第六章-化学物质与蛋白质的相互作用3-4节ppt课件.ppt
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1、第三节第三节 化学物质对蛋白质侧链基团的共价化学物质对蛋白质侧链基团的共价修饰作用修饰作用 Covalentmodificationofproteinside-chaingroupsbychemicals 化学物质的共价修饰作用化学物质的共价修饰作用 化学物质与生物大分子的共价作用常常涉及到物质化学物质与生物大分子的共价作用常常涉及到物质的生理活性(包括药理、毒理等),如何判断化合的生理活性(包括药理、毒理等),如何判断化合物与蛋白质分子中的哪类基团作用,在体外主要用物与蛋白质分子中的哪类基团作用,在体外主要用化合修饰的方法。化合修饰的方法。该方法是研究蛋白质结构与功能的一种重要的基础该方法是
2、研究蛋白质结构与功能的一种重要的基础手段。手段。一、生物体内蛋白质加合物的形成一、生物体内蛋白质加合物的形成 许多化学毒物对细胞产生的损害与其亲电代谢产物同细胞许多化学毒物对细胞产生的损害与其亲电代谢产物同细胞大分子的亲核部位大分子的亲核部位(如蛋白质的巯基如蛋白质的巯基)发生不可逆结合具有发生不可逆结合具有密切关系。密切关系。当外源化合物的活性代谢产物与细胞内重要生物大分子,当外源化合物的活性代谢产物与细胞内重要生物大分子,如核酸、蛋白质、脂质等共价结合,发生烷基化或芳基化,如核酸、蛋白质、脂质等共价结合,发生烷基化或芳基化,即导致即导致DNA损伤、蛋白质正常功能丧失,乃至细胞的损伤损伤、蛋
3、白质正常功能丧失,乃至细胞的损伤或死亡。或死亡。外源化合物与生物大分子相互作用主要有两种方式:外源化合物与生物大分子相互作用主要有两种方式:非共非共价结合和共价结合价结合和共价结合。1、可与蛋白质发生反应的化合物、可与蛋白质发生反应的化合物 除少数烷化剂外,绝大多数外源化合物需经体内除少数烷化剂外,绝大多数外源化合物需经体内代谢活化,转变成亲电子的活性代谢物,再与细代谢活化,转变成亲电子的活性代谢物,再与细胞内生物大分子中的亲核部位和基团发生共价结胞内生物大分子中的亲核部位和基团发生共价结合。合。例如蛋白质分子中的亲核基团、例如蛋白质分子中的亲核基团、DNA、RNA及一及一些小分子物质如谷胱甘
4、肽等的亲核部位等。些小分子物质如谷胱甘肽等的亲核部位等。试剂类型试剂类型化合物或前体化合物或前体反应机制反应机制烷基化烷基化芳香基化芳香基化卤代物卤代物亲核取代亲核取代环氧化物环氧化物硫酸烷基酯硫酸烷基酯活泼的烯烃活泼的烯烃1,4-加成加成羰基化合物羰基化合物醛醛形成席佛碱形成席佛碱酰基化酰基化有机酸酐、酰氯等有机酸酐、酰氯等亲核取代或加成亲核取代或加成磷酰化磷酰化有机磷有机磷亲核取代亲核取代自由基自由基OH、CCl3自由基反应自由基反应具有亲电氮化合物具有亲电氮化合物芳香胺芳香胺亲核取代亲核取代表表6-1 可与蛋白质形成共价加合物的化合物类型可与蛋白质形成共价加合物的化合物类型2、蛋白质分子
5、中的可反应基团、蛋白质分子中的可反应基团 蛋白质分子中有许多功能基团可与外源化合物相互作用,除各种氨基酸分蛋白质分子中有许多功能基团可与外源化合物相互作用,除各种氨基酸分子普遍存在氨基和羧基外,丝氨酸和苏氨酸所特有的羟基、半胱氨酸分子子普遍存在氨基和羧基外,丝氨酸和苏氨酸所特有的羟基、半胱氨酸分子中得巯基中得巯基.一旦这些部位与外源化合物发生共价结合,必将影响蛋白质结构和功能。一旦这些部位与外源化合物发生共价结合,必将影响蛋白质结构和功能。致癌物分子量的大小不同,反应是不同的,分子量较小的,如乙烯、丙烷致癌物分子量的大小不同,反应是不同的,分子量较小的,如乙烯、丙烷和苯乙烯的氧化物、尿烷和氯乙
6、烯的环氧化物、丙烯酰胺等,与蛋白质作和苯乙烯的氧化物、尿烷和氯乙烯的环氧化物、丙烯酰胺等,与蛋白质作用时,所形成的加合物依赖于外源化合物与各种氨基酸反应的相对速率。用时,所形成的加合物依赖于外源化合物与各种氨基酸反应的相对速率。3、与白蛋白的共价结合、与白蛋白的共价结合白蛋白是血液和组织间质中的主要蛋白质,也是脂肪酸、白蛋白是血液和组织间质中的主要蛋白质,也是脂肪酸、内源性(生物体内存在的)化合物及外源性运输的主要载内源性(生物体内存在的)化合物及外源性运输的主要载体,它容易与终致癌物结合形成共价加合物。体,它容易与终致癌物结合形成共价加合物。5、与细胞内蛋白质共价结合、与细胞内蛋白质共价结合
7、进入体内的外源化合物或其代谢产物可与胞浆、质膜以及进入体内的外源化合物或其代谢产物可与胞浆、质膜以及细胞核内蛋白质发生共价结合而形成加合物,已经发现有细胞核内蛋白质发生共价结合而形成加合物,已经发现有数十种外源化合物与蛋白质共价结合与其毒性有密切关系。数十种外源化合物与蛋白质共价结合与其毒性有密切关系。溴苯是一种重要的肝脏毒物,进入体内后经细胞色素溴苯是一种重要的肝脏毒物,进入体内后经细胞色素P450作用形成溴苯作用形成溴苯-3,4-环氧化物,可与蛋白质、环氧化物,可与蛋白质、DNA等等共价结合。共价结合。4、与血红蛋白的共价结合、与血红蛋白的共价结合外源化合物进入血液后,可与红细胞膜结合而进
8、入红细胞外源化合物进入血液后,可与红细胞膜结合而进入红细胞内与血红蛋白发生共价结合。其中血红蛋白氨基酸中的氨内与血红蛋白发生共价结合。其中血红蛋白氨基酸中的氨基、巯基易与外源化合物发生共价结合。基、巯基易与外源化合物发生共价结合。烷基化试剂可与血红蛋白末端氨基酸的氨基、半胱氨酸的烷基化试剂可与血红蛋白末端氨基酸的氨基、半胱氨酸的巯基以及组氨酸咪唑环上巯基以及组氨酸咪唑环上N1或或N3共价结合。共价结合。环氧乙烷、环氧丙烷可与血红蛋白中组氨酸、末端氨基酸环氧乙烷、环氧丙烷可与血红蛋白中组氨酸、末端氨基酸残基共价结合;残基共价结合;4-氨基联苯、苯胺经体内代谢氧化后可与半胱氨酸的巯基结氨基联苯、苯
9、胺经体内代谢氧化后可与半胱氨酸的巯基结合。合。蛋白质侧链基团的修饰是通过选择性的试剂或亲和标记试蛋白质侧链基团的修饰是通过选择性的试剂或亲和标记试剂与蛋白质分子侧链上特定的功能基团发生化合反应而实剂与蛋白质分子侧链上特定的功能基团发生化合反应而实现的。现的。其中的一个重要作用是用来探测活性部位的结构。其中的一个重要作用是用来探测活性部位的结构。理想情况下,修饰试剂只是有选择地与某一特定的残基反理想情况下,修饰试剂只是有选择地与某一特定的残基反应,很少或几乎不引起蛋白质分子的构象变化。应,很少或几乎不引起蛋白质分子的构象变化。在此基础上,从该基团的修饰对蛋白质分子的生物活性所在此基础上,从该基团
10、的修饰对蛋白质分子的生物活性所造成的影响,就可以推测出被修饰的残基在该蛋白质分子造成的影响,就可以推测出被修饰的残基在该蛋白质分子中的功能。中的功能。二、特定的氨基酸残基侧链基团的修饰二、特定的氨基酸残基侧链基团的修饰1 1、巯基的化学修饰、巯基的化学修饰 烷烷基基化化试试剂剂是是一一种种重重要要的的巯巯基基修修饰饰试试剂剂,如如碘碘乙乙酸酸和和碘碘乙乙酰酰胺,用于多肽链氨基酸顺序分析过程防止半胱氨酸的氧化。胺,用于多肽链氨基酸顺序分析过程防止半胱氨酸的氧化。5,5-二二硫硫-2-硝硝基基苯苯甲甲酸酸(DTNB),又又称称为为Ellman试试剂剂,目目前前已已成成为为最最常常用用的的巯巯基基修
11、修饰饰试试剂剂。DTNB可可与与巯巯基基反反应应形形成成二二硫硫键键,产产生生的的5-巯巯基基-2-硝硝基基苯苯甲甲酸酸阴阴离离子子在在412nm具具有有很很强强的的吸收,可以很容易通过光吸收的变化来监测反应的程度。吸收,可以很容易通过光吸收的变化来监测反应的程度。有机汞试剂是最早使用的巯基修饰试剂之一,其中最常用的有机汞试剂是最早使用的巯基修饰试剂之一,其中最常用的是对氯汞苯甲酸,该化合物溶于水中形成羟基衍生物,与巯是对氯汞苯甲酸,该化合物溶于水中形成羟基衍生物,与巯基相互作用时在基相互作用时在255nm处光吸收具有较大的增强效应。处光吸收具有较大的增强效应。2、氨基的化学修饰、氨基的化学修
12、饰 有许多化合物都可用来修饰赖氨酸残基,三硝基苯磺酸有许多化合物都可用来修饰赖氨酸残基,三硝基苯磺酸(TNBS)就是其中非常有效的一种。就是其中非常有效的一种。TNBS与赖氨酸残基反应,与赖氨酸残基反应,在在420nm和和367nm能够产生特定的光吸收。能够产生特定的光吸收。在蛋白质序列分析中,用于多肽链在蛋白质序列分析中,用于多肽链N-末端残基的测定的化合末端残基的测定的化合修饰方法修饰方法-2,4-二硝基氟苯二硝基氟苯(DNFD)法、丹磺酰氯法、丹磺酰氯(DNS)法和法和苯异硫氰酸酯苯异硫氰酸酯(PITC)法都是常用的氨基修饰方法。法都是常用的氨基修饰方法。3、羧基的化学修饰、羧基的化学修
13、饰 水溶性的碳化二亚胺类特定修饰蛋白质分子的羧基基团,目水溶性的碳化二亚胺类特定修饰蛋白质分子的羧基基团,目前已成为一种应用最普遍的标准方法,它在比较温和的条件前已成为一种应用最普遍的标准方法,它在比较温和的条件下就可以进行。下就可以进行。4、咪唑基的化学修饰、咪唑基的化学修饰 焦碳酸二乙酯焦碳酸二乙酯(DPC)是最常用的修饰组氨酸残基的试剂。该试是最常用的修饰组氨酸残基的试剂。该试剂在接近中性的情况下表现出比较好的专一性,与组氨酸残剂在接近中性的情况下表现出比较好的专一性,与组氨酸残基反应使咪唑基上的基反应使咪唑基上的1个氮羧乙基化,并且使得在个氮羧乙基化,并且使得在240nm处处的光吸收增
14、加。的光吸收增加。该取代反应在碱性条件下是可逆的,可以重新生成组氨酸残该取代反应在碱性条件下是可逆的,可以重新生成组氨酸残基。基。5、酚和脂肪族羟基的化学修饰、酚和脂肪族羟基的化学修饰 四硝基甲烷(四硝基甲烷(TNM)由于反应的高度专一性和反应条件比较)由于反应的高度专一性和反应条件比较温和,已经成为酪氨酸残基修饰最常用的试剂,它与酪氨酸温和,已经成为酪氨酸残基修饰最常用的试剂,它与酪氨酸残基反应生成离子化的发色基团残基反应生成离子化的发色基团-3-硝基酪氨酸衍生物。硝基酪氨酸衍生物。苏氨酸和丝氨酸残基的专一性化学修饰研究较少苏氨酸和丝氨酸残基的专一性化学修饰研究较少,其羟基可,其羟基可被修饰
15、酚羟基的修饰试剂所修饰,只是反应更严格。被修饰酚羟基的修饰试剂所修饰,只是反应更严格。6、胍基的化学修饰、胍基的化学修饰 丁二酮和丁二酮和1,2-环己酮与胍基反应可逆地形成精氨酸环己酮与胍基反应可逆地形成精氨酸-丁二酮复丁二酮复合物,该产物可以与硼酸结合而稳定下来。合物,该产物可以与硼酸结合而稳定下来。苯乙二醛是最早用来对精氨酸残基进行修饰的,通常是两个苯乙二醛是最早用来对精氨酸残基进行修饰的,通常是两个分子的苯乙二醛与分子的苯乙二醛与1个精氨酸残基不可逆地结合,该试剂与个精氨酸残基不可逆地结合,该试剂与-氨基也有一定反氨基也有一定反应应性。性。4-羟羟基基-3-硝基苯乙二硝基苯乙二醛醛在温和
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