MEGA 使用教程学习.pptx
《MEGA 使用教程学习.pptx》由会员分享,可在线阅读,更多相关《MEGA 使用教程学习.pptx(12页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、将拼好后的序列和下载的序列填在一个txt文档中保存后,将文件后缀由.txt 改成.fas第1页/共12页打开MEGA 5.05软件,点击菜单栏File,选择open a file,打开刚才的.fas文件。弹出窗口后选择Align。弹出副窗口。第2页/共12页在主窗口中,点击上方工具栏W标志,将序列比对对齐。第3页/共12页序列对齐,修饰后,点击工具栏 保存图标,将文件进行保存。格式为mas格式第4页/共12页保存后关闭上一个副窗口,回到主窗口,重新在File中打开刚保存的.mas格式的文件。弹出新的副窗口(序列已对齐)第5页/共12页在工具栏Data中打开刚才保存的.mas文件,Analysi
2、s分析,可在主窗口中出现TA图标(如图)。第6页/共12页点击TA图标,可弹出小窗口,由次窗口可知简约信息位点,不变位点等信息。点击工具栏statistics,选择第一项进行核酸比较,可在excel表中导出碱基组成信息。第7页/共12页点击主窗口中Distance中的第一项,可对物种之间遗传距离进行计算。注意Bootstrap参数设置(一般为1000)。模型选用Kimura双参数模型进行计算。点击Computr进行计算关于遗传距离第8页/共12页关于系统发育树点击主窗口中Phylogeny下选择想用的算法(最大似然法ML或者是邻接法NJ),一般选用ML。第9页/共12页各参数设置如图,点击Computr进行计算,构建出一个系统发育树。第10页/共12页左侧工具栏可对树的拓扑结构进行调整。点击保存,将文件保存成mts格式(仅可以用MEGA打开)。也可以点击上方工具栏中的Image,save as 为其他格式。若想更改字体,可将文件保存成PDF格式后,用Adobe Illustrator CS5对其进行修改。第11页/共12页感谢您的观看。第12页/共12页
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- MEGA 使用教程学习 使用 教程 学习
限制150内