p53基因Arg72Pro多样性与青海胃癌遗传易感性的关系,医学遗传学论文.docx
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1、p53基因Arg72Pro多样性与青海胃癌遗传易感性的关系,医学遗传学论文p53 基因第 72 密码子多态性与胃癌存在易感性。有报道以为,其易感性存在区域性1 3。青海地区地处青藏高原,平均海拔 3 500 m,是胃癌高发区,胃癌检出率高达 10 7%,高于其他地区4。本研究旨在通过对该地区胃癌基因型的分析,讨论p53 基因 Arg72Pro 多态性与青海地区胃癌遗传易感性的关系及胃癌发生部位的关系。 1 材料与方式方法 1 1 研究对象 胃癌组64 例,为2020 年12 月 2020 年9 月在青海大学附属医院行胃镜检查并经病理确诊的汉族胃癌患者,按胃癌发生部位分为贲门部、胃底部、胃体部、
2、胃窦部四组; 华而不实男 51 例,女 13 例,年龄( 42 85) 岁,平均 61 28 岁。对照组 72 例,为同期同医院排除肿瘤和消化系统疾病的汉族健康体检者,华而不实男 56 例,女 16 例,年龄( 40 83) 岁,平均 58 82岁。两组研究对象均在青海地区寓居 20 年以上。 两组间性别和年龄分布经 2检验差异无统计学意义( P 分别为 0 79、0 90) 。 1 2 方式方法 1 2 1 外周血基因组 DNA 的提取 真空采集管抽取胃癌组及对照组个体静脉血5 mL,以 EDTA 抗凝,转移 2 mL 至 EP 管,置 80 冰箱保存,使用柱式血液基因组提取试剂盒( 生工生
3、物工程上海股份有限公司) 从外周血白细胞中提取基因组 DNA,提取的基因组 DNA 用紫外分光光度计( Eppendorf Bio Photometer) 测定含量并调整浓度后置 20 冰箱保存。 1 2 2 引物及探针的设计与合成 根据以下为参考文献1及 Primer 5 0 软件设计荧光标记探针及引物。 探针及引物均由生工生物工程上海股份有限公司合成。 1 2 3 PC 扩增反响体系和基因分型检测 PC 扩增反响体系见表 1。 将加好样品的 384 孔板放在 LightCycler480Software Setup( oche 罗氏) 荧光定量 PC 仪进行反响。反响条件: 50 预变性
4、2 min,95 变性10 min,95 变性 15 s,60 退火 60 s,循环 40 次,再 72 延伸 6 min。 根据探针设计,自 FAM 通道检测到的荧光信号为 Arg/Arg 基因型,自 VIC 通道检测到的荧光信号为 Pro/Pro 基因型,两通道同时检测到的荧光信号为 Arg/Pro 基因型。三种基因型荧光信号特点如此图1。 1 3 统计学处理方式方法 用 SPSS17 0 软件完成,用 2检验确认基因能否符合 Hardy Weinberg 遗传平衡,并用 2检验进行各基因型和等位基因频率分布差异的比拟及基因型频率在胃癌不同部位的分布差异的比拟。所有统计检验均为双侧检验,检
5、验水准 =0 05。 2 结果 2 1 p53 基因多态性在两组中的分布情况 经检验两组基因型分布均符合 Hardy Wein-berg 平衡规律( P 0 05) 。等位基因 Arg 和等位基因 Pro 在 胃 癌 中 的 频 率 分 布 分 别 为 48 44%、51 56% ,在对照组中分别为 42 36% 、57 64% 。两组等位基因频率分布无统计学差异( P = 0 32) 。 Arg / Arg、Pro / Pro、Arg / Pro 三种基因型在胃癌组中的频率分别为 21 86%、25 00%、53 14%,在对照组中分别为 16 67%、31 94%、51 39%,三种基因型
6、分布在两组中无显著性差异( P =0 59) ,见图 1、表2 2.2 p53 基因型与胃癌部位的关系 本研究显示,胃癌病例中以胃体部胃癌最常见( 占 54 70%) ,胃 底 部 胃 癌 所 占 比 例 最 小 ( 占6 25% ) 。Arg / Arg 基因型频率在贲门部、胃底部、胃体部、胃窦部分别为 7 14%、7 14%、57 14%、28 57% ; Pro / Pro 基 因 型 频 率 依 次 为 12 50% 、6 25% 、62 5% 、18 75% ; Arg / Pro 基因型频率依次为 26 47%、5 88%、50 00%、17 65%。经 2检验,三种不同基因型频率
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