固态纳米孔分析检测技术在分析化学中的应用,分析化学论文.docx
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1、固态纳米孔分析检测技术在分析化学中的应用,分析化学论文Application of Single Solid State Nanopore/Nanochannel Based on Polymer Membrane and Glass Nanopipette in Analytical Chemistry Abstract:Nanopore/nanochannel sensing technique drawing more attention in analytical chemistry due to its unique advantages and the fabricated ele
2、ctrochemical sensors and electrochemical responsive gates have been widely used for more target detection, including single molecule protein and DNA sequencing. Nanopore/nanochannel that used for fabricating electrochemical detection system is mainly divided into biological nanopore and solid state
3、nanopore, and among them, solid state nanopore/nanochannel has a wide range of application due to its inherent properties, such as easy for modification, good mechanical property and stability. Resistive pulse sensing and current-voltage curves ion current rectification are two main methods of nanop
4、ore/nanochannel sensing technique used for target analysis, so in this review, we introduced the fundamentals and applications of nanopore sensing technique based on the above two methods. In addition, we concluded the application and development of single state nanopore/nanochannel in recent years,
5、 and also gave a brief look at the future challenges and prospects in the development of this field. Keyword:Single solid nanopore/nanochannel; Resistive pulse; Ion current rectification; Sensor, Responsive gate; Review; 1、引言 生物医学的快速发展和实际需求为生物传感分析提出了新挑战, 疾病早期诊断及复杂生物样品中的灵敏、准确检测的迫切要求促进分析化学传感技术由传统的定性与定
6、量分析向更高层次的单分子水平检测发展。自库尔特计数器发明以来, 随着单通道电流的记录技术及纳米微加工技术的日趋成熟, 纳米孔检测技术以其独特的优势, 如低成本、操作简单快速、高通量、实时在线、免标记等, 已在分析化学领域获得广泛的关注和发展13.基于纳米孔构建的电化学传感器已被广泛用于检测各种离子、生物分子、单分子蛋白及DNA, 并有望成为第四代DNA测序的新技术4,5. 当前, 基于纳米孔构建的电化学检测系统主要分为三类:蛋白质纳米孔、固态纳米孔及结合两者优势构建的杂化纳米孔。蛋白质纳米孔包括 -溶血毒素 -HL 、耻垢分枝杆菌毒素蛋白A Msp A 、噬菌体phi29连接器马达蛋白 Phi
7、29 connector 等, 蛋白质纳米孔的孔径精到准确、固定, 相关文献报道展示了其在区分短的寡核苷酸片段及单链DNA方面的绝对优势6,7.但是, 蛋白质纳米孔本身所具有的局限性, 如机械稳定性差、对实验条件 温度、p H值、盐浓度等 要求苛刻, 限制了其广泛应用810.相对于蛋白质纳米孔, 以人工材料构筑的固态纳米孔, 包括氮化硅、氧化硅、石墨烯以及有机高分子薄膜11, 具备较好的机械强度、优异的化学稳定性和热稳定性, 能够适应愈加复杂的检测环境, 还可重复使用, 节约成本12.固态纳米孔的形状和尺寸可调控, 且能在其外表进行灵敏的化学或生物修饰, 能够用于多种复杂构造分子目的物的检测。
8、除此之外, 其稳定的构造有助于与其它微型探测器和探针或分析电路相集成, 构建愈加灵敏的单分子检测的生物传感器12,13.除此之外, 杂化纳米孔的发展实现了生物孔和固态孔更好的优势结合, 且避免了两者的缺点, 对于单分子目的物的分析检测具有更大优势14.当前开发的杂化纳米孔主要有 -HL与Si Nx杂化的纳米孔15, 将碳纳米管嵌入磷脂双分子层或者细胞膜构建的杂化孔16.随着DNA折纸技术的发展, 三维DNA折纸构造与固态纳米孔相结合构建的杂化纳米孔已见诸报道17. 本文结合固态纳米孔的独特优势和性能, 总结了固态纳米孔检测的原理及在分析化学领域的应用, 分别介绍了以电阻脉冲作为输出信号的固态纳
9、米孔用于检测单分子DNA、蛋白质及提高检测性能的方式方法, 对固态纳米孔以离子整流作为输出信号用于响应开关及电化学传感器的构建进行了概述。 2、 电阻脉冲检测方式方法 电阻脉冲检测方式方法具有原理简单、可实时在线监测及响应信号灵敏等优势, 且电流信号经膜片钳系统检测、放大和转换后, 易于读取和分析, 是当前纳米孔分析技术最常用的检测手段11,18.其工作原理如此图1所示, 在纳米通道两段施加恒电位, 在电场作用下, 电解质溶液中的离子流经通道, 产生稳定恒电流 图1A .当电解质溶液中存在待测物时, 待测物质能够在扩散作用和电压驱动下进入纳米孔, 堵塞纳米通道, 导致电流降低 图1B .当检测
10、物完全离开孔道时, 通道中的电解质状态复原, 电流恢复初始值, 相应的会出现一个电阻的脉冲峰 图1C .通过分析脉冲电阻图能够得到3个重要信息:阻塞脉冲电流、分析物滞留时间及阻塞脉冲频率。通过对以上数据进行综合分析即可实现对检测物的定性和定量检测19.单个分子/纳米颗粒造成纳米孔道尖端离子流的加强或减弱均会产生显着的离子流扰动信号, 可用于获得待测物的构造、长度、外表电荷、振动动频率等信息。 当前, 基于该原理的检测方式方法常被用于单分子DNA的传感分析, 其对纳米孔的尺寸要求比拟严格, 纳米孔的尺寸应尽量与目的检测物在溶液相中的动态尺寸相匹配, 纳米孔的尺寸过大或过小均不能产生理想的电阻脉冲
11、信号22,23.另外, 目的检测物在电压的驱动作用下穿过纳米孔的速度非常快, 以当前的检测手段及仪器的精度和时间分辨率, 对于实现单分子水平的检测仍然存在挑战, 尤其是对DNA测序经过中单个核苷酸的分辨辨别8,14.通常可通过增加溶液的盐浓度、降低所施加的驱动电压或缩小纳米孔的尺寸, 以降低目的物穿孔的速度, 加强信噪比24.例如, Xu等25开发了一种简单有效的缩小玻璃管纳米孔的尺寸的湿化学方式方法 图2A , 通过硅酸盐的水解反响在纳米孔内壁构成Si O2层, 纳米孔的尺寸缩小到 10 nm.该方式方法简单有效, 低消耗, 对环境友好, 并且不改变玻璃管纳米孔本身的特性。尺寸缩小之后的纳米
12、孔不仅降低了DNA的迁移速率, 而且显着加强了DNA的迁移信号和信噪比。另外, 很多文献报道已经证实, 在纳米孔外表进行适当的功能化修饰, 不仅能够有效降低纳米孔对目的检测物的非特异性吸附, 防止孔道堵塞, 降低背景信号, 也能够缩小纳米孔径提高检测效果24.其原理主要依靠纳米孔外表功能化修饰的官能团能够对目的检测物产生互相吸引力 如氢键、范德华互相作用等 , 降低目的物的穿孔速度。Crick等26在玻璃管纳米孔外表覆盖多层石墨烯, 将纳米孔完全覆盖, 通过原位电化学刻蚀, 纳米孔由完全闭合转化为完全打开的状态, 进而精到准确地制备具有任何孔径尺寸的纳米孔 图2B .在较小孔径尺寸下, 能够有
13、效降低DNA穿孔速率, 提高检测效果。除此之外, 石墨烯外表具有较多的含氧基团, 不仅对DNA迁移速率起调节效果, 而且为纳米孔外表的功能化提供了良好平台。 尽管在纳米孔内外表进行功能化和缩小纳米孔的尺寸在降低目的物穿孔速度、提高选择性和灵敏性方面展现出了一定的优势, 但是这些策略通常需要细致、繁琐的优化经过。开发易于制作和功能化的免标记生物传感器, 实现对单分子目的物 如核酸DNA和蛋白质 的检测仍然存在挑战。近期的研究表示清楚, 在固态纳米孔道内嵌入一个门电极, 提供一个局部的电场, 可通过调控门电极的电压实现对目的检测物通过纳米孔的速度及迁移方向的有效控制27,28.除此之外, 研究人员
14、还将场效应晶体管 FET 与纳米孔相结合, 制备出具有离子效应的场效应管, 其物理原理与传统的半导体场效应管类似, 即通过栅极控制离子的流速, 而非电子或者空穴。该传感平台在提高选择性和控制目的物运输方面具有潜在优势。例如, Ren等29通过在具有双孔的玻璃管纳米孔的一个孔道内填充碳, 构成碳纳米电极, 然后在玻璃管纳米孔外表沉积一层聚吡咯导电层作为门电极, 构建了一个新的纳米孔扩展的场效应晶体管 nex FET .如此图3A所示, 通过控制门电压, 可有效控制DNA在单分子水平上通过纳米孔道, 实现对其检测。另外, 聚吡咯栅层合适嵌入可用于选择性分子传感的人工受体, 通过将胰岛素嵌入到聚吡咯
15、导电层, 实现了对抗胰岛素人类免疫球蛋白抗体的检测。nex FET的显着优势是能实时调整纳米孔的离子运输特点, 通过电聚合调整纳米孔的尺寸与分析物相吻合, 在实现高通量检测的同时可以显着加强信噪比。除此之外, 该课题组同样基于两个孔道的玻璃管纳米孔, 通过在其底部滴加一滴液滴构成纳米桥梁, 将核酸DNA分子的转移限制在间隔为20 nm的两个纳米孔之间 图3B 30.相对于传统的纳米孔检测方式方法而言, 该方式方法使目的分子的移动速率能够降低约3个数量级, 有效加强了对目的物检测的信噪比、分辨率、灵敏度, 降低了检测限;同时, 该方式方法具有普适性, 能够扩展用于双链DNA、RNA、单链DNA及
16、蛋白质分子的检测。 近期, 研究人员开场将纳米孔作为一种确定蛋白物理参数的强有力的分析工具, 如蛋白的尺寸、构象状态、蛋白与蛋白之间的互相作用及与适配体和抗体作用的动力学等3133.但是, 相对于DNA而言, 蛋白种确定蛋白物理参数的强有力的分析工具, 如蛋白的尺寸、构象状态、蛋白与蛋白之间的互相作用及与适配体和抗体作用的动力学等3133.但是, 相对于DNA而言, 蛋白质具有不同的尺寸、三维构造和不均匀种确定蛋白物理参数的强有力的分析工具, 如蛋白的尺寸、构象状态、蛋白与蛋白之间的互相作用及与适配体和抗体作用的动力学等3133.但是, 相对于DNA而言, 蛋白质具有不同的尺寸、三维构造和不均
17、匀的电荷分布, 这些都对纳米孔技术检测蛋白质提出了挑战, 尤其是对类似尺寸的蛋白质检测的弊端就是缺乏选择性。解决以上问题主要有两种方式方法, 第一种方式方法是在纳米孔外表修饰特异性的辨别受体, 蛋白质与受体特异性结合阻塞纳米孔34,35;另一种方式方法是利用DNA作为载体分子分离和检测蛋白33,36.Bell等37通过DNA杂交将190个寡核苷酸 约7.2 kbp 组装构成线性的双链DNA作为载体, 在特定位置设置与目的蛋白质结合的特异性结合位点, 进而实现了对链霉亲和素的检测。首先, 将亲和素负载在双链DNA载体上, 华而不实, 1B、3B和5B分别对应着负载了1个、3个和5个亲和素位点,
18、链霉亲和素通过特异性结合作用连接到DNA载体上。将DNA载体置于纳米孔检测系统中, 在电压的驱动作用下, DNA载体和蛋白的复合物进入纳米孔道。由于结合的蛋白质分子位于DNA载体的中心位置, 所以在离子电流轨迹中, 蛋白质的特征电流峰信号清楚明晰地出如今DNA信号中间。另外, 随着蛋白绑定位点数量增加, 蛋白信号的振幅增大。利用该纳米孔传感器实现了在混合体系中对目的蛋白的特异性灵敏检测。近期, Lin等38采用溶菌酶适配体修饰的金纳米粒子为分子载体, 在复杂体系下实现对溶菌酶的高选择性检测。相对于目的蛋白而言, 适配体修饰的金纳米粒子的引入有效增大了复合物的尺寸, 降低了外表的电荷量, 削弱了
19、目的蛋白与纳米孔之间的互相作用, 显着加强了目的蛋白穿孔频率及信噪比。值得一提的是, 以上的检测只能实现对单一目的蛋白分子的检测。Bell等39基于载体-蛋白复合构造的检测方式方法, 提出了一种数字编码的纳米构造, 实现了在复杂体系中对4种蛋白的同时检测。在该工作中, 在DNA载体中引入了纳米孔可辨别的独特的条形码, 当该DNA纳米构造通过固态纳米孔检测时, 含有3个构造单元的条形码对其检测的准确性可到达94%.选取4个条形码, 在每个条形码的特定位置修饰对4种目的抗体具有特异性结合的绑定位点, 将其用于混合体系中四种抗体蛋白的同时检测, 很容易通过条形码的明显差异实现对4种抗体的检测和区分。
20、基于载体-蛋白的检测方式方法对蛋白质的检测和辨别相比照较成熟和准确, 但是这种DNA载体的设计和合成通常比拟复杂, 需要基因工程和DNA合成化学等。 除了用于单分子的DNA和蛋白质检测外, 固态纳米孔作为一种强大的分析工具在其它应用方面也展现出了绝对的优势。Chen等40利用单个的玻璃管锥形纳米孔作为一个模型系统模拟研究了单膜磷脂囊泡迁移的动力学, 囊泡依次动态通过纳米孔, 可通过周期性出现的离子动态阻塞电流信号进行直观的观察。另外, 通过调控纳米孔的尺寸、溶液p H值、囊泡浓度、施加的电压及纳米孔内外表的荷电性所引起的离子电流阻塞信号振幅和滞留时间的变化, 实现对单膜磷脂囊泡迁移行为的系统研
21、究。该课题组还利用纳米孔分析技术在完全均质的条件下实现了对单分子DNA组装构造的表征41.他们以DNA杂交链反响 HCR 和催化发卡组装 CHA 反响为例, 基于纳米孔分析技术的超灵敏特性, 实现了对所构成的DNA纳米构造的表征。当构成的DNA串联体通过纳米孔时, 其在孔道内的滞留时间能够提供所构成的DNA串联体的精到准确的长度和折叠信息。与原子力显微镜分析技术相比, 纳米孔分析技术可通过对其穿孔事件进行计数和分析实现对单个的串联体信息的检测;与凝胶电泳相比, 可通过电流降低的幅度和滞留时间实现对构成的DNA串联体的大致长度和构造信息的表征, 其超灵敏的检测性同样能够揭示被凝胶电泳及其它分析方
22、式方法所掩盖的DNA串联体的构造信息。另外, 该检测方式方法在均一溶液中进行, 最大程度避免了由于孵化、探针标记、无限稀释、电场强度等对DNA串联体构造的损伤。该纳米孔的分析技术同样适用于具有更复杂构造DNA折叠行为的表征。 3、离子整流 离子整流效应是非对称纳米通道的一种独特的性质, 华而不实, 伏安曲线 I-V 是其电化学测定结果的直观表现, 即在两侧电解质溶液完全一样的情况下, 非对称的纳米通道在一样外加电场强度下所测得的电流值有明显差异不同, 伏安曲线呈一条曲线。在这种情况下, 离子整流比为正负一样的输入电压下所得的两个电流的比值42,43.Siwy等42,44对离子整流现象进行了深切
23、进入的研究, 并基于纳米孔道小孔的尺寸 接近双电层 及外表带电荷的不对称性分布, 提出了广为接受的静电刺齿模型, 对纳米通道内离子整流现象进行了解释。Jiang的课题组4547基于亲疏水特性界面的仿生纳米通道在该领域也开展了一系列行之有效的工作。自2008年Wang等48基于锥形纳米孔的离子整流现象实现了对药物分子的成功检测以来, 离子整流现象作为一种信号输出检测方式方法被用于对目的探测物进行定性和定量研究11, 4951.本部分主要集中介绍了基于离子整流效应的固态纳米孔在分析化学传感领域的应用, 包括玻璃管纳米孔和高分子聚合物纳米孔。 3.1 玻璃管纳米孔 玻璃管纳米孔以离子整流作为信号输出
24、实现对目的物检测的报道比拟少, 其主要原因可能是在其外表不容易进行化学修饰。Chen等52基于玻璃管纳米孔, 利用聚谷氨酸作为一种非孵化探针, 实现了对Cu2+的快速选择性检测。聚谷氨酸的等电点为3.22, 在中性溶液 p H=7.0 中带负电荷, 所以在纳米孔的两端分别参加聚谷氨酸和Cu2+, 在电压的驱动下, 分别向纳米孔的小孔端移动靠近, 且二者在小孔端发生螯合反响, 构成的螯合物阻塞纳米孔, 引起电流值降低。该传感器对Cu2+具有良好的检测效果, 通过调控p H值可再生利用, 具有潜在的应用价值。尽管该方式方法通过选择不同的螯合剂可实现对其它目的金属离子的检测, 但是其应用仍然存在局限
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