有几种不同的剪接模式见116最常见的模式是外.pdf
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1、有几种不同的剪接模式(见图1-1)1,6。最常见的模式是外显子跳跃,使盒式外显子在成熟的 mRNA(也称为跳过外显子)任何包含或排除。跳绳外显子的一个著名的例子是果蝇性别致死(SXL)的基因,这是性别决定开关。SXL 基因第 3 外显子跳绳可以保持女性的分化。第 3 外显子的 SXL 包含一个成熟前终止密码子,并列入本外显子的产生截断,可能非功能性蛋白7,8。另一个拼接模式是相互排斥的外显子,它允许被包含在最终产品中只有一两个相邻的外显子。人类成纤维细胞生长因子受体2(FGFR-2)基因含有外显子 IIIB 和 IIIC是相互排斥的。从外显子的 IIIb 的基因产物,具有低得多的成纤维细胞生长
2、因子9的亲和力。而不是整个外显子剪接也可以拼接出的外显子的一部分。替代5或 3剪接位点的选择生成或不延长,侧面外显子的变种。果蝇无果而终(FRU)和双性别(DSX)基因包含了女性特有的替代剪接位点,在 5 前者和后者在 3端。这些剪接位点的替代选择可以产生小的扩展10,11的变种。剪接可以发生在任何结束的成绩单。替代终端外显子不仅改变列入最后一个外显子,而且还影响聚腺苷酸化的网站选择。在许多情况下,它可以导致过早终止密码子在最后一个外显子,要么产生功能截断多肽或导致无意义介导衰变(NMD 降解基因密码子与终止的最后一个外显子-外显子位于上游超过 50-55 BP交界处)2,12,13。钙调节激
3、素(降钙素)基因包括6 个外显子。成熟的的降钙素谈话包含四个外显子和使用外显子4,代表基因产物在甲状腺C 细胞 98的多聚腺苷酸化网站。同时,在大脑和周围神经系统,与前三剪接变异体,第五和第六外显子编码降钙素相关肽的前体,并利用下游腺苷酸化网站(CGRP)14,15。同样,替代启动使用,可以选择不同的促销员转录和一般影响的第一个外显子。尽管人们普遍认为作为转录调控,替代启动使用广泛与剪接。它已被观察替代发起人的基因更容易进行剪接和替代发起人的数字是正相关,与剪接变异数16。鼠标单羧酸转运蛋白2(MCT2)基因有几种可供选择的推动者,在五个独特的第一外显子(1A-1E)。外显子 1C 是用于在各
4、种组织中,而另一些组织特异性17。最后,内含子也可以参与剪接。内含子保留完整的内含子可以包括或排除。它被视为稀有的模式在人类1。然而,最近的研究表明,频率要高得多,在已知的人类基因(约 15)18。1内含子保留是更常见植物比其他真核生物中19。例如,拟南芥在 50以上的事件是内含子保留20。人类 FOSB(FBJ 骨肉瘤小鼠骨肉瘤病毒的基因同源 B)基因包含一个 140 bp的序列,它可以是剪接出来,产生一个截断的产品FosB 的最后一个外显子。慢性吸毒21观察动物的FosB 表达。基底剪接机制两个替代构拼接使用相同的基础机械,称为剪接。剪接的识别和选择的剪接位点(外显子内含子路口)和催化打破
5、和重新加入RNA 链。剪接体主要由五个小核核糖(snRNPs)时,U1,U2,U4,U5 和 U6 的,其中包括尿苷丰富的小核RNA 和多种蛋白质。他们能够认识到对前体mRNA 的剪接信号和交互互相或与其他辅助拼接因素22-24。“三个代表”的保守序列元素需要拼接。这些措施包括规范或不规范的剪接,polypyrimidine道和分支点(见图 1-2)22,23。剪接位点含有保守的跨越外显子内含子交界处的短序列。顾和 AG 核苷酸是常用不变,分别在 5和 3内含子两端。这种类型 GU-AG 的剪接交界处的一双被称为典型的超过 98的哺乳动物的基因组内含子的剪接位点存在25。非经典的剪接位点含有核
6、苷酸对如 GC-AG,AT-AC 等,通常都是罕见的。polypyrimidine道是 UC 丰富段位于 3内含年底和明年 3剪接位点。它是拼接几个因素,如U2 snRNP 辅助因子(U2AF)和polypyrimidine 道结合蛋白(PTB)的26,结合位点。分支点(也称为分支站点)位于上游 polypyrimidine 道。分支点和 3剪接交界之间的平均距离大约是在人类和小鼠 2730-40 BP。虽然分支点序列在哺乳动物中是可变的,可以促进分支点突变的剪接从构的转变27。剪接体组装称为剪接体循环连续的方式,其中包括识别序列中的元素,此外,重排和 snRNPs释放(见图 1-2)。U1
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