第四章--DNA的突变损伤和修复课件.ppt
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1、Chapter 4.DNA damage,repair,mutation第一节:突变第一节:突变(mutation)mutation)一、突变的主要类型突变是突变是DNADNA碱基序列水平上的永久的、可遗传的改变。碱基序碱基序列水平上的永久的、可遗传的改变。碱基序列的变化可以分为下面几种类型列的变化可以分为下面几种类型:碱基替换(碱基替换(base substitutionbase substitution),即),即DNADNA分子中一个碱基被分子中一个碱基被另一个碱基替代;插入(另一个碱基替代;插入(insertioninsertion),涉及一个或多个碱基插),涉及一个或多个碱基插入到入
2、到DNADNA序列中;缺失(序列中;缺失(deletiondeletion),涉及),涉及DNADNA序列上一个或多序列上一个或多个碱基的缺失;个碱基的缺失;重复(重复(duplicationduplication),一段碱基序列发生一次重复;倒位),一段碱基序列发生一次重复;倒位(inversioninversion),一段碱基序列发生倒转,但仍保留在原来的位),一段碱基序列发生倒转,但仍保留在原来的位置上;易位(置上;易位(translocationtranslocation),一段碱基序列从原来的位置移),一段碱基序列从原来的位置移出,并插入到基因组的另一位置。出,并插入到基因组的另一位
3、置。1.1.碱基替换碱基替换 碱基替换又称为点突变(碱基替换又称为点突变(point mutationpoint mutation),是一种最简单),是一种最简单的突变。碱基替换可以分为转换(的突变。碱基替换可以分为转换(transitiontransition)和颠换)和颠换(transversiontransversion)两种类型。转换是指嘌呤与嘌呤之间,或嘧)两种类型。转换是指嘌呤与嘌呤之间,或嘧啶与嘧啶之间的替换;颠换是指嘌呤与嘧啶之间的替换。啶与嘧啶之间的替换;颠换是指嘌呤与嘧啶之间的替换。转转 换换:嘌嘌 呤呤 与与 嘌嘌 呤呤 之之 间间,嘧嘧 啶啶 与与 嘧嘧 啶啶 之之 间
4、间 的的 互互 换换 AG T C颠换颠换:嘌呤与嘧啶之间发生互换嘌呤与嘧啶之间发生互换 A T or C T A or G G T or C C A or G 根根据据碱碱基基替替代代对对多多肽肽链链中中氨氨基基酸酸顺顺序序的的影影响响,点点突突变变又又可可以以分为同义突变、错义突变和无义突变三种类型。分为同义突变、错义突变和无义突变三种类型。有有时时DNADNA的的一一个个碱碱基基对对的的改改变变并并不不会会影影响响基基因因所所编编码码的的蛋蛋白白质质的的氨氨基基酸酸序序列列,这这是是因因为为改改变变后后的的密密码码子子和和改改变变前前的的密密码码子子是是简简并并密密码码子子,它它们们编编
5、码码同同一一种种氨氨基基酸酸,这这种种基基因因突突变变称为称为同义突变(同义突变(synonymous mutation)synonymous mutation)。由由于于碱碱基基对对的的改改变变而而使使决决定定某某一一氨氨基基酸酸的的密密码码子子变变为为决决定定另另一一种种氨氨基基酸酸的的密密码码子子的的基基因因突突变变叫叫错错义义突突变变(missensemissense mutationmutation)。)。基基因因突突变变有有可可能能使使它它所所编编码码的的蛋蛋白白质质部部分分或或完完全全失失活活,例例如如人人血血红红蛋蛋白白链链的的基基因因如如果果将将决决定定第第6 6位位氨氨基基
6、酸酸的的密密码码子子由由GAG GAG(谷谷氨氨酸酸)变变为为GTG(GTG(缬缬氨氨酸酸),从从而而引引起起镰镰刀刀形形细细胞胞贫贫血血病。病。fig.11.2sickle cell disease 有有一一些些错错义义突突变变造造成成的的氨氨基基酸酸替替代代并并不不影影响响蛋蛋白白质质的的功功能能,我我们们就就称称之之为为中中性性突突变变。例例如如密密码码子子AGGAAGAGGAAG,导导致致了了LysLys取取代代了了ArgArg,这这两两种种氨氨基基酸酸都都是是碱碱性性氨氨基基酸酸,性性质质十十分分相相似似,所所以以蛋蛋白白的的功功能能并并不不发发生生重重大大的的改改变变。中中性性突突
7、变变连连同同同同义义突突变变一一起起被被称为沉默突变(称为沉默突变(silent mutationsilent mutation)。)。由由于于某某个个碱碱基基替替代代使使决决定定某某一一氨氨基基酸酸的的密密码码子子变变成成一一个个终终止止密密码码子子的的基基因因突突变变叫叫无无义义突突变变(nonsense nonsense mutationmutation)。其其中中密密码码子子改改变变为为UAGUAG的的无无义义突突变变又又叫叫琥琥珀珀突突变变,密密码码子子改改变变成成UAAUAA的的无无义义突突变变又又叫叫赭赭石石突突变变。无无义义突突变变使使多多肽肽链链的的合合成成提提前前终终止止,
8、产产生生截截短短的的蛋蛋白白质质,这这样样的的蛋蛋白白质质常常常常是是没没有有活活性性的。的。突变也可以把终止密码子转变成编码某一氨基酸的有义密突变也可以把终止密码子转变成编码某一氨基酸的有义密码子,造成终止信号的通读(码子,造成终止信号的通读(readthroughreadthrough),结果是多肽链),结果是多肽链的的C C末端添加了一段氨基酸序列。对于大多数蛋白质,末端添加了一段氨基酸序列。对于大多数蛋白质,C C末端延末端延伸一段短的氨基酸序列,并不影响它们的功能,但是过长的延伸一段短的氨基酸序列,并不影响它们的功能,但是过长的延伸会影响蛋白质的折叠,降低蛋白质的活性。伸会影响蛋白质
9、的折叠,降低蛋白质的活性。2.Deletions,Insertions and Frameshift mutations 基基因因的的编编码码序序列列中中插插入入或或者者缺缺失失一一个个或或两两个个碱碱基基,会会使使DNADNA的的阅阅读读框框架架发发生生改改变变,导导致致插插入入或或缺缺失失部部位位之之后后的的所所有有密密码码子子都都跟跟着着发发生生变变化化,结结果果产产生生一一种种截截短短的的或或异异常常的的多多肽肽链链,这这种种突突变变称称为为移移码码突突变变(frameshiftframeshift mutationsmutations)。移移码码突突变变常常常常完完全全破破坏坏了了编
10、编码码蛋蛋白白质质的的功功能能,除除非非移移码码突突变变发发生生在在靠靠近近读读码码框框的远端的地方。的远端的地方。Frameshiftmutation5AUGUGGGGACCCAAGGGUAGCCCC.3(wild-type)mettrpglyprolysglyserpro.5AUGUGGGGGGACCCAAGGGUAGCCCC.3(mutant)mettrpglythrglnglystopTwo changes in polypeptides are possible:(1)every amino acid downstream of the mutation is changed,(2)
11、a truncated(shortened)protein is produced.然而,一次插入或者缺失三个碱基会添加或者删除一个完整然而,一次插入或者缺失三个碱基会添加或者删除一个完整的密码子,阅读框又得到恢复。这时,除了添加或缺失一个氨的密码子,阅读框又得到恢复。这时,除了添加或缺失一个氨基酸残基,蛋白质的其他部分并未发生变化。如果添加(或缺基酸残基,蛋白质的其他部分并未发生变化。如果添加(或缺失)的氨基酸不在蛋白质的功能区,仍能产生功能蛋白。失)的氨基酸不在蛋白质的功能区,仍能产生功能蛋白。3.DNA重排 DNADNA重排包括缺失、倒位、易位和重复。基因组中相似序列重排包括缺失、倒位、
12、易位和重复。基因组中相似序列之间的配对,以及随后发生的重组可以造成之间的配对,以及随后发生的重组可以造成DNADNA的重排。如图,的重排。如图,同一同一DNADNA分子的两个同向重复序列之间的配对和重组将使两个重分子的两个同向重复序列之间的配对和重组将使两个重复序列之间的部分形成一个独立的环,从原来的复序列之间的部分形成一个独立的环,从原来的DNADNA分子上释放分子上释放出来。原来的出来。原来的DNADNA分子则产生相应的缺失。分子则产生相应的缺失。图表示同一图表示同一DNADNA分子上的两个反向重复序列发生配对形成的茎分子上的两个反向重复序列发生配对形成的茎环结构。配对后的重组将导致反向重
13、复序列之间的部分发生倒环结构。配对后的重组将导致反向重复序列之间的部分发生倒位。大肠杆菌染色体含有位。大肠杆菌染色体含有7 7个拷贝的个拷贝的rRNArRNA基因。有一些大肠杆菌基因。有一些大肠杆菌菌株,染色体上两个菌株,染色体上两个rRNArRNA操纵子之间的序列发生了倒位。这些操纵子之间的序列发生了倒位。这些菌株能够存活,但生长速度比正常的菌株要慢一些。菌株能够存活,但生长速度比正常的菌株要慢一些。二、突变的产生1 1自发突变自发突变(1 1)复制差错可以引起自发突变()复制差错可以引起自发突变(spontaneous spontaneous mutationmutation)DNA DN
14、A聚合酶在聚合酶在DNADNA复制过程中偶尔会出现差错,将错误的碱基复制过程中偶尔会出现差错,将错误的碱基插入到插入到DNADNA分子中,引发突变。分子中,引发突变。另外,碱基的互变异构有时也会另外,碱基的互变异构有时也会导致突变的发生。导致突变的发生。DNADNA分子中的碱基都存在两种互变异构体,它分子中的碱基都存在两种互变异构体,它们处于动态平衡中,所以每一种碱基都可以从一种异构体转变们处于动态平衡中,所以每一种碱基都可以从一种异构体转变为另一种异构体。为另一种异构体。DNADNA复复制制时时,碱碱基基配配对对的的性性质质由由于于碱碱基基互互变变异异构构化化而而发发生生的的改改变变也也能能
15、产产生生突突变变。图图表表示示偶偶尔尔在在复复制制叉叉到到达达的的关关键键时时刻刻,模模板板上上的的G G从从酮酮式式变变为为稀稀醇醇式式,致致使使碱碱基基的的配配对对性性质质发发生生了了变变化化,与与T T而而不不是是与与C C配配对对。DNADNA再再复复制制一一次次产产生生的的两两个个子子代代双双螺螺旋旋中中的的一一个个将将带带有有突突变变,罕罕见见的的互互变变异异构构体体会会转转变变成成其其常常见见形形式式,配配对对性性质质有有恢恢复复到到正正常常。由由于于正正常常碱碱基基形形成成异异构构体体的的几几率率很很低低,所所以以自自发发突突变变的的频频率率也也很很低低,一一般般为为10106
16、 610101010。如如果果某某一一碱碱基基类类似似物物能能以以较较高高的的频频率率产产生生异异构构体体,当掺入当掺入DNADNA分子后,就能提高突变率。分子后,就能提高突变率。Tautomeric shifts can be a source of rare spontaneous mutationDuring the next round of DNA replication,the transition mutation becomes“fixed”in the DNA.并并非非所所有有的的复复制制错错误误都都是是点点突突变变,异异常常的的复复制制也也可可以以造造成成插插入入或或缺缺失
17、失突突变变。当当复复制制叉叉遇遇到到串串联联重重复复序序列列时时模模板板链链与与新新生生链链之之间间有有时时会会发发生生相相对对移移动动,导导致致部部分分模模板板链链被被重重复复复复制制或或者者被被遗遗漏漏,其其结结果果是是新新生生链链多多了了或或少少了了一一些些重重复复单单位位。复复制制滑滑移移(strand strand slippageslippage)是是微微卫卫星星(microsatellitemicrosatellite)产生的主要原因。产生的主要原因。(a)Normalreplication.(b)Backwardslippage,resultingintheinsertionm
18、utation.(c)Forwardslippage,resultinginthedeletionmutation.微卫星是一种短串连重复微卫星是一种短串连重复DNADNA。典型的微卫星是以。典型的微卫星是以1 1,2 2,3 3或或4 4 bpbp长的序列为单位,重复长的序列为单位,重复10102020次形成的。人类微卫星中,最次形成的。人类微卫星中,最常见的类型是二核苷酸重复序列,在整个人类基因组中约常见的类型是二核苷酸重复序列,在整个人类基因组中约140 140 000000拷贝。比如,人类基因组具有拷贝。比如,人类基因组具有CACA重复的微卫星,重复的微卫星,CACACACACACAC
19、ACCACACACACACACAC,占基因组,占基因组0.250.25,共,共8 Mb8 Mb。发生在短重复序列处的链的滑移也可能与人类的三核苷酸重复发生在短重复序列处的链的滑移也可能与人类的三核苷酸重复序列扩增疾病(序列扩增疾病(trinucleotidetrinucleotide repeat expansion disease repeat expansion disease)的发生有关。例如,人类的发生有关。例如,人类HDHD基因含有串联重复基因含有串联重复6 63535次的次的5-5-CAG-3CAG-3,编码蛋白质产物中的多聚谷胺酰胺。在亨廷顿氏病,编码蛋白质产物中的多聚谷胺酰胺。
20、在亨廷顿氏病(Huntington diseaseHuntington disease)中,这些重复序列扩增至)中,这些重复序列扩增至3636121121个个拷贝,增加了多聚谷胺酰胺的长度,造成蛋白质功能障碍。一拷贝,增加了多聚谷胺酰胺的长度,造成蛋白质功能障碍。一些与智力缺陷有关的疾病与基因前导区的三核苷酸扩增引起的些与智力缺陷有关的疾病与基因前导区的三核苷酸扩增引起的染色体脆性位点(染色体脆性位点(fragile sitefragile site)有关。)有关。(2)(2)碱基的脱氨作用引起的自发突变碱基的脱氨作用引起的自发突变在正常的生理条件下,腺嘌呤、鸟嘌呤、尤其是胞嘧啶可在正常的生理
21、条件下,腺嘌呤、鸟嘌呤、尤其是胞嘧啶可以自发地发生脱氨作用(以自发地发生脱氨作用(deaminationdeamination),脱去嘌呤环或嘧啶),脱去嘌呤环或嘧啶环上的氨基。胞嘧啶脱氨产生尿嘧啶,因此复制时在新生链对环上的氨基。胞嘧啶脱氨产生尿嘧啶,因此复制时在新生链对应的位点上插入的是腺嘌呤而不是鸟嘌呤。腺嘌呤自发脱氨转应的位点上插入的是腺嘌呤而不是鸟嘌呤。腺嘌呤自发脱氨转变成次黄嘌呤,次黄嘌呤优先与胞嘧啶配对,而不是与胸腺嘧变成次黄嘌呤,次黄嘌呤优先与胞嘧啶配对,而不是与胸腺嘧啶配对。因此,腺嘌呤和胞嘧啶的脱氨作用可以造成突变。鸟啶配对。因此,腺嘌呤和胞嘧啶的脱氨作用可以造成突变。鸟嘌
22、呤脱氨后变成了黄嘌呤(嘌呤脱氨后变成了黄嘌呤(xanthinexanthine),由于黄嘌呤仍与胞嘧),由于黄嘌呤仍与胞嘧啶配对,只是它们之间只形成两个氢键,因此鸟嘌呤的脱氨作啶配对,只是它们之间只形成两个氢键,因此鸟嘌呤的脱氨作用并不能引起突变。用并不能引起突变。Deamination of C yields U which base pairs with AResults in C-G to T-A transitionThis occurs spontaneouslyDeamination2.Mutations are produced by mutagens某某些些物物理理或或化化学学
23、因因素素可可以以提提高高突突变变率率,这这些些能能够够导导致致突突变变的的物物理理或或化化学学因因素素就就称称为为诱诱变变剂剂(mutagenmutagen)。诱诱变变剂剂会会对对DNADNA分分子子造造成成损损伤伤。如如果果损损伤伤在在DNADNA复复制制之之前前还还没没有有被被体体内内的的修修复复系系统统所所修修复复,在在DNADNA复复制制过过程程中中,当当复复制制叉叉抵抵达达损损伤伤部部位位时时,常常常常发发生生复复制制错错误误,从从而而引引起起诱诱变变。不不同同的的诱诱变变剂剂以以不不同同的的方方式式对对DNADNA分分子子产产生生损损伤伤,因因而而诱诱导导突突变变的的方方式式可可能
24、能也也不不同同。对对DNADNA造造成成损损伤伤的的因因素素并并不不一一定定都都是是诱诱变变剂剂,比比如如造造成成DNADNA断断裂裂的的断断裂裂剂剂。这这种种类类型型的的损损伤伤可可阻阻遏遏复复制制,导导致致细细胞死亡。胞死亡。(1)(1)物理诱变剂物理诱变剂 紫外线引起相邻的嘧啶碱基产生嘧啶二聚体紫外线引起相邻的嘧啶碱基产生嘧啶二聚体X-X-射线和射线和-射线是电离辐射,它们作用于水分子以及其他的射线是电离辐射,它们作用于水分子以及其他的细胞内分子产生离子和自由基,尤其是羟自由基(细胞内分子产生离子和自由基,尤其是羟自由基(hydroxyl hydroxyl radicalradical)
25、。具有高度反应活性的自由基会对)。具有高度反应活性的自由基会对DNADNA分子产生广分子产生广泛的损伤。泛的损伤。X-X-射线和射线和-射线也可以直接作用于射线也可以直接作用于DNADNA,对,对DNADNA产产生损伤。在分子生物学发展的早期,生损伤。在分子生物学发展的早期,X X射线经常被用来在实射线经常被用来在实验室产生突变。验室产生突变。X X射线倾向于产生多种突变,并且常常造成射线倾向于产生多种突变,并且常常造成DNADNA重排,例如缺失、倒转和移位。重排,例如缺失、倒转和移位。加加热热可可以以促促进进碱碱基基和和戊戊糖糖之之间间N N-糖糖苷苷键键的的水水解解,结结果果导导致致DNA
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- 第四 DNA 突变 损伤 修复 课件
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