DNA复制和修复.ppt
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1、第三十四章第三十四章 DNADNA的复制和修复的复制和修复12分子生物学的中心法则分子生物学的中心法则(central dogma)(central dogma)DNA RNA DNA RNA 蛋白质蛋白质复制复制复制复制转录转录转录转录翻译翻译翻译翻译逆转录逆转录逆转录逆转录RNARNA复制复制复制复制3一、一、DNADNA复制的基本原则复制的基本原则(特点)(特点)(一)(一)半保留复制半保留复制(semisemiconservativeconservative replicationreplication)l l模板模板l l原则原则l l特点特点l l亲代亲代DNADNA双链,每股链都
2、可作为模板双链,每股链都可作为模板l l按按碱基配对碱基配对原则指导新链合成原则指导新链合成l l合成的两个子代合成的两个子代DNADNA分子碱基顺序与分子碱基顺序与亲代分子完全一样亲代分子完全一样l l一条链来自于亲代的一条链来自于亲代的DNADNA链,另一条链,另一条链是新合成的链链是新合成的链4亲代亲代DNA子子代代子子代代半保留复制半保留复制新链新链5Old strandNew strandThe hypothesis ofsemiconservativereplication proposed by Watson and Crickin 1953.6Radioisotope labe
3、lingand density gradientcentrifugation clearlydistinguishes replications ofsemiconservative from conservative.(1958)78910A electron micrograph of the replicationintermediate of a plasmid DNA:-shaped structures were observed;no single strandedDNA is visible.No complete unwinding of the two parental s
4、trands occurred before the daughter strands are synthesized11(二)(二)半不连续复制半不连续复制 (semidiscontinuousdiscontinuous replicationreplication)1 1、体内仅存在体内仅存在5 35 3的的DNADNA聚合酶聚合酶2 2、前导链与随从链(前导链与随从链(岗崎片段岗崎片段)1255533335555333355553333 前导链前导链前导链前导链随从链随从链随从链随从链岗崎片段岗崎片段岗崎片段岗崎片段半不连续复制半不连续复制13前导链(前导链(leading strand
5、leading strand):):DNADNA复制复制时,一股以时,一股以3 53 5方向的方向的母链作为母链作为模板模板,新合成的链以,新合成的链以5 35 3方方向向连续连续合成的链称为前导链。合成的链称为前导链。(复制方向与解链方向一致)(复制方向与解链方向一致)14随从链(随从链(lagging strand):lagging strand):DNADNA复制复制时,一股以时,一股以5 35 3方向的方向的母链作为母链作为模板模板,新合成链沿,新合成链沿5 35 3合成合成1000-20001000-2000个核苷酸个核苷酸不连续的小片段不连续的小片段称为随称为随从链。从链。(复制方
6、向与解链方向相反(复制方向与解链方向相反)岗崎片段岗崎片段(OkazakiOkazaki)岗崎片段由岗崎片段由DNADNA连接酶连成一条完整的新链连接酶连成一条完整的新链15 DNADNA半不连续复制:半不连续复制:3 53 5方向母链为方向母链为模板模板,新链,新链5 35 3方向方向连连续续合成合成5 35 3方向母链为方向母链为模板模板,新链,新链5 35 3方向合成许多方向合成许多不连续不连续的片段(岗崎片段)的片段(岗崎片段)这种复制方式称之为半不连续复制。这种复制方式称之为半不连续复制。16(三)(三)RNARNA引物引物DNADNA聚合酶聚合酶l l不能不能催化两个游离催化两个游
7、离dNTPdNTP在在DNADNA模板上聚合模板上聚合l l需要具需要具3-OH3-OH的引物的引物RNARNA聚合酶聚合酶l l能能催化两个游离催化两个游离NTPNTP在在DNADNA模板上聚合模板上聚合l l提供提供3-OH3-OHl l引物最后被引物最后被DNADNA聚合聚合酶酶除去、补满,再除去、补满,再由连接酶连接由连接酶连接减少突变,提高减少突变,提高DNADNA复制的真实性复制的真实性175555333355553333 前导链前导链前导链前导链随从链随从链随从链随从链岗崎片段岗崎片段岗崎片段岗崎片段RNARNA引物引物引物引物3-OH3-OH18(四)(四)复制的真实性复制的真
8、实性l l严格的碱基配对规律严格的碱基配对规律l lRNARNA引物引物l l聚合酶的选择作用聚合酶的选择作用l l复制时有即时的校读功能复制时有即时的校读功能 3 53 5外切酶功能外切酶功能l lDNADNA损伤的修复机制损伤的修复机制19二、参与二、参与DNADNA复制的酶类和蛋白质复制的酶类和蛋白质DNADNA链合成的条件链合成的条件l ldNTPdNTPl lMgMg+l l3-OH3-OH引物引物l lDNADNA模板模板l l酶和蛋白质因子酶和蛋白质因子20酶和蛋白质因子酶和蛋白质因子l lDNADNA聚合酶聚合酶/l l解旋酶解旋酶l l单链结合蛋白单链结合蛋白(SSB(SSB
9、)l l拓扑异构酶拓扑异构酶/l l引发体引发体l lDNADNA连接酶连接酶212223(一)DNA的聚合反应的聚合反应2425(二)大肠杆菌(二)大肠杆菌DNADNA聚合酶(原核生物)聚合酶(原核生物)3,5-磷酸二酯键磷酸二酯键35图图12-426DNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶l l多功能酶多功能酶多功能酶多功能酶 5 35 35 35 3外切酶外切酶外切酶外切酶 3 53 53 53 5外切酶外切酶外切酶外切酶 5 3 5 3 5 3 5 3聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶l l单链多肽(单链多肽(单链多肽(单链多肽(ZnZnZnZn2+2+2+2+)大小二个片段大小二个片段
10、大小二个片段大小二个片段l l切除切除切除切除RNARNARNARNA引物,引物,引物,引物,填补空缺填补空缺填补空缺填补空缺l l损伤后修复损伤后修复损伤后修复损伤后修复DNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶l l多功能酶多功能酶多功能酶多功能酶 5 35 35 35 3聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶 3 53 53 53 5外切酶外切酶外切酶外切酶 l l不对称二聚体不对称二聚体不对称二聚体不对称二聚体单体单体单体单体1 1 1 1-前导链前导链前导链前导链/单体单体单体单体2 2 2 2-随从链随从链随从链随从链l lDNADNADNADNA复制的主要酶复制的主要酶复制的主要酶复制的
11、主要酶 高续进性高续进性高续进性高续进性 高聚合酶活性高聚合酶活性高聚合酶活性高聚合酶活性 高产物真实性高产物真实性高产物真实性高产物真实性2728 3 5 5 33 5 5 33 5 5 33 5 5 3 外切酶外切酶外切酶外切酶 聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶N NC C 5 3 5 3 5 3 5 3外切酶外切酶外切酶外切酶小片段小片段小片段小片段大片段(大片段(大片段(大片段(klenow klenow片段)片段)片段)片段)切除切除切除切除RNARNARNARNA引物引物引物引物损伤修复损伤修复损伤修复损伤修复校读功能校读功能校读功能校读功能(常用的工具酶)常用的工具酶)常用的工具酶)常用
12、的工具酶)1 1、DNA聚合酶聚合酶(DNA PolymeraseDNA Polymerase)KornbergKornberg酶酶酶酶、DNADNA指导的指导的指导的指导的DNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶 (DNA-Directed DNA Polymerase,DDDPDNA-Directed DNA Polymerase,DDDP)聚合功能聚合功能聚合功能聚合功能29Large(Klenow)fragment of DNA pol 30313233DNA pol 仅参与局部仅参与局部修复修复,不是不是真正的复制酶真正的复制酶l合成速度太慢合成速度太慢l持续合成能力低持续合成能力低l影
13、响影响DNA复制的基因突变与复制的基因突变与DNA pol 无关无关34352 2、DNA聚合酶聚合酶全酶全酶(DNA Polymerase holoenzymeDNA Polymerase holoenzyme)10101010种亚基组成,含锌种亚基组成,含锌种亚基组成,含锌种亚基组成,含锌l ll ll l2 2 2 2 l l(4(4(4(4个个个个)DNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶全酶全酶全酶全酶l l核心聚合酶核心聚合酶核心聚合酶核心聚合酶l l连接两个核心聚合酶连接两个核心聚合酶连接两个核心聚合酶连接两个核心聚合酶l l夹钳装置复合体夹钳装置复合体夹钳装置复合体夹钳
14、装置复合体l l星环状星环状星环状星环状,容纳容纳容纳容纳DNADNADNADNA双链双链双链双链36Sliding clamp subunits聚合酶活性聚合酶活性聚合酶活性聚合酶活性3 5 外切活性外切活性 复合物,复合物,促进促进亚基结合于亚基结合于DNADNA pol III(复制酶)(复制酶)无无5-3 外切酶活性外切酶活性 组成核心酶组成核心酶促进核心酶形成二聚体组装2 373839真核细胞的真核细胞的DNADNA聚合酶聚合酶l l五种五种五种五种l lDNA DNA DNA DNA 聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶l lDNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶和和和和PCNAPC
15、NAPCNAPCNAl lDNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶l lDNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶、l l引物的合成引物的合成引物的合成引物的合成l l前导链、随从链合成前导链、随从链合成前导链、随从链合成前导链、随从链合成l l参与线粒体参与线粒体参与线粒体参与线粒体DNADNADNADNA的合成的合成的合成的合成l l参与参与参与参与DNADNADNADNA的修复的修复的修复的修复增殖细胞核抗原(类似于亚基)403 3、DNA聚合酶聚合酶、lDNA聚合酶聚合酶 5 35 3聚合酶活性聚合酶活性 3 53 5外切酶活性外切酶活性 lDNA聚合酶聚合酶和和 DNA
16、受严重损伤时诱导产生受严重损伤时诱导产生 跨越受损部位跨越受损部位 使复制缺乏准确性使复制缺乏准确性(修复酶)(修复酶)41(三)(三)DNA解旋酶及解旋酶及SSBl lDNA解旋酶解旋酶(helicase)l l单链结合蛋白单链结合蛋白 (SSB)l l解开解开DNADNA双链双链每对碱基消耗每对碱基消耗2 2个个ATPATPl l维持单链状态维持单链状态(镇纸镇纸)l l使其不受核酸酶水解使其不受核酸酶水解l l避免单链避免单链DNADNA自身发夹自身发夹螺旋形成螺旋形成l l使前端螺旋易解开使前端螺旋易解开大肠杆菌大肠杆菌SSBSSB与与DNADNA结合具有结合具有协同效应协同效应42(
17、四)(四)DNA拓扑异构酶拓扑异构酶Linking number两条链的互绕数两条链的互绕数4344454647484950含拓扑异构酶含拓扑异构酶(及(及H1H1)与与DNADNA复制及转录有关复制及转录有关5152l l拓扑异构酶拓扑异构酶/(topoisomerasetopoisomerasetopoisomerasetopoisomerase)l l拓扑异构酶拓扑异构酶/旋转酶旋转酶 (gyrasegyrase)l l切断切断DNADNA双螺旋中双螺旋中一股一股,张力下降后封闭张力下降后封闭l l消除负超螺旋消除负超螺旋l l不需能量不需能量l l切断切断DNADNA双链双链l l引入
18、负超螺旋引入负超螺旋l l需需ATPATP供能供能1、大肠杆菌的拓扑异构酶、大肠杆菌的拓扑异构酶53磷酸二酯键的转移磷酸二酯键的转移54555657l l拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶l l拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶 类型类型类型类型 :切断切断切断切断DNADNADNADNA双螺双螺双螺双螺旋中一股;不需能量旋中一股;不需能量旋中一股;不需能量旋中一股;不需能量l l拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶/l l消除正消除正消除正消除正/负超螺旋负超螺旋负超螺旋负超螺旋l l消除负超螺旋消除负超螺旋消除负超螺旋消除负超螺旋l l消除正消除正消除正消除正/负超螺旋负超
19、螺旋负超螺旋负超螺旋l l不能导入负超螺旋不能导入负超螺旋不能导入负超螺旋不能导入负超螺旋2、真核细胞的拓扑异构酶、真核细胞的拓扑异构酶58(五)引发体(五)引发体(primosome)l l蛋白质蛋白质蛋白质蛋白质l lDnaADnaADnaADnaAl lDnaBDnaBDnaBDnaBl l引物合成酶引物合成酶引物合成酶引物合成酶l l结合到结合到结合到结合到DNADNADNADNA双链复制起始部位双链复制起始部位双链复制起始部位双链复制起始部位(需需需需ATP)ATP)ATP)ATP)l l解链酶的作用解链酶的作用解链酶的作用解链酶的作用l l合成合成合成合成RNARNARNARNA引
20、物引物引物引物RNARNA引物的合成是复制起始所必需的引物的合成是复制起始所必需的5960(六)(六)DNADNA连接酶连接酶l l催化二段催化二段DNADNA链之间链之间3,5 3,5 磷酸二酯键的形磷酸二酯键的形成成33OHOH5533 O OOO-P O P O O O-有缺口的有缺口的有缺口的有缺口的DNADNADNADNA链链链链DNADNADNADNA连接酶连接酶连接酶连接酶ATPATPAMP+PPiAMP+PPi O OOO P O P O O O-533缺口封闭缺口封闭缺口封闭缺口封闭61626364l l缺口填补缺口填补:l l连接双股连接双股DNADNA分子中一链的切口分子
21、中一链的切口l l双链双链DNADNA分子中双链的切口分子中双链的切口l l不能不能连接二分子单链连接二分子单链DNA DNA 65应用应用:(1 1)岗崎片段之间的连接)岗崎片段之间的连接(2 2)DNADNA损伤修复中的连接损伤修复中的连接(3 3)一种重要的工具酶)一种重要的工具酶:限制性内切酶切割后形成的限制性内切酶切割后形成的 粘性末端或平头末端的连接粘性末端或平头末端的连接6667三、三、DNADNA复制的过程复制的过程(起始、延伸、终止)起始、延伸、终止)l l确定复制的确定复制的起始点起始点l l解开双链解开双链DNA,DNA,提供单链提供单链DNADNA模板模板l l形成形成
22、复制叉复制叉l lDNA合成的合成的起始起始和和延长延长l l形成带有新合成的形成带有新合成的DNA片段的片段的复制泡复制泡l l复制的复制的终止终止68l l原核生物原核生物l l双向复制双向复制(型复制)型复制)l l特定起始点:特定起始点:oriCoriCl l真核生物真核生物l l多个复制单位多个复制单位(复制泡)(复制泡)(复制起始点(复制起始点+复制叉)复制叉)l l多个起始点多个起始点(一)复制的起始(一)复制的起始69大肠杆菌复制起始点大肠杆菌复制起始点oriCoriC的结构的结构(1)9个核苷酸的重复序列4个(2)13个核苷酸的重复序列3个70形成起始复合物形成起始复合物71
23、 DNA DNA的甲基化与复制的发动有关的甲基化与复制的发动有关OricOric中含中含1111个个GATCGATCDamDam甲基化酶使甲基化酶使A A上上N N6 6甲基化(亲代)甲基化(亲代)半甲基化的半甲基化的OricOric可与细胞膜结合可与细胞膜结合72 原核生物双向复制(原核生物双向复制(型复制)型复制)73真核生物复制泡(复制起始点真核生物复制泡(复制起始点+复制叉)复制叉)7475DNADNA双链复制起始点双链复制起始点 dnaAdnaAdnaB/dnaCdnaB/dnaCDNADNA双链解开成双链解开成单链单链DNADNASSBSSB引物酶引物酶引物酶引物酶RNARNA引物
24、引物/3-OH/3-OHDNADNADNADNA聚合酶聚合酶聚合酶聚合酶dNTPdNTP和和3-OH3-OH形成形成3535磷酸二酯键磷酸二酯键解旋酶解旋酶SSBSSB33335555引发体引发体解旋酶解旋酶解旋酶解旋酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶拓扑异构酶76(二)复制的延伸(二)复制的延伸1.1.DNADNA聚合酶聚合酶的作用的作用2.2.前导链前导链合成合成1000-20001000-2000个核苷酸后,个核苷酸后,3.3.随从链随从链开始合成,岗崎片段的长度开始合成,岗崎片段的长度 为为1000-20001000-2000个(大肠杆菌)个(大肠杆菌)4.Pol4.Pol为不对称二聚体
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- 关 键 词:
- DNA 复制 修复
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