《翻译水平的调节》PPT课件.ppt
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1、四、翻译水平的调节遗传密码的性质遗传密码的性质通过校正通过校正tRNA的方式的方式校正基因的碱校正基因的碱基缺失和插入基缺失和插入l为催化为催化DNA拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催拓扑学异构体相互转变的酶之总称。催化化DNA链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反链断开和结合的偶联反应,为了分析体外反应机制,用环状应机制,用环状DNA为底物。在闭环状双链为底物。在闭环状双链DNA的拓扑学转变中,要暂时的将的拓扑学转变中,要暂时的将DNA的一个链或两个的一个链或两个链切断,根据异构体化的方式而分为二个型。切断链切断,根据异构体化的方式而分为二个型。切断一个链而改变拓扑结构的称为一个链而改变拓扑
2、结构的称为型拓扑异构酶型拓扑异构酶(top-oisomerase),通过切断二个链来进行的),通过切断二个链来进行的称为称为型拓扑异构酶(型拓扑异构酶(topoisomerase)。属于)。属于型的拓扑异构酶,有大肠杆菌的型的拓扑异构酶,有大肠杆菌的蛋白(蛋白(-protein,由分子量,由分子量11万的单个多肽链所成)及各种真核细万的单个多肽链所成)及各种真核细胞中存在的切断胞中存在的切断-结合酶(结合酶(nicking-closingenzyme,分子量约,分子量约6万万5千千7万的及分子量约万的及分子量约10万的)。万的)。型拓扑异构酶,有存在于细菌中的型拓扑异构酶,有存在于细菌中的DN
3、A促旋酶、促旋酶、噬菌体噬菌体T4的拓扑异构酶的拓扑异构酶以及真核细胞中依赖以及真核细胞中依赖ATP的拓扑异构酶的拓扑异构酶等。等。l在在型拓扑异构酶中,型拓扑异构酶中,DNA促旋酶可单促旋酶可单独催化闭环状独催化闭环状DNA产生超螺旋,这是独产生超螺旋,这是独特的。特的。(一一)翻译内含子翻译内含子(translationalintron)lT4DNA拓扑异构酶在拓扑异构酶在ATP存在下,可使超螺旋存在下,可使超螺旋DNA变成松散的变成松散的DNA,其中有,其中有DNA双链的断双链的断裂,链的旋转,再缝合。全酶由三种亚基六个裂,链的旋转,再缝合。全酶由三种亚基六个蛋白质分子组成,分别由基因蛋
4、白质分子组成,分别由基因39、基因、基因52和基和基因因60编码。基因编码。基因39编码的亚基有编码的亚基有520个氨基酸,个氨基酸,ATP酶活性。基因酶活性。基因52编码的亚基有编码的亚基有441个氨基个氨基酸,松散酸,松散DNA超螺旋。基因超螺旋。基因60编码的亚基有编码的亚基有160个氨基酸,结合各亚基,协调功能。这三个氨基酸,结合各亚基,协调功能。这三个亚基的蛋白质顺序已分析清楚。已经获得基个亚基的蛋白质顺序已分析清楚。已经获得基因因39、52、60的的DNA克隆,并在大肠杆菌中克隆,并在大肠杆菌中高效表达蛋白质。高效表达蛋白质。lT4DNAtopoisomerase:anewATP-
5、dependentenzymeessentialforinitiationofT4bacteriophageDNAreplicationlNature281,456-461(11October1979)lLeroyF.Liu,Chung-ChengLiu&BruceM.AlbertslDepartmentofBiochemistryandBiophysics,UniversityofCalifornia,SanFrancisco,California94143lNucleotidesequenceofatypeIIDNAtopoisomerasegene.BacteriophageT4gene
6、39lNucleicAcidsResearch,1986,Vol.14,No.197751-7765lWaiMunHuanglDepartmentofCellular,ViralandMolecularBiology,UniversityofUtahMedicalCenterSaltLakeCity,UT84132,USAlThe52-proteinsubunitofT4DNAtopoisomeraseishomologoustothegyrA-proteinofgyrase.lNucleicAcidsRes.1986September25;14(18):73797390.lWMHuangl对
7、基因对基因60的核苷酸序列分析后,难以排的核苷酸序列分析后,难以排出合适的阅读框架,与它表达产物蛋白出合适的阅读框架,与它表达产物蛋白质的氨基酸顺序对照,发现在第质的氨基酸顺序对照,发现在第46位甘位甘氨酸和第氨酸和第47位亮氨酸密码子之间,有位亮氨酸密码子之间,有50个核苷酸插入,其中紧跟第个核苷酸插入,其中紧跟第46位甘氨酸位甘氨酸密码的是一个终止密码密码的是一个终止密码TAG。DNA有义链有义链5GGCTAGCTC3mRNA5GGCUAGCTC3蛋白质序列蛋白质序列甘氨酸甘氨酸亮氨酸亮氨酸第第46位位第第47位位在细胞中,在细胞中,mRNA中是否也有这中是否也有这段插入序列?段插入序列?
8、l人人工工合合成成基基因因60编编码码区区的的30聚聚多多核核苷苷酸酸和和插插入入序序列列的的30聚聚多多核核苷苷酸酸作作为为两两种种探探针针,分分别别检检测测T4感感染染细细胞胞的的RNA,杂杂交交分分析析,两两种种探探针针完完全全给给出出相相同同的的杂杂交交图图谱谱一一条条带带,实实际际上上细细胞胞中中只只有有一一种种RNA,没没有有发发现现有有mRNA剪剪切切加加工工的的现现象象。对对细细胞胞中中基基因因60的的mRNA作作核核苷苷酸酸序序列列分分析析,都都发发现现有有50核苷酸插入序列的存在核苷酸插入序列的存在。RNA电泳电泳转转移移杂交分析杂交分析正极正极负极负极共三条带共三条带编码
9、区探针编码区探针插入序列探针插入序列探针DNA转录转录剪接剪接+无论哪种探针都只有一条相同的带,说无论哪种探针都只有一条相同的带,说明细胞中只有一种明细胞中只有一种RNA普遍性:普遍性:l1.将将50个个核核苷苷酸酸序序列列插插入入到到LacZ的的适适当当编编码码序序列列内内,在在翻翻译译过过程程中中,大大肠肠杆杆菌菌核核糖糖体体同同样样可可以以跳跳过过这这个个非非翻翻译译序序列列,产生完整的产生完整的半乳糖苷酶。半乳糖苷酶。l2.在酵母表达系统中,酵母核糖体也能在酵母表达系统中,酵母核糖体也能跳过这段序列,产生完整的蛋白质。跳过这段序列,产生完整的蛋白质。意义:意义:l设想在翻译水平上调控,
10、形成设想在翻译水平上调控,形成不同的二级结构。不同的二级结构。Evaluationofthemutationssuggests5requirementsforefficientribosomehopping:Aminoacidresidues17to32ofthenascentpeptideTerminationcodonrightaftercodon47Ashorthairpinatthetake-offsiteIdentitybetweencodons47and48A50ntspacingbetweencodons47and48lScience,Vol239,Issue4843,1005-
11、1012,1988lApersistentuntranslatedsequencewithinbacteriophageT4DNAtopoisomerasegene60lWMHuang,SZAo,SCasjens,ROrlandi,RZeikus,RWeiss,DWinge,andMFanglDepartmentofCellular,ViralandMolecularBiology,UniversityofUtahMedicalCenter,SaltLakeCity84132abstractlA50-nucleotideuntranslatedregionisshowntobepresentw
12、ithinthecodingsequenceofEscherichiacolibacteriophageT4gene60,whichencodesoneofthesubunitsforitstypeIIDNAtopoisomerase.ThisinterruptionispartofthetranscribedmessengerRNAandappearsnottoberemovedbeforetranslation.Thus,theusualcolinearitybetweenmessengerRNAandtheencodedproteinsequenceapparentlydoesnotex
13、istinthiscase.Theinterruptionisbracketedbyadirectrepeatoffivebasepairs.Amechanismisproposedinwhichfoldingoftheuntranslatedregionbringstogethercodonsseparatedbytheinterruptionsothattheelongatingribosomemayskipthe50nucleotidesduringtranslation.Thealternativepossibility,thattheproteinisefficientlytrans
14、latedfromaveryminorandundetectableformofprocessedmessengerRNA,seemsunlikely,buthasnotbeencompletelyruledout.(二)(二)microRNA(三)蛋白质合成过程的调节(三)蛋白质合成过程的调节1.珠蛋白合成调控珠蛋白合成调控-eIF2磷酸化对翻译磷酸化对翻译的调控的调控:l红细胞体积很小,直径只有红细胞体积很小,直径只有78m,形如圆盘,形如圆盘,中间下凹,边缘较厚。它具有弹性和可塑性,中间下凹,边缘较厚。它具有弹性和可塑性,在通过直径比它还小的毛细血管时,可以改变在通过直径比它还小的毛细血
15、管时,可以改变形状,通过后仍恢复原形。形状,通过后仍恢复原形。正常成熟的红细胞没有细胞核,也没有高尔基正常成熟的红细胞没有细胞核,也没有高尔基体和线粒体等细胞器,但它仍具有代谢功能。体和线粒体等细胞器,但它仍具有代谢功能。红细胞内充满着丰富的血红蛋白,血红蛋白约红细胞内充满着丰富的血红蛋白,血红蛋白约占细胞重量的占细胞重量的32,水占,水占64,其余,其余4为脂为脂质、糖类和各种电解质。质、糖类和各种电解质。哺乳动物网织哺乳动物网织红细胞蛋白质合红细胞蛋白质合成调控研究得较成调控研究得较为详细。为详细。网织红网织红细胞是红细胞成细胞是红细胞成熟前发育的最后熟前发育的最后阶段,由它合成阶段,由它
16、合成的蛋白质的蛋白质90以以上是珠蛋白上是珠蛋白。珠蛋白珠蛋白铁卟啉铁卟啉血红素血红素血红蛋白血红蛋白血红素与珠蛋白的合成血红素与珠蛋白的合成以平行速度进行,如完整细以平行速度进行,如完整细胞中缺铁或网织红细胞内缺胞中缺铁或网织红细胞内缺血红素,合成蛋白质的速度血红素,合成蛋白质的速度下降到原来的下降到原来的10。l血血红红素素缺缺乏乏造造成成的的影影响响是是生生成成了了一一个个抑抑制制物物血血红红素素调调控控阻阻遏遏物物(HCR)。分分子子量量80,000-90,000,含含有有蛋蛋白白激激酶酶的的性性质质,可可磷磷酰酰化化eIF-2,80S起起始始复复合合物物不不能能形形成成,加加入入外外
17、源源的的eIF-2或或HCR抗抗体体可可克克服服HCR的的影影响响。有有一一种种专专一一性性的磷酸酶可以催化这个逆反应。的磷酸酶可以催化这个逆反应。2.酵母酵母eIF-2的磷酸化对的磷酸化对GCN4mRNA翻译起始的激活作用翻译起始的激活作用l啤酒酵母的啤酒酵母的GCN4是一个转录因子,是一个转录因子,它能特异地结合与许多氨基酸合成它能特异地结合与许多氨基酸合成酶基因的启动子酶基因的启动子TGACTC上,诱导上,诱导基因的转录。基因的转录。lGCN4蛋白质合成量的增多是由于蛋白质合成量的增多是由于GCN4mRNA在翻译时被激活。在翻译时被激活。l上游的上游的AUG起始密码子的存在抑起始密码子的
18、存在抑制下游制下游ORF的翻译的翻译l在在eIF-2正常水平时,上游的每个正常水平时,上游的每个ORF都能进行翻译,都能进行翻译,GCN4的翻译的翻译几率较少几率较少l在氨基酸饥饿的条件下,磷酸化的在氨基酸饥饿的条件下,磷酸化的eIF-2增多,活化的增多,活化的eIF-2减少,翻译减少,翻译起始复合物的再循环必然受到限制。起始复合物的再循环必然受到限制。翻译完翻译完uORF1后的核糖体迅速滑过后的核糖体迅速滑过其它其它uORF,到达,到达GCN4-ORF开始开始翻译,逃避了其它翻译,逃避了其它uORF的抑制。的抑制。五、翻译后水平的调节l(一)蛋白质的成熟(一)蛋白质的成熟l1.多余序列的切除
19、多余序列的切除胰岛素原的激活胰岛素原的激活2.蛋白质内含子蛋白质内含子Inteinl蛋白质内含子是蛋白质中的一段蛋白质内含子是蛋白质中的一段多肽链,靠自我剪切的方式从前多肽链,靠自我剪切的方式从前体蛋白中分离出来,同时两端以体蛋白中分离出来,同时两端以肽键的方式相连。肽键的方式相连。特征序列特征序列 lA、B、C、D、E、F、G六个保守六个保守的的motiflSer类型类型自我剪切过程自我剪切过程 lCys类型类型用途l构建表达载体,产生蛋白质。构建表达载体,产生蛋白质。lNEWENGLANDBioLabsINC.lIMPACT-CNSystem(二)蛋白质高级结构的正确形成(二)蛋白质高级结
20、构的正确形成:分子伴侣分子伴侣 1.Anfinsen的牛胰核的牛胰核糖核酸酶糖核酸酶变性复性变性复性试验试验RNaseA50年代末完成全序列测定的第一个年代末完成全序列测定的第一个蛋白质,蛋白质,124个氨基酸,个氨基酸,MW12600,4对二硫键。在对二硫键。在8mol/L尿素,尿素,-巯基乙醇巯基乙醇存在时,二硫键被破坏,变为松散结构。存在时,二硫键被破坏,变为松散结构。透析,除去尿素和透析,除去尿素和-巯基乙醇,再加入巯基乙醇,再加入氧化剂,则重新恢复构象。氧化剂,则重新恢复构象。蛋白质自组装蛋白质自组装(Selfassembly)假假说说l第一阶段是成核(第一阶段是成核(nucleat
21、ion)。由于挤压效应。由于挤压效应或疏水作用,多肽链中的一些小肽段迅速行成或疏水作用,多肽链中的一些小肽段迅速行成螺旋,作为进一步折叠的核心,称为核区。螺旋,作为进一步折叠的核心,称为核区。l第二阶段是折卷(第二阶段是折卷(collapse)。已成为核的结构,。已成为核的结构,随后散落成为较大的超二级结构单元的集合体,随后散落成为较大的超二级结构单元的集合体,包括一些包括一些-折叠片和折叠片和-转角的形成。转角的形成。l第三阶段是凝集(第三阶段是凝集(condensation)。上述集合体。上述集合体在原子水平上凝集,形成致密的三级结构。在原子水平上凝集,形成致密的三级结构。“这个实验出色地
22、证明了蛋白这个实验出色地证明了蛋白质的功能取决于特定的天然质的功能取决于特定的天然构象,而规定其构象所需要构象,而规定其构象所需要的信息包含在它的氨基酸序的信息包含在它的氨基酸序列中。列中。”摘自基础生物化学摘自基础生物化学(高等教育出版社,(高等教育出版社,2001.7)lChristianB.Anfinsen(USA)因此获得因此获得1972年诺贝尔生理或医学奖。年诺贝尔生理或医学奖。问题:问题:特例特例:RNase的超稳定性。的超稳定性。蛋白质的合成过程:蛋白质的合成过程:蛋白质合成中,首先合成蛋白质合成中,首先合成N端,再向端,再向C端延端延伸。在水相中,亲水的力量迫使多肽链疏水的基伸
23、。在水相中,亲水的力量迫使多肽链疏水的基团聚集于内部,亲水基团位于外部。新生肽键的团聚集于内部,亲水基团位于外部。新生肽键的折叠在合成早期业已开始,随肽键的延伸同时进折叠在合成早期业已开始,随肽键的延伸同时进行折叠,形成某种结构。这与一条变形伸展的完行折叠,形成某种结构。这与一条变形伸展的完整肽键的重折叠的情况是完全不同的。整肽键的重折叠的情况是完全不同的。发现过程发现过程2.Molecularchaperone的发现过程及定义的发现过程及定义 1962年,意大利生物学家在研年,意大利生物学家在研究果蝇究果蝇(Drosophila)的发育时,发现的发育时,发现:当培养果蝇的温度从正常的当培养果
24、蝇的温度从正常的25上上升到升到32时,幼虫时,幼虫(larvae)细胞中细胞中的一些巨型染色体上的新的位点变得的一些巨型染色体上的新的位点变得异常活跃。研究表明,温度的升高促异常活跃。研究表明,温度的升高促使一些新基因的表达。这就是使一些新基因的表达。这就是热激反热激反应(应(heat-shock response)的发现。的发现。l l定义定义定义定义lThemolecularchaperoneconcept.EllisRJ.DepartmentofBiologicalSciences,UniversityofWarwick,Coventry,UK.Molecularchaperonesa
25、reaubiquitousfamilyofcellularproteinswhichmediatethecorrectfoldingofotherpolypeptides,andinsomecasestheirassemblyintooligomericstructures,butwhicharenotcomponentsofthosefinalstructures.一一类类相相互互之之间间没没有有关关系系的的蛋蛋白白质质。它它们们的的功功能能是是帮帮助助多多肽肽结结构构的的其其它它物物质质在在体体内内进进行行正正确确的的非非共共价价的的组组装装,并并且且不不是是组组装装完完成成的的结结构构在
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