第10章基因组表观遗传精.ppt

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1、第10章基因组表观遗传第1页，本讲稿共62页l多细胞生物通常由许多形态和功能不同的组织和多细胞生物通常由许多形态和功能不同的组织和细胞组成细胞组成,虽然具有相同的基因型虽然具有相同的基因型,但不同细胞的基因表但不同细胞的基因表达模式却各不相同达模式却各不相同.多细胞生物个体不同组织细胞如何维多细胞生物个体不同组织细胞如何维持不同表达模式呢持不同表达模式呢?l已分化的同一类型细胞其表达模式是一致的，保留着相已分化的同一类型细胞其表达模式是一致的，保留着相同的遗传同的遗传“记忆记忆”，这种遗传，这种遗传“记忆记忆”是通过是通过“表观遗表观遗传传”(epigenetic）的方式实现的，表观遗传也是基

2、）的方式实现的，表观遗传也是基因组程序化的主要表现形式。因组程序化的主要表现形式。10.1 什么是表观遗传第2页，本讲稿共62页表观遗传学(epigenetics)：研究在研究在不改变不改变DNA顺序顺序的情况下基因表达的情况下基因表达出现出现可遗传变化可遗传变化的学科的学科.这种表达模式的改这种表达模式的改变可通过有丝分裂和减数分裂传递给子代变可通过有丝分裂和减数分裂传递给子代.表观遗传学是功能基因组学研究的重要领表观遗传学是功能基因组学研究的重要领域域,是基因表达调控的重要方式之一是基因表达调控的重要方式之一.10.2 表观遗传的定义第3页，本讲稿共62页10.1.2 表观遗传现象表观遗传

3、现象广义的表观遗传广义的表观遗传(epigenetic)包括以下内容包括以下内容:1)DNA的甲基化的甲基化2)位置效应位置效应3)核小体和组蛋白的修饰核小体和组蛋白的修饰(乙酰基化和甲基化乙酰基化和甲基化)4)RNAi(siRNA和和miRNA)5)染色质的动态异染色质化染色质的动态异染色质化(如如X-染色体的失活染色体的失活)6)基因组印记基因组印记(genomicgenomicimprintingimprinting)7)等位基因的副突变及同源抑制，颠换效应等位基因的副突变及同源抑制，颠换效应8)朊蛋白朊蛋白(Prion)第4页，本讲稿共62页10.1.3 表观遗传机制l虽然表观遗传现象

4、不涉及基因或DNA序列的改变,但表观遗传仍然具有物质基础,它们同DNA的序列组成、序列组成、基因的空间位置、染色体的构型变化和基因的空间位置、染色体的构型变化和DNA的碱基修的碱基修饰饰有关。第5页，本讲稿共62页染色质重建：染色质重建：染色质状态的改变染色质状态的改变SNF/SWIHistone ModificationAcetylationUbiquitinationSumoylationMethylationPhosphorylationDNA MethylationCpG dinucleotidesMeCP2Histone SubstitutionH2AZH2AxH3.3Transcr

5、iption FactorModificationAcetylationPhosphorylation 染色质修饰染色质修饰第6页，本讲稿共62页DNA去甲基化与肌肉细胞分化第7页，本讲稿共62页基因的三维调控第8页，本讲稿共62页10.2 位 置 效 应与表观遗传 位置效应位置效应:由于基因变换了在染色体上的位置而引由于基因变换了在染色体上的位置而引起表现型改变的现象。起表现型改变的现象。位置效应表明基因的功能以及基因对生物表现型的位置效应表明基因的功能以及基因对生物表现型的影响可以在不改变遗传物质本身的情况下仅仅由影响可以在不改变遗传物质本身的情况下仅仅由于遗传物质在染色体上的位置差别而发

6、生变化。于遗传物质在染色体上的位置差别而发生变化。位置效应实际上反映了基因组不同区域的特定位置效应实际上反映了基因组不同区域的特定 的染色质结构。的染色质结构。第9页，本讲稿共62页两种位置效应美国学者美国学者E.B.E.B.刘易斯把位置效应分为两大刘易斯把位置效应分为两大类型：类型：稳定型和花斑型稳定型和花斑型。稳定型位置效应稳定型位置效应 简称简称S S型位置效应，表型型位置效应，表型 改变是稳定的。改变是稳定的。花斑型位置效应花斑型位置效应 简称简称V V型效应，其表型改型效应，其表型改 变是不稳定的，从而导致显性和隐性变是不稳定的，从而导致显性和隐性 性状嵌合的花斑现象。性状嵌合的花斑

7、现象。第10页，本讲稿共62页花斑型位置效应花斑型位置效应当某一基因由当某一基因由于染色体重排于染色体重排从原来的常染从原来的常染色质区移到异色质区移到异染色质区附近染色质区附近,因异染色质的因异染色质的扩散效应扩散效应,造造成基因表达的成基因表达的改变改变.这种抑这种抑制效应的差别制效应的差别使基因表达受使基因表达受抑程度不同抑程度不同,由此产生嵌合由此产生嵌合.第11页，本讲稿共62页10.2.1 座位控制区l在基因本身的调控序列之外还有其他的位于5上游区域的DNA序列对下游一组基因的表达进行调控,这些调控序列称之为座位控制区(locus control region,LCR).lLCR与

8、其下游的一个或一组基因共同组成独立的功能域.lLCR的DNase超敏位点随发育状态而改变,因此LCR区的染色质结构模式是动态的.第12页，本讲稿共62页-球蛋白质基因座位控制区球蛋白质基因座位控制区第13页，本讲稿共62页-球蛋球蛋白质白质基因基因座位座位控制控制区区第14页，本讲稿共62页10.2.2 绝缘子1 1）19851985年，年，UdvardyUdvardy等在果蝇染色体等在果蝇染色体87A787A7条带热激蛋白基因座的条带热激蛋白基因座的两侧发现了两段取名为两侧发现了两段取名为scs scs 和和scsscs(specialized chronatin (specialized

9、chronatin structures,structures,特化染色质区特化染色质区)的顺序。的顺序。scsscs和和scs scs 长分别为长分别为350 350 bp bp 和和 200 bp200 bp，对，对DNAase I DNAase I 有高度抗性。这两个序列的两侧均有高度抗性。这两个序列的两侧均有有DNaseIDNaseI超敏位点，各为超敏位点，各为100 bp100 bp。2 2）将将scsscs置置于于控控制制眼眼睛睛颜颜色色的的基基因因两两侧侧然然后后导导入入果果蝇蝇，转转化化的的果果蝇蝇品品系系不不管管转转基基因因位位于于何何处处，均均可可产产生生类类似似的的表表型

10、型，说说明明scsscs可使转基因免受内源染色质的可使转基因免受内源染色质的“位置影响位置影响”。这这种种可可以以阻阻止止邻邻近近位位置置激激活活或或失失活活效效应应的的顺顺序序现现在在称称之之为为绝缘子绝缘子（insulatorinsulator）。第15页，本讲稿共62页 果蝇绝缘子（insulator）第16页，本讲稿共62页 果蝇多线染色体横纹区果蝇多线染色体横纹区SCSSCS专一性结合蛋白质专一性结合蛋白质InterbandScs,BEAF-32第17页，本讲稿共62页绝缘子可阻止相邻基因之间绝缘子可阻止相邻基因之间增强子的彼此干扰增强子的彼此干扰1)真核生物增强子具有双向作用真核生

11、物增强子具有双向作用,超长距离功超长距离功 能能,从而带来位置相邻基因之间的彼此干扰从而带来位置相邻基因之间的彼此干扰 问题问题.2)有些基因位与异染色质邻近有些基因位与异染色质邻近,会受到抑制效应的干会受到抑制效应的干扰扰.绝缘子可以阻止上述因位置原因产生的对基因表绝缘子可以阻止上述因位置原因产生的对基因表达的抑制达的抑制.第18页，本讲稿共62页绝缘子的普遍性第19页，本讲稿共62页绝缘子结合蛋白（CTCF）（1）第20页，本讲稿共62页 绝缘子DNA结合蛋白一种一种DNA-结合蛋白结合蛋白CTCF(CCCTC-binding factor,CCCTC结合因子结合因子)可专一性与该可专一性

12、与该42 bp顺序结合。顺序结合。CTCF已在其它实已在其它实验中被证明参与基因的转录激活与沉默，是一个含有验中被证明参与基因的转录激活与沉默，是一个含有11个个锌指的分子量为锌指的分子量为82 ku的蛋白质。人体的蛋白质。人体T细胞受体细胞受体/座位座位及爪蟾（及爪蟾（Xenopus）RO(repeat organizer,重复顺序组织者重复顺序组织者)rRNA基因调控区绝缘子均有保守的基因调控区绝缘子均有保守的CTCF结合位点结合位点(Bell,2001)。这些在进化上处于不同地位的物种中广泛存在绝缘。这些在进化上处于不同地位的物种中广泛存在绝缘子的现象表明，子的现象表明，以绝缘子界定增强

13、子的作用范围是真核基以绝缘子界定增强子的作用范围是真核基因组一种普遍的控制基因活性的机制因组一种普遍的控制基因活性的机制.第21页，本讲稿共62页绝缘子的定向控制第22页，本讲稿共62页 绝缘子效应方向性的说明绝缘子的效应具有方向性绝缘子的效应具有方向性 果蝇的果蝇的yellow（y）座位有）座位有4个个增强子元件，增强子元件，2个位于启动子上游，另个位于启动子上游，另2个位于外显子个位于外显子1和和2之间，它们分别负责不同组织特异性的之间，它们分别负责不同组织特异性的yellow基因的表基因的表达。将含有绝缘子的果蝇逆转录转座子达。将含有绝缘子的果蝇逆转录转座子gypsy依次分别插依次分别插

14、入每个增强子元件的附近，绝缘子对增强子的阻隔效应入每个增强子元件的附近，绝缘子对增强子的阻隔效应依位置不同而异依位置不同而异:1)如果插入位置在启动子的如果插入位置在启动子的5方向，将影响绝缘子上游方向，将影响绝缘子上游 增强子元件的作用。增强子元件的作用。2)如果插入位置在启动子的如果插入位置在启动子的3方向，只影响下游增强子方向，只影响下游增强子 元件的功能。元件的功能。3)如果插入位置不在增强子与启动子之间，绝缘子对增如果插入位置不在增强子与启动子之间，绝缘子对增 强子无阻隔效应。强子无阻隔效应。第23页，本讲稿共62页 绝缘子的两种工作模型第24页，本讲稿共62页10.2.3 副突变l

15、副突变(paramutation):在杂合子中某一等位基因影响同一座位上另一等位基因的表型,副突变在转基因表现型中也已发现,称为同源抑制.产生原因:两个同源的等位基因之间存在反式互作,使其中一个等位基因的DNA甲基化状态发生改变从而导致染色质结构的变化,并进一步影响到基因的表达.第25页，本讲稿共62页副突变副突变副突变:最初在玉米最初在玉米中发现的中发现的.副突变不涉副突变不涉及基因结构及基因结构的改变的改变,只是只是等位基因的等位基因的表达模式不表达模式不同于原来的同于原来的同源基因同源基因.第26页，本讲稿共62页副突变遗传效应第27页，本讲稿共62页10.3 DNA甲基化与表观遗传 基

16、因组的甲基化模式可影响表型并能通过体细胞遗传,但不改变细胞的基因型.A甲基转移酶主要存在于低等真核生物 C甲基转移酶主要存在于高等真核生物 两者都以SAM(S腺苷甲硫氨酸)为底物.第28页，本讲稿共62页高等生物基因组普遍存在甲基化 1）DNA分子的化学修饰主要是甲基化，分子的化学修饰主要是甲基化，脊椎动物基因脊椎动物基因 组中约组中约60-80%双核苷酸双核苷酸CpG的胞嘧啶（的胞嘧啶（C）被甲基）被甲基 化。化。被子植物基因组被子植物基因组中，甲基化位置主要出现在中，甲基化位置主要出现在 CpG和和CpNpG回文对称顺序，大约回文对称顺序，大约20-30%的胞嘧啶的胞嘧啶 （C）被甲基化。

17、被甲基化。DNA的甲基化在基因的表达调控中的甲基化在基因的表达调控中 起重要作用。起重要作用。2）基因组的甲基化模式可影响表型并能通过体细胞遗）基因组的甲基化模式可影响表型并能通过体细胞遗 传，但不改变细胞的基因型，传，但不改变细胞的基因型，基因组的甲基化是表观基因组的甲基化是表观 遗传的重要内容之一遗传的重要内容之一.第29页，本讲稿共62页真核生物胞嘧啶DNA甲基化酶的结构第30页，本讲稿共62页10.3.2 甲基化与基因调控甲基化与基因调控 DNA甲基甲基化主要通化主要通过影响染过影响染色质的结色质的结构阻止转构阻止转录因子与录因子与启动子或启动子或增强子的增强子的结合控制结合控制基因表

18、达基因表达.第31页，本讲稿共62页10.3.3 DNA甲基化与转座子活性玉米转座子玉米转座子Spm的活性与的活性与DNA甲基化甲基化第32页，本讲稿共62页 DNA甲基化抑制转座第33页，本讲稿共62页10.3.4 基因组印记1)19911)1991年年TM.TM.德切艾拉等报道德切艾拉等报道,老鼠老鼠7 7号染色体上中有一个号染色体上中有一个称为类胰岛素生长因子称为类胰岛素生长因子Igf2Igf2的基因的基因(insulin-like growth factorII),该基因的突变纯合子表现为侏儒症该基因的突变纯合子表现为侏儒症.在杂合子在杂合子中中,如果突变等位基因来自父亲如果突变等位基

19、因来自父亲,表型异常表型异常.如果来自母如果来自母亲亲,表型正常表型正常,即母源即母源Igf2Igf2基因在子代被抑制基因在子代被抑制.2)2)这种这种因为亲本来源不同而使等位基因表达模式发生改因为亲本来源不同而使等位基因表达模式发生改变的现象称为印记变的现象称为印记(imprinting).它有两个特点它有两个特点:1.1.子代的两个等位基因中有一个发生沉默子代的两个等位基因中有一个发生沉默,即不表达即不表达.2.2.哪一个等位基因沉默取决于哪一个等位基因沉默取决于等位基因的亲本来源等位基因的亲本来源.这是在哺乳动物中最早发现的表观遗传现像这是在哺乳动物中最早发现的表观遗传现像.随后又在老随

20、后又在老鼠中发现另外一个基因鼠中发现另外一个基因,即即7 7号染色体上与号染色体上与Igf2Igf2紧密连锁紧密连锁的的H19H19也有类似的情况也有类似的情况,只是表现相反只是表现相反,即父源的即父源的H19H19等位等位基因在子代中不表达基因在子代中不表达,母源的母源的H19H19基因在子代中正常表达基因在子代中正常表达.第34页，本讲稿共62页哺乳动物Igf2Igf2基因的印记循环第35页，本讲稿共62页基因组印记的分子机制Igf2-H19座位印记控制区座位印记控制区(ICR)DNA甲基化的确立与维持甲基化的确立与维持第36页，本讲稿共62页 DNA甲基化与基因组表达程序化 第37页，本

21、讲稿共62页基因组印记的生物学意义1)基因组印记使两倍体体细胞中的一个等位基基因组印记使两倍体体细胞中的一个等位基 因沉默因沉默,这与两倍体生物学的意义是相悖的这与两倍体生物学的意义是相悖的,容易使突变等位基因暴露容易使突变等位基因暴露.2)目前已有三种理论用予解释基因组印记的生物学意目前已有三种理论用予解释基因组印记的生物学意义义:进化理论进化理论:一组各有缺陷的基因在相互组一组各有缺陷的基因在相互组 合时有优势合时有优势,为了不被淘汰而暂时沉默为了不被淘汰而暂时沉默.卵巢期理论卵巢期理论:避免畸胎瘤避免畸胎瘤,需要胎盘基因沉默需要胎盘基因沉默.冲突理论冲突理论:血缘关系理论血缘关系理论(k

22、inship theory)第38页，本讲稿共62页 体细胞克隆的问题1)是否发育正常是否发育正常-基因组印记基因组印记 (genomic imprinting)问题问题2)体细胞基因组的重新程序化是体细胞基因组的重新程序化是 否偏离正常轨道从而产生发育否偏离正常轨道从而产生发育 和生理生化活性异常的问题和生理生化活性异常的问题.第39页，本讲稿共62页受受受受精精精精胚胚胚胚与与与与体体体体细细细细胞胞胞胞胚胚胚胚的的的的发发发发育育育育差差差差异异异异哺乳动物哺乳动物体细胞胚体细胞胚胎发育胎发育,受受精卵胚胎精卵胚胎发育存在发育存在许多异许多异.这这些差异主些差异主要表现在要表现在体细胚与

23、体细胚与受精胚基受精胚基因组的程因组的程序化序化.受精受精胚的雄核与胚的雄核与雌核在去甲雌核在去甲化的程序上化的程序上存在时间差存在时间差.甲化程序的甲化程序的差异会导致差异会导致胎发育异常胎发育异常.第40页，本讲稿共62页猪的猪的体细体细胞克胞克隆隆-巨型巨型胎儿胎儿第41页，本讲稿共62页双卵融合克隆小鼠 哺乳动物均有基因组印记哺乳动物均有基因组印记,因此哺乳动物没有孤雌生殖因此哺乳动物没有孤雌生殖.只有将野生型只有将野生型H19基因和突变型基因和突变型19基因的卵细胞融合才得到成体克隆鼠基因的卵细胞融合才得到成体克隆鼠.见见:Nature 428:860-864,2004Nature

24、428:860-864,2004第42页，本讲稿共62页10.4 染色质重建与表观遗传染色质结构至少在2方面对基因表达施加影响:首先,染色体的某一区段包装程度决定于该区段的基因是否表达;其次,假如某一基因可以接触,基因所在的核小体位置及其周边环境会影响到该基因的表达.第43页，本讲稿共62页核小体1)核小体是染色质结构的基本单位核小体是染色质结构的基本单位.2)核小体是连接核小体是连接DNA和染色体高级结构和染色体高级结构的中间环节的中间环节.3)核小体核心核小体核心8聚体与聚体与DNA的结合不是随的结合不是随机的机的.4)核小体核心核小体核心8聚体与聚体与DNA的结合位置是的结合位置是动态的

25、动态的.第44页，本讲稿共62页转录因子与组蛋白结构比较第45页，本讲稿共62页核小体相位核小体相位(nucleosome phasing)1）核核小小体体相相位位（nucleosome phasing）系系指指一一段段顺顺序序确确定定的的DNA与与 核核小小体体核核心心8聚聚体体的的可可变变结结合合方方式式。例例如如缠缠绕绕在在核核心心组组蛋蛋白白8聚聚体体上上的的DNA顺顺序序可可向向前前或或朝朝后后移移动动若若干干碱碱基基对对，从从而而改改变变双双螺螺旋旋大大小小沟沟的的朝朝向向，也也可可称称为为核核小小体体定定位位（nucleosome positioning）。）。2）核小体的定位方

26、式：）核小体的定位方式：平移定位（平移定位（translational position）旋转定位（旋转定位（rotational posiyion）第46页，本讲稿共62页核小体平移定位核小体平移定位平移定位（平移定位（translational position）假定核小体与假定核小体与DNA的结合存在特的结合存在特异性，当移动异性，当移动10 bp 倍数的顺序时，缠绕核小体的序列将会改变位置，倍数的顺序时，缠绕核小体的序列将会改变位置，从而使核小体之间连接的顺序发生移位，但不改变从而使核小体之间连接的顺序发生移位，但不改变DNA顺序原有的顺序原有的朝向。朝向。移位可使下一轮暴露的连接移位

27、可使下一轮暴露的连接DNA顺序增加或减少。用微球菌顺序增加或减少。用微球菌核酸酶处理样品，可发现移位的顺序核酸酶处理样品，可发现移位的顺序.第47页，本讲稿共62页核小体旋转定位旋转定位（旋转定位（rotational position）缠绕在核小体上的缠绕在核小体上的DNA分子总是一面朝分子总是一面朝外，一面朝内。当移外，一面朝内。当移动缠绕在核小体上的动缠绕在核小体上的DNA时，若改变的顺时，若改变的顺序少于整圈螺旋碱基序少于整圈螺旋碱基对数（对数（10.2 bp），），原有的顺序朝向将原有的顺序朝向将发生变化。因朝外发生变化。因朝外一侧比朝内一侧更一侧比朝内一侧更易受到核酸酶的攻易受到核

28、酸酶的攻击，采用合适的酶击，采用合适的酶处理可检测到这种处理可检测到这种变化。变化。第48页，本讲稿共62页染色质重建与转录基因基因转录时要以编码基因转录时要以编码DNA为模板合成为模板合成mRNA前体前体,但但DNA分子缠绕在核小体上分子缠绕在核小体上,因此必需使因此必需使DNA离开核小体离开核小体.第49页，本讲稿共62页Pol IIIPol III基因转录时如何通过核小体基因转录时如何通过核小体基因转录时如何通过核小体基因转录时如何通过核小体实验实验1）一段长）一段长227 bp DNA正好缠绕一个核小体，并覆盖了一个正好缠绕一个核小体，并覆盖了一个 Hae限制酶位点。该限制酶位点。该D

29、NA有一段游离于核小体的顺序有一段游离于核小体的顺序 含有含有RNA多聚多聚III识别的核心启动子，使多聚酶在遇上核识别的核心启动子，使多聚酶在遇上核 小体前即可合成小体前即可合成RNA。2）如果转录时核小体离开模板）如果转录时核小体离开模板DNA，在加入限制酶，在加入限制酶HaeII 的样品反应液中将能检测到酶切产生的的样品反应液中将能检测到酶切产生的DNA片段。实验片段。实验 结果并未发现酶切结果并未发现酶切DNA片断。片断。3）将同位素标记的与核小体结合的）将同位素标记的与核小体结合的DNA与过量的与过量的DNA分子分子 混合，这些过量的混合，这些过量的DNA 分子与核小体上的分子与核小

30、体上的DNA相同，相同，只是呈游离状态。如果转录过程中有任何核小体与只是呈游离状态。如果转录过程中有任何核小体与DNA 分子脱离，那么当它们再与分子脱离，那么当它们再与DNA分子结合时有可能选择分子结合时有可能选择 未标记的未标记的DNA。实际结果是，这种情况并未发生。实际结果是，这种情况并未发生。结论：结论：Pol III基因转录时核小体从未离开基因转录时核小体从未离开DNA。第50页，本讲稿共62页Pol III基因转录时如何通过核小体基因转录时如何通过核小体第51页，本讲稿共62页Pol II转录时组蛋白的代换与重定位转录时组蛋白的代换与重定位Pol II在转录时会促使所通过的核小体组蛋

31、白在转录时会促使所通过的核小体组蛋白H2A的代换的代换,但核小体并不离开原来的位置但核小体并不离开原来的位置.第52页，本讲稿共62页核小体装配与表观遗传1)1)虽然有报道表明虽然有报道表明DNADNA复制时核小体也采取半保复制时核小体也采取半保 守装配守装配,但更多的实验证据支持核小体核心但更多的实验证据支持核小体核心8 8 聚体在聚体在DNADNA复制时是保守装配复制时是保守装配.2)2)由此产生一个问题由此产生一个问题,即染色质的表观遗传状即染色质的表观遗传状 态是如何传递的态是如何传递的.现在的证据倾向于现在的证据倾向于,染色质染色质 的表观遗传状态可以通过转录时的组蛋白二的表观遗传状

32、态可以通过转录时的组蛋白二 聚体正向的聚体正向的(开放开放)或反向的或反向的(关闭关闭)代换保持代换保持.3)Pol II3)Pol II基因在转录时可通过核小体基因在转录时可通过核小体,会破坏核会破坏核 小体的结构小体的结构,使使H2A-H2BH2A-H2B组蛋白丢失组蛋白丢失,但核小体并没但核小体并没有离开原来有离开原来DNADNA的位置的位置.此时会发生此时会发生H2AZH2AZ取代取代H2AH2A组蛋白事件组蛋白事件.第53页，本讲稿共62页染色质重建依赖于组蛋白的修饰1)核小体的修饰是染色质水平进行基因表核小体的修饰是染色质水平进行基因表达调控的中心环节达调控的中心环节.2)核小体修

33、饰的目的是促使核小体核心核小体修饰的目的是促使核小体核心8聚体与聚体与DNA分子的结合或者松弛或者强分子的结合或者松弛或者强化化,便于核小体移动或固定便于核小体移动或固定,使转录调控使转录调控因子结合或排斥因子结合或排斥.第54页，本讲稿共62页组蛋白的修饰目前已发现的组蛋白修饰目前已发现的组蛋白修饰:1)乙酰基化乙酰基化(可逆可逆)2)甲基化甲基化(不可逆不可逆)3)泛素化泛素化(可逆可逆)4)Sumoylation(可逆可逆)5)磷酸化磷酸化(可逆可逆)RNAi可介导组蛋白修饰可介导组蛋白修饰见见:Cell 116:259-272,2004(重重要参考文献要参考文献)第55页，本讲稿共62

34、页核小体第56页，本讲稿共62页核小体组蛋白空间分布第57页，本讲稿共62页组蛋白修饰乙酰基化和去乙酰基化第58页，本讲稿共62页组蛋白的修饰乙酰基化组蛋白乙酰基化是基因在染色质水平表达调控的主要方式之组蛋白乙酰基化是基因在染色质水平表达调控的主要方式之一一.组蛋白乙酰基化使其与组蛋白乙酰基化使其与DNA的结合松弛的结合松弛,利于核小体位移利于核小体位移.第59页，本讲稿共62页组蛋白甲基化组蛋白的甲基化是不可逆的组蛋白的甲基化是不可逆的,直接参与染色质的表观遗传直接参与染色质的表观遗传.甲甲基化主要出现在基化主要出现在lys位置位置,有抑制和激活两种不同的效应有抑制和激活两种不同的效应.第60页，本讲稿共62页10.4.4 非编码RNA与染色质结构的动态变化第61页，本讲稿共62页小结l1 表观遗传l 定义、现象、机制（位置效应、甲基化、染色质重建）l2 位置效应（LCR insulator paramutation）l3 DNA甲基化（甲基化与基因调控、甲基化与转座子沉默、基因组印记）l4 染色质重建与表观遗传第62页，本讲稿共62页