WesternBlot详解(原理、分类、试剂、步骤及问题解答).docx
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1、四、WEST BLOTTINGWestern Blot详解(原理、分类、试剂、步骤及问题解答)佚名文章来源:本站原创点击数:12403更时间:2022-9-30 9:50:44收藏此页Western免疫印迹(Western Blot)是将蛋白质转移到膜上,然后利用抗体进展检测。对表达蛋白,可用相 应抗体作为一抗进展检测,对基因的表达产物,可通过融合局部的抗体检测。本文主要通过以下几个方面来具体地介绍一下Western Blot技术:一、原理二、分类i.放射自显影ii,底物化学发光ECLECFiv.底物DAB呈色三、主要试剂四、主要步骤五、试验常见的问题指南.参考书推举1 .针对样品的常见问题.
2、抗体2 .滤纸、胶和膜的问题.Marker的相关疑问6.染色的选择.参照的疑问7 .缓冲液配方的常见问题.条件的摸索8 .方法的介绍.结果分析W. Western Blot中抗体的重复应用问题解答:抗体工作溶液一般不主见储存反复使用,但是如抗体比拟贵重,可反复使用23次。稀释后应在2 一3天内使用,4度保存,避开反复冻融。4.滤纸、胶和膜的问题NC膜 PVDF膜 尼龙膜怎样鉴别?解答:尼龙膜是较抱负的核酸固相支持物,有多种类型;硝酸纤维素膜是目前应用最广的一种固相支持物,价 格最廉价;PVDF膜介于二者之间。就结合力量而言:尼龙膜结合DNA和RNA力量可达480600Rg/cm2,可结合短至1
3、0bp的核酸片段;硝 酸纤维素膜结合DNA和RNA力量可达80-100gg/cm2,对于200bp的核酸片段结合力量不强;PVDF膜 结合DNA和RNA力量可达125 300(ig/cm2。就温度适应性而言:尼龙膜经烘烤或紫外线照耀后,核酸中的局部喀咤碱基可与膜上的正电荷结合;硝酸 纤维素膜依靠疏水性相互作用结合DNA,结合不结实;PVDF膜结合结实,耐高温,特别适合于蛋白印迹。 就韧性而言:尼龙膜较强;硝酸纤维素膜较脆,易裂开;PVDF膜较强。就重复性而言:尼龙膜可反复用于分子杂交,杂交后,探针分子可经碱变性被洗脱下来;硝酸纤维素膜不 能重复使用;PVDF膜可以重复使用。Y.在做Wester
4、n Blot时,PBDF膜用甲醇浸泡的目的?解答:PVDF膜用甲醇泡的目的是为了活化PVDF膜上面的正电基团,使它更简洁跟带负电的蛋白质结合, 做小分子的蛋白转移时多加甲醇也是这个目的。Z.检测磷酸化的JNK和非磷酸化的JNK可以在同一张膜上吗?解答:可以。AA.转膜后经丽春红染色的条带,为什么大蛋白分子的一端(即点样空的一侧)的转膜好象不是很好,为 什么?解答:这是正常的,大分子的蛋白转移的慢,你延长转移时间和电流,大分子一端就会好的多,但是小分 子的就有可能会变淡。BB.我想问您裂解细胞用三去污裂解法,还是用上样缓冲液?解答:用上样缓冲液,这样有几个好处,可以提取总蛋白,同时又可以让磷酸化
5、酶失活。CC.承受tank system有什么讲究?解答:建议低电压,长时间,一般tank System用衡压好点),如28V 14 16hrsoDD.做HSP WESTEN定量,同样的抗体免疫组化能做出,而WESTEN却不能?解答:这多半是抗体的问题,要看抗体的说明,是否能做Western Blot和IHC。EE.膜一般要如何处理?解答:一般用甲醇泡泡就可以了。FF.假设是6x8转印膜,要加多少一抗?解答:一抗的稀释度是有说明的,依据你的一抗看看就知道了,但是那么大的膜孵育体积一般最少为3- 5mloGG.上下槽缓冲液有何要求,怎样才能到达最正确效果。解答:无要求。HH.跑电泳的时候配的胶总
6、是“缩”是什么缘由呢?是有的成分不对吗?解答:没什么问题,就是你胶里的水分被蒸发了。过夜时拿保鲜膜包起来,在里面加点水保持湿度就可以 了。假设过夜,胶里的水分被蒸发,承受保鲜膜包上也可以;也可能母液(30%聚丙酰胺)有问题,你可 以重配制一份观看;能够替换的试剂,尽量换一下,选用好的试剂,避开找问题麻烦。脱色液中甲醇的含 量太高也会造成胶缩。n.膜、滤纸、胶大小有何讲究?解答:假设是用的是半干转,挨次为:阴极一滤纸一胶一膜一滤纸。滤纸的长宽分别比胶小L 2mm,而膜 的长宽分别比胶大1 2mm。确定禁忌:上下两层滤纸由于过大而相互接触,这样会短路,电流不会通过 胶和滤纸。JJ.蛋白质的分子量跨
7、度很大,如要分别小21KD,中至66KD,大至170KD,可以一次做好吗?解答:这么广的分布不好转移,一般建议:21kd和66kd可以一起转,12%SDS-,湿转36V , 3- 5hrs 就可以了,可以依据你试验室的阅历调整;170kd用7%SDS , 48V 10hrs-16hrsoKK.不能很好地将大分子量蛋白转移到膜上,转移效率低怎么样解决?解答:可以考虑:转移缓冲液中参加20%甲醇(是指终浓度)(优化的转移缓冲液,可以参考蛋白质技术 手册),由于甲醇可降低蛋白质洗脱效率,但可增加蛋白质和NC膜的结合力量,甲醇可以防止凝胶变形, 甲醇对高分子量蛋白质可延长转移时间;转移缓冲液参加终浓度
8、0.1%SDS,也是为了增加转移效率;用优 质的转移膜,或使用小孔径的NC膜(0.2微米);使用戊二醛交联;低浓度胶,如低至6%。太大时还可 以考虑用琼脂糖胶;提高转移电压/电流;增加转移时间。LL.如何选择最适宜的蛋白杂交膜?解答:蛋白质印迹杂交是分子生物学试验中极为常用的一门技术。选择质量上层、符合要求、便利适用的 杂交膜是打算这项试验成败的重要环节。依据杂交方案、被转移生物大分子的特性以及分子大小等等因素, 我们要量体裁衣,从杂交膜的材质、孔径和规格上都要做出合理的选择。硝酸纤维素膜:硝酸纤维素膜是蛋白印迹试验的标准固相支持物。在低离子转移缓冲液的环境下,大多数 带负电荷的蛋白质会与硝酸
9、纤维素膜发生疏水作用而高亲和力的结合在一起,虽然这其中的机制还不是格 外清楚,但由于硝酸纤维素膜的这个特性,而且易于封闭非特异性结合,从而得到了广泛的应用。在非离 子型的去污剂作用下,结合的蛋白还可以被洗脱下来。依据被转移的蛋白分子量大小,要选择不同孔径的 硝酸纤维素膜。由于随着膜孔径的不断减小,膜对低分子量蛋白的结合就越结实。但是膜孔径假设小于 0.1mm,蛋白的转移就很难进展了。因此,我们通常用0.45岬和0.2pm两种规格的硝酸纤维素膜。大于 20kD的蛋白就可以用0.45叩的膜,小于20kD的蛋白就要用0.2gm的膜了,假设用0.45gm的膜就会发生 “BlowthroRgh”的现象。
10、从膜的质地上来看,最重要的指标就是单位面积上能够结合的蛋白的量。硝酸纤维 素膜的结合力量主要与膜的硝酸纤维素的纯度有关,市场上有些硝酸纤维素膜通常会还有大量的醋酸纤维 素,因而降低了蛋白的结合量。S&S公司承受的是100%纯度的硝酸纤维素,保证了最大的蛋白结合量, 可达80-15(Hig/cm2。由于100%的纯度,因而也大大削减了非特异性的结合,降低杂交背景,无需高严谨 度的洗脱步骤。其次,膜的强度和韧性也是需要考虑的因素。常规的硝酸纤维素膜比拟脆,漂洗一两次就 会破损,不能反复使用。PVDF转移膜:PVDF是一种高强度、耐腐蚀的物质,通常是用来制造水管的。PVDF膜可以结合蛋白质, 而且可
11、以分别小片段的蛋白质,最初是将它用于蛋白质的序列测定,由于硝酸纤维素膜在Edman试剂中会 降解,所以就查找了 PDVF作为替代品,虽然PDVF膜结合蛋白的效率没有硝酸纤维素膜高,但由于它的稳 定、耐腐蚀使它成为蛋白测序抱负的用品,始终沿用至今。PVDF膜与硝酸纤维素膜一样,可以进展各种 染色和化学发光检测,也有很广的适用范围。这种PVDF膜,灵敏度、区分率和蛋白亲和力在精细工艺下比 常规的膜都要高,格外适合于低分子量蛋白的检测。但PVDF膜在使用之前必需用纯甲醇进展浸泡饱和1-5秒钟。离子交换型转移膜:硝酸纤维素和PVDF膜是靠疏水作用结合蛋白的,还有一类膜是依据离子交换的方式 结合生物大分
12、子的。由DEAE (二乙氨乙基)修饰的纤维素制成的DEAE阴离子交换膜同样可以作为蛋白 质印迹的固相支持物。DEAE可以有效的结合阴离子基团,包括那些高于其等电点的蛋白质。在pH10以下, DEAE基团都能带电荷,在低离子强度的转移液中结合蛋白分子。其最适的pH环境为5-7。DEAE膜可以 用于蛋白多糖、病毒、酶以及血红蛋白的争辩。这种0.45m孔径的DEAE膜,除了可以做Western Blotting 外,还可以用于核酸结合争辩。还有一种离子交换型膜是竣甲基(CM)修饰的纤维素膜,它可以结合蛋白和多肽分子,以及其他的一些带 正电荷的样品,最适结合pH范围在4-7o结合的多肽分子可以从CM膜
13、上洗脱下来,用于氨基酸系列分析或 微测序。5 . Marker的相关疑问MM.我用的是可视marker (BICLRAD),但是电泳总跑不全8条带,请问什么缘由?怎样改善?胶用过8%, 10%, 12%,都是这样。marker是买的。解答:一般来说,是小分子量Marker跑走了,增加胶浓度或削减电泳时间试试看。固然梯度胶也是不错的 选择。NN.用的是 Roche molecular Biochemicals 公司的由 lOOkd, 75kd, 45kd, 30kd, 20kd, Nkd 组成的 marker。 开头做Western Blot时还能够看到marker,固然也仅能观察其中最多三条带
14、。用80V进展SDS-电泳,用恒压 10V45min转印的。前几次做Western Blot时没有进展丽春红染色,但尽管用了此方法也仅能看到marker有 一条大约是30KD的条带消灭。再就是把70KD和130KD两个目的蛋白同时在一块胶上进展分析,用培育基样 品进展分析,没有用间接法,而是直接用融合蛋白C端的V5表位的酶联抗体(Anti-V5-HRP)。但就是出不 来结果,我很茫然。感谢您过赐予教导!解答:1、“我用的是 Roche molecular Biochemicals 公司的由 lOOkd, 75kd, 45kd, 30kd, 20kd, lOkd 组成 的marker。开头做We
15、stern Blot时还能够看到marker,固然也仅能观察其中最多三条带。“有的时候,Prestained Marker放久了效果就会变差,电泳是条带不清楚,集中。但是你的问题可能还有其他的方面的问题,可能 是蛋白跟膜结合的不严密。转移是多加点甲醇。2、“前几次做Western Blot时没有进展丽春红染色,但尽管用了此方法也仅能看到marker有一条大约是 30KD的条带消灭。”转移时半干法建议用恒流,你这样的也就30kd-50kd的转移地比拟好。3、“再就是把70KD和130KD两个目的蛋白同时在一块胶上进展分析,用培育基样品进展分析,没有用间接 法,而是直接用融合蛋白C端的V5表位的酶
16、联抗体(Anti-V5-HRP)。是否检测了表达量,二抗是否是好的,你做了阳性比照?你要做这么大的蛋白最好转移时间延长到1.5hrs。6 .染色的选择00. Western Blot哪种染色好?解答:(1)阴离子染料是最常用的,特别是氨基黑,脱色快,背景低检测极限可到达1.5摩,考马虽然与 氨基黑有一样的灵敏度,但脱色慢,背景高。丽春红S和快绿在检测后简洁从蛋白质中除去,以便进展随 后的氨基酸分析。缺点是:溶剂系统的甲醇会引起硝化纤维素膜的皱缩或破坏。不能用语正电贺的膜。灵 敏度低。(2)胶体金,灵敏度高,检测范围可到pg级,但染色比稳定。(3)生物素化灵敏度位于1、2之间,可用于任何一种膜。
17、7 .参照的疑问PP.是否Western Blot试验半定量肯定要加ACTIN内参?解答:对于发表文章的试验最好加内参,试验严谨。QQ.用BANDSCAN分析结果行吗?解答:分析一般的结果没问题。RR.核内抗原Western Blot内参选择什么适宜?解答:可以选用组蛋白,组蛋白在细胞核中的表达是很稳定的,有很多都可以当成内参,在网上查查就可 以选出你耍的内参。SS.转膜时承受电流是否比电压准确,是否依据0.8mA/cm2, 一般1小时左右? 解答:不是的,半干法推举用恒流,一般依据目的蛋白的大小来确定电流和时间。TT.做半定量人卵巢癌细胞系的Western Blot,内参Bactin, GA
18、PDH,那个好?解答:选用beta-actin就可以。8 .缓冲液配方的常见问题UU.转膜后的脱脂奶粉封闭时,所用的防沫剂A是什么?还有Tris-HCl是不是就是用Tris和盐酸配出来的呢?解答:转膜后的脱脂奶粉封闭液是5%的TBST脱脂奶粉。Tris-HCl就是Tris盐用HC1调ph值,配置而 成。VV.预备做大鼠脑子的Western Blot,蛋白质位于细胞核中,请问此蛋白质的提取液及操作方法是?每一步 都必需要低温吗?这种蛋白质是磷酸化的蛋白质,操作时如何防止去磷酸化的发生? 解答:可以用提取总蛋白的buffer提核蛋白,可以加NaF防止去磷酸化。WW.想问一下细胞裂解液选择蛋白酶抑制
19、剂时有什么原那么吗?受不受组织来源的影响?胞膜和胞浆有区 分吗?解答:一般来说提取时参加光谱的蛋白酶抑制剂就可以了,操作时保持低温。除非有文献特别指明用特别 的方法,一般来说都没有区分。XX.最近作了两次Western Blot,不但没阳性结果,显色背景都没有,电泳和转膜都染过,有条带。底片和 显色液及DAB显色液均试过,没问题。1、检测GAD-分子量67kd,提取液有蔗糖,其余同三去污裂解液。 蔗糖不会有影响把?样本-20度放置一周内测。2、一抗放置2年,可能效价不高!用的是1:100。假设是 一抗的缘由,不会背景都没有把? 3、第一次有不均匀背景,由于一抗过夜时密封袋不均匀。后两次无背景
20、显色。4、封闭液用的是含15%脱脂奶粉TBST,漂洗液用的是含1%BSA的TBST液,TWEEN-20为0.1%, 不会是封闭液的问题吧?解答:可以在下面几个问题上找找缘由。1.封闭液用5%Milk,漂洗液(washing buffer用TBST) 2.看看 一抗是否能work,降到1: 20o 3.看看二抗是否有问题。YY.加甲醇的目的是什么?解答:加甲醇起着肯定的固定作用,由于小分子蛋白质简洁转出去.(特别是在硝酸纤维素膜上,由于NC膜 结合蛋白质的力量较弱)。ZZ. “转膜后的脱脂奶粉封闭液是5%的TBST脱脂奶粉”,其中TBST最终那个T是Tween吗,浓度多大? 解答:是 Tween
21、,配方如下:Tris-Buffered Saline Tween-20 (TBST), Dissolve 8.8g of NaCl, 0.2g of KC1, and 3g of Tris base in 800ml of distilled H20, Add 500ul of Tween-20, Adjust the pH to 7.4 with HC1, Add distilledH20 to IL, Sterilize by autoclaving.AAA.封闭,一抗,二抗时的温度有没有什么规定呢,比方现在我就在室温里做,或者要在4度下?解答:均可在室温进展,假设时间不够,一抗孵育可以先
22、在室温进展一个小时,然后 4 度过夜。BBB.试验室暂无NP40我用sds可以吗?另外有过用尿素和硫麻提取膜蛋白吗?配方如下:7M尿素,2M 硫版,Triton-x-100 0.2ml,颖参加:65mM DTT蛋白酶抑制剂:试剂盒 HaltTM Protease inhibitor cocktail kit I %(v/v)是用于抽提双向电泳用蛋白的配方。不止用于抽提细胞全蛋白(主要是想得到其中的膜蛋白)是否可行? 改进的 RIPA 裂解缓冲液(Tris.HCl, 50 mmol/L, pH 7.5; NaCl, 150 mmol/L; NP-40, 1%;脱氧胆酸钠, 0.5%; SDS,
23、0.1%; EDTA, 1 mmol/L; PMSF, 1 mmol/L; Leupeptin, 2 Rg/ml)不知对于膜蛋白效果如何? 此外该方中的EDTA,是否用做蛋白酶抑制剂?解答:做2D确定不推举使用NP 4 0 (由于即使进口的NP 4 0也不纯,其中的杂质会影响质 谱结果)。对于动物细胞,其蛋白酶活性较弱(相对于组织和大肠杆菌等),可以不使用cocktail,由于7M 尿素+ 2 M硫腺+ 4%CHAPS构成的变性环境已经足以抑制大局部蛋白酶的活性,2 M硫腺+ 4%C HA PS对于抽提膜蛋白有很大的帮助,不过假设您专职做膜蛋白建议承受分级抽提法。此外还可以承受 梯度离心法和一
24、些基于去垢剂的方法。EDTA用于灭活金属蛋白酶(主要是其整合作用)。加过多的蛋 白酶抑制剂可以导致蛋白质的修饰,做WB无所谓,做MA I LD I时会给正确鉴定带来麻烦。裂解缓冲 液中少了两性电解质(在2-D裂解缓冲液中,两性电解质起的作用:供给连续的PH梯度,从很大程度上增 加蛋白质的溶解性;还可以去除一局部核酸);也不推举承受SDS,因SDS会与蛋白质结合导致其等电点发 生转变,假设您实在要用,终浓度降到0.1%以下。METHOD2(50ml 总量):?-mercaptoethanol 342 gl; 20% SDS 5 ml; Tris-Cl pH 6.7 3.125 ml;加 ddH2
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