RNA聚合酶聚合酶识别原核细胞的启动识别原核细胞的启动子,催化所有子,催化所有RNA的合成。的合成。2.原核生物的表达是以原核生物的表达是以操纵子操纵子为单位的。为单位的。Z Z编码编码-半乳糖苷酶;半乳糖苷酶;Y Y编码编码-半乳糖苷透过酶;半乳糖苷透过酶;A A编码编码-半乳糖苷乙酰半乳糖苷乙酰基转移酶。基转移酶。第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达一、原核生物细胞表达
10、的特点一、原核生物细胞表达的特点 3.原核生物的转录与翻译是偶联的,也是连续进行的。原核生物的转录与翻译是偶联的,也是连续进行的。4.原核细胞中缺乏真核细胞的转录后加工系统。原核细胞中缺乏真核细胞的转录后加工系统。5.原核生物基因的控制主要在转录水平,这种控制要比原核生物基因的控制主要在转录水平,这种控制要比对基因产物直接控制要慢。对基因产物直接控制要慢。第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达一、原核生物细胞表达的特点一、原核生物细胞表达的特点 6.在大肠杆菌在大肠杆菌mRNA的核糖体结合位点上,含有一个翻的核糖体结合位点上,含有一个翻译起始密码子及同译起始密码子及
11、同16S RNA 3末端碱基互补的序列,即末端碱基互补的序列,即SD序列序列。Shine-Dalgarno(S-D)sequence:含有一个启始密码子含有一个启始密码子和一段同核糖体和一段同核糖体16SRNA3末端碱基互补的序列,叫末端碱基互补的序列,叫Shine-Dalgarno(S-D)序列。)序列。第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达二、外源基因在原核细胞中表达具备条件二、外源基因在原核细胞中表达具备条件 1.通过通过表达载体表达载体将外源基因导入宿主菌,并指导宿主菌的酶系统合将外源基因导入宿主菌,并指导宿主菌的酶系统合成外源蛋白。成外源蛋白。2.外源基因
12、不能带有间隔顺序外源基因不能带有间隔顺序(内含子内含子),因而必须用,因而必须用cDNA或全化或全化学合成基因,而不能用基因组学合成基因,而不能用基因组DNA。3.必须利用原核细胞的必须利用原核细胞的强启动子强启动子和和SD序列序列等调控元件控制外源基等调控元件控制外源基因的表达。因的表达。4.外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的外源基因与表达载体连接后,必须形成正确的开放阅读框架开放阅读框架(ORF)。5.利用利用宿主菌的调控系统宿主菌的调控系统,调节外源基因的表达,防止外源基因的,调节外源基因的表达,防止外源基因的表达产物对宿主菌的毒害。表达产物对宿主菌的毒害。第二节第二节 外源基因在
13、原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达 原核生物基因表达载体的组成特征原核生物基因表达载体的组成特征 启动子启动子 核糖体结合位点核糖体结合位点(SD序列序列)终止子终止子 选择标记基因选择标记基因 复制子复制子 原核生物基因表达的受体系统原核生物基因表达的受体系统 大肠杆菌受体系统、芽孢杆菌受体系统大肠杆菌受体系统、芽孢杆菌受体系统 链霉菌受体系统、蓝藻受体系统链霉菌受体系统、蓝藻受体系统大肠杆菌表达载体的基本成分大肠杆菌表达载体的基本成分第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表
14、达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子 是是DNA上的能与上的能与RNA聚合酶结合并能起始聚合酶结合并能起始mRNA合成合成的序列。的序列。(1)启动子序列)启动子序列 大大肠肠杆杆菌菌的的所所有有启启动动子子中中都都有有两两段段一一致致顺顺序序(consensus sequence)。)。-35 Box 和和-10 Box 第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达不同启动子的不同启动子的consensus sequences 第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动
15、子启动子(1)启动子序列)启动子序列 -35 box:RNA聚合酶聚合酶 亚基的识别位点亚基的识别位点。5-TTGACA-3 -10 box(Pribnow Box):):5-TATAAT-3 TTGACATTGACA TATAAT TATAAT 转录起始位点转录起始位点 17bp17bp 5 5 核糖体结合位点核糖体结合位点 第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达原核启动子共有序列的功能 三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子(1)启动子序列)启动子序列第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基
16、因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 1.启动子启动子 (2)翻译的起始位点)翻译的起始位点 a)核糖体结合位点(核糖体结合位点(ribosome binding site,RBS)Shine-Dalgarno(SD)sequence:mRNA上与核糖体上与核糖体16sRNA结合的序列。结合的序列。S-D序列距离序列距离AUG的距离也影响翻译,最佳距离的距离也影响翻译,最佳距离4-8 nt b)起始密码:位于起始密码:位于SD序列下游序列下游 AUG(91%)、)、GUG(8%)、)、UUG(1%)第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三
17、、原核生物基因表达的调控 2.RNA多聚酶多聚酶 大肠杆菌只有一种类型的大肠杆菌只有一种类型的RNA多聚酶转录多聚酶转录tRNA,rRNA和和mRNA。第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.转录终止子转录终止子 在表达载体克隆位点的下游一般设计一段转录终止子。在表达载体克隆位点的下游一般设计一段转录终止子。启动子启动子 操纵区操纵区S-D序列序列 目的基因目的基因 终止子终止子 第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.转录终止
18、子转录终止子 原理:原理:茎环结构茎环结构 反向回文顺序被转录后,立即形成一个茎环结构,使反向回文顺序被转录后,立即形成一个茎环结构,使转录物与模板之间配对的碱基数降低,整个减弱了转录物与模板之间配对的碱基数降低,整个减弱了RNA 与与DNA的互作的互作 多聚多聚A/U 由于茎环由于茎环3段紧接一串段紧接一串A/U的配对,稳定性比较差,有的配对,稳定性比较差,有利于转录物脱落而不利于转录延续。利于转录物脱落而不利于转录延续。第二节第二节 外源基因在原核细胞中的表达外源基因在原核细胞中的表达三、原核生物基因表达的调控三、原核生物基因表达的调控 3.转录终止子转录终止子第二节第二节 外源基因在原核
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- 第七 基因 表达 及其 优化 策略 课件
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