DNA的复制与修复.ppt
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1、第十四章第十四章 DNA DNA的复制与修复的复制与修复 DNA的复制、反转录以及的复制、反转录以及DNA损伤的修复损伤的修复 主要内容:主要内容:一、一、DNA的复制的复制(一)(一)DNA的半保留复制(的半保留复制(semicoservative replication)1958年年Meselson和和Stahl用同位素示踪和密度梯度用同位素示踪和密度梯度离心的方法证明了离心的方法证明了DNA的半保留复制的半保留复制(二)与(二)与DNA复制有关的酶和蛋白质复制有关的酶和蛋白质 1.DNA聚合酶(聚合酶(DNA Polymerase):):又称又称 DNA nucleotidyl tran
2、sferase,or DNA-directed DNA polymerase,or DNA-dependent DNA polymerase i.e.DDDPase DNA聚合酶催化的反应聚合酶催化的反应 ndATPndGTPndCTPndTTP模板(模板(DNA),引物(),引物(RNA,DNA)DNA聚合酶聚合酶DNA 4nPPiDNA聚合酶的作用机理聚合酶的作用机理 在大肠杆菌中至少发现了五种在大肠杆菌中至少发现了五种DNA polymerase,分,分别是别是DNA polymerase I、II、III、IV和和V,其中,其中Polymerase I发现最早(发现最早(1956年),
3、而年),而polymerase IV和和V直到直到1999年才发现。年才发现。DNA polymerase I(pol I):):1956年年Kornberg等在等在Ecoli中发现的第一个中发现的第一个DNA聚合酶,是聚合酶,是DNA复制研究中的重要里程碑,因此于复制研究中的重要里程碑,因此于1959年年Kornberg获得诺贝尔化学奖。获得诺贝尔化学奖。DNA pol I 也称也称Kornberg酶酶,Mr 103 Kd,一条多肽链一条多肽链,一个锌原子(活性所必需),每个一个锌原子(活性所必需),每个E.Coli细胞内大细胞内大约有约有400个分子的个分子的pol I。(1)53聚合作用
4、聚合作用(2)35核酸外切酶的活性核酸外切酶的活性(3)53核酸外切酶的活性核酸外切酶的活性(4)焦磷酸解作用)焦磷酸解作用(5)焦磷酸基交换的作用)焦磷酸基交换的作用 因此它属于一种多功能酶因此它属于一种多功能酶功能功能(1)53聚合作用:聚合作用:DNA pol I 不能不能“从无到有从无到有”,只能从已有的多,只能从已有的多核苷酸链的核苷酸链的3-OH端延长端延长DNA链,也就是说必须要链,也就是说必须要有有Primer,primer多数情况下是多数情况下是RNA,少数情况下,少数情况下是是DNA,Primer必须要有一个游离的必须要有一个游离的3-OH。模板:模板:单链单链DNA(单链
5、线状(单链线状DNA、单链环状、单链环状DNA)局部变成了单链的双链局部变成了单链的双链DNA 有切口(有切口(nick)的双链)的双链DNA 有缺口(有缺口(gap)的双链)的双链DNA 注意:完整的双链注意:完整的双链DNA不能作模板不能作模板 单链线状单链线状DNA单链环状单链环状DNAB.局部变成了单链局部变成了单链 的双链的双链DNAC.有切口(有切口(nick)的双链)的双链DNAD.有缺口(有缺口(gap)的双链)的双链DNA模板引物模板引物53 53 A.单链单链DNA5 3 3 3 5 缺口填充缺口填充3 3 3 5 5 3 用用胰蛋白酶或其他蛋白水解酶处理胰蛋白酶或其他蛋白
6、水解酶处理DNA pol I可可以得到两个片段以得到两个片段。A.大片段:第大片段:第324928氨基酸残基组成,氨基酸残基组成,Mr68000,具有聚合酶的活性和具有聚合酶的活性和35核酸外切酶核酸外切酶 的活性,这大片段称的活性,这大片段称Klenow fragment。B.小片段:第小片段:第1323个氨基酸残基组成,个氨基酸残基组成,Mr 35000,具有具有53核酸外切酶的活性。核酸外切酶的活性。大片段:大片段:35核酸外切酶主要功能校对。核酸外切酶主要功能校对。53核酸外切酶的主要功能在核酸外切酶的主要功能在DNA修复和切除修复和切除引物中起作用。引物中起作用。小片段:小片段:Po
7、l II是由一条是由一条Mr为为88Kd的多肽链组成,它的的多肽链组成,它的活性大约只有活性大约只有polI活性的活性的5%,也要模板和带,也要模板和带3OH 的引物,最好的模板是带短的的引物,最好的模板是带短的gap的双链的双链DNA,有,有53聚合酶和聚合酶和35核酸外切酶的活性,但核酸外切酶的活性,但没有没有53核酸外切酶的活性,主要用于核酸外切酶的活性,主要用于DNA的修的修复。复。DNA Polymerase II(DNA pol II):):1970年和年和1971年先后分离出年先后分离出pol II和和pol III,是由多种蛋白质组成的复合物是由多种蛋白质组成的复合物,Mr 高
8、达高达900Kd。每个每个Ecoli约含约含10分子分子DNA pol III,虽然,虽然pol III的量很少,但活性很强,为的量很少,但活性很强,为pol I的的15倍,模板和倍,模板和pol II大致相同,除聚合酶活性外,还具有大致相同,除聚合酶活性外,还具有35核酸外核酸外切酶的活性,但无切酶的活性,但无53核酸外切酶的活性,核酸外切酶的活性,DNA pol III是原核细胞是原核细胞DNA复制的主要酶。它催化脱氧复制的主要酶。它催化脱氧核苷酸的合成速率达到体内核苷酸的合成速率达到体内DNA的合成速率。这个的合成速率。这个酶的缺陷株往往是致死的。酶的缺陷株往往是致死的。DNA poly
9、merase III(DNA pol III):DNA polymerase IV和和V(DNA pol IV和和V):):1999年才被发现,涉及年才被发现,涉及DNA的错误倾向修复,的错误倾向修复,当当DNA受到严重损伤时,即可诱导产生这两种酶,受到严重损伤时,即可诱导产生这两种酶,使修复缺乏准确性,因而出现高的突变率。使修复缺乏准确性,因而出现高的突变率。大肠杆菌三种大肠杆菌三种DNA聚合酶的比较聚合酶的比较pol Ipol IIpol III分子量分子量103Kd88Kd900Kd不同种类亚基数目不同种类亚基数目1 7 10每个细胞的分子数每个细胞的分子数40010010生物学活性生物
10、学活性10.051553聚合酶活性聚合酶活性35外切酶活性外切酶活性53外切酶活性外切酶活性功能功能 校正,修复,校正,修复,去除去除RNA引物引物修复修复复制(复制(53聚合作用)聚合作用)真核生物真核生物DNA pol;有有DNA pol.、5种,除种,除DNA pol r存在于线粒体内,其余均存在于细胞核中。存在于线粒体内,其余均存在于细胞核中。它们的它们的差别除了细胞定位外,主要在于动力学性质和对抑差别除了细胞定位外,主要在于动力学性质和对抑制剂的敏感性不同。其他性质基本上同制剂的敏感性不同。其他性质基本上同E coli的聚的聚合酶,合酶,也需要模板也需要模板,带带3-OH的引物和的引
11、物和4种脱氧核苷种脱氧核苷三磷酸,链的延伸方向为三磷酸,链的延伸方向为53。哺乳动物哺乳动物DNADNA聚合物聚合物定位定位细胞核细胞核细胞核细胞核线粒体线粒体细胞核细胞核细胞核细胞核聚合方向:聚合方向:53 外切酶活性外切酶活性35功能功能引物引物合成合成修复修复线粒体线粒体DNA合合成成核核DNA合成合成修复修复2.DNA 连接酶(连接酶(DNA ligase)3.使使DNA双螺旋解开所需的酶或蛋白质。双螺旋解开所需的酶或蛋白质。(1)DNA helicase(DNA 解螺旋酶,解螺旋酶,DNA解解 旋酶,旋酶,DNA解链酶)解链酶):目前已知目前已知E.Coli含有含有4种解螺旋酶,即解
12、种解螺旋酶,即解螺旋酶螺旋酶I、II、III和和Rep蛋白,其中蛋白,其中Rep蛋白是蛋白是E.Coli中最主要的解螺旋酶,每解开一个碱基中最主要的解螺旋酶,每解开一个碱基对需水解对需水解2分子分子ATP。通过水解。通过水解ATP打断互补打断互补双链间的氢键双链间的氢键。通过水解通过水解ATP获得能量获得能量,使双螺旋使双螺旋DNA两两条链分开。条链分开。(2)Single-strand binding proteins(SS-B,单,单 链结合蛋白):链结合蛋白):功能:功能:与解开双螺旋后的单链与解开双螺旋后的单链DNA结合,防结合,防止单链止单链DNA重新形成双螺旋,另外防止单链重新形成
13、双螺旋,另外防止单链DNA被核酸酶降解。被核酸酶降解。原核生物的原核生物的SS-B与单链与单链DNA的结合表现为的结合表现为正协同效应,而真核生物的正协同效应,而真核生物的SS-B就没有这种协就没有这种协同效应。同效应。这酶首先在这酶首先在E.Coli中发现,当时称中发现,当时称-蛋白,蛋白,后来在真核生物中也发现了类似活性的酶,真核后来在真核生物中也发现了类似活性的酶,真核生物中的这类酶名称各不相同,有称生物中的这类酶名称各不相同,有称nicking-closing enzyme(切口开合酶,切口闭合酶等),(切口开合酶,切口闭合酶等),untwisting enzyme(解缠酶)。(解缠酶
14、)。(3)topoisomerase I(拓扑异构酶(拓扑异构酶I,Top I):这个酶的功能这个酶的功能是切开超螺旋双链是切开超螺旋双链DNA中的中的一条链,链的切口末端就可转动,使一条链,链的切口末端就可转动,使DNA变成变成松驰状态,然后再将切口封闭,这酶作用时不松驰状态,然后再将切口封闭,这酶作用时不消耗消耗ATP。它的功能它的功能也是使超螺旋松驰。也是使超螺旋松驰。在消耗在消耗ATP的情的情况下况下,能将复制叉前方产生的正超螺旋变成负超螺,能将复制叉前方产生的正超螺旋变成负超螺旋。旋。在无在无ATP时时,可同时切开超螺旋的两条链,使,可同时切开超螺旋的两条链,使DNA变成松驰状态,然
15、后将切口封接好,克服解链变成松驰状态,然后将切口封接好,克服解链过程中在复制叉前方造成的过程中在复制叉前方造成的“打结打结”现象。现象。(4)topoisomerase II(拓扑异构酶(拓扑异构酶II,Top II):):这酶首先也是在这酶首先也是在E.Coli中发现,也称中发现,也称DNA gyrase(DNA旋转酶),旋转酶),Top I和和Top II使超螺旋松驰机制的相似处和不同处。使超螺旋松驰机制的相似处和不同处。(三)(三)DNA的复制过程的复制过程 1.DNA复制的起点和方向:复制的起点和方向:原核生物:原核生物:1个起点(个起点(origin of replication,复
16、,复 制起点,复制原点)。制起点,复制原点)。复制起点核苷酸序列的特征复制起点核苷酸序列的特征:(1)碱基序列高度保守。)碱基序列高度保守。(2)富含)富含AT,有利于,有利于DNA的解链。的解链。方向方向:大多为双向复制。大多为双向复制。E.Coli染色体染色体DNA复制复制:复制时有一个复制起点,双复制时有一个复制起点,双向展开,形成向展开,形成状中间物,直至两个复制叉相遇,这状中间物,直至两个复制叉相遇,这种复制称种复制称复制。复制。复制子复制子:受同一个复制起始区控制的受同一个复制起始区控制的DNA被被称为复制子(称为复制子(replicon),它是复制的功能单位。),它是复制的功能单
17、位。原核细胞原核细胞DNA复制只有一个复制起始区,因复制只有一个复制起始区,因此它只有一个复制子。此它只有一个复制子。通常细菌、病毒和线粒通常细菌、病毒和线粒体的体的DNA分子都是作为单个复制子完成复制的。分子都是作为单个复制子完成复制的。真核生物:有很多复制起点,复制方向也是真核生物:有很多复制起点,复制方向也是双向。真核细胞的细胞核双向。真核细胞的细胞核DNA复制有多个复制复制有多个复制起始区,因此它包含多个复制子。起始区,因此它包含多个复制子。起点起点起点起点+复制眼复制眼在复制的起始点处,在复制的起始点处,DNA双链部分解开为单链,形双链部分解开为单链,形成叉子形状称复制叉(成叉子形状
18、称复制叉(replication fork)。)。大多数生物大多数生物DNA的复制是双向的,但也有例外,如滚的复制是双向的,但也有例外,如滚环式复制(环式复制(rolling circle replication)。)。2.DNA的半不连续复制(的半不连续复制(semi-discontinuous replication)所有已知的所有已知的DNA聚合酶的合成方向都是聚合酶的合成方向都是53。1968年日年日本学者本学者Okazaki冈崎提出了冈崎提出了DNA的不连续复制模型,他认为的不连续复制模型,他认为35走向的走向的DNA链的合成是不连续的,是由许多链的合成是不连续的,是由许多53方向方
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- DNA 复制 修复
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