环境工程微生物学第六章.pptx
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1、6.1 代谢概述代谢概述l广义的代谢:指生物活体与外界不断进行物质广义的代谢:指生物活体与外界不断进行物质交换。交换。合成代谢:指生物体不断地从外界摄取营养物质合合成代谢:指生物体不断地从外界摄取营养物质合成为自身细胞物质的过程,因此又称同化作用。需成为自身细胞物质的过程,因此又称同化作用。需要吸收能量,消耗还原力;要吸收能量,消耗还原力;分解代谢:是生物将自身的或外来的各种复杂有机分解代谢:是生物将自身的或外来的各种复杂有机物分解为简单化合物的过程,故又称之为异化作用,物分解为简单化合物的过程,故又称之为异化作用,伴随着能量的释放并产生还原力伴随着能量的释放并产生还原力H。l分解过程产生的中
2、间产物、还原力分解过程产生的中间产物、还原力 H及能量又可用于合及能量又可用于合成细胞所需复杂有机物。成细胞所需复杂有机物。第第1页页/共共126页页合成代谢合成代谢消耗能量分解代谢分解代谢产生能量基质产物生物合成质子驱动力6.1 代谢概述(续)代谢概述(续)单体大分子和其他细胞组分第第2页页/共共126页页质子驱动力(PMF)l在细胞膜上镶嵌有许多进行电子传递的蛋白质;l在传递电子的同时,也一起或分开传递质子;l电子在电子传递链上传递的时候,质子被泵出细胞膜外;l导致细胞膜外形成微酸环境;l用于还原最终电子受体O2为水的质子,来自于细胞原生质;l这些质子来自于水的分解,留下OH-于细胞内;l
3、最终造成跨膜的电化学梯度.第第3页页/共共126页页质子驱动力的产生l质子驱动力产生的关键步质子驱动力产生的关键步骤是:载体接受氢原子,骤是:载体接受氢原子,仅传递一个电子;仅传递一个电子;l好氧呼吸的最终氧化作用好氧呼吸的最终氧化作用是还原氧气为水;是还原氧气为水;原生质原生质环境环境第第4页页/共共126页页质子驱动力和ATP的形成l将将PMF转化为转化为ATP,需要大量的膜嵌酶;,需要大量的膜嵌酶;lATP合成酶由三部分组成,又称合成酶由三部分组成,又称F1F0-ATP合酶;合酶;F1头部:位于原生质中头部:位于原生质中F0基部:位于膜上,传递质子基部:位于膜上,传递质子柄部:连接柄部:
4、连接F1和和F0的部位,有控制质子流的作用的部位,有控制质子流的作用lATP合成酶催化的反应是可逆的;合成酶催化的反应是可逆的;l F1F0-ATP合酶是已知的最小的生物马达;合酶是已知的最小的生物马达;lATP合酶催化合酶催化ATP的合成反应,就是氧化磷酸化过程;的合成反应,就是氧化磷酸化过程;l每一个每一个ATP的产生需要传递的产生需要传递3-4个质子;个质子;第第5页页/共共126页页五种亚基五种亚基33九种多肽九种多肽及及亚基上有亚基上有ATP结合部位,结合部位,亚基亚基是催化亚基;是催化亚基;可能有闸门的作可能有闸门的作用,控制质子通过;用,控制质子通过;亚基是亚基是F1与膜相与膜相
5、连通的质子通道;连通的质子通道;亚基是酶的调节亚基是酶的调节亚基;亚基;abc三类亚基,三类亚基,abc12结合组成结合组成ATP合成动画原生质原生质环境环境第第6页页/共共126页页6.2 微生物的酶及酶促反应微生物的酶及酶促反应l酶是一种由生物细胞产生的,可以独立存在并具有催化活性的生物催化剂。l生物的代谢是在酶的催化作用下进行的一系列不同的化学反应所组成。l没有酶,就没有新陈代谢,也就没有生命。第第7页页/共共126页页酶的组成酶的组成l(1)酶分子的组成酶分子的组成单成分酶:酶的分子全部是蛋白质单成分酶:酶的分子全部是蛋白质l例如蛋白酶、淀粉酶例如蛋白酶、淀粉酶全酶:其分子组成除了蛋白
6、质外,还含有对全酶:其分子组成除了蛋白质外,还含有对热稳定的非蛋白质类小分子物质。热稳定的非蛋白质类小分子物质。l全酶中的蛋白质部分叫酶蛋白全酶中的蛋白质部分叫酶蛋白l全酶中非蛋白质小分子叫辅全酶中非蛋白质小分子叫辅(助助)因子。因子。第第8页页/共共126页页(1)酶分子的组成酶分子的组成 酶的分子组成如下:酶的分子组成如下:单成分酶单成分酶=酶蛋白酶蛋白(如淀粉酶如淀粉酶)全全 酶酶=酶蛋白酶蛋白+有机物有机物 全全 酶酶=酶蛋白酶蛋白+有机物有机物+金属离子金属离子 全全 酶酶=酶蛋白酶蛋白+金属离子金属离子 酶蛋白酶蛋白 辅因子辅因子第第9页页/共共126页页(1)酶分子的组成(续)酶
7、分子的组成(续)l酶的辅因子有些是小分子有机物,有些是金属酶的辅因子有些是小分子有机物,有些是金属离子,有时两者都有。离子,有时两者都有。l辅酶:与酶蛋白结合较松弛、用透析法可以除辅酶:与酶蛋白结合较松弛、用透析法可以除去的小分子有机物的酶的辅因子;去的小分子有机物的酶的辅因子;l辅基:与酶蛋白结合比较紧的、用透析法不易辅基:与酶蛋白结合比较紧的、用透析法不易除去的小分子物质除去的小分子物质(包括金属离子包括金属离子)称为辅基。称为辅基。辅基一般都以共价键或配位键与酶蛋白相结合,需辅基一般都以共价键或配位键与酶蛋白相结合,需经特殊化学处理才能与酶蛋白分开。经特殊化学处理才能与酶蛋白分开。第第1
8、0页页/共共126页页(2)酶的化学组成l元素组成元素组成C、H、O、N、S有微量元素有微量元素P、Fe、Zn、Cu、Mn、I等等其中氮的含量在各种蛋白质中都比较稳定,其中氮的含量在各种蛋白质中都比较稳定,平均约平均约16%。l氨基酸是蛋白质的基本组成单位,组成氨基酸是蛋白质的基本组成单位,组成蛋白质的氨基酸有蛋白质的氨基酸有20种。种。第第11页页/共共126页页酶的结构与功能酶的结构与功能l酶蛋白决定着酶的催化特性。酶蛋白决定着酶的催化特性。酶蛋白是由酶蛋白是由L-a-氨基酸通过肽键连接而成的多肽链,氨基酸通过肽键连接而成的多肽链,再由一条或几条多肽链按各自的特殊方式组合成具再由一条或几条
9、多肽链按各自的特殊方式组合成具有生物活性的大分子。有生物活性的大分子。l蛋白质的结构分为蛋白质的结构分为一级结构一级结构二级结构二级结构三级结构三级结构四级结构四级结构第第12页页/共共126页页酶的活性中心及作用酶的活性中心及作用l酶的活性中心酶的活性中心(活性部位活性部位)是指酶分子中直接和是指酶分子中直接和底物结合并与酶的催化作用直接有关的部位。底物结合并与酶的催化作用直接有关的部位。单成分酶的活性中心是由一些氨基酸残基的侧链基单成分酶的活性中心是由一些氨基酸残基的侧链基团组成团组成(有时也包括某些肽键基团有时也包括某些肽键基团)对于全酶、辅酶或辅基上的某一部分往往也是活性对于全酶、辅酶
10、或辅基上的某一部分往往也是活性中心的组成部分。中心的组成部分。l活性中心的基团分为:活性中心的基团分为:结合基团:参与和底物结合的基团结合基团:参与和底物结合的基团催化基团:直接参与催化反应的基团催化基团:直接参与催化反应的基团第第13页页/共共126页页酶催化作用实例NAD+结合位点结合位点活性中心活性中心基质基质被氧化被氧化的基质的基质基质基质电子供体电子供体酶酶I酶和基质酶-基质复合物酶和产物反应1 酶I与基质(电子供体)和氧化态辅酶NAD+的反应NADH结合位点结合位点活性中心活性中心基质基质被还原被还原的基质的基质基质基质电子受体电子受体酶酶II酶-基质复合物反应2 酶II与基质(电
11、子受体)和还原态辅酶NADH的反应第第14页页/共共126页页重要辅酶的结构与功能重要辅酶的结构与功能l(1)烟酰胺核苷酸烟酰胺核苷酸 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+),又叫辅酶,又叫辅酶I(CoI);还原态还原态CoI常写成常写成NADH+H+方式,也可用方式,也可用NADH2表示表示 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+),又叫,又叫辅酶辅酶(CoII)都含有烟酰胺都含有烟酰胺(维生素维生素B5)基。基。第第15页页/共共126页页辅酶CoI的氧化还原态结构Nicotinamide Adenine Dinucleotide(NAD+)NADH脱氢
12、酶 接受来自NADH的氢原子(细胞内反应产生的),并传递氢原子给黄素蛋白(flavoproteins),其功能团是烟酰胺基的吡啶环。腺嘌呤核糖烟酰胺核糖被氧化被还原烟酰胺腺嘌呤烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸二核苷酸磷酸(NADP+)第第16页页/共共126页页(2)黄素核苷酸:黄素核苷酸:黄素蛋白(Flavoproteins)的辅酶l核黄素核黄素(维生素维生素B2)是其重要是其重要成分成分l是黄素蛋白中能被氧化和还是黄素蛋白中能被氧化和还原的辅酶;原的辅酶;l黄素蛋白接受氢原子,提供黄素蛋白接受氢原子,提供电子;电子;l有两类,均呈黄色:有两类,均呈黄色:黄素单核苷酸黄素单核苷酸 Flavin mo
13、nonucleotide(FMN)黄素腺瞟呤二核苷酸黄素腺瞟呤二核苷酸 Flavin adenine dinucleotide(FAD)异咯嗪环核糖醇 110呈黄色呈黄色被氧化被还原第第17页页/共共126页页Flavin mononucleotideFMN黄素单核苷酸,核黄素-5-磷酸Flavin adenine dinucleotideFAD黄素腺嘌呤二核苷酸核黄素-5-腺苷二磷酸核黄素adenine腺嘌呤FMN第第18页页/共共126页页(3)细胞色素(Cytochromes)l是含铁普菲林环(原血红素)蛋白的辅酶;是含铁普菲林环(原血红素)蛋白的辅酶;l通过细胞色素中心的铁得、失一个电
14、子来进行通过细胞色素中心的铁得、失一个电子来进行氧化还原反应;氧化还原反应;(铁在铁在 Fe2+和和Fe3+之间转换之间转换)l已知有几种细胞色素,分别具有不同的氧化还已知有几种细胞色素,分别具有不同的氧化还原电位;原电位;l能与其它的细胞色素或铁能与其它的细胞色素或铁-硫蛋白组成牢固的硫蛋白组成牢固的复合物;复合物;第第19页页/共共126页页细胞色素的结构吡咯(luo)环普菲林环四吡咯,C20H14N4原血红素细胞色素组氨酸半胱氨酸半胱氨酸氨基酸-氨基酸组氨酸蛋白质第第20页页/共共126页页(4)铁-硫蛋白Iron-sulfur proteinsl其中铁没有绑定原血红素;其中铁没有绑定原
15、血红素;l铁与硫有不同的组合形式;铁与硫有不同的组合形式;lFe2S2和和Fe4S4较普遍;较普遍;l铁通过半胱氨酸残基绑定到铁通过半胱氨酸残基绑定到蛋白质上;蛋白质上;l不同的铁不同的铁-硫蛋白具有很大硫蛋白具有很大差异的氧化还原电位,使得差异的氧化还原电位,使得它们在电子传递链上不同位它们在电子传递链上不同位置发挥作用;置发挥作用;l仅仅传递电子;仅仅传递电子;Fe4S4R-半胱氨酸半胱氨酸R-半胱氨酸半胱氨酸R-半胱氨酸半胱氨酸R-半胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸R半胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸半胱氨酸Fe2S2第第21页页/共共126页页(5)泛醌(辅酶泛醌(辅酶Q,Quin
16、ones)l高疏水性分子;高疏水性分子;l非蛋白质;非蛋白质;l甲萘醌与维生素甲萘醌与维生素K有有关;关;l接受氢原子,提供电接受氢原子,提供电子;子;l其自身可组成一氧化其自身可组成一氧化还原体系,起着传递还原体系,起着传递电子的作用:电子的作用:被氧化被氧化被还原被还原第第22页页/共共126页页(6)辅酶辅酶A CoA,coenzymeCoA或或HSCoA 含有维生素含有维生素B族的泛酸、腺嘌呤核苷酸和巯基乙胺等组分。族的泛酸、腺嘌呤核苷酸和巯基乙胺等组分。酰基转移酶的辅酶,其中巯基酰基转移酶的辅酶,其中巯基“HS-”是重要功能团。是重要功能团。乙酰基团乙酰基团泛酸泛酸磷酸磷酸2-巯基乙
17、胺巯基乙胺或硫代乙醇胺或硫代乙醇胺CoA第第23页页/共共126页页一条电子传递链一条电子传递链e.g.线粒体和特定细菌(线粒体和特定细菌(脱脱氮副球菌氮副球菌Paracoccus denitrificans)中典型的电)中典型的电子传递链;子传递链;大肠杆菌大肠杆菌(E.coli)的细胞的细胞色素色素c和和 aa3缺失,电子通缺失,电子通过细胞色素过细胞色素 b、o或或 d进行进行传递传递基质基质 黄素蛋白黄素蛋白 铁铁-硫蛋白硫蛋白泛醌泛醌细胞色素细胞色素细胞色素细胞色素细胞色素细胞色素还还原原电电位位(V)第第24页页/共共126页页电子传递链与电子塔的比较CO2/葡萄糖葡萄糖(-0.4
18、3)24e-2H+/H2(-0.42)2e-CO2/甲醇甲醇(-0.38)6e-CO2/醋酸盐醋酸盐(-0.28)8e-丙酮酸丙酮酸/乳酸乳酸(-0.19)2e-富马酸富马酸/琥珀酸琥珀酸(+0.03)2e-细胞色素细胞色素box/red(+0.035)1e-Fe3+/Fe2+(+0.2)1e-(pH 7)泛醌泛醌ox/red(+0.11)2e-细胞色素细胞色素cox/red(+0.25)1e-细胞色素细胞色素aox/red(+0.39)1e-NO3-/NO2-(+0.42)2e-S0/H2S(-0.28)2e-SO42-/H2S(-0.22)8e-S4O62-/S2O32-(+0.024)2
19、e-NAD+/NADH(-0.32)2e-氧化还原对氧化还原对H2作为电子供体的作为电子供体的反应实例反应实例H2+富马酸富马酸琥珀酸琥珀酸基质基质 黄素蛋白黄素蛋白 铁铁-硫蛋白硫蛋白泛醌泛醌细胞色素细胞色素细胞色素细胞色素细胞色素细胞色素还还原原电电位位(V)第第25页页/共共126页页623 酶促反应的特点酶促反应的特点l酶积极参与生物化学反应,提高反应酶积极参与生物化学反应,提高反应速率,降低活化能;缩短反应到达平衡速率,降低活化能;缩短反应到达平衡的时间,但不改变反应的平衡点。酶在的时间,但不改变反应的平衡点。酶在参与反应的前后,其功能和数量不变,参与反应的前后,其功能和数量不变,但
20、活性可能会降低。但活性可能会降低。第第26页页/共共126页页假设的放能反应过程:A+BC+D没有酶的活化态GAct有酶的活化态G有酶参与的活化能基质(A+B)G0 reaction产物(C+D)反应过程自由能第第27页页/共共126页页623 酶促反应的特点(续)酶促反应的特点(续)l酶的催化作用具有专一性。一种酶只作用于酶的催化作用具有专一性。一种酶只作用于一种物质或一类物质,或催化一种或一类化学一种物质或一类物质,或催化一种或一类化学反应,产生一定的产物。反应,产生一定的产物。绝对专一性:只能催化一种物质发生反应,对其他绝对专一性:只能催化一种物质发生反应,对其他物质不起作用物质不起作用
21、相对专一性:指一种酶能催化一类具有相同化学键相对专一性:指一种酶能催化一类具有相同化学键或基团的物质进行某种类型的反应或基团的物质进行某种类型的反应立体异构专一性:是指某种酶只能对含不对称碳原立体异构专一性:是指某种酶只能对含不对称碳原子的某一种异构体起催化作用,而不能催化它的另子的某一种异构体起催化作用,而不能催化它的另一种异构体。一种异构体。l如如L-乳酸脱氢酶只催化乳酸脱氢酶只催化L-乳酸脱氢而对乳酸脱氢而对D-乳酸不起作用乳酸不起作用 第第28页页/共共126页页623 酶促反应的特点(续)酶促反应的特点(续)l酶的催化作用条件温和。酶的催化作用条件温和。酶只需在常温、常压和近中性的水
22、溶液中就酶只需在常温、常压和近中性的水溶液中就可使催化反应进行。可使催化反应进行。l酶对环境条件极为敏感。高温、强酸、酶对环境条件极为敏感。高温、强酸、强碱都能使酶丧失活性;等重金属离子强碱都能使酶丧失活性;等重金属离子能使酶钝化,失去活性。能使酶钝化,失去活性。第第29页页/共共126页页623 酶促反应的特点(续)酶促反应的特点(续)l酶的高率性,比无机催化剂的催化效率高几酶的高率性,比无机催化剂的催化效率高几千倍至百亿倍。千倍至百亿倍。2H2O2 2H2O+O2 1molFe每秒催化每秒催化10-5mol的的H2O2分解分解1mol的的H2O2酶每秒能催化酶每秒能催化105mol的的H2
23、O2分分解解 第第30页页/共共126页页酶的种类酶的种类l(1)按照酶所催化的化学反应类型按照酶所催化的化学反应类型水解酶类:催化大分子有机物水解成小分水解酶类:催化大分子有机物水解成小分子的酶。水解反应的通式如下:子的酶。水解反应的通式如下:A-B+HOH AOH+BH第第31页页/共共126页页酶的种类酶的种类l氧化还原酶类氧化还原酶类 催化氧化还原反应的酶催化氧化还原反应的酶称为氧化还原酶。其反应通式为:称为氧化还原酶。其反应通式为:AH2+B A+BH2 AH2是供氢体,根据供氢体的性质分为氧化酶、脱氢酶是供氢体,根据供氢体的性质分为氧化酶、脱氢酶第第32页页/共共126页页酶的种类
24、(续)酶的种类(续)l 转移酶类:催化底物的基团转移到另一有机物上转移酶类:催化底物的基团转移到另一有机物上的酶。其反应通式为:的酶。其反应通式为:A-R+B A+B-R R如氨基、醛基、酮基、磷酸基如氨基、醛基、酮基、磷酸基第第33页页/共共126页页酶的种类(续)酶的种类(续)l异构酶类:催化同分异构分子内的基团重新排列。异构酶类:催化同分异构分子内的基团重新排列。其反应通式为:其反应通式为:A A第第34页页/共共126页页酶的种类(续)酶的种类(续)l 裂解酶类裂解酶类:催化有机物裂解为小分子有机物。:催化有机物裂解为小分子有机物。其反应通式为:其反应通式为:AB A+B 第第35页页
25、/共共126页页酶的种类(续)酶的种类(续)l合成酶类:催化底物的合成反应。需要消耗合成酶类:催化底物的合成反应。需要消耗ATP以获取能量。反应通式为以获取能量。反应通式为 A+B+ATP AB+ADP+H3PO4第第36页页/共共126页页酶的种类(续)酶的种类(续)l(2)按酶在细胞的存在部位,分为按酶在细胞的存在部位,分为胞外酶胞外酶胞内酶胞内酶表面酶表面酶l(3)按酶作用底物的不同,分为按酶作用底物的不同,分为淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶、核糖核酸酶等。淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶、核糖核酸酶等。l以上三种分类和命名方法可有机地联系和统一起来。以上三种分类和命名方法可有机地联系
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