《超分子化学简介》PPT课件.ppt
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1、 第七章 超分子化学简介Introduction to supermolucular chemistry7.1 超分子的概念超分子的概念7.2超分子稳定形成的因素超分子稳定形成的因素 7.2.1 能量因素能量因素 7.2.2 熵增加因素熵增加因素 7.2.3 锁和钥匙原理锁和钥匙原理7.3 分子识别和自组装分子识别和自组装 7.3.1 两个概念两个概念 7.3.2 冠醚和穴状配体的识别和组装冠醚和穴状配体的识别和组装 7.3.3 氢键识别和自组装氢键识别和自组装 第第第第7 7 7 7章目录章目录章目录章目录 7.3.4 配位键的自组装配位键的自组装 7.3.5 疏水作用的识别和组装疏水作用的
2、识别和组装7.4 晶体工程晶体工程 7.4.1 概念和特点概念和特点 7.4.2 晶体工程的谋略晶体工程的谋略 7.4.3 晶体工程构筑示例晶体工程构筑示例7.5 应用和展望应用和展望 第第第第7 7 7 7章目录章目录章目录章目录超分子化学起源于碱金属阳离子能被冠醚和穴醚选择超分子化学起源于碱金属阳离子能被冠醚和穴醚选择性结合,它拓展后导致了分子识别的出现并证明为一性结合,它拓展后导致了分子识别的出现并证明为一新的化学领域,进一步延伸到分子相互作用和过程,新的化学领域,进一步延伸到分子相互作用和过程,并广泛扩展到其他领域后诞生了超分子化学。并广泛扩展到其他领域后诞生了超分子化学。超分子化学定
3、义的表述:正如基于共价键存在着分子超分子化学定义的表述:正如基于共价键存在着分子化学领域,基于分子有序体和分子间价键而存在这超化学领域,基于分子有序体和分子间价键而存在这超分子化学分子化学 7.1 超分子的概念超分子化学是超越分子之上的化学,超分子是由两个或超分子化学是超越分子之上的化学,超分子是由两个或者更多的化学物种通过分子间力缔合在一起而形成的具者更多的化学物种通过分子间力缔合在一起而形成的具有更高复杂性的有组织实体。有更高复杂性的有组织实体。7.1 超分子的概念受体受体底物底物超分子超分子相互作用转换识别易位自组织自组装供能组分分子分子/超分子超分子器件器件合成共价键ABCD分子化学超
4、分子化学一个化学物种是通过其组分、通过把这些组分连在一起的价键的性质,及由此产生的空间(几何、拓扑)特征而被定义 7.1 超分子的概念超分子物种是由其组分、建筑或超结构的空间排列、连接组分的分子间价键的性质来表征。具有确定的结构、构象、化学热力学、动力学和分子动力学性质。不同类型的相互作用力是可以区分的,代表不同程度的强度、取向及对距离和角度的依赖性。作用力:金属离子配位键、静电引力、氢键、范德华相互作用、给体-受体相互作用。强度分布:氢键的弱到中等(如酶-底物),到金属离子配位键的强或非常强(其强度可达到包含很多独立相互作用的抗原抗体作用强度范围,或更强些)。超分子物种的热力学稳定性不如分子
5、,但动力学上更易变,具有动态柔顺性。超分子化学涉及的是软化学键,代表一门“软化学”。超分子化学研究对象是:超分子实体(supramolecular entities),即具有分子本身的特征并由这些特征来定义的超分子(supermolecule)。分子与原子和共价键的关系如同超分子与分子和分子间价键。超分子代表了继基本粒子、原子核、原子和分子之后的下一个层次的物质的复杂性。化学术语中的原子、分子、超分子相当于字母、单词和句子。7.1 超分子的概念超分子化合物中的组分被命名为受体()和底物(),底物通常指被结合的较小部分。一个特定的底物与受体选择性结合后产生了超分子()。如果受体除又结合位点外,还
6、有反应功能,则它可能在被束缚的底物上产生一化学变化而引起超分子试剂作用。亲油的膜溶性受体可作为载体使被束缚的底物易位。超分子物种基本功能:分子识别、转换、易位。结合组织化的多分子有序体和相(层结构、膜、囊泡、液晶等),功能超分子可以导致分子和分子器件的发展。近期的研究方向涉及到自发过程(自组装、自组织、复制)和程序化高分子设计。7.1 超分子的概念超分子化学分成部分交叉的两大领域 超分子指几个组分(一个受体及一个或多个底物)在分子识别原理的基础上按照内装的构造方案通过分子间缔合而形成的含义明确的、分立的寡聚分子物种 超分子有序体指数目不定的大量组分自发缔合产生某个特定的相而形成得多分子实体。这
7、里,特定的相(薄膜、层结构、膜结构、囊泡、胶束、液晶相、固态结构等)或多或少具有确定的微观组织和取决于本性的宏观性质。域自身所表明的,从分子化学到超分子化学的过渡导致了对象和目标从结构和性质变成了体系和功能。7.1 超分子的概念超分子命名描述被结合底物与受体间的相对空间位置也需要一些方式。外部加合复合物可以表示成A,B或A/B,表示 与 的包合;,表示 与 部分交叠目前,超分子化学的术语正在形成之中,一个有概念、术语和琐碎的名词组成的体系正在产生之中。超分子化学概念的凝聚力和学科交叉的特性,吸引了不同化学领域的研究者。7.1 超分子的概念7.2 超分子稳定形成的因素超分子稳定形成的因素 7.2
8、 超分子稳定形成的因素 G=H-TS 能量因素 熵因素是是远远程程相相互互作作用用能能。Kesoon、Debye和和London等等人人的的研研究究分分别揭示了其中静电能、诱导能和色散能的性质。别揭示了其中静电能、诱导能和色散能的性质。静静电电作作用用 两两种种极极性性分分子子的的永永久久偶偶极极矩矩1与与2之之间间产产生生的的相相互互作用能属于静电能,亦称作用能属于静电能,亦称Kesoon能,平均能量为能,平均能量为 7.2.1 能量因素7.2.1 能量因素能量因素:降低能量在于分子间键的形成能量因素:降低能量在于分子间键的形成。1.van der Waals作用能作用能 诱导作用诱导作用
9、极性分子的永久偶极矩极性分子的永久偶极矩1,会使极化率为,会使极化率为2的邻近分子发生电的邻近分子发生电荷位移,出现诱导偶极矩。永久偶极矩和诱导偶极矩之间的相互作荷位移,出现诱导偶极矩。永久偶极矩和诱导偶极矩之间的相互作用能称为诱导能,亦称用能称为诱导能,亦称Debye能。平均值为能。平均值为 色散作用色散作用 非极性分子虽没有永久偶极矩,却有瞬间偶极矩,使邻近分子非极性分子虽没有永久偶极矩,却有瞬间偶极矩,使邻近分子产生诱导偶极矩,瞬间偶极矩与诱导偶极矩间的相互作用能称为色产生诱导偶极矩,瞬间偶极矩与诱导偶极矩间的相互作用能称为色散能,亦称散能,亦称London能。近似表达式为能。近似表达式
10、为 7.2.1 能量因素 在超分子中,在超分子中,van der Waals作用能对包合物的形成非常重作用能对包合物的形成非常重要,但这种作用能通常没有方向性和饱和性,因而在超分子化要,但这种作用能通常没有方向性和饱和性,因而在超分子化学中设计主学中设计主-客体的选择性配合时应用有限。客体的选择性配合时应用有限。7.2.1 能量因素 常常规规氢氢键键的的一一般般形形式式是是D-H-A。D是是氢氢键键给给体体,A是是氢氢键键受受体体。也也可可以以是是对对称称氢氢键键X-H-X。按按其其作作用用能能大大小小,可分为强氢键、中等氢键、弱氢键可分为强氢键、中等氢键、弱氢键3类。类。(1)强氢键、中等氢
11、键和弱氢键)强氢键、中等氢键和弱氢键氢键性质强中等弱D-H-A相互作用共价作用为主静电作用为主静电作用键能/(kJmol-1)12060601612键长/pm D-A220250250320320400 H-A120150150220220320键角/()17518013018090150 7.2.1 能量因素2.氢键作用氢键作用(2)常规氢键和非常规氢键)常规氢键和非常规氢键常规氢键常规氢键常规氢键常规氢键的一般形式是的一般形式是D-H-A由常规氢键形成的分立形结构由常规氢键形成的分立形结构由常规氢键形成的链状结构由常规氢键形成的链状结构 7.2.1 能量因素由常规氢键形成的层状结构由常规氢
12、键形成的层状结构 7.2.1 能量因素由常规氢键形成的三维网状结构由常规氢键形成的三维网状结构水分子之间通过水分子之间通过O-H-O氢键形成三维网状结构的冰氢键形成三维网状结构的冰 7.2.1 能量因素 DNA的的碱碱基基T(胸腺嘧啶)与与A(腺嘌呤)之之间间有有一一个个N-H-O和和一个一个N-H-N氢键氢键C(胞嘧啶)与与G(鸟嘌呤)之之间间有有一一个个N-H-N和和两两个个N-H-O氢键氢键 7.2.2 氢键 -螺螺旋旋是是一一种种典典型型的的蛋蛋白白质质二二级级结结构构,主主要要稳稳定定因因素素是是第第i个个氨氨基基酸酸残残基基的的肽肽键键氧氧与与第第i+4个个氨氨基基酸酸残残基基的的
13、肽肽键键氮氮氢氢之之间间形形成成的的N-H-O氢键。氢键。7.2.2 氢键 我我相相信信,当当结结构构化化学学方方法法进进一一步步被被应应用用到到生生理理问问题题上上时时,人人们们将将会会发发现现氢氢键键在在生生理理学学上上的的意意义义比比其其他他任任何何一个结构特点都大。一个结构特点都大。Pauling 化学键的本质化学键的本质 7.2.1 能量因素 Cl在在一一定定条条件件下下也也能能参参与与形形成成氢氢键键,例例如如,顺顺式式邻邻氯氯苯苯酚酚分分子子内内有有O-H-Cl氢氢键键;C附附近近存存在在电电负负性性较较大大的的原原子子时时也也能能形形成成氢氢键键,例例如如,(HCN)2、(HC
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