核酸的结构学习.pptx
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1、 组成核酸的戊糖有两种。组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为所含的糖为 -D-2-脱氧核糖;脱氧核糖;RNA所含的糖则为所含的糖则为-D-核糖。核糖。一、核酸的化学组成一、核酸的化学组成 元素组成:元素组成:C H O N PC H O N P(一一)戊糖戊糖RiboseRiboseDeoxyriboseDeoxyribose第1页/共56页(二二)碱基碱基1.嘌呤(嘌呤(Purine)1 12 23 34 45 56 69 97 78 8 腺嘌呤腺嘌呤AdenineA A鸟嘌呤鸟嘌呤guanineGG第2页/共56页2.嘧啶(嘧啶(Pyrimidine)1 12 23 34 45 56 6
2、尿嘧啶尿嘧啶uracilU胞嘧啶胞嘧啶cytosineC胸腺嘧啶胸腺嘧啶thymineT第3页/共56页(三三)核苷(核苷(nucleoside)核苷核苷 戊糖戊糖+碱基碱基 糖与碱基之间的糖与碱基之间的C-NC-N键,称为键,称为C-NC-N糖苷键糖苷键1122334455(OH)1122334455(OH)第4页/共56页Adenosine Guanosine Cytidine Uridine第5页/共56页(四四)核苷酸(核苷酸(nucleotide)核苷酸核苷酸 核苷核苷+磷酸磷酸 戊糖戊糖+碱基碱基+磷酸磷酸HHHHHHH H HOH AMP dAMP第6页/共56页(五五)核苷酸衍
3、生物核苷酸衍生物1.1.核苷酸继续磷酸化核苷酸继续磷酸化AMPADPATP第7页/共56页 核苷一磷酸可以进一步磷酸化,形成核苷二磷酸和核苷三核苷一磷酸可以进一步磷酸化,形成核苷二磷酸和核苷三磷酸。下图给出了腺苷一磷酸(磷酸。下图给出了腺苷一磷酸(AMPAMP)、腺苷二磷酸()、腺苷二磷酸(ADPADP)和)和腺苷三磷酸(腺苷三磷酸(ATPATP)的结构。)的结构。第8页/共56页2.2.环化磷酸化环化磷酸化 cAMPcGMP第9页/共56页3.3.肌苷酸及鸟苷酸肌苷酸及鸟苷酸(强力味精强力味精)4.4.辅酶辅酶 NADNAD、NADPNADP、FMNFMNIMP GMP第10页/共56页(六
4、六)多聚核苷酸(核酸)多聚核苷酸(核酸)多聚核苷酸是通过一个核苷酸的多聚核苷酸是通过一个核苷酸的C C3 3-OH-OH 与另一分子核苷酸与另一分子核苷酸的的5 5-磷酸基形成磷酸基形成3 3,5,5-磷酸二酯键相连而成的链状磷酸二酯键相连而成的链状聚合物。聚合物。5533第11页/共56页 核酸中核苷酸是通过核酸中核苷酸是通过3,5-3,5-磷酸二酯键连接的磷酸二酯键连接的 交替的戊糖和磷酸基团形成多核苷酸链的共价骨架。碱基给出了核酸序交替的戊糖和磷酸基团形成多核苷酸链的共价骨架。碱基给出了核酸序列上的变化。聚合酶催化细胞中的列上的变化。聚合酶催化细胞中的RNARNA和和DNADNA的合成。
5、的合成。核苷三磷酸核苷三磷酸ATPATP、GTPGTP、CTPCTP、UTP UTP 是是RNARNA合成的底物,而合成的底物,而dATPdATP、dGTPdGTP、dCTPdCTP和和dTTPdTTP是是DNADNA合成的底合成的底物。物。聚合酶通过催化一个核苷酸的聚合酶通过催化一个核苷酸的3-OH3-OH与另一个核苷酸的与另一个核苷酸的5-5-磷酸之间形磷酸之间形成成3,5-3,5-3,5-3,5-磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键磷酸二酯键,将核苷单磷酸加到生长的多核苷酸链上,下图给出将核苷单磷酸加到生长的多核苷酸链上,下图给出了了DNADNA分子的延长反应。分子的延长反应。由核糖核苷酸聚合
6、形成的多核苷酸链是核糖核酸(由核糖核苷酸聚合形成的多核苷酸链是核糖核酸(RNARNA);由脱氧核糖);由脱氧核糖核苷酸聚合的多核苷酸链是脱氧核糖核酸(核苷酸聚合的多核苷酸链是脱氧核糖核酸(DNADNA)。)。第12页/共56页 核酸的一级结构是核酸的一级结构是通过通过3,5-3,5-磷酸二酯磷酸二酯键连接的核苷酸序列。键连接的核苷酸序列。DNADNA和和RNARNA的生物合的生物合成都是按照成都是按照5353方方向进行的,向进行的,没有特别指没有特别指没有特别指没有特别指定时,核苷酸序列都是定时,核苷酸序列都是定时,核苷酸序列都是定时,核苷酸序列都是按照按照按照按照53535353方向读写方向
7、读写方向读写方向读写。磷酸二磷酸二酯键酯键第13页/共56页l5-5-磷酸端(常用磷酸端(常用5 5-P-P表示);表示);3-3-羟基端(常用羟基端(常用3 3-OH-OH表表示)示)l多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须注明它的方向是注明它的方向是5353或是或是3535。多聚核苷酸的表示方式多聚核苷酸的表示方式DNA RNA5PdAPdCPdGPdTOH 3 5PAPCPGPUOH 或5ACGTGCGT 3 5ACGUAUGU 3 ACGTGCGT ACGUAUGUT53OH U53OH OH OH OH OH 第1
8、4页/共56页 (七七七七)DNADNA的碱基组成是有规律的的碱基组成是有规律的 ChargaffChargaff观观察察到到来来自自不不同同种种属属的的DNADNA的的4 4种种碱碱基基组组成成不不同同,例例如如来来自自人人、猪猪、羊羊、牛牛、细细菌菌和和酵酵母母菌菌的的DNADNA的的碱碱基基的的数数量量和和相对比例很不相同,即相对比例很不相同,即DNADNADNADNA的碱基组成具有种属的特异性的碱基组成具有种属的特异性的碱基组成具有种属的特异性的碱基组成具有种属的特异性。来来自自同同一一种种属属不不同同组组织织的的DNADNA样样品品具具有有相相同同的的碱碱基基组组成成,即即碱碱碱碱基
9、基基基组组组组成成成成没没没没有有有有组组组组织织织织和和和和器器器器官官官官的的的的特特特特异异异异性性性性。对对于于一一个个给给定定种种属属的的DNADNA碱碱基组成不会随有机体的年龄、营养状态和环境变化而改变。基组成不会随有机体的年龄、营养状态和环境变化而改变。Chargaff Chargaff 得得出出的的一一个个最最重重要要的的碱碱基基定定量量关关系系:不不管管种种属属如如何何不不同同,但但在在所所有有的的DNADNA中中,腺腺嘌嘌呤呤残残基基摩摩尔尔数数等等于于胸胸腺腺嘧嘧啶啶残残基基摩摩尔尔数数(即即,A AT T),而而鸟鸟嘌嘌呤呤残残基基摩摩尔尔数数等等于于胞胞嘧嘧啶啶残残基
10、基摩摩尔尔数数(即即,G GC C)。从从这这些些关关系系中中可可以以得得出出,嘌嘌呤呤残残基基的的总总摩尔数等于嘧啶残基的总摩尔数,即摩尔数等于嘧啶残基的总摩尔数,即A A A AG G G GT T T TC C C C。第15页/共56页 DNADNA中碱基组成的这些定量关系,也称为中碱基组成的这些定量关系,也称为ChargaffChargaff法则,法则,后来又被其他的研究者证实。碱基之间的这些定量关系对于建后来又被其他的研究者证实。碱基之间的这些定量关系对于建立立DNADNA的三维结构以及遗传信息是如何编码的三维结构以及遗传信息是如何编码,在在DNADNA中一代一代中一代一代传下去是
11、一个关键。传下去是一个关键。不同来源的不同来源的DNADNA的碱基组成(摩尔百分比)和碱基比例的碱基组成(摩尔百分比)和碱基比例第16页/共56页二二.DNA.DNA的结构的结构(一一一一)DNA)DNA)DNA)DNA的的的的一级结构一级结构 脱氧核糖核酸的排列顺序可以用碱基排列顺序表示;脱氧核糖核酸的排列顺序可以用碱基排列顺序表示;脱氧核糖核酸的排列顺序可以用碱基排列顺序表示;脱氧核糖核酸的排列顺序可以用碱基排列顺序表示;DNADNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于界物种的多样性即寓于DNADNA分子中四种核苷
12、酸千变万化的分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。不同排列组合之中。连接键:连接键:连接键:连接键:3 3 3 3,5 5 5 5-磷酸二酯键;磷酸二酯键;磷酸二酯键;磷酸二酯键;磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架;磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架;磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架;磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架;碱基形成侧链;碱基形成侧链;碱基形成侧链;碱基形成侧链;多核苷酸链均有多核苷酸链均有多核苷酸链均有多核苷酸链均有5 5 5 5-末端和末端和末端和末端和3 3 3 3-末端末端末端末端 第17页/共56页2.基因与基因组基因与基因组基因(基因(genegene):):一段有功能的一段有
13、功能的DNADNA片段,生物细胞中片段,生物细胞中DNADNA 分子的最小功能单位。分子的最小功能单位。蛋白质(蛋白质(mRNA mRNA 蛋白质)蛋白质)产物产物 tRNA tRNA RNA RNA rRNA rRNA 调节功能:调节基因调节功能:调节基因无产物无产物 作用未知作用未知结构基因结构基因第18页/共56页基因组(基因组(genomegenome):):某生物体(完整单倍体)所含全部遗某生物体(完整单倍体)所含全部遗 传物质的总和。传物质的总和。包括:核基因组(拟核包括:核基因组(拟核/核核DNADNA)及核外(质粒)及核外(质粒/质体质体DNADNA)bp bp(碱基对(碱基对
14、)103 104 105 106 107 108 109 1010 1011 1012人人两栖类两栖类鱼类鱼类藻类藻类酵母酵母细菌细菌E.ColiE.Coli病毒病毒质粒质粒各种细胞、病毒和细菌质粒中基因组的大小各种细胞、病毒和细菌质粒中基因组的大小第19页/共56页3.原核生物基因组特点原核生物基因组特点l 重复序列少,多位编码区重复序列少,多位编码区l 多为操纵子形式组织多为操纵子形式组织l 有重叠基因存在有重叠基因存在4.真核生物基因组特点真核生物基因组特点l 以染色体存在以染色体存在l 重复序列多重复序列多 基因组计划基因组计划人类基因组计划(人类基因组计划(Human Genome
15、Project,HGP)酵母基因组计划酵母基因组计划 (YGP)大肠杆菌(大肠杆菌(E.Coli)第20页/共56页 (二二)DNA)DNA的二级结构的二级结构 DNADNA的双螺旋模型的双螺旋模型 19531953年年,J.J.WatsonWatson和和F.F.Crick Crick 在在前前人人研研究究工工作作的的基基础础上上,根根据据DNADNA结结晶晶的的X-X-衍衍射射图图谱谱和和ChargaffChargaff法法则则等等前前人人工工作作,提提出出了了著著名名的的DNADNA双双螺螺旋旋结结构构模模型型,并并对对模模型型的的生生物物学学意意义义作作出出了了科科学学的的解解释释和预
16、测。和预测。第21页/共56页 DNADNADNADNA二级结构是一个双螺旋结构二级结构是一个双螺旋结构二级结构是一个双螺旋结构二级结构是一个双螺旋结构 肺肺炎炎球球菌菌的的转转化化实实验验以以及及噬噬菌菌体体感感染染实实验验使使科科学学家家们们相相信信DNADNA是遗传物质,但遗传信息是如何贮存在是遗传物质,但遗传信息是如何贮存在DNADNA分子中的呢?分子中的呢?当当时时摆摆在在研研究究者者面面前前的的问问题题就就是是建建立立一一个个DNADNA分分子子的的三三维维模型,该模型要能够解释模型,该模型要能够解释ChargaffChargaff法则,以及遗传规律等问题。法则,以及遗传规律等问题
17、。提出提出DNADNA双螺旋模型的是年仅双螺旋模型的是年仅2525岁的沃森和岁的沃森和3535岁的克里岁的克里克,克,19621962年沃森、克里克和威尔金斯三人获得了诺贝尔医学和年沃森、克里克和威尔金斯三人获得了诺贝尔医学和生理学奖。但不要忘记富兰克林以及查加夫等人的贡献,正是生理学奖。但不要忘记富兰克林以及查加夫等人的贡献,正是由于富兰克林拍摄的由于富兰克林拍摄的DNAX-DNAX-射线衍射图成就了沃森和克里克。射线衍射图成就了沃森和克里克。第22页/共56页 19511951年年 FranklinFranklin和和 WilkinsWilkins利用利用X-X-射线衍射方法分析了射线衍射
18、方法分析了DNADNA的晶体,得到了的晶体,得到了DNA X-DNA X-射线衍射图。从衍射图推测出射线衍射图。从衍射图推测出DNADNADNADNA的结构的结构的结构的结构是一个螺旋结构是一个螺旋结构是一个螺旋结构是一个螺旋结构,螺旋沿着螺旋的长轴有两个周期性,第一个周,螺旋沿着螺旋的长轴有两个周期性,第一个周期出现在期出现在0.34nm0.34nm,第二个周期出现在第二个周期出现在第二个周期出现在第二个周期出现在3.4nm3.4nm3.4nm3.4nm。这对于确定。这对于确定DNADNA的结的结构是至关重要的线索。构是至关重要的线索。DNA晶体晶体 X-射线衍射图射线衍射图第23页/共56
19、页 19531953年和依据年和依据X-X-射线衍射数据和射线衍射数据和ChargaffChargaff法则等法则等进行进行DNADNA研究工作,研究工作,建立一个建立一个DNADNA分子的三维模型,称分子的三维模型,称为为DNADNA双螺旋结构模型双螺旋结构模型,这一模型可以圆满地解释有,这一模型可以圆满地解释有关关DNADNA的所有数据,包括的所有数据,包括DNADNA晶体晶体X-X-射线衍射数据和射线衍射数据和ChargaffChargaff法则,这一模型现在来看也基本是正确的。法则,这一模型现在来看也基本是正确的。WatsonWatson和和Crick Crick 于于19531953
20、年年的的4 4月月2525日日在在NatueNatue上上发发表表了了题题为为“核核酸酸的的分分子子结结构构脱脱氧氧核核糖糖核核酸酸的的结结构构”的文章,阐述了双螺旋结构模型的要点的文章,阐述了双螺旋结构模型的要点。第24页/共56页 DNA DNA双螺旋结构要点:双螺旋结构要点:1 1、两两条条反反向向平平行行的的多多核核苷苷酸酸链链围围绕绕同同一一中中心心轴轴缠缠绕绕,形形成成一一个个右右手手的的双双螺螺旋旋。即即两两条条链链均均为为右右手手螺螺旋旋,一一条条是是5353方方向向,另另一一条条是是3535方方向向。一一条条链链上上的的碱碱基基通通过过氢氢键键与与另另一一条条链链上上的的碱碱
21、基基连连接接,形形成成碱碱基基对对。G G与与C C配配对对,A A与与T T配对(碱基互补),配对(碱基互补),G G和和C C之间可形成三个氢键,而之间可形成三个氢键,而A A和和T T之间只能形成二个氢键。之间只能形成二个氢键。2 2、交交替替的的脱脱氧氧核核糖糖和和带带负负电电荷荷的的磷磷酸酸基基团团骨骨架架位位于于双双螺螺旋旋的的外外侧侧,糖糖环环平平面面几几乎乎与与碱碱基基平平面面成成直直角角。两两条条链链上上的的嘌嘌呤呤碱碱基基与与嘧嘧啶啶碱碱基基堆堆积积在在双双螺螺旋旋的的内内部部,碱基平面与螺旋的长轴垂直。碱基平面与螺旋的长轴垂直。3 3、双双螺螺旋旋的的平平均均直直径径为为
22、2nm2nm,相相邻邻碱碱基基对对的的距距离离为为0.34nm0.34nm,相相邻邻核核苷苷酸酸的的夹夹角角为为3636。沿螺旋的长轴每一转含有。沿螺旋的长轴每一转含有1010个碱基对,其螺距为个碱基对,其螺距为3.4nm3.4nm。第25页/共56页4 4、由于碱基对的堆积和糖、由于碱基对的堆积和糖-磷酸骨架的扭转导致螺旋的表面形成产生了磷酸骨架的扭转导致螺旋的表面形成产生了二条不等宽的沟,宽的、深的沟叫大沟,窄的、浅的称之小沟。在这些二条不等宽的沟,宽的、深的沟叫大沟,窄的、浅的称之小沟。在这些沟内,碱基对的边缘是暴露给溶剂的,所以能够与特定的碱基对相互作沟内,碱基对的边缘是暴露给溶剂的,
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