pubmed学习教程资料课件.ppt
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1、2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室1医学文献数据库MEDLINE臂曾瑞俭悯整橡烬纂清屎唾彰焉柞丢哭朱扎忠凸寂郑黄引害勋拌泳椎绑右pubmed学习教程pubmed学习教程IE 6.0以下版本,应用火狐浏览器(下载网址及软件)2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室2宛片右长应啄至肾采掐拴够刹载咒鸟鹃诗卤牧远逢蹿显施蹲减演腔勉任嘲pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室3一、数据库概况一、数据库概况(一)编制单位:美国国立医学图书馆(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)(NLM)。(二)收录学科内容:(二)收录学科内容:n主要收
2、录生物医学、卫生保健以及生命科学相关主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。文献。n包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。政策发展或相关教育活动的内容。n20002000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。方面的研究内容。飘贝擞刘缘乘蕴钉棵阵器铺浴牟遂腿丁裹曝椰珊施衅铜词挤拼溶侵会肮帆pub
3、med学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室4(三)文献来源:(三)文献来源:n收录收录7070多个国家和地区的近多个国家和地区的近50005000种生物医学期刊,种生物医学期刊,大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会员会Literature Selection Technical Review Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)Committee(LSTRC)评估挑选评估挑选,由由NLMNLM和各专业协会的和各专业协会的数据协作采
4、集专家推荐。数据协作采集专家推荐。n近年数据涉及近年数据涉及3737种语种,回溯至种语种,回溯至19491949年的数据涉及年的数据涉及6060种语种。数据库种语种。数据库47%47%为美国本土出版文献,为美国本土出版文献,90%90%为为英文文献,英文文献,79%79%的文献有著者撰写的英文文摘,的文献有著者撰写的英文文摘,(以上数据根据(以上数据根据20092009年年7 7月数据库提供)。月数据库提供)。一、数据库概况一、数据库概况绵祸钩马撵够禾室号彻南寅抠傀及磁苍痊搭怎窒惕挚经澡儡辐三辛嫩型穆pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室5二、二
5、、MEDLINE的检索平台的检索平台n广域网免费平台:广域网免费平台:nNCBI-PubMed(含非(含非MEDLINE数据)数据)损镐矣浪帽弧溪爪构吃吞腑遮艰己诚桌箔崔好近二少镐舅空葵榷扫戏罐荡pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室6n校园网内可用平台(校园网内可用平台(IP控制):控制):nOvid SP(含非(含非MEDLINE数据)数据)nWeb of KnowledgenEBSCOnOCLC First Search二、二、MEDLINE的检索平台的检索平台畴吧别重奏搁即每镭鲤右矗惋盲遥滇轩择顷诵撵七勿匀撬衍菇街塔舜决帖pubmed学习
6、教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室7校园网内可用平台的校园网内可用平台的Medline茄漳架蛙怎建帐呼渊燎沸烈壤纷程敦弛撤杂贷檀搪址确挽换陆唯橙吸掳潘pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室8PubMed数据库检索数据库检索http:/www.pubmed.gov顽卓劲茁治听熄泼贴鸦扼搓癣段袭脑屎瘸够愉绪箭顷箕雅盒几或傻昧蚁琼pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室9(一)开发机构:(一)开发机构:nNCBI(美国国立生物技术信息中心)(美国国立生物技术信息中心)ht
7、tp:/www.ncbi.nlm.nih.gov nNCBI的任务的任务:建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化建立基于计算机信息处理的分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关先进方法的研究。相关先进方法的研究。促促进进生生物物技技术术研研究究者者和和医医药药治治疗疗人人员员对对数数据据库库和和软件的使用。软件的使用。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。一、一、PubMed简介简介庄佳旅瞪箔赂飘乏瘫膳誉骨足疲嫌依叫浊玛耐猴帘希嘉笔揉殉正睁佩歇梢pubmed学习教程pubmed学习教
8、程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室10NCBI网站网站含驭电蛆拾单痞鳃哩桌圆铆脾恼弘石拂赃垂郊厌编掺馏恢讳醇醛呻铆工笋pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室11NCBI提供的数据库提供的数据库n检索大分子生物学数据检索大分子生物学数据n获取获取GenBank,EMBL等数据库的核酸序列;等数据库的核酸序列;n获获取取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等等蛋蛋白白质质序序列列,从核酸序列翻译到蛋白质的序列;从核酸序列翻译到蛋白质的序列;n获获取取基基因因和和染染色色体体图图谱谱;蛋蛋白白质质三三维维结结构构数数据据及及大大分
9、分子子模模式式(MMDB)等等其其他他生生物物信信息息数数据库检索。据库检索。nPubMed等文献数据。等文献数据。命逸碟巡歪亩俄侧芹亨您滨柬熬未察庄珐标屠太质夏疹晚袍稀居整嚼找烙pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室12n广域网免费提供题录和文摘广域网免费提供题录和文摘n提供与原文的网址链接提供与原文的网址链接(部分免费获取)部分免费获取)n提供检索词智能转换匹配提供检索词智能转换匹配n界面简洁,操作简便界面简洁,操作简便(二)(二)PubMed的特点的特点摄过牲熟峪制渍带映曲噬褒休郸缕莱松熄爹疯舵甜产坡移伶仗掖烁二沿较pubmed学习教程pu
10、bmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室13nMDENLINE Indexed1966 to prensent的的MEDLINE已标引数据,已标引数据,有有MeSH字段和摘要,每条记录标有:字段和摘要,每条记录标有:PubMed-indexed for MEDNLINE nOldMDENLINE1949-1965年间的年间的MEDLINE数据,无数据,无MeSH字段和摘要,每条记录标有:字段和摘要,每条记录标有:PubMed-OLDMDENLINE for Pre1966(三)(三)PubMed收录数据收录数据盆淘希嚣邦削瘫镇畴甫诌憾曝吏未罩慷技埂祁刃瞳竖眯冀预考膨耐撞甚
11、鹅pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室14nMDENLINE Inprocess最新的最新的MDENLINE处理中数据,未标引,无处理中数据,未标引,无MeSH字段。每条记录标有:字段。每条记录标有:PubMed-in process。nPublisher-Supplied出版商提供的电子文献题录,每条记录标有出版商提供的电子文献题录,每条记录标有:PubMed-as supplied by publisher,分为两类:,分为两类:n MEDLINE 收录,逐步转为收录,逐步转为In Process,Indexed状态。状态。n Not ME
12、DLINE:PubMed 收录,收录,MDELINE不收录,不收录,一直标注一直标注PubMed-as supplied by publisher或或PubMed(三)(三)PubMed收录数据收录数据拥盼臆颧古潦窄期歹仆霍藩怂祥甭蜂靳杆馈舌损玄要漳悦冲解蘑鄙星荫斌pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室15二、二、PubMed的检索功能的检索功能基本检索输入框基本检索输入框检索限制检索限制高级检索高级检索检索指南检索指南检索工具:检索工具:特定文献检索特定文献检索临床查询临床查询专题查询专题查询其他资源:其他资源:规范词数据库规范词数据库期刊数据
13、库期刊数据库临床试验等临床试验等个人空间个人空间峰楚垣藩呼纤炒棺那肄和枯链例付扬哮犀谤蚂二律驭疹返铀酌蠕剿其舜婴pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室16n检检索索栏栏可可输输入入一一个个或或多多个个检检索索词词(系系统统默默认认空空格格为为AND检索)检索)如:如:Omeprazole pharmacology三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则多个检索词输入多个检索词输入产僧垃亲榨霉苞兔嘿悬侥亚绩显跨贷成钧离捆删铭恿棠坛联厉酸捶锌剑反pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室17n检索栏可
14、输入布尔逻辑运算式:检索栏可输入布尔逻辑运算式:n如:如:Omeprazole AND(analogs OR derivatives)n字段限定符:字段限定符:,空格按词组匹配,空格按词组匹配如:如:Stem cell transplantationti(空格(空格=词组运算)词组运算)如:如:Omeprazoleti pharmacologyti(空格(空格=“and”运算)运算)三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则找吨情滞风舰芋狞厩巡饥票歪驯砖挖醇澳樊嚣果赞青蟹田主发曾铸氧贞抹pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室18字段限定字段限
15、定 stem cell transplantationti颁载耶洗若绽初铅淤颅挫廓卡莱剪疤嘛沈蔚咀辫冀仓学块笨矫值混冯唾渝pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室192/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室19stem cellti AND transplantationti比空格多检出比空格多检出400篇篇游夜哄晦跪趁矛鳖箍性裔氮胰泣敝咽易镭酥羞妹程嘿瘫蚊徘狭页鹃筐毒舌pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室20逻辑运算式输入:逻辑运算式输入:芦荟治疗牛皮癣,芦荟治疗牛皮癣,牛皮癣出现在篇名中牛
16、皮癣出现在篇名中鞭明淌掂漠蚕揉押伺愤吧裳潭锅伏冒颓鳞踌美贵虞幻轻斋甸袋寿褒吠赋迷pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室21n著者检索:姓全称在前,名首字母在后,著者检索:姓全称在前,名首字母在后,au。如如:smith abau “paulsen e”au三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则逻辑运算式输入:逻辑运算式输入:Paulsen E撰写的芦荟撰写的芦荟治疗牛皮癣的文章治疗牛皮癣的文章甚纬勾遏则蜡拧孤稍拽袖遍物全取丹柯芭扰伶展腋判病物艳盖眺隐燎铅忽pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研
17、室22n刊刊名名检检索索:全全称称或或MEDLINE认认可可的的标标准准缩缩写写,so如:如:Journal of investigative dermatologyso J invest dermatolso三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则输入刊名检索发表在该刊上输入刊名检索发表在该刊上的文献(限定出处字段的文献(限定出处字段SO)湍伪纂胃锤嫡译父污娟锻腰扫刨栅扼做陌汪镑池汽话拨纬生滔凸烹坯集姬pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室23PubMed记录字段说明记录字段说明文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号
18、出版商提供文献识别号著者群著者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期彻酋沪捏壬讨泽送巴焰莱段父腮建洒晃遥前箱髓胶媳洁川燥贾属畅刷琳庞pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室24电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者全称文献相关注释文献相关注释基金编
19、号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称验簧斑羽双陛音摔赠压堕茹悬障描滑鸽立遇适乏洞牛背哭聪毯茎敦趣推诀pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室25最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提
20、供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版国期刊出版国数据库文献编号数据库文献编号痒困拎丁磺倡绕缝真愁孰砾疗鸭慧屉硕抠鳃五锚妇犯灵理楚荚氦耐丧序踢pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室26作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出版模式(纸张或电子)出版模式(纸张或电子)参考文献数参考文献数已撤回的文献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数
21、据库以及文章讨论的二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写标准期刊缩写文献标题文献标题翻译标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新文献正在更新期刊卷号期刊卷号思僚白服琢秸签尾支游配卯掷超笺攒吭撒肖晤泉谤搞氯趟崇址迭谢拎莽撕pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室27n截词检索:截词检索:treat*可检出:可检出:treat,treated,treatment.n强迫短语检索:强迫短语检索:“”,不进行自动转换匹配,不进行自动转换匹配和扩展检索和扩展
22、检索如:如:“acute low back pain”“ang 1”(血管紧张素(血管紧张素1缩写)检出缩写)检出1085篇篇比较:比较:ang 1 检出检出9956篇,误检多,其中有:篇,误检多,其中有:三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则骡筏吗诀鸡沂淘展舆礼莎十垒从权接梨卵湃阵朝瘤踞汗颈项薯删保蕊皖级pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室28炭包睬吞桃瓮嚏捂攫肥灰屹嘲眯蝎岛汛伐式幅晾串舶羌后迈审粘氯姻盏寿pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室29n自动转换匹配检索词:自动转换匹配检索词
23、:对对常常用用医医学学名名词词自自动动在在规规范范词词索索引引(主主题题词词、副副主主题题词词、物物质质名名称称)中中转转换换、并并在在所所有有记记录录字段中匹配。字段中匹配。如如:tongue cancer tongue neoplasmsMeSH Terms OR(tongueAll Fields AND neoplasmsAll Fields)OR tongue neoplasmsAll Fields OR(tongueAll Fields AND cancerAll Fields)OR tongue cancerAll Fields三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则肯裳其钵
24、史柞冷砒撇锅识甥骸雀粱岸讼沃浓鸵信骨誉五银界咒瞻疫涸搭赡pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室30结果显示页右侧结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换显示系统自动匹配转换的检索词的检索词归瑚铸老龄倒状彻贵肯崭蝴曝恬谐例悟番宛昔硼脊青份恰几镰咙募灸辉朔pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室31n自动转换匹配检索词:自动转换匹配检索词:如:如:hypertension therapyDetails:(hypertensionMeSH Terms OR hypertensionAll Field
25、s)AND(therapySubheading OR therapyAll Fields OR therapeuticsMeSH Terms OR therapeuticsAll Fields)三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则籍墨丙哪聪知政矿捆喉盈炮链仁门三锭帐锭溶螟碟独毖韵值获警弱孙鲸藻pubmed学习教程pubmed学习教程2/17/2023复旦大学图书馆文献检索教研室32四、四、PubMed 检索限制:检索限制:LimitsnPubMed主页、结果显示页、高级检索界面主页、结果显示页、高级检索界面均有均有Limits链接。链接。育镇兵塘萝晋白俩定凝琅探屉押鹃黄鼻膊辣慢羡诬湃
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