[农学]大学生物化学课件.ppt
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1、第九章第九章 蛋白质的生物合成蛋白质的生物合成本章教学目的和要求:本章教学目的和要求:掌握蛋白质的生物合成过程以及合成体系掌握蛋白质的生物合成过程以及合成体系中的重要组分,了解蛋白质合成后的加工中的重要组分,了解蛋白质合成后的加工和运送特点。和运送特点。重点、难点:重点、难点:蛋白质的生物合成过程。蛋白质的生物合成过程。目 录第一节第一节 蛋白质合成体系蛋白质合成体系第二节第二节 蛋白质合成过蛋白质合成过程程第三节第三节 蛋白质定位蛋白质定位(自学自学)中心法则中心法则蛋白质生物合成蛋白质生物合成:是指是指mRNAmRNA分子上分子上4 4种核苷酸种核苷酸的遗传信息,变成蛋白质的遗传信息,变成
2、蛋白质多肽链多肽链的的2020种氨基种氨基酸排列顺序的过程,酸排列顺序的过程,类似一种语言翻译成另类似一种语言翻译成另一种语言时的情形,所以也称为一种语言时的情形,所以也称为翻译翻译。遗遗传传信信息息流流动动示示意意图图核糖体核糖体DNAmRNAtRNADNAmRNA核糖体核糖体tRNA第一节 蛋白质合成体系 蛋白质合成体系的组分蛋白质合成体系的组分 蛋蛋白白质质的的合合成成是是一一个个十十分分复复杂杂的的过过程程,蛋蛋白白质质的的合合成成要要求求100100多多种种大大分分子子物物质质参参与与和和相相互互协协作作,这这些些大大分分子子物物质质包包括括mRNAmRNA、tRNAtRNA、核糖体
3、、多种活化酶及各种蛋白质因子。核糖体、多种活化酶及各种蛋白质因子。蛋白质的合成不只是氨基酸之间形成肽键的蛋白质的合成不只是氨基酸之间形成肽键的问题,更重要的在于安排氨基酸的排列顺序,以问题,更重要的在于安排氨基酸的排列顺序,以形成千差万别的蛋白质。形成千差万别的蛋白质。2020种氨基酸(种氨基酸(AAAA)作为原料作为原料 酶及众多蛋白因子酶及众多蛋白因子,如如IFIF、eIFeIF ATPATP、GTPGTP、无机离子无机离子参与蛋白质生物合成的物质包括:参与蛋白质生物合成的物质包括:l 三种三种RNARNAmRNAmRNA(messenger RNA,messenger RNA,信使信使R
4、NARNA)rRNArRNA(ribosomal RNA,ribosomal RNA,核蛋白体核蛋白体RNARNA)tRNAtRNA(transfer RNA,transfer RNA,转移转移RNARNA)合成方向:合成方向:NCNC端端 在蛋白质合成中,在蛋白质合成中,tRNA 按按mRNA 模板的模板的要求将相应的氨基酸搬运到蛋白质合成的场所要求将相应的氨基酸搬运到蛋白质合成的场所-核糖体核糖体(ribosome)上,所以把核糖体称上,所以把核糖体称作蛋白质合成的工厂,氨基酸之间以肽键连接,作蛋白质合成的工厂,氨基酸之间以肽键连接,生成具有一定排列顺序的蛋白质。生成具有一定排列顺序的蛋白
5、质。蛋白质合成的原料是氨基酸,反应所需能量蛋白质合成的原料是氨基酸,反应所需能量由由ATP和和GTP 提供。提供。mRNA (messenger RNA)是是蛋白质生物合成过程蛋白质生物合成过程中直接指令氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体。中直接指令氨基酸掺入的模板,是遗传信息的载体。一、一、一、一、m R N Am R N A原核生物原核生物和和真核生物真核生物mRNA的比较的比较 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子顺反子(cistron)。原核生物的一段原核生物的一段mRNA常常编码几种功能相关的蛋常常编码几种功能相关的蛋白质,这种白质,这种mRNA
6、被称为被称为多顺反子多顺反子(poly cistron)。真核生物的一段真核生物的一段mRNA常常只能编码一条多肽链,常常只能编码一条多肽链,这种这种mRNA被称为被称为单顺反子单顺反子(single cistron)。)。多顺多顺反子反子单顺单顺反子反子真核生物真核生物原核生物原核生物非编码序列遗遗 传传 密密 码码 遗遗传传密密码码:mRNAmRNA中中的的核核苷苷酸酸序序列列与与蛋蛋白白质质中中氨基酸序列之间的对应关系称为氨基酸序列之间的对应关系称为遗传密码遗传密码。密密码码子子(codoncodon):mRNAmRNA上上每每3 3个个相相邻邻的的核核苷苷酸酸编编码码蛋蛋白白质质多多肽
7、肽链链中中的的1 1个个氨氨基基酸酸,这这3 3个个核核苷酸就称为苷酸就称为1 1个个密码子密码子或三联体密码。或三联体密码。mRNAmRNA及遗传密码及遗传密码1mRNA作为蛋白质生物合成的作为蛋白质生物合成的直接模板直接模板。2mRNA分子中分子中核苷酸顺序核苷酸顺序与蛋白质分子中与蛋白质分子中氨基酸排列顺序氨基酸排列顺序通过遗传密码相沟通。通过遗传密码相沟通。3每三个核苷酸组成一个密码子每三个核苷酸组成一个密码子,四种碱基四种碱基可组成可组成64种密码子,代表种密码子,代表20种氨基酸,种氨基酸,AUG既既是起始密码,同时也是是起始密码,同时也是蛋氨酸蛋氨酸密码子密码子;UAA、UAG、
8、UGA作为作为终止密码终止密码。遗传密码字典遗传密码字典UACGUCAGUCAG第二位第二位 第一位第一位(5)第三位第三位(3)UCAGUCAGUCAG(1)(1)连续性和方向性连续性和方向性:两个密码子之间无任何核两个密码子之间无任何核苷酸加以隔开和重叠,如插入苷酸加以隔开和重叠,如插入/删除碱基,可删除碱基,可发生移码突变发生移码突变.方向方向5 53遗传密码的特点遗传密码的特点5.UACGGACAUCUG.35.UACCGGACAUCUG.3酪酪甘甘组组蛋蛋酪酪精精苏苏半胱半胱5.UACGACAUCUG.3酪酪天天异亮异亮插入插入缺失缺失(2)简并性简并性:是指大多数氨基酸都可以具有几
9、组不是指大多数氨基酸都可以具有几组不同的密码子。如同的密码子。如UUA、UUG、CUU、CUC、CUA、CUG 六组密码子都编码六组密码子都编码亮氨酸亮氨酸。编码同一编码同一个氨基酸的一组密码称为个氨基酸的一组密码称为同义密码子同义密码子。只有色氨只有色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子。酸和甲硫氨酸仅有一个密码子。遗传密码的简并性遗传密码的简并性(3 3)密码子的通用性和例外密码子的通用性和例外 密码子的密码子的通用性通用性是指生物细胞共同使用是指生物细胞共同使用同一套同一套遗传密码字典。只有在一些线粒体中使用的遗传密遗传密码字典。只有在一些线粒体中使用的遗传密码与通用密码有所区别。如人线粒体中码
10、与通用密码有所区别。如人线粒体中UGAUGA不再是不再是终止密码子,而编码终止密码子,而编码色氨酸色氨酸。所以说遗传密码基本通用,但非绝对通用。所以说遗传密码基本通用,但非绝对通用。(4 4)起始密码子和终止密码子起始密码子和终止密码子 在在6464个个密密码码子子中中,有有3 3个个密密码码子子不不编编码码任任何何氨氨基基酸酸,从从而而成成为为肽肽链链合合成成的的终终止止信信号号,称称为为终终止止密密码码子子或或无无义义密密码码子子,它它们们是是UAAUAA、UAGUAG、UGAUGA。其其余余的的6161个个密密码码子子均均编编码码不不同同的的氨氨基基酸酸,其其中中AUGAUG既既是是Me
11、tMet的的密密码码子子,又又是是肽肽链链合合成成的的起起始始信信号号,称称为为起起始始密密码码子子。但但细细菌菌例例外外,在在细菌中细菌中GUG表示起始的甲酰蛋氨酸表示起始的甲酰蛋氨酸(5 5)密码子的摆动性(变偶性)密码子的摆动性(变偶性)密密码码子子的的专专一一性性主主要要是是由由前前两两位位的的碱碱基基决决定定,而而第第三三位碱基有较大的灵活性。位碱基有较大的灵活性。二、二、tRNAtRNA 在蛋白质合成中,在蛋白质合成中,tRNA 是搬运是搬运活性氨基酸活性氨基酸的工具。它将氨基酸按照的工具。它将氨基酸按照mRNA 链上的密码子链上的密码子所决定的氨基酸顺序搬运到蛋白质合成的场所所决
12、定的氨基酸顺序搬运到蛋白质合成的场所-核糖体核糖体的特定部位。的特定部位。tRNA的二级结构示意图的二级结构示意图tRNA的三级结构示意图的三级结构示意图1 1、33端端CCACCA上氨基酸接受位点上氨基酸接受位点2 2、识别氨酰、识别氨酰tRNAtRNA合成酶合成酶 的位点(的位点(DHUDHU、反密码环氨、反密码环氨基酸臂基酸臂)3 3、核糖体识别位点、核糖体识别位点(T(TC)C)4 4、反密码子位点、反密码子位点 在在tRNAtRNA 链链上有三个特定的碱基,组成一上有三个特定的碱基,组成一个反密码子,反密码子与密码个反密码子,反密码子与密码子的方向相反。子的方向相反。由于密码的简并性
13、,绝大多数氨基酸需要一由于密码的简并性,绝大多数氨基酸需要一种以上的种以上的tRNA作为转运工具。运输同一种氨基作为转运工具。运输同一种氨基酸的不同酸的不同tRNA称为同工受体称为同工受体tRNA。蛋氨酸有两种蛋氨酸有两种tRNA:tRNAffmet只与起始密码子结合只与起始密码子结合tRNAmmet负责把负责把MET运到肽链中间运到肽链中间真核生物起始真核生物起始tRNA表示为:表示为:tRNAimet用于肽链延伸的表示为:用于肽链延伸的表示为:tRNAmet1.1.被特定的氨酰被特定的氨酰-tRNAtRNA合成酶所识别。合成酶所识别。2.2.识别识别mRNAmRNA链上的密码子,这是因为链
14、上的密码子,这是因为tRNAtRNA上有上有3 3个个特定碱基组成的一个反密码子与特定碱基组成的一个反密码子与mRNAmRNA链上的密链上的密码子配对,保证氨基酸按码子配对,保证氨基酸按mRNAmRNA的碱基顺序入号的碱基顺序入号3.3.tRNAtRNA将多肽链联结在核糖体上。将多肽链联结在核糖体上。tRNA的功能的功能 三、三、核糖体核糖体核糖体是合成蛋白质的场所。核糖体是合成蛋白质的场所。19551955年,年,年,年,Paul Paul ZamecnikZamecnik通过实验确认核糖体是通过实验确认核糖体是通过实验确认核糖体是通过实验确认核糖体是蛋白合成的场所。他将放射性同位素标记的氨
15、基酸注蛋白合成的场所。他将放射性同位素标记的氨基酸注蛋白合成的场所。他将放射性同位素标记的氨基酸注蛋白合成的场所。他将放射性同位素标记的氨基酸注射到小鼠体内,经短时间后取出肝脏,制成匀浆,离射到小鼠体内,经短时间后取出肝脏,制成匀浆,离射到小鼠体内,经短时间后取出肝脏,制成匀浆,离射到小鼠体内,经短时间后取出肝脏,制成匀浆,离心后分成细胞核、线粒体、微粒体和可溶部分。发现心后分成细胞核、线粒体、微粒体和可溶部分。发现心后分成细胞核、线粒体、微粒体和可溶部分。发现心后分成细胞核、线粒体、微粒体和可溶部分。发现微粒体中的放射性强度最高,若将微粒体部分进一步微粒体中的放射性强度最高,若将微粒体部分进
16、一步微粒体中的放射性强度最高,若将微粒体部分进一步微粒体中的放射性强度最高,若将微粒体部分进一步分级分离,可在核糖体中大量回收到所掺入的放射性,分级分离,可在核糖体中大量回收到所掺入的放射性,分级分离,可在核糖体中大量回收到所掺入的放射性,分级分离,可在核糖体中大量回收到所掺入的放射性,这说明这说明这说明这说明核糖体是合成蛋白质的部位。核糖体是合成蛋白质的部位。核糖体是合成蛋白质的部位。核糖体是合成蛋白质的部位。1.1.核糖体的存在部位核糖体的存在部位核糖体核糖体是由是由rRNA(ribosomal ribonucleic asid)和多种蛋白质结合而成的一种大的核和多种蛋白质结合而成的一种大
17、的核糖核蛋白颗粒,糖核蛋白颗粒,蛋白质肽键蛋白质肽键的合成就是在的合成就是在这种核糖体上进行的。这种核糖体上进行的。每个细菌细胞内平均约有每个细菌细胞内平均约有2000个核糖体,个核糖体,每个真核细胞内大约含每个真核细胞内大约含106-107个核糖体个核糖体线粒体和叶绿体也有自己的核糖体线粒体和叶绿体也有自己的核糖体 真核生物的核糖体一部分在细胞质中呈游真核生物的核糖体一部分在细胞质中呈游离状态,离状态,参与细胞固有蛋白质的合成参与细胞固有蛋白质的合成。另一另一部分与内质网结合,形成粗糙内质网。此外部分与内质网结合,形成粗糙内质网。此外在其线粒体和叶绿体中也有核糖体。在其线粒体和叶绿体中也有核
18、糖体。原核生物的核糖体存在于细胞质中;原核生物的核糖体存在于细胞质中;功能:功能:核糖体核糖体相当于装配机,大亚基有转相当于装配机,大亚基有转肽酶活性,促进氨基酸合成肽肽酶活性,促进氨基酸合成肽核糖体的组成核糖体的组成原核生物核原核生物核原核生物核原核生物核糖体的组成糖体的组成糖体的组成糖体的组成原核生物核糖体结构示意图原核生物核糖体结构示意图核糖体核糖体rRNArRNA蛋白质蛋白质原核生物原核生物70S70S30S30S16S16S2121种种50S50S23S23S、5S5S3434种种真核生物真核生物80S80S40S40S18S18S30-3230-32种种60S60S28S28S、5
19、S5S、5.8S5.8S36-5036-50种种核核蛋蛋白白体体的的组组成成mRNAmRNA结合部位:结合部位:小亚基由头部、基部和平台组成,平台和头部小亚基由头部、基部和平台组成,平台和头部之间有一个裂缝。大亚基有一个柄、一个中央凸之间有一个裂缝。大亚基有一个柄、一个中央凸出部和一个脊;大小亚基之间存在一条细沟,用出部和一个脊;大小亚基之间存在一条细沟,用于接纳于接纳mRNAmRNA;此外,小亚基的此外,小亚基的16SrRNA16SrRNA可以与可以与mRNAmRNA相互作用,从而参与相互作用,从而参与mRNAmRNA与核糖体的结合。与核糖体的结合。3.3.核糖体上的活性部位核糖体上的活性部
20、位(1)(1)结合部位结合部位与与tRNAtRNA结合部位:有结合部位:有2 2个个 氨酰基部位(氨酰基部位(A A位位)新参入的氨酰新参入的氨酰tRNAtRNA的结的结合部位;合部位;肽基部位肽基部位 (P P位位)正在延长的多肽基正在延长的多肽基tRNAtRNA的结合部位;的结合部位;tRNAtRNA的这两个结合位点在核糖体上紧挨在的这两个结合位点在核糖体上紧挨在一起,各占据一个密码子的空间。有一小部分一起,各占据一个密码子的空间。有一小部分在在30S30S亚基内,大部分在亚基内,大部分在50S50S亚基内。亚基内。原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:A位
21、:氨基酰位位:氨基酰位(aminoacyl site)P位:肽酰位位:肽酰位(peptidyl site)催化肽键形成的部位:催化肽键形成的部位:称为肽基转移酶,又叫转肽酶。位于大亚称为肽基转移酶,又叫转肽酶。位于大亚基上。基上。19921992年发现该活性是由年发现该活性是由23S 23S rRNArRNA提供的。提供的。(2)(2)催化部位催化部位催化催化GTPGTP水解的部位:水解的部位:位于大亚基上,在核糖体移位期间将位于大亚基上,在核糖体移位期间将GTPGTP水解水解成成GDPGDP和和PiPi。多核糖体多核糖体一一mRNAmRNA上同时结合多个核蛋白体进行蛋白质多肽链合成,上同时结
22、合多个核蛋白体进行蛋白质多肽链合成,每个核糖体独立完成一条多肽链的合成。每个核糖体独立完成一条多肽链的合成。电镜下的多聚核蛋白体现象电镜下的多聚核蛋白体现象游离核糖体及核糖体亚基:游离核糖体及核糖体亚基:以单体形式存在的非功能性核糖体。以单体形式存在的非功能性核糖体。是处于储备状态的核糖体。是处于储备状态的核糖体。核糖体亚基是从核糖体亚基是从mRNA释放的。释放的。核糖体循环:核糖体在三种状态(多核糖体、核糖体循环:核糖体在三种状态(多核糖体、游离核糖体、核糖体亚基)之间的转换。游离核糖体、核糖体亚基)之间的转换。四、辅助四、辅助因子因子 在蛋白质合成体系中,还有溶解在胞质中的在蛋白质合成体系
23、中,还有溶解在胞质中的蛋白质,在蛋白质合成的不同阶段起作用,分别蛋白质,在蛋白质合成的不同阶段起作用,分别有:有:蛋白质因子蛋白质因子蛋白质因子蛋白质因子其它因子其它因子第二节第二节 蛋白质的生物合成过程蛋白质的生物合成过程氨基酸的氨基酸的活化活化多肽链合成的多肽链合成的起始起始肽链的肽链的延长延长肽链合成肽链合成终止与释放终止与释放(以原核为例)(以原核为例)翻译后加工翻译后加工一、氨基酸的活化一、氨基酸的活化 游离氨基酸掺入多肽链以前必须活化即氨游离氨基酸掺入多肽链以前必须活化即氨基酸与特异基酸与特异tRNA形成氨酰形成氨酰-tRNA。1.1.氨酰氨酰-tRNAtRNA的形成的形成 氨基酸
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- 农学 大学 生物化学 课件
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