文献计量学视角探析极端微生物的研究现状与趋势,文献计量学论文.docx

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1、文献计量学视角探析极端微生物的研究现在状况与趋势,文献计量学论文内容摘要：以Web of Science论文数据库为数据源, 采用专业数据分析工具VOSviewer软件对2008-2021年极端微生物论文进行数据挖掘和定量分析。总结了此领域论文发表量的总体趋势, 包括发表国家、发表机构、发表期刊、发表作者、研究方向等方面的发表数量的排比以及被引频次。结果表示清楚, 中国最近几年相关论文的发表数量有所提高, 但论文的总引用频次和均篇被引频次和发达国家还是有很大的差距, 讲明我们国家极端微生物方面与世界领先水平还有一定差距。 本文关键词语：极端微生物; 文献计量; 态势分析; 收稿日期：2022-

2、03-04 Quantitative analysis of the study of extremophiles LI Xiao-feng TANG Miao-miao FENG Jin-hua College of Oceanography, Hebei Agricultural University Abstract：With Web of Science paper database as the data source, VOSviewer software, a professional data analysis tool, was used to conduct data mi

3、ning and quantitative analysis of papers on extremophiles from 2008 to 2021. We summarized the general trend of the number of papers published in this field, the comparison of the number of publications and the frequency of citations in aspects of countries of publications, institutions of publicati

4、ons, journals of publications, and authors of the publications. The results showed that the number of papers about extremophiles published in China had increased in recent years, however, China still lagged behind developed countries in the total citation frequency and the average citation frequency

5、 of the papers, indicating that China still lagged behind the leading countries in the study of extremophiles. Keyword:extremophiles; bibliometrics; situational analysis; Received： 2022-03-04 极端微生物是指在一般生物无法生存的极端环境之中, 能够正常生活的微生物的统称, 根据生存环境的非生物特性, 可将微生物分为嗜热、嗜冷、嗜酸、嗜碱、嗜盐和嗜压六大类1。极端微生物由于具有独特的基因类型、特殊的生理机制及

6、代谢产物, 对生命起源和演化的研究具有重要的启示2,3, 在工农业及药物领域中也具有广阔的应用前景4,5。极端微生物的特性可能使原来不可能的生物技术成为可能, 为高效率、低成本生物技术奠定基础, 这有可能改变整个生物技术的相貌6。极端微生物的研究已经成为国际上的一个热门领域, 日本、美国、欧洲等国家都已经启动了极端微生物的研究计划, 中国科学院微生物研究所也成立了极端微生物研究组。主要的研究工作包括:新物种的发现7,8、新产物的研究与生产9、极端酶的构造与功能及其基因的克隆与表示出10,11、适应机理的分子基础及遗传原理12,13、基因组分析等14。当前获得的研究成果也被广泛应用于食品、化工、

7、工业等领域15,16,17。但到当前为止, 对极端微生物文献计量的统计研究相当少。因而, 本研究选取Web of Science平台的Web of Science核心期刊为数据源从国际视野把握国际动态, 通过文献计量方式方法对极端微生物研究进行统计分析和内容挖掘, 分析研究该领域的主要问题, 探寻该领域的发展现在状况和态势, 以期为我们国家极端微生物的研究方向提供科学参考。 1 数据获取与方式方法 本文主要阐述的是微生物方面的极端微生物的研究, 本文是基于Web of Science平台的Web of Science核心期刊为数据源。 对检索结果进行人工查阅最终选择2008-2021年论文1

8、103篇 (选择日期2008.01.01-2021.12.12) 。通过统计发表国家、机构、期刊、作者、研究方向等数量的数据, 再将统计得到的数据转化为趋势图, 根据趋势图对相关论文总体趋势、发表国家、发表机构、发表期刊、发表作者、研究方向、发表数量的排比以及被引频次进行比照分析, 进而得到极端微生物这一领域在国际的发展态势。 2 极端微生物研究现在状况与趋势 2.1 文献的总体趋势 一个研究方向的进展情况能够从论文的发表数量以及增长趋势表现出其重要性。根据数据统计可知, 1986-2021年极端微生物相关出版物总量1 596篇, 被引频次总计49 385。由近十年的论文发表数量趋势图 (图1

9、) 来看, 出版物总量1 103篇, 被引频次总计18 189, 近十年发表论文数量约为总数量的69.11%。近十年大致呈上升趋势, 表示清楚近年来研究极端微生物的人数在不断增加, 极端微生物正在成为国际研究的热门。 图1 国际发表论文总量和论文增长率 2.2 发表国家 极端微生物相关论文发布数据显示, 共有81个国家发表过相关论文, 发表数量排在前十 (如表1所示) 的依次是美国、德国、中国、西班牙、印度、法国、意大利、英国、巴西、智利, 论文发表数量上百的仅有三个国家, 美国、德国、中国, 但最强的还是美国, 其发表数量比德国和中国发表数量之和还要多。但是近三年论文发表量占比排名依次是美国

10、、中国、德国、印度、西班牙、意大利、英国、法国、巴西、智利, 讲明中国在这方面的研究正在呈上升趋势。由图2可知, 美国相关论文发表数量、被引频次和均篇被引频次都相对较高, 德国、西班牙、法国、英国、智利等国固然发表论文数量比拟低, 但其论文均篇被引的次数还是比拟高的。论文均篇被引频次前三是美国、法国、德国, 其发表论文质量是比拟好的。固然中国发表论文的数量位居被引频次数却位居引频次数 (图3) 来看, 固然有的期刊发表的论文数量比拟多, 但其论文总被引频次数比拟少, 均篇被引频次数也比拟少, 如(微生物学前沿发表数量能排到被引频次仅排被引频次能排到, 所牵涉到的作者数量很大, 如今根据发表数量

11、排名前十名的作者 (如表4所示) 依次是AMILS R、COCKELL CS、KELLY RM、SELBMANN L、ASCASO C、MCKAY CP、ONOFRI S、WIERZCHOS J、ISOLA D、ADAMS MWW, 前十名作者发文量之和占9.8%, 接近特别之一, 还是比拟高的。从近三年的发文量能够看出ADAMS MWW和ONOFRI S发文量占比明显有所提高, 当然也有作者发文量降低, 如AMILS R和MCKAY CP。再结合作者被引总数和均篇被引频次能够看出, 参考价值比拟高的作者是ASCASO C、KELLY RM、ADAMS MWW、WIERZCHOS J, 这几位

12、作者的被引总数与均篇被引频次都是比拟高的, 愈加值得一提的是ADAMS MWW这位作者发文量仅仅排到被引却排到论文中总牵涉到74个方向, 排前十的研究方向 (如表5所示) 为微生物学、生物技术应用微生物学、生态环境科学、生物化学分子生物学、科学技术其他主题、地质、化学、农业、生命科学、生物医学其他主题、工程。从总体设计方向来讲, 极端微生物所牵涉到的领域比拟广阔, 但是从发表量来看, 还是比拟集中分布在生物、环境领域。 图4 发表数量前十作者论文被引频次与均篇被引频次 表5 发表数量前十研究方向数据表 导出到EXCEL 2.7 关键字 基于2008-2021极端微生物论文本文关键词语进行统计分

13、析, 将出现频次最高的前50个本文关键词语进行可视化分析, 得到图5。图5中节点与字体的大小取决于该节点的权重, 权重越大, 字体与节点越大, 节点间的关联用节点间的连线表示, 关系的强弱用连线粗细代表。从图中能够看出, 2008-2021年间, 极端微生物研究本文关键词语具体表现出出如下特点: (1) 在本文关键词语出现频次中应用最高的本文关键词语microorganisms、diversity、bacteria、escherichia-coli为主, 出现次数依次是243、135、129、121, 在论文中占领主导地位。 (2) 除了有微生物、生命类等的本文关键词语外, 环境、土地、水、鉴

14、定等本文关键词语出现比率也占有一定的比例, 讲明极端微生物的研究领域不断地扩大。 图5 2008-2021年极端微生物研究热门图谱 3 总结 通过对2008-2021年间极端微生物研究论文和被引用数据统计, 并制作比照图进行分析, 描绘叙述国际上极端微生物发展态势及最近几年研究状况, 分析表示清楚: 从国际总体角度出发, 极端微生物最近几年发表论文数量呈稳定增加趋势, 学术影响力逐步增高, 随着极端微生物研究领域的扩展以及研究的不断深切进入, 能够预见将来极端微生物方面的论文发表数量将进一步提升。 从研究实力的角度出发, 在极端微生物研究领域中, 美国、德国、中国仍然是最大的论文产出国, 西班

15、牙、印度、法国、意大利等国家发展速度较快。在学术影响力上, 科技发达国家仍占一定的优势, 我们国家最近几年来极端微生物论文发表数量有明显提高, 整体研究实力提升。中国科学院已经步入该领域国际领先水平的行列中, 尤其最近几年论文发表数量明显增加。但在极端微生物的研究领域中, 我们国家还需进一步提高论文质量, 进而提高其学术影响力, 建议将前沿的研究技术手段引入研究经过, 加强国际沟通合作, 注重研究成果的应用、推广和宣传等。 从发表的期刊角度出发, 极端微生物发表期刊还是以生物类、生态类期刊为主, 发表数量上来讲以(极端微生物(公共科学图书馆 综合(微生物学前沿等期刊为主, 但以ISME杂志引用

16、率和均篇引用率为高。 从发展的领域来看, 微生物研究方向以微生物学、生物技术应用微生物学、生态环境科学等为主, 但极端微生物的研究方向不断扩展, 已经涉足到了地质、化学、农业等领域, 可见极端微生物在科学研究领域的地位不断提升, 发展很有前景。 以下为参考文献 1 RAMPELOTTO P H.Extremophiles and Extreme EnvironmentsJ.Life, 2020, 3 (3) :482-485. 2 BEATTY J T, OVERMANN J, LINCE M T, et al.An Obligately Photosynthetic Bacterial An

17、aerobe from a Deep-Sea Hydrothermal VentJ.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2005, 102 (26) :9306. 3 SCHIPPERS A, NERETIN L N, KALLMEYER J, et al.Prokaryotic cells of the deep sub-seafloor biosphere identified as living bacteriaJ.Nature, 2005, 433 (7028)

18、 :861. 4 黎唯, 李一青, 李铭刚, 等.极端环境微生物源活性物质的研究进展J.国外医药抗生素分册, 2007, 28 (1) :1-5. 5 熊海容.极端微生物与燃料酒精工业C/湖北省暨武汉市生化与分子生物学学会.湖北省暨武汉市生物化学与分子生物学学会第八届第十七次学术年会论文汇编, 2007:1. 6 马延和.新的生命形式:极端微生物J.微生物学通报, 1999, 26 (1) :80. 7 WOESE C R, KANDLER O, WHEELIS M L.Towards a natural system of organisms:proposal for the domains

19、 Archaea, Bacteria, and EucaryaJ.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1990, 87 (12) :4576. 8 周正富.新疆沙漠枯燥环境中耐辐射细菌的多样性及耐辐射细菌新物种的分离鉴定C/中国微生物学会微生物资源专业委员会、工业微生物学专业委员会.第三届全国微生物资源学术暨国家微生物资源平台运行服务研讨会会议论文内容摘要集. 9 李升康, 王玉桥.深海微生物极端酶的研究进展J.海洋科学, 2018, 33 (5) :98-102. 1

20、0 刘杰凤, 马超, 王春, 等.海洋微生物纤维素酶及半纤维素酶基因克隆与表示出研究进展J.生物技术通报, 2020 (6) :36-42. 11 TRIVEDI N, GUPTA V, KUMAR M, et al.An alkali-halotolerant cellulase from Bacillus flexus, isolated from green seaweed Ulva lactucaJ.Carbohydrate Polymers, 2018, 83 (2) :891-897. 12 ROSSI M, CIARAMELLA M, CANNIO R, et al.Extrem

21、ophiles 2002J.Journal of Bacteriology, 2003, 185 (13) :3683. 13 董锡文, 薛春梅, 吴玉德.极端微生物及其适应机理的研究进展J.微生物学杂志, 2005, 25 (1) :74-77. 14 汪天虹, 侯运华.海洋极端微生物和极端酶分子生物学研究J.科技导报, 2004 (9) :7-10. 15 顾觉奋, 罗学刚.极端微生物活性物质的研究进展J.中国天然药物, 2003, 1 (4) :252-256. 16 梅建凤, 王普, 陈虹.极端微生物源抗生素的研究与开发J.中国当代应用药学, 2004 (s1) :44-46. 17 曹竹安, 陈博, 林章凛.能源生物技术:能源植物与极端微生物J.生物产业技术, 2008 (5) :19-24