外文数据库PUBMED检索.ppt

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1、外文数据库PUBMED检索 PubMed数据库PubMed简介简介PubMed的检索规则的检索规则PubMed的检索方法的检索方法PubMed全文获取方式全文获取方式一、PubMed简介网址：网址：或或 www.pubmed.gov(com;org;net)世界最具权威性的医学文献数据库，世界最具权威性的医学文献数据库，由由NLM（美国国立医学图书馆）（美国国立医学图书馆）NCBI（美国国家生物技术信息中（美国国家生物技术信息中心）向因特网用户提供心）向因特网用户提供免费免费文献检文献检索服务索服务(自自1997-6-26起起)收录收录70余个国家余个国家5400多种生物医学多种生物医学期刊的

2、题录与文摘，其中收录中文期刊的题录与文摘，其中收录中文刊刊100余种，是世界上最权威的医学余种，是世界上最权威的医学数据库。数据库。现有现有1950年以来的年以来的2200多万篇文献多万篇文献的记录的记录(其中其中MEDLINE记录记录1700多多万条万条)目前每年增加目前每年增加60余万条文献记录余万条文献记录记录中记录中90%的文献为英文。的文献为英文。PubMed简介MEDLINE IndexedMEDLINE Indexed1966 to prensent1966 to prensent的的MEDLINEMEDLINE已标引数据，已标引数据，有有MeSHMeSH字段和摘要，每条记录标有

3、：字段和摘要，每条记录标有：PubMed-indexed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINEOldMEDLINE1949-19651949-1965年间的年间的MEDLINEMEDLINE数据，无数据，无MeSHMeSH字字段和摘要，每条记录标有：段和摘要，每条记录标有：PubMed-PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966OLDMEDLINE for Pre1966 PubMed收录数据MEDLINE InproceMEDLINE Inprocess最新的最新的MEDLINEMEDLINE处理中数据，未标引，无处

4、理中数据，未标引，无MeSHMeSH字段。每条记录标有：字段。每条记录标有：PubMed-in PubMed-in processprocess。Publisher-SuppliedPublisher-Supplied出版商提供的电子文献题录，每条记录标有出版商提供的电子文献题录，每条记录标有:PubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisher，分，分为两类：为两类：MEDLINE MEDLINE 收录，逐步转为收录，逐步转为In In ProcessProcess,IndexedIndexed状态。状态。Not MED

5、LINE Not MEDLINE：PubMed PubMed 收录，收录，MEDLINEMEDLINE不不收录，一直标注收录，一直标注PubMed-as supplied by PubMed-as supplied by publisherpublisher或或PubMedPubMedPubMed收录数据 PubMed数据类型（状态）PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文献按处理过程分4种类型（或状态）属于Medline收录范围，建立ti、au、ab等基本书目信息。（暂）不属于Medline收录范围，但也建立ti、au、ab等基本书目信息。赋予MeSH、PT等字段并被in

6、dex。PubMed主页主页初识初识 PubMed使用帮助使用帮助使用帮助使用帮助常用工具常用工具常用工具常用工具更多服务更多服务更多服务更多服务检索词输入框检索词输入框检索词输入框检索词输入框标题标题作者作者出处出处处理状态处理状态非英文的文献非英文的文献非英文的文献非英文的文献篇名上有中括篇名上有中括篇名上有中括篇名上有中括号号号号 且注明且注明且注明且注明有语种有语种有语种有语种英文文献英文文献英文文献英文文献土耳其语土耳其语土耳其语土耳其语 篇名篇名篇名篇名 布尔逻辑运算布尔逻辑运算截词检索截词检索强制检索强制检索字段检索字段检索二、二、PUBMED的检索规则的检索规则可输入可输入单词

7、单词、词组词组或或句子句子进行进行检索检索可用的逻辑运算符：可用的逻辑运算符：ANDAND、NOTNOT、OROR（必须大写）（必须大写）布尔逻辑运算顺序是从左至右，布尔逻辑运算顺序是从左至右，圆括号优先圆括号优先布尔逻辑运算截词检索截词检索v可使用截词符*，扩大检索范围，提高查全率。VaccinaVaccineVaccinesVaccinationvaccinatedVaccin*截词检索可以截词检索可以截词检索可以截词检索可以扩大检索范围扩大检索范围扩大检索范围扩大检索范围提高查全率。提高查全率。提高查全率。提高查全率。Vaccin*tiVaccin*ti强制检索强制检索 词组强制检索词组

8、强制检索(精确检索精确检索)用双引号，用双引号，例：例：“single cell,系统系统会将其作为一个不可分割的词组在会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。数据库的全部字段中进行检索。词组强制和截词检索时，系统的智词组强制和截词检索时，系统的智能词语匹配功能将不再被执行。例能词语匹配功能将不再被执行。例如：如：liver cancer将不映射到将不映射到 MeSH 词词 Liver Neoplasms强制检索强制检索强制检索强制检索普通检索普通检索普通检索普通检索single cellsingle cellsingle cellsingle cell字段限定检索字段限定检

9、索可在检索词后加可在检索词后加字段名字段名，进行，进行限定字段检索。如：查找作者为限定字段检索。如：查找作者为crick在在1993年发表的有关年发表的有关DNA方方面的文献面的文献.检索式：检索式：DNAmh AND crickau AND 1993dp字段限制检索字段限制检索字段限制检索字段限制检索其规则是：检其规则是：检其规则是：检其规则是：检索词索词索词索词+字段字段字段字段标识标识标识标识 DNAmh AND crickau AND 1993dpDNAmh AND crickau AND 1993dp缩写缩写全称全称缩缩写写全称全称ABAbstractLA LanguageADAff

10、iliation（机构）（机构）MHMeSHTermsAUAuthor（作者）（作者）PT PublicationTypeDPPublicationDateSO SourceCPPublicationcountryTAJournalTitle（刊（刊名）名）TITitleTITitle（篇名）（篇名）ISISSNTWTextWords常用字段常用字段（检索时大小写都可以检索时大小写都可以）三、PUBMED的检索方法基本检索基本检索主题检索主题检索高级检索高级检索（一）基本检索（一）基本检索检索某主题的文献检索某主题的文献检索某一作者发表的文献检索某一作者发表的文献检索发表在某期刊上的文献检索发

11、表在某期刊上的文献.在在检检索索框框中中键键入入一一个个或或多多个个英英文文单单词词（大大写写或或小小写写均均可可），点点击击GOGO按按钮钮。PubMedPubMed系系统统会会自自动动在在主主题题词词表表，期期刊刊刊刊名名表表，著著者者全全称称表表及及著著者者索索引引中中查查询询与与输输入入的的词词相相匹匹配配的的形形式式，这这就就是是它它特特有有的的“自自动动词词汇汇匹匹配配功功能能”。1.某一主题的检索某一主题的检索检索有关肿瘤检索有关肿瘤(cancer)的文献的文献cancerneoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAl

12、l Fields书写规则：书写规则：姓前名后姓前名后,姓用全称，名缩写。姓用全称，名缩写。考虑到作者姓名的不同形式，考虑到作者姓名的不同形式，PubMedPubMed采用自采用自动转换功能进行作者姓名检索，如：动转换功能进行作者姓名检索，如：smith jsmith j将将检索成检索成smith ja,smith jb,smith jr smith ja,smith jb,smith jr 等。等。精确检索：可以用双引号将作者名引起来，精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限定再加作者字段限定AUAU，如：，如：smith jausmith jau，实现精确查找。实现精确查找。2.

13、检索某一作者发表的文献检索某一作者发表的文献 作者姓名检索作者姓名检索作者姓名检索作者姓名检索按照姓按照姓按照姓按照姓(全写全写全写全写)+名名名名(缩写缩写缩写缩写)，之间不用标点之间不用标点之间不用标点之间不用标点键入作者姓名键入作者姓名键入作者姓名键入作者姓名smith jsmith j精确检索避免精确检索避免精确检索避免精确检索避免PubMedPubMed自动自动自动自动词汇转换。词汇转换。词汇转换。词汇转换。smith jausmith jau规则：全称或规则：全称或ISSN号或号或MEDLINE认可的标准缩写认可的标准缩写,ta 如：检索细胞生物分子期刊，在检索框中键入期刊如：检索

14、细胞生物分子期刊，在检索框中键入期刊名，名，molecular biology of the cellmolecular biology of the cell，系统会将它转换成，系统会将它转换成mol biol celljournalmol biol celljournal进行检索。或直接输入进行检索。或直接输入MedlineMedline的的期刊标准缩写形式（期刊标准缩写形式（mol biol cellmol biol cell），输入刊物的），输入刊物的ISSNISSN：1059-15241059-1524。如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：

15、cancercancer，science science，cellcell等，等，PubMedPubMed会首先将这些词转换成会首先将这些词转换成MeSHMeSH词表中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标词表中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即在杂志名后面加准化处理，即在杂志名后面加TATA。如：。如：“cell”ta“cell”ta 3.检索某一期刊上的文献检索某一期刊上的文献 mol biol cell期刊的一般检期刊的一般检期刊的一般检期刊的一般检索，是在检索索，是在检索索，是在检索索，是在检索输入框中键入输入框中键入输入框中键入输入框中键入期刊名或期刊期刊

16、名或期刊期刊名或期刊期刊名或期刊的的的的ISSNISSN号号号号期刊的标准检期刊的标准检期刊的标准检期刊的标准检索，是在期刊索，是在期刊索，是在期刊索，是在期刊名后面加字段名后面加字段名后面加字段名后面加字段限定限定限定限定TA.TA.比比比比如如如如:cellta:celltacelltacellta FilterFilter是一个条件限定，可以进行年龄组、是一个条件限定，可以进行年龄组、性别、人或动物、出版类型、时间、语言等性别、人或动物、出版类型、时间、语言等方面的选择，将检索的文献限定在一定范围方面的选择，将检索的文献限定在一定范围内。内。4.Filter 限定检索限定检索 文献年限文

17、献年限文献可获取性文献可获取性文献类型文献类型 研究对象类研究对象类型型 清除清除我不记得字段我不记得字段我想看看之我想看看之前的操作前的操作有高级检索呢有高级检索呢 （二）高级检索（advanced search)字段选择字段选择检索历史检索历史1 1、点击主页右下角的、点击主页右下角的MeSH DatabaseMeSH Database进入主题词检索界面；进入主题词检索界面；2 2、输入检索词后，点击、输入检索词后，点击gogo按钮，系统将显示与该词有关主按钮，系统将显示与该词有关主题词；题词；3 3、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树状结构、点击该主题词进一步显示该主题词的定义、树

18、状结构、组配的副主题词；组配的副主题词；4 4、选择合适的主题词与副主题词后，点击、选择合适的主题词与副主题词后，点击send tosend to按钮，进按钮，进入检索表达式浏览窗口；入检索表达式浏览窗口；5 5、点击、点击Search PubMedSearch PubMed将显示检索结果。将显示检索结果。（三）主题检索（Mesh Database)主题词主题词MeSH检索检索主题词数据库主题词数据库主题词数据库主题词数据库在在在在PubMedPubMed首首首首页导航栏的右页导航栏的右页导航栏的右页导航栏的右下角下角下角下角主题词数据库主题词数据库主题词数据库主题词数据库主题词主题词MeSH

19、检索检索输入普通词输入普通词输入普通词输入普通词查找对应主题词查找对应主题词查找对应主题词查找对应主题词主题词主题词MeSH检索检索一般一个主题一般一个主题一般一个主题一般一个主题词还要配合一词还要配合一词还要配合一词还要配合一个副主题词进个副主题词进个副主题词进个副主题词进行组合检索行组合检索行组合检索行组合检索选择副主题词选择副主题词选择副主题词选择副主题词选中副主题词选中副主题词选中副主题词选中副主题词添加到检索框中，添加到检索框中，添加到检索框中，添加到检索框中，查看检索式，检索查看检索式，检索查看检索式，检索查看检索式，检索比较主题词检索举例1、检索肾衰竭（Kidney Failur

20、e）治疗（therapy）方面的文献。2、缺血性心脏病（ischemic heart disease）引起心力衰竭（heart failure）老年人方面的带文摘的文献。通过通过通过通过PubMedPubMed检索出来的文献，部分通过浏检索出来的文献，部分通过浏检索出来的文献，部分通过浏检索出来的文献，部分通过浏览摘要即可，有的还需要查看全文，以作进一步览摘要即可，有的还需要查看全文，以作进一步览摘要即可，有的还需要查看全文，以作进一步览摘要即可，有的还需要查看全文，以作进一步的研究，全文的获取方法主要有：的研究，全文的获取方法主要有：的研究，全文的获取方法主要有：的研究，全文的获取方法主要有

21、：一：一：一：一：免费的全文免费的全文免费的全文免费的全文四、PUBMED全文获取PubMedPubMed收录收录收录收录的文献大约有的文献大约有的文献大约有的文献大约有5%5%是免费的是免费的是免费的是免费的可以直接打开可以直接打开可以直接打开可以直接打开全文全文全文全文免费全文免费全文免费全文免费全文点击打开全文点击打开全文点击打开全文点击打开全文PubMed全文获取全文获取打开打开打开打开PDFPDF全文全文全文全文免费的全文并免费的全文并免费的全文并免费的全文并不代表学术价不代表学术价不代表学术价不代表学术价值低，大部分值低，大部分值低，大部分值低，大部分的生命科学的的生命科学的的生命

22、科学的的生命科学的全文都是免费全文都是免费全文都是免费全文都是免费的的的的 二：二：二：二：学校已订购的全文学校已订购的全文学校已订购的全文学校已订购的全文 如果需要的文献，学校已订购了该文献所在如果需要的文献，学校已订购了该文献所在如果需要的文献，学校已订购了该文献所在如果需要的文献，学校已订购了该文献所在的全文数据库，可以直接打开或到相应的全文数的全文数据库，可以直接打开或到相应的全文数的全文数据库，可以直接打开或到相应的全文数的全文数据库，可以直接打开或到相应的全文数据库中查找。据库中查找。据库中查找。据库中查找。学校学校学校学校已订购已订购已订购已订购SpringerLinkSprin

23、gerLink和和和和EBSCOEBSCO等外等外等外等外文全文库，一文全文库，一文全文库，一文全文库，一般学校也有订般学校也有订般学校也有订般学校也有订购购购购学校学校已订购已订购学校未订购的学校未订购的学校未订购的学校未订购的全文，如果不全文，如果不全文，如果不全文，如果不是免费的，一是免费的，一是免费的，一是免费的，一般需要付费般需要付费般需要付费般需要付费学校未学校未学校未学校未订购订购订购订购三：三：三：三：济南泉方济南泉方济南泉方济南泉方PubMedPubMed文献服务系统文献服务系统文献服务系统文献服务系统 没有免费的全文以及学校未订购的全文，一没有免费的全文以及学校未订购的全文，一没有免费的全文以及学校未订购的全文，一没有免费的全文以及学校未订购的全文，一般需要付费才可以看到，这类文献可以通过基般需要付费才可以看到，这类文献可以通过基般需要付费才可以看到，这类文献可以通过基般需要付费才可以看到，这类文献可以通过基于馆际互借的济南泉方于馆际互借的济南泉方于馆际互借的济南泉方于馆际互借的济南泉方PubMedPubMed文献服务系统文献服务系统文献服务系统文献服务系统来获取来获取来获取来获取()()，但需要邮箱绑定。，但需要邮箱绑定。，但需要邮箱绑定。，但需要邮箱绑定。