临床基因扩增检验的质量保证 (2)精.ppt
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1、临床基因扩增检验的质量保证第1页,本讲稿共84页定定 义n质量保证质量保证(QualityAssurance,QA)为一产品或服务满足特为一产品或服务满足特定质量要求提供充分定质量要求提供充分可信性可信性所必要的所必要的有计划的和系统的措有计划的和系统的措施施。n室内质量控制(室内质量控制(InternalQualityControl,IQC)由由实验室实验室工作人员工作人员,采取一定的方法和步骤,连续评价本实验室,采取一定的方法和步骤,连续评价本实验室工作的可靠性程度,旨在工作的可靠性程度,旨在监测和控制本实验室工作的监测和控制本实验室工作的精密度精密度,提高本室常规工作中批内、批间样本检验
2、的一,提高本室常规工作中批内、批间样本检验的一致性,以致性,以确定测定结果是否可靠、可否发出报告的一项确定测定结果是否可靠、可否发出报告的一项工作工作。第2页,本讲稿共84页定定 义n室室间间质质量量评评价价 (External External Quality Quality Assessment,Assessment,EQAEQA)为为客客观观比比较较一一实实验验室室的的测测定定结结果果与与靶靶值值的的差差异异,由由外外单单位位机机构构,采采取取一一定定的的办办法法,连连续续、客客观观地地评评价价实实验验室室的的结结果果,发发现现误误差差并并校校正正结结果果,使使各各实实验验室室之之间间的
3、的结结果果具具有有可可比比性性。这这是是对对实实验验室室操操作作和和实实验验方方法法的的回回顾顾性性评评价价,而而不不是是用用来来决决定定在在实实时时的的测测定定结结果果的的可可接接受受性性。当当EQAEQA用用来来为为执执业业许许可可或或实实验验室室认认证证的的目目的的而而评评价价实实验验室室操操作作时时,常常描描述述为为实实验验室室能能力力验验证证(Proficiency Proficiency testing,testing,PTPT)。在在以以前前的的文文献献中中,EQAEQA常描述室间质量控制常描述室间质量控制。第3页,本讲稿共84页定定 义n批批(Run)在相同条件下所获得的一组测
4、定。在相同条件下所获得的一组测定。n均值(均值(Mean)n标准差(标准差(Standarddeviation,SD或或s)n变异系数(变异系数(Coefficientofvariation,CV)第4页,本讲稿共84页定定 义 n准确度准确度(Accuracy)(Accuracy)待测物的测定值待测物的测定值与其真值的一致性程度。与其真值的一致性程度。准确度不能直接以数准确度不能直接以数值表示,通常以不准确度来间接衡量。对一分值表示,通常以不准确度来间接衡量。对一分析物重复多次测定,所得均值与其真值或参考析物重复多次测定,所得均值与其真值或参考靶值之间的差异亦即偏差即为测定的不准确度。靶值之
5、间的差异亦即偏差即为测定的不准确度。n偏差偏差(Bias)(Bias)待测物的测定值与一可接待测物的测定值与一可接受参考值之间的差异。受参考值之间的差异。第5页,本讲稿共84页定定 义n精密度精密度(Precision)在一定条件下所获得的在一定条件下所获得的独立的测定结果之间的一致性程度。与准独立的测定结果之间的一致性程度。与准确度一样,精密度同样也是以不精密度来确度一样,精密度同样也是以不精密度来间接表示。测定不精密度的主要来源是随间接表示。测定不精密度的主要来源是随机误差,以标准差(机误差,以标准差(SD)和)和/或变异系数或变异系数(CV)具体表示。)具体表示。SD或或CV越大,表示重
6、复越大,表示重复测定的离散度越大,精密度越差,反之则测定的离散度越大,精密度越差,反之则越好。越好。第6页,本讲稿共84页定定 义n正态分布正态分布(Gaussiandistribution)当一质控物用同一方法在不同的时间重复多次测定,当测定数据足够多时,如以横轴表示测定值,纵轴表示在大量测定中相应测定值的个数,则可得到一个两头低,中间高,中为所有测定值的均值,左右对称的“钟形”曲线,亦即正态分布,又称高斯分布。第7页,本讲稿共84页定定 义n正态分布的基本统计学含义可用均数()、标准差(s)和概率来说明。第8页,本讲稿共84页临床基因扩增检验实验室临床基因扩增检验实验室常规测定步骤常规测定
7、步骤n标本收集:标本收集:选择测定项目、标本收集和保存。n实验室测定:实验室测定:标本接收、贴标签、样本处理、核酸扩增、产物检测、测定的有效性和临床诊疗价值。n报告和解释:报告和解释:结果发出、结果解释和临床管理。第9页,本讲稿共84页质量保证、室内质控和室间质评之间的质量保证、室内质控和室间质评之间的关系关系第10页,本讲稿共84页临床标本收集、运送、保存临床标本收集、运送、保存及其质量控制及其质量控制 n标本收集本收集 n标本保存本保存n标本运送本运送 第11页,本讲稿共84页标本收集标本收集n标本采集本采集时间对扩增增检测结果的影响果的影响 n标本采集部位的准本采集部位的准备 n标本的本
8、的类型和采集量型和采集量 n采采样质量的量的评价价 n采采样及运及运输容器容器 n标本采集中的防本采集中的防污染染 第12页,本讲稿共84页标本采集时间对扩增检测结果的影标本采集时间对扩增检测结果的影响响n在疾病在疾病发展展过程中,程中,标本采集本采集过早或早或过晚晚都可能会都可能会给出假阴性出假阴性结果。果。第13页,本讲稿共84页标本采集部位的准备标本采集部位的准备n血液血液标本采集本采集n分分泌泌物物标本本:采采集集部部位位的的清清洁消消毒毒可可去去掉掉污染染的的微微生生物物或或其其它它杂物物,但但应适适度度,过度度清清洁消消毒毒有有可可能能会会去去掉掉或或破破坏坏靶靶微微生生物物,故故
9、标本本采采集集部部位位的准的准备应由由训练有素的人有素的人员进行行。第14页,本讲稿共84页标本的类型和采集量标本的类型和采集量n标本的本的类型型:血清血清(浆浆)、分泌物、痰、分泌物、痰、粪便、尿和便、尿和脑脊脊液等。液等。n标本的采集量本的采集量:应根据所根据所测病原体而定。一病原体而定。一般来般来说,如果,如果标本的量本的量对病原体培养病原体培养够用用的的话,则其量亦足以用于核酸提取及其后其量亦足以用于核酸提取及其后的的扩增增检测。n对于定量于定量测定来定来说,对标本的收集要求更本的收集要求更为精确。精确。第15页,本讲稿共84页采样质量的评价采样质量的评价n血清血清(浆浆)标本标本:溶
10、血、脂血等;溶血、脂血等;n分泌物、痰:评价内容包括细胞组成,分泌物、痰:评价内容包括细胞组成,所需类型细胞的数量和核酸总量。所需类型细胞的数量和核酸总量。评价方法:包括肉眼观察评价方法:包括肉眼观察,显微镜下观察显微镜下观察和化学分析等。和化学分析等。第16页,本讲稿共84页采样及运输容器采样及运输容器 n标本的采集材料如棉本的采集材料如棉签应为一次性使用;一次性使用;n采采样及运及运输容器容器应为密密闭的一次性无菌的一次性无菌装置;装置;n采采样所用的防腐所用的防腐剂、抗凝、抗凝剂及相关及相关试剂材料不材料不应对核酸核酸扩增及增及检测过程造成干程造成干扰。第17页,本讲稿共84页标本采集中
11、的防污染标本采集中的防污染 n采集中要特别注意污染,防止混入采集中要特别注意污染,防止混入操作者的头发、表皮细胞、痰液等;操作者的头发、表皮细胞、痰液等;n如使用玻璃器皿,必须经高压灭菌,如使用玻璃器皿,必须经高压灭菌,以使可能存在的以使可能存在的RNase失活失活。第18页,本讲稿共84页标本保存标本保存 n靶核酸靶核酸(尤其是尤其是RNA)易受核酸酶易受核酸酶的作用而迅速降解,因此标本的的作用而迅速降解,因此标本的保存对于核酸扩增测定的有效性保存对于核酸扩增测定的有效性极为重要。极为重要。n使用使用GITC作为稳定剂保存标本,作为稳定剂保存标本,标本可在室温下稳定约标本可在室温下稳定约7天
12、。天。第19页,本讲稿共84页标本保存标本保存n临床体液标本长期保存应在-70下。n如为提取核酸后用于DNA扩增分析的样本,可于10 mmol/L Tris,1mmol/L EDTA(pH7.58.0)缓冲液中4 下保存。n用于RNA扩增分析的样本,则应于上述缓冲液中-80或液氮下保存。n核酸的乙醇沉淀物则可于-20下保存。第20页,本讲稿共84页标本运送标本运送 n样本一经采集,则应尽可能快的送至检测样本一经采集,则应尽可能快的送至检测实验室。实验室。n样本中如加入了适当的稳定剂样本中如加入了适当的稳定剂,如用于如用于RNARNA测定加入测定加入GITCGITC的血清的血清(浆浆)样本和用于
13、样本和用于DNADNA测定的测定的EDTAEDTA抗凝血等抗凝血等,则可在室温下运则可在室温下运送或邮寄。送或邮寄。n实验室应根据待测靶核酸的特性,对各实验室应根据待测靶核酸的特性,对各种临床样本的运送条件作出相应的规定。种临床样本的运送条件作出相应的规定。第21页,本讲稿共84页临床基因扩增检验的室内质量控制临床基因扩增检验的室内质量控制n测定前的定前的质量控制量控制n核酸核酸样本的制本的制备及其及其质量控制量控制 n统计学学质量控制量控制n质量控制的量控制的评价价第22页,本讲稿共84页测定前定前质量控制量控制n实验室室设施、施、仪器器设备及管理及管理n理想的理想的试剂和操作方法和操作方法
14、 n人人员培培训第23页,本讲稿共84页实验室设施、仪器设备及管理实验室设施、仪器设备及管理n临床基因扩增检验实验室应有充分合理的临床基因扩增检验实验室应有充分合理的空间、良好的照明和空调设备空间、良好的照明和空调设备 ;n实验室仪器设备应保养良好,实验用品实验室仪器设备应保养良好,实验用品要达到相应的要求。要达到相应的要求。加样器的校准?带加样器的校准?带滤塞吸头的使用及质检?离心机?热循滤塞吸头的使用及质检?离心机?热循环仪?水浴箱和环仪?水浴箱和/或恒温干浴仪?酶标仪或恒温干浴仪?酶标仪和洗板机?和洗板机?第24页,本讲稿共84页基因扩增仪器设备的质控基因扩增仪器设备的质控第25页,本讲
15、稿共84页带滤塞吸塞吸头的使用及的使用及质检n首先制备一个含12%甘油及色素(如甲基橙)的水溶液,如果吸头的最大体积为100l,则将加样器吸取体积调至110120l,再套上吸头后吸取上述有色液体。如果吸头质量好,则有色液体不应出现在滤塞之上,否则说明滤塞不严。第26页,本讲稿共84页带滤塞吸塞吸头的使用及的使用及质检n用实验来检验带滤塞吸头的质量:先纯化制备数份强阳性和数份阴性核酸标本,然后将加样器吸取量设至扩增加样所需的体积,使用待评价带滤塞吸头对一份强阳性样本来回吸取10次(模拟10份阳性样本的吸取),将最后一次的吸取液加至一含扩增反应液的管中,之后,换一个新吸头,连续吸取10份阴性样本分
16、别至10个扩增反应管中,此过程重复35次,最后对每一管按所用试剂方法进行扩增检测。强阳性样本应为强阳性,阳性弱或出现阴性则说明吸头可能含有扩增抑制物。所有阴性样本应为阴性,出现阳性则表明吸头不能有效地防止气溶胶对加样器的污染。第27页,本讲稿共84页核酸提取用离心管质检核酸提取用离心管质检n离心管离心管PCRPCR抑制物抑制物质检n其他其他第28页,本讲稿共84页扩增仪孔间温度的重复性和均一性扩增仪孔间温度的重复性和均一性的的检测方法方法n一是使用一种热电偶探针、微伏转换器和自动图示记录仪组成扩增加热模块孔内温度监测记录系统,当孔间温度变异超出1时,其可测出来。n具体做法是将装有TE缓冲液并上
17、加石蜡油的扩增反应管放置于扩增仪各孔中,热电偶探针透过扩增反应管盖插至缓冲液中,然后按程序进行一个常规的PCR扩增,加热模块如为96孔,则至少要测定12孔不同位置孔内的温度,在整个扩增过程中,可移动热电偶探针至上述不同孔中监测温度,但每一孔内温度监测至少要有一个扩增周期。第29页,本讲稿共84页扩增仪孔间温度的重复性和均一性扩增仪孔间温度的重复性和均一性的的检测方法方法n第二种方法并非直接测定孔内温度,而是通过扩增功能来间接获知孔间的均一性,即将加有一已知的含一定浓度的阳性质控样本的扩增反应管置于扩增仪各孔中按常规进行扩增检测,观察结果的一致性程度,如果有某一个或几个孔结果有问题,则应确定这一
18、个或几个孔是否会重复性地得到假阴性结果,如果是,则表明相应孔的热传导有损坏。第30页,本讲稿共84页理想的试剂和操作方法理想的试剂和操作方法 n试剂盒的质检n定量测定的精密度是测定组成步骤的变异和的平方根(SD)=上式中SDa、SDb、SDc是步骤a、b、c等(例如试剂准备、标本采集、核酸提取、扩增和产物检测等)的标准差;第31页,本讲稿共84页理想的试剂和操作方法理想的试剂和操作方法n改善测定精密度的措施必须首先着重在最不精密的步骤上,应对试剂准备、标本收集、核酸提取、测定方法和仪器操作写出“标准操作程序”(SOP)第32页,本讲稿共84页人员培训人员培训 n临床基因扩增检验的操作主要是标本
19、处理中的核酸提取步骤,这其中所涉及的又主要是加样器的使用,尽管操作简单,但由于均为微量操作,要获得稳定可靠的测定结果,操作人员需要一定的专业技术知识和经验.n知其然知其然又知其所以然又知其所以然。第33页,本讲稿共84页核酸样本的制备、扩增检测核酸样本的制备、扩增检测及其质量控制及其质量控制n一般核酸提取试剂促使靶核酸从细胞内释出的原理n核酸的分离纯化n靶核酸提取的质量 n临床标本及核酸提取中可能存在的抑制和干扰物质 n核酸样本制备及扩增检测的质控 n产物检测的质控 第34页,本讲稿共84页一般核酸提取试剂促使靶核酸从一般核酸提取试剂促使靶核酸从细胞内释出的原理细胞内释出的原理n靶核酸可以与宿
20、主细胞整合,核内游离及胞浆内各种构形存在于细胞内,如测定的是病原微生物,则靶核酸存在于细菌、病毒、原虫或真菌细胞内,如果上述细胞破裂,则靶核酸亦可存在于细胞外。n一般均使用去垢剂(如Triton-100)裂解细胞,用一种蛋白裂解酶(如蛋白酶K)消化结合于核酸的蛋白质,从而将靶核酸从细胞内释放出来。第35页,本讲稿共84页核酸的分离纯化核酸的分离纯化 n核酸的分离纯化就是要将蛋白、脂类等干扰核酸扩增的物质去除。n经典方法n硅吸附法n对于商品核酸提取试剂盒,临床实验室在使用前,必须对其核酸提取纯度和效率进行评价。第36页,本讲稿共84页临床标本及核酸提取中可能存在的临床标本及核酸提取中可能存在的抑
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