克隆柞蚕免疫相关基因克隆和诱导表达,免疫学论文.docx

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1、克隆柞蚕免疫相关基因克隆和诱导表达,免疫学论文昆虫免疫主要是以产生的抗菌肽、抗病毒因子、凝集素、溶菌酶及蛋白酶抑制剂等多种活性物质,配合多种功能的血细胞建立的一个开放防御体系.昆虫仅具有先天性免疫,不具有适应性免疫.昆虫的先天免疫系统主要分为细胞免疫和体液免疫2大部分.体液免疫中转录因子Rel/ NF- B介导的信号转导通路主要有Toll通路和Imd通路1,昆虫主要通过这2种通路抵抗微生物的侵染. 研究发现,这2种通路通过激活不同的Rel/ NF- B家族成员调控不同抗菌肽基因的表示出,华而不实Toll通路主要激活转录因子Dorsal和Dif,Imd通路主要激活转录因子Relish1-5.已经

2、知道的Rel/ NF- B蛋白家族成员有8种,哺乳动物中有5种,昆虫细胞中的3种分别是Dorsal、Dif和Relish.华而不实Dorsal和Dif无锚定重复序列,Relish有锚定重复序列. Rel/ NF- B蛋白的主要功能是调节机体免疫应答、炎症反响、细胞凋亡和生长发育,炎症、癌症、本身免疫疾病等病理经过与NF- B的过度活化相关6. 由于Rel/ NF- B介导的Toll通路与Imd通路在无脊椎动物和脊椎动物中非常保守1,7,因而,对昆虫Rel/ NF- B的研究不仅能够系统了解昆虫的先天免疫机制,而且可为深切进入了解高等动物的免疫机制及疾病防治提供重要根据.尽管Rel/ NF- B

3、蛋白在先天免疫经过中起着非常重要的作用,但当前为止尚未见到有关柞蚕Rel/ NF- B家族成员的报道.本项研究利用生物信息学方式方法和分子生物学技术,以柞蚕蛹为试验材料,克隆柞蚕免疫相关基因Apdorsal的全长cDNA序列,并将其编码的氨基酸序列与其它物种的Rel/ NF- B氨基酸序列进行比对及构建系统进化树,利用实时荧光定量PCR技术检测Apdorsal基因经不同微生物诱导处理后的组织表示出变化,为讨论柞蚕的先天免疫机制提供参考. 1材料与方式方法 1.1材料和主要试剂 供试柞蚕品种为青6号,柞蚕蛹由辽宁省蚕业科学研究所惠赠,4 条件下保存备用.大肠杆菌(E.coli)Top10、枯草芽

4、孢杆菌(Bacillus subtilis)、毕赤酵母(Pichia pastoris)、柞蚕核 型 多 角 体 病 毒(ApNPV)等微生物由本实验室保存.Trizol试剂,Reverse Transcriptase M-MLV试剂盒,ExTaq酶,凝胶回收试剂盒,pMD18-T载体,T4-DNA连接酶,限制性内切酶EcoR和Hind,RLM-RACE试 剂 盒, SYBR-PrimeScript-RT-PCR Kit(Perfect Real Time),均购自宝生物工程(大连)有限公司. 1. 2柞蚕蛹总RNA提取及目的基因的RT-PCR扩增 取20 L培养过夜的E.coliTop10,

5、注射到柞蚕蛹体内,12 h后解剖取脂肪体组织,用Trizol试剂提取柞蚕蛹脂肪体总RNA,然后根据Reverse Tran-scriptase M-MLV试剂盒讲明书将提取的总RNA反转录成cDNA. 根据GeneBank登录的烟草天蛾Dorsal(登录号:ADK39025)、家蚕Rel(登录号:NP_001036896)和冈比亚按蚊Rel(登录号:XP_310177)的cDNA序列设计简并引物F(5 -TGCGARGGMCGSTCGG-3 )、R(5 -CATKGCCTTCTTRTCG(T/ A) AGATG-3 ).简并引物F/ R进行cDNA片段扩增,反响条件如下:94 预变性5 min

6、;94 变性3 s,55 退火30s,72 延伸30 s,35个循环;72 终延伸7 min.PCR产物经电泳检测后纯化回收,连接到pMD18-T载体,转化E.coliTop10感受态细胞,通过酶切鉴定挑选阳性克隆,送珍宝生物工程(大连)有限公司进行测序分析. 1. 3目的基因的RLM-RACE扩增 根据 1. 2 中扩增得到的cDNA序列设计RACE扩增特异引物:Dor-5 RACE outer primer(5 -CCAGGTTGTGCGAGTGAGGC-3 ),Dor-5 RACE innerprimer(5 -ATTGTAGGGTAGGTGCGGTTCTCG-3 ),Dor-3 RAC

7、E outer primer(5 -CTCGGCATCCAGTGCGTCAA-3 ),Dor-3 RACE inner primer(5 -GGAATCACCCGC-AGAGCATC-3 ). 5 -RACE和3 -RACE扩增分别根据RLM-RACE试剂盒讲明书进行,PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳、纯化回收后连接到pMD18-T载体,转化E.coliTop10感受态细胞,通过酶切鉴定挑选阳性克隆,送珍宝生物工程(大连)有限公司进行测序. 1.4目的基因的序列分析 测序结果用GenBank的BLAST比对,并用在线软件Expasy进行蛋白质分子质量和等电点分析.获得的柞蚕Dorsal基因用在线

8、软件BLASTW进行氨基酸序列同源性比对,并用MEGA5. 0软件构建系统进化树. 1. 5不同微生物对柞蚕蛹的诱导处理及各组织总RNA提取 取30只健康柞蚕蛹随机分为5组,每组6只,雌雄各3只.第1组为空白对照;第2组注射50 LE.coliTop10D(600 nm)= 1. 2,用无菌水稀释 10倍;第3组注射50 L枯草芽孢杆菌D(600 nm)=1. 2,用无菌水稀释10倍;第4组注射50 L毕赤酵母D(600 nm)= 1. 2,用无菌水稀释 10 倍;第 5组注射50 L ApNPV(2 106mL-1病毒悬液,用无菌水稀释10倍).用一次性无菌注射器从柞蚕蛹第1腹节处注射,常温

9、孵育24 h后,分别取柞蚕蛹的表皮、生殖腺、脂肪体、血淋巴、头部、气管6个组织器官,加液氮研磨成粉后,用Trizol试剂提取总RNA,然后根据Reverse Transcriptase M-MLV讲明书将提取的总RNA反转录成cDNA. 1. 6目的基因表示出的实时荧光定量PCR检测 1. 6. 1引物设计 根据获得的柞蚕Dorsal基因序列设计real-time PCR引物: QTF-ApdorsalA(5 -AG-GATCATTTACGCTGGAGGTACG-3 ), QTR-ApdorsalA(5 -CTTCTCAGTTTCAACAGGTGTCCG-3 );QTF-Ap-dorsalB

10、( 5 -TGCGCGAGTGTCAGTGTAGTTTGA-3 ),QTR-ApdorsalB(5 -CGCAGTGTTCGCTTCCAAGAA-TCA-3 ).以组成型表示出的柞蚕 -actin基因作为内参,引物为:A3F(5 -ACCAACTGGGACGACATGGA-GAAA-3 ),A3R(5 -TCTCTCTGTTGGCCTTTGGGT-TGA-3 ). 1. 6. 2实时荧光定量PCR 实时荧光定量PCR反响采用荧光染料SYBR Green(R)在Rotor Gene3000-6实时荧光定量基因扩增仪(上海天呈科技有限公司)上进行.根据SYBR-PrimeScript-RT-PCR

11、Kit讲明书配制25 L反响体系:cDNA模板2 L,2 SYBR Premix ExTaq酶12. 5 L,10 mol/ L正向引物0. 5 L,10 mol/ L反向引物0. 5 L,RNaseFree dH2O 9. 5 L. PCR反响条件: 95 预变性30s,30个循环(95 变性35 s,60 退火/延伸20s). 反响结束后,20 min缓慢升温绘制熔解曲线,利用Botor Gene 6软件的2- Ct方式方法8对目的基因的表示出水平进行分析. 2 结果与分析 2.1 Apdorsal基因的获得与序列特征 利用RLM-RACE扩增从柞蚕蛹脂肪体中克隆得到了2个Apdorsal

12、基因的cDNA序列,分别命名为ApdorsalA和ApdorsalB (登 录 号: JF488068、JF488069).华而不实,ApdorsalA的cDNA全长1 872bp,有一个1 158 bp的开放阅读框(2661 423 nt),编码386个氨基酸,该cDNA还包括265 bp的5 端非编码区和449 bp的3 端非编码区;ApdorsalB的cDNA全长1 860 bp,有一个1 008 bp的开放阅读框(4041 411 nt),编码336个氨基酸,该cDNA还包括403 bp的5 端非编码区和449 bp的3 端非编码区. 推导的氨基酸序列中都包含Rel/ NF- B蛋白家

13、族的特征区RHD,但是3 端没有Dorsal蛋白通常所具有的TD转录激活区(图1). 将ApdorsalA蛋白与其它物种的Rel/ NF- B家族蛋白进行全长氨基酸序列比对,结果显示柞蚕ApdorsalA蛋白与Dorsal、Dif、P65都属于无锚定重复 序 列 的 一 类 蛋 白, ApdorsalA与 烟 草 天 蛾MsDorsal、家蚕BmRelA、冈比亚按蚊Gambif、皱纹盘鲍AbRel、人Hsp65、褐家鼠Rnp65、果蝇DmDif、家蚕BmReish1和果蝇DmRelish的序列类似度分别为78%、70%、56%、48%、45%、45%、41%、32%、34%. 应用MEGA5.

14、 0软件构建柞蚕ApdorsalA蛋白与其它物种Rel/ NF- B蛋白的系统进化树,结果显示ApdorsalA蛋白与烟草天蛾Msdorsal、家蚕BmRelA蛋白有较近的亲缘关系(图2). 2.2 Apdorsal基因mRNA组织分布及不同微生物诱导的表示出变化 为了进一步了解Apdorsal基因在柞蚕不同组织中的表示出情况及Apdorsal能否介入了对不同微生物的免疫应答反响,利用real-time PCR技术以柞蚕 -actin基由于内参检测各种组织中ApdorsalA和ApdorsalB基因mRNA的转录情况.结果表示清楚2个Apdorsal基因mRNA在柞蚕蛹各组织中都有转录,在表皮

15、和气管中的转录水平最高,在脂肪体和头部中的转录水平次之,在血淋巴中的转录水平较低.柞蚕蛹脂肪体中的Apdorsal基因mRNA经ApNPV诱导处理后的转录水平最高,经毕赤酵母和枯草芽孢杆菌诱导处理后的转录水平次之,经E.coli诱导处理后的转录水平最低(图3). 3 讨论 本实验克隆得到了2个编码柞蚕Dorsal蛋白的cDNA序列,二者的5 端部分序列不同,推导的氨基酸序列仅仅仅是N端的50个氨基酸残基有差异.出现这种现象可能是由于可变剪切的结果,在其它物种的研究中也出现过由于可变剪切编码不同Rel/ NF- B蛋白的现象,例如家蚕BmRelA和BmRelB的氨基酸序列也仅仅是N端52个氨基酸

16、残基有差异9.本实验克隆的2个Apdorsal基因的编码蛋白质都有典型的Rel/ NF- B蛋白特征,N端含有由293个氨基酸组成的Rel同源区(RHD),华而不实包括核定位信号(NLS)和DNA结合构造域等基序. Apdorsal C末端与果蝇和家蚕的Relish10-11不同的是该区域中没有锚定重复序列.固然Apdorsal的构造特征与BmRelA9和Gambif112类似,但不具有BmRelA和Gambif1的亮氨酸锌指构造与脯氨酸富集区.值得注意的是,Apdorsal有一个相对较短的C末端片段,这与典型的Dorsal蛋白不同,而且Apdorsal也没有典型的Dorsal转录激活域,这可

17、能是可变剪切造成的13. 从系统进化树中能够看出,Apdorsal与家蚕BmRelA和烟草天蛾Msdorsal有很近的亲缘关系,同属于Rel/ NF- B蛋白家族的Dorsal类,表示清楚它们可能起源于同一个祖先.应用real-time PCR技术检测到2个Apdorsal基因在柞蚕蛹脂肪体、血细胞、气管、表皮、生殖腺和头部6个组织器官中都有表示出,具体表现出了该蛋白质在柞蚕中的多功能性6.Apdorsal基因在表皮和气管中的表示出量最高,在脂肪体和头部中的表示出量次之,在血淋巴中的表示出量较低,这是由于表皮是昆虫抵御微生物感染的第一道防线,而脂肪体是介入免疫应答的重要组织器官.用不同微生物诱

18、导处理柞蚕蛹后,部分组织中Apdorsal基因的表示出量比空白对照偏低,出现这种现象的原因可能是注射处理经过中物理性伤害产生的抑制作用,这与家蚕注射NaCl溶液后各组织中的BmToll9基因的表示出量出现降低的结果相一致14. 柞蚕蛹脂肪体中的Apdorsal基因经ApNPV诱导处理后的表示出水平最高,经毕赤酵母和枯草芽孢杆菌诱导处理后的表示出水平次之,经E.coli诱导处理后的表示出水平最低.该结果讲明柞蚕蛹脂肪体中的Apdorsal可能与对病毒、真菌、革兰阳性菌的免疫有关,而与对革兰阴性菌的免疫无关.这与Dorsal蛋白在Toll通路中对革兰阳性菌和真菌侵染具有抵抗作用的研究结果一致1,8

19、.对于病毒侵染昆虫后能否激活了NF- B信号通路尚无定论.已有文献报道Toll样受体(TLRs)介入了病毒的辨别,进而激活Toll通路15;Zambon等16也报道果蝇在抵抗病毒侵染的经过中通过激活Toll通路产生抗菌肽(AMPs),但不是通过AMPs抗病毒,而是由Toll通路激活细胞免疫杀灭病毒,讲明病毒侵染可能会使Toll通路中的Dorsal的表示出量增加. 这与本实验对柞蚕蛹注射ApNPV悬液后脂肪体中的Apdorsal基因的表示出量增加的结果相一致.然而Hirai等17用病毒侵染柞蚕后未检测到抗菌肽Attacin基因的表示出,以为病毒不能激活NF- B信号通路.对于病毒能否激活NF-

20、B信号通路及病毒侵染使Apdorsal表示出量增加的分子机制仍需继续探究. 以下为参考文献References) 1 Hoffmann J A. The immune response ofDrosophilaJ. Nature,2003,426(6962):33-38 2 Lemaitre B,Reichhart J M,Hoffmann J A.Drosophilahost defense:differential induction of antimicrobial peptide genes after infectionby various classes of microorgan

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