鲍林DNA研究失败的原因探讨,自然辩证法论文.docx
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1、鲍林DNA研究失败的原因探讨,自然辩证法论文DNA 科学竞争在美国加州理工学院的鲍林Linus Pauling、科里Robert Corey和英国卡文迪许实验室的沃森James Watson、克里克Francis Crick之间进行。1953年2月21日,鲍林和科里在(自然Nature发表研究简报 核酸的构造 Structure of the Nucleic Acids: 根据X射线衍射图的主要特征和基本的分子构造原理,我们提出了核酸的构造。这个构造包括三条相互缠绕的螺旋多核苷酸链 磷酸基团沿分子的中心轴严密堆积,戊糖残基围绕在周围,嘌呤和嘧啶向四周张开,平面与分子轴垂直。 1, p.3461
2、953 年初,鲍林和科里又在(美国科学院院刊Proceedings of National Academy of Sciences发表 为核酸设想的构造 A Proposed Structure for the Nucleic Acids,具体给出了嘌呤碱与嘧啶碱位于分子的外侧,核苷酸链依靠磷酸之间的氢键结合的三链螺旋模型。图1左为中心轴附近的三个四面体磷酸基团,实线圆圈代表氧原子,虚线圆圈代表磷原子;右图为24-残基7-转的单核苷酸链,四面体表示磷酸基团,呋喃核糖由连接它们的弧线表示。2, pp.87-88。 1953 年 4 月 25 日,三篇 DNA 构造的论文连续刊登在(自然上,包括威
3、尔金斯Maurice Wilkins、斯托克Alex Stokes、威尔逊Herbert Wilson的 脱氧戊糖核酸的分子构造 Molecular Structure ofDeoxypentose Nucleic Acids,富兰克林Rosalind Franklin、戈斯林Raymond Gosling的 胸腺核酸钠的分子构型 Molecular Configuration in Sodium Thymonucleate,沃森、克里克的 核酸的分子构造 Molecular Structure of Nucleic Acids。3, p.737在 核酸的分子构造 中,沃森和克里克提出了DNA
4、 的双螺旋构造:两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴互相缠绕,嘌呤与嘧啶碱位于双螺旋的内侧,两条核苷酸链依靠碱基之间的氢键结合。1953年5月30日,他们又在(自然发表 脱氧核糖核酸构造的遗传含义 Genetical Implications of the Structure of Deoxyribonucleic Acid,进一步回答了 脱氧核糖核酸怎样自我复制 的问题。沃森和克里克也因而获得1962年的诺贝尔生理学或医学奖。 DNA 科学竞争被形容为 远方传奇的大力士被两个无名小卒砍倒 4, p.436的故事,20 世纪出色的化学家被两个 名不见经传 的年轻人打败的原因值得深究,有关沃森
5、和克里克发现DNA双螺旋构造的论着很多,但对于鲍林DNA研究失败的原因还尚未见相关的报道,本文试作一些初步的讨论。 一、鲍林失败原因的主要观点 鲍林DNA研究失败的原因是什么?对于这一问题,可谓见仁见智,大体能够归纳为下面几种观点: 1. 资料缺乏 讲 X 射线衍射图是 DNA 研究的关键之一。20 世纪 50 年代初,清楚明晰的 DNA 晶体衍射图极难获得,主要由于DNA难以与粘附的蛋白质分离,并且分离出来的也只是衍射图非常模糊的DNA钠盐。固然国王学院的朗德尔John Randall实验室已经拍摄出了清楚明晰的X射线衍射图,但是鲍林和科里使用的仍然是英国晶体学家阿斯特贝里William T
6、. Astbury1938年发表的 相当模糊 的X射线衍射图。鲍林在(构造化学与分子生物学五十年的进展Fifty Years of Progress in Structural Chemistry and Molecular Biology中指出: 我们那些相当模糊的X射线照片,事实上相应于DNA纤维的两种形式图形的重迭,它们导致我得出这样的结论:DNA纤维是三个分子相互盘绕的螺旋络合物,而不是我早年论文中根据互补论据提出的我所期望的双螺旋。 1951 年夏天,鲍林遵从加州理工学院客座教授吉拉尔特 奥斯特Gerald Oster的建议致函朗德尔,希望看一看威尔金斯的X射线衍射图。1951年8月
7、28日,朗德尔在回信中写道: 很抱歉,奥斯特误解了我们在DNA方面的意图,威尔金斯和其别人正忙于解释X射线衍射图,把这些照片交给您,对于他们或者整个实验室的努力来讲都是不公平的。 1952年5月,鲍林原计划出席英国皇家学会的蛋白质会议,并且访问朗德尔的实验室,当时富兰克林拍摄的B型DNA钠盐纤维的X射线衍射图,清楚地显示出双重对称性,能够有力地排除三链螺旋的可能性。在会议的前夕,由于 你提议中的旅行不符合美国的最大利益 ,美国拒绝给鲍林签发出国护照。历史学家罗伯特 奥尔贝Robert Olby以为,假如鲍林得以成行, 威尔金斯是会拿出这些东西给他看的 ,5, p.49这样鲍林很有可能揭示DNA
8、的正确构造。 2. 浮躁 与 自负 讲 鲍林的传记作家托马斯 哈格Thomas Hager以为, 浮躁 与 自负 是鲍林DNA研究失败的主要原因之一。20 世纪 50 年代初是鲍林科学生涯的一个高峰。1951 年 4 月,鲍林和科里在(美国科学院院刊发表 蛋白质的构造:多肽链的两种螺旋构型 ,6, p.205他们以肽键的平面性为基础,成功提出每圈3.6个氨基酸残基,相邻螺圈之间构成链内氢键的 -螺旋构造。之后,鲍林和科里又发表 多肽链的两种螺旋构型的原子坐标和构造因子 、 合成多肽链的构造 、 毛发、肌肉和其他相关蛋白质的构造 、 血红蛋白和其他球蛋白的多肽链构型 等七篇论文, 戏剧性地 占据
9、(美国科学院院刊1951年5月号的全部版面。 剑桥大学的卡文迪许实验室也在资深晶体学家劳伦斯 布拉格William Lawrence Bragg的领导下进行蛋白质构造研究,1950年3月31日,布拉格、肯德鲁、佩鲁茨在英国(皇家学会学报Proceedingof the Royal Academy发表论文 晶体蛋白的多肽链构型 Polypeptide Chain Configurations in CrystallineProteins。与鲍林相反,卡文迪许研究小组犯了两个主要的错误:一是局限于整数螺旋,严格限定每一圈的氨基酸残基数目为3或4等整数;二是忽视了肽键的平面性,没有从化学特性方面施加
10、限制,他们提出的蛋白质构造到达二十种之多。 战胜世界着名晶体学家给鲍林带来了极大的荣誉,也在一定程度上产生了 自负 的心理,哈格就以为: 在解决了阿尔法螺旋问题后,他以为自个不再需要做别人需要做的那些研究的准备工作了。很清楚,他是世界上解决大分子构造的最佳人选。 4, p.435 -螺旋研究前后历时十多年,鲍林研究小组在生物分子的键长和键角方面做了大量的工作,而DNA研究却特别仓促。哈格作了这样的比拟: 阿尔法螺旋是他十多年翻来覆去进行分析的结果,华而不实凝结了他在成千上万小时中艰辛细致地进行晶体衍射研究的心血。在他正式发表他的模型前,他的实验室将氨基酸的各个成分精到准确地测定到了几分之一度或
11、百分之一埃。 在蛋白质这一课题上,存在着用X射线拍摄到的大量清楚明晰的资料,能够让鲍林作仔细的研究,使他有可能将几十种不同的构造剔除掉 对于DNA,这些事情都没有做。 4, pp.427-428 3. 老科学家 异常感觉和状态 佩鲁茨Max F.Perutz因研究血红蛋白的构造而获得1962年诺贝尔化学奖,他在(真该早点惹怒你 关于科学、科学家和人性的随笔I Wish I d Made You Angry Earlier-Essays on Science, Scientists, andHumanity中指出: 直到生命的最后一息,鲍林仍不停地发表论文,但这些文章没有一篇像早期的阐述那样重要
12、,可能由于他过于专注于某些事情,起先是核战争,以后又是维生素C的问题。 7, p.13鲍林DNA研究失败后,麻省理工学院的生物学家也曾揣测鲍林能否是 老科学家 异常感觉和状态,他们把这种异常感觉和状态定义为 伟大人物脱离了科学家互相提醒对方错误的有利系统时所发生的。 8, p.50这些观点牵涉到科学家的创造性和科学研究的风格。很多科学家的创造性成就往往是中青年时期做出的, 老年 科学家有知识和经历体验的优势,但是,他们也容易受思维定式的影响,也容易由于声望而听不进批评意见。互相批评、自由讨论是克制个人局限的有效方式方法,在鲍林的实验室,是一种 大师的研究工作处于中心地位,其决策权威不容质疑 4
13、, p.187的研究风格,这种研究风格不利于发挥集体的智慧,不利于克制个人认识的局限。总之,鲍林DNA研究失败的原因是多方面的,上述每一种观点都有一定道理,我们还能够结合详细研究经过做进一步的分析。 二、认识和方式方法的局限是导致鲍林失败的主因 1. 从 遗传信息的载体 看认识的局限 任何科学突破都需要条件的积累,敏锐把握科学条件的变化,是做出科学发现的重要前提。20世纪50 年代初,科学发展已经为揭示 DNA 的构造准备了条件。从米歇尔Friedrich Miescher、柯塞尔AlbrechtKossel到列文Phoebus Levene已经认识到了 DNA 的组成、种类和连接方式;美国化
14、学家列文、英国晶体学家阿斯特贝里、挪威晶体学家福伯格已先后提出过DNA的构造模型;X射线技术的完善也为揭示DNA 构造准备了实验条件;更重要的是,越来越多的证据显示 DNA 才是遗传信息的载体。但是,鲍林对于DNA意义的认识却经历了一个弯曲复杂的经过: 120世纪40年代初,鲍林也 迷失 在蛋白质的偏见中。在列文的四核苷酸假讲中,四种碱基在DNA中的含量相等,单调和重复构造的DNA似乎不合适携带遗传信息;而蛋白质由20种不同的氨基酸组成,它们具有多种形式和复杂的排列方式,多样性构造可能正合适储存复杂的遗传信息。与当时的普遍认识一样,鲍林也以为构造简单的DNA很可能只是一种 构造性 的成分,蛋白
15、质最可能是遗传信息的载体。 2实际上,19世纪60年代米歇尔的研究已经预示DNA的遗传意义,但是他的工作 在很大程度上 被忽视了。直到1935年,洛克菲勒研究院的艾弗里Oswald T. Avery发现,DNA本身就能在肺炎球菌之间传递新的遗传信息,艾弗里、麦克劳德、麦卡蒂的细菌特征转化研究显示,遗传单位不存在于复杂的蛋白质中,而存在于外表看起来单调的DNA中。1944年,艾弗里发表论文,提出DNA在肺炎球菌之间传递遗传特性的观点,并且解释了格里菲斯的 转化现象 。当艾弗里的论文在(实验医学杂志Journalof Experimental Medicine上发表时,鲍林并没有真正改变对于 DN
16、A 意义的看法,他讲: 我以前就知道DNA 是一种遗传物质的论点,然而,我没有接受这一论点,你们知道,那时我正热衷于蛋白质的研究,我以为蛋白质最有可能是遗传物质,不可能是核酸 当然,核酸也有作用。 4, p.4003真正认识到DNA的意义是法国 卢瓦蒙噬菌体会议 之后。1952年7月,鲍林出席在法国举行的国际生物化学大会,之后又参加在巴黎城郊的卢瓦蒙修道院举行的国际噬菌体会议,听取美国微生物学家赫尔希Alfred D. Hershey的报告。1952年春,赫尔希和蔡斯Martha Chase采用放射性同位素磷P32和硫S35对T2噬菌体的DNA标记,他们发现,当噬菌体侵染其寄主细菌细胞时,只要
17、噬菌体的DNA进入细胞内部,而蛋白质却留在外面,实验以确凿的证据表示清楚DNA是遗传信息的载体。 卢瓦蒙噬菌体会议 之后,鲍林才意识到自个 走向了错误的方向 。 克里克讲: 双螺旋的发现经过,从科学上讲,是特别平凡的;我以为这一点是必须加以强调的。重要的 在于发现了DNA构造这个课题本身。 9, p.55贾德森Horace Judson也指出: 发现DNA构造在当时是很难的,但不是由于其内在的原因,而是由于人们没有认识到它的重要性和特殊性。 8, p.8首先,DNA在于其 概念的重要性 ,不仅赋予这项研究以重要意义,而且对正确研究DNA的构造也具有重要的指导意义。对于鲍林来讲,他只是把DNA看
18、成是一种比拟重要的生物大分子罢了, 核酸只不过是令人感兴趣的化学品,正如氯化钠是一种有趣的化合物一样。 4, p.434认识的局限束缚了研究者的视野。与鲍林不同,沃森和克里克更早就认识到了DNA的意义,并且将研究目的确立为 生命究竟是什么 这种 宗教式的目的 ,是他们从一开场时就具有愈加开阔研究视野的重要原因。其次,从时间来看,鲍林、科里和沃森、克里克都是从1951年才真正开场研究,到1953年4月沃森和克里克在(自然发表 核酸的分子构造 为止,前后不到三年时间。正确认识研究对象的意义,并且以极大的热情投入到研究中去,在这一案例中显得尤为重要。 2. 从研究经过看思维方式的局限 从研究经过来看
19、,受蛋白质思维定式的影响,这是鲍林失败的重要原因。唐有祺院士1946年9月到1951年在加州理工学院学习,跟随鲍林主攻X射线晶体学,他在 化学的回首和瞻望 中写道: 鲍林通过模型方式方法成功的揭示了蛋白质的 -螺旋构造,在蛋白质构造和DNA的构造之间存在的差异不同是,在为一个多肽链段搭出一个 -螺旋时,只需考虑一个靠分子内氢键构成的单螺旋,20 种氨基酸残基的多种 R 基伸向螺旋外侧,进而并不影响螺旋主体的规则性 在 -螺旋的情况下将氨基酸残基的R基放在螺旋的外侧正能够使螺旋的主体保持规则性,而这个先入为主的想法很可能是在搭建DNA螺旋体时错误地将顺序变幻不定的4种不同的有机碱放在外侧并将磷酸
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