酶化学2学习教程.pptx
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1、学习指导1、了解酶的化学本质和催化作用的特点,酶的组成和国际系统分类。2、掌握酶结构与功能之间的关系,掌握有关基本概念:必需基团、酶原激活的本质、活性中心、调节酶及静态酶的聚合和解聚;了解共价修饰的概念。3、掌酶促反应具有高效率和专一性的机理。4、掌握米氏方程、Km值的意义、求法及应用掌握有关理化因素对酶促反应速度的影响及有关的基本概念。5、理解酶活力单位的涵义,掌握酶活力的概念,了解测定酶活力的方法。第1页/共127页第一节概述一、酶的概念1、酶的概念酶是生物催化剂(1)所有的酶均由生物体产生,所有的生物体都产生酶(2)酶和生命活动密切相关几乎所有的生命活动或过程都有酶参加生物进化和组织分化
2、的基础酶催化的生物化学反应,称为酶促反应(酶催化的生物化学反应,称为酶促反应(Enzymatic reaction)。)。在酶的催化下发生化学变化的物质,称为底物(在酶的催化下发生化学变化的物质,称为底物(在酶的催化下发生化学变化的物质,称为底物(在酶的催化下发生化学变化的物质,称为底物(substratesubstrate)。)。)。)。第2页/共127页鸟嘌呤的分解代谢:鸟嘌呤脱氢酶鸟嘌呤黄嘌呤人、灵长类黄嘌呤氧化酶尿酸其他哺乳动物尿酸酶尿囊素硬骨鱼类尿囊素酶尿囊酸其他鱼类、两栖类尿囊酸酶尿素第3页/共127页 调节机构:酶的生成和反应活性是受到调节和控制的。A(A(E1E1)B()B(E
3、2E2)C()C(E3E3)D()D(E4E4)F)FF-F-反馈调节反馈调节E1-E1-限速酶限速酶第4页/共127页2、酶的化学本质大多数酶是蛋白质依据:某些某些RNARNA有催化活性有催化活性19821982年美国年美国T.CechT.Cech等人发现四膜虫的等人发现四膜虫的rRNArRNA前体能前体能在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发现在完全没有蛋白质的情况下进行自我加工,发现RNARNA有催化活性有催化活性 核酶(ribozyme)第5页/共127页二、酶的催化特性酶与一般催化剂比较酶与一般催化剂比较共性共性 (1 1)用量少而催化效率高:)用量少而催化效率高:(2 2)能加快
4、化学反应的速度,但不改变平衡点,反应前后)能加快化学反应的速度,但不改变平衡点,反应前后本身不发生变化;本身不发生变化;(3 3)降低反应所需的活化能)降低反应所需的活化能 第6页/共127页酶作为生物催化剂的特性 (1 1)高效率 以以摩摩尔尔为为单单位位进进行行比比较较,酶酶的的催催化化效效率率比比化化学学催催化化剂剂高高10107 710101313倍,比非催化反应高倍,比非催化反应高10108 810102020倍。倍。例例:2H2O22H2O+O2 反反反反 应应应应活化能活化能活化能活化能非催化反应非催化反应非催化反应非催化反应75.24kJ/mol75.24kJ/mol钯催化反应
5、钯催化反应钯催化反应钯催化反应48.9kJ/mol48.9kJ/molH H2 2OO2 2酶催化酶催化酶催化酶催化8.36kJ/mol8.36kJ/mol第7页/共127页(2 2)专一性即酶只能对特定的一种或一类底物起作用,这种专一性是由酶蛋白的立体结构所决定的。第8页/共127页(3 3)反应条件温和酶促反应一般在pH 5-8pH 5-8 水溶液中进行,反应温度范围为20-4020-40 C C。高温或其它苛刻的物理或化学条件,将引起酶的失活。(4 4)酶的催化活性是受到调节和控制的如酶浓度的调节、激素调节、反馈调节、抑制剂和激活剂的调节、别构调节、酶的共价修饰调节、酶原活化等。第9页/
6、共127页三、酶的组成及分类1、酶的组成蛋白质部分:酶蛋白蛋白质部分:酶蛋白 (apoenzyme)辅因子辅因子(cofactor)金属离子金属离子小分子有机化合物小分子有机化合物全酶全酶(holoenzyme)结合酶结合酶结合酶结合酶 (conjugated enzyme)(conjugated enzyme)n n单纯酶单纯酶单纯酶单纯酶 (simple enzyme)n结合酶结合酶 全酶=酶蛋白+辅因子(辅酶、辅基)第10页/共127页q*各部分在催化反应中的作用各部分在催化反应中的作用q酶蛋白酶蛋白决定酶作用的专一性决定酶作用的专一性q辅因子辅因子参与化学反应,决定酶促反应的类型参与化
7、学反应,决定酶促反应的类型第11页/共127页辅因子分类辅因子分类(按其(按其与酶蛋白结合的紧密程度与酶蛋白结合的紧密程度)辅酶辅酶(coenzyme):与酶蛋白结合与酶蛋白结合疏松,可用疏松,可用透析或超滤的透析或超滤的方法除去。方法除去。辅基辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合与酶蛋白结合紧密,不能用紧密,不能用透析或超透析或超滤的方法除去滤的方法除去。第12页/共127页酶的不同形式单体酶(monomeric enzyme)(monomeric enzyme):仅由单一肽链组成的具有完全催化活性的酶。寡聚酶(oligomeric enzyme)(oligomeric e
8、nzyme):由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。多酶体系(multienzyme system)(multienzyme system):由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。A(A(E1E1)B()B(E2E2)C()C(E3E3)D()D(E4E4)F)F第13页/共127页2、酶的命名与分的命名与分类(一一)习惯命名法命名法(二二)国国际系系统命名法命名法19611961年国际酶学委员会年国际酶学委员会(enzyme commissionenzyme commission)提出的酶的命名和分类方法。)提出的酶的命名和分类方法。系系统名名应包括;包括;底物(构型)底物(构型
9、)(酶作用的基作用的基团)、催化反、催化反应的的类型型不管酶催化正反应还是逆反应,都用同一名称。不管酶催化正反应还是逆反应,都用同一名称。习惯名称名称系系统名称名称谷丙谷丙转氨氨酶丙氨酸丙氨酸 :酮戊二酸戊二酸氨基氨基转移移酶乙醇脱乙醇脱氢酶 乙醇:乙醇:NAD+氧化氧化还原原酶第14页/共127页 (1 1)分类:6 6大类酶,氧化还原、转移、水解、裂合、异构、合成(2 2)编号:用4 4个阿拉伯数字的编号表示,数字中用“”隔开,前面冠以ECEC(为Enzyme Enzyme CommissionCommission)。EC EC 类.亚类.亚亚类.排号,如第15页/共127页第一个数字:6
10、大类,指明反应性质第二个数字:底物中被作用的基团或键的特点(亚类)第三个数字:参加反应的底物的性质,或酶促反应作用的某一具体化学键,更精确地表示底物的性质(亚亚类)第四个数字:该种酶的序号第16页/共127页第17页/共127页第18页/共127页(1)(1)氧化氧化-还原酶还原酶 OxidoreductaseOxidoreductase AH AH2 2 +B =A +BH +B =A +BH2 2乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶第19页/共127页AB +C =A +CB谷丙转氨酶(2)(2)转移酶 TransferaseTransferase第20页/共127页主要包括主要包括淀粉酶、蛋白酶、核酸酶
11、及脂酶淀粉酶、蛋白酶、核酸酶及脂酶等。等。A AB+B+HOHHOHA AOHOH +B +BH H如:脂酶如:脂酶(Lipase)(Lipase)(3)(3)水解酶水解酶 hydrolasehydrolase第21页/共127页催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双催化从底物分子中移去一个基团或原子形成双键的反应及其逆反应。键的反应及其逆反应。醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。醛缩酶、水化酶及脱氨酶等。AB =A +BAB =A +B如:延胡索酸水合酶如:延胡索酸水合酶(4)(4)裂合酶裂合酶 LyaseLyase第22页/共127页催化各种同分异构体的相互转化 A=B如:葡萄糖异构酶(5)(5)
12、异构酶异构酶 IsomeraseIsomerase第23页/共127页(连接酶)能够催化与ATPATP分解反应相偶联的由小分子合成大分子的反应。A+B+ATP+H-O-H A+B+ATP+H-O-H A A B+ADP+Pi B+ADP+Pi 丙酮酸羧化酶 ATP+ATP+丙酮酸 +COCO2 2 草酰乙酸+ADP+Pi+ADP+Pi(6)(6)合成酶 Ligase or SynthetaseLigase or Synthetase第24页/共127页酶的编号(乳酸脱氢酶为例)酶的编号(乳酸脱氢酶为例)EC 1.1.1.27第一大类,氧化还第一大类,氧化还原酶原酶 第一亚类,被氧化基第一亚类,
13、被氧化基团为团为 CHOH 第一亚亚类,氢第一亚亚类,氢受体为受体为 NAD+第25页/共127页第二节酶的结构与功能的关系一、酶的一级结构与催化功能的关系1、必需基团:与酶的催化活性直接相关概念:必需基团必需基团必需基团必需基团结合基团结合基团(binding group)与底物相结合与底物相结合与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalytic group)促进底物发生化学变化促进底物发生化学变化 第26页/共127页2、酶原激活酶原酶原酶原酶原 (zymogen)(zymogen)有些酶在细胞内合成或初分泌时只是有些酶在细胞内合成或初分泌时只是有些酶在细胞内合成或初分泌时只是有
14、些酶在细胞内合成或初分泌时只是酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。酶的无活性前体,此前体物质称为酶原。酶原的激活酶原的激活酶原的激活酶原的激活在一定条件下,酶原向有活性酶转化在一定条件下,酶原向有活性酶转化在一定条件下,酶原向有活性酶转化在一定条件下,酶原向有活性酶转化的过程。的过程。的过程。的过程。第27页/共127页赖赖缬缬天天天天天天天天甘甘异异赖赖缬缬天天天天天天天天缬缬组组丝丝S SS SS SS S464618183 3甘甘异异缬缬组组丝丝S SS SS SS S肠激酶肠激酶肠激酶肠激酶胰蛋白酶胰蛋白酶胰蛋白酶
15、胰蛋白酶活性中心活性中心活性中心活性中心胰蛋白酶原的激活过程胰蛋白酶原的激活过程胰蛋白酶原的激活过程胰蛋白酶原的激活过程第28页/共127页 酶原激活的机理酶原激活的机理酶酶 原原分子构象发生改变分子构象发生改变形成或暴露出酶的活性中心形成或暴露出酶的活性中心 一个或几个特定的肽键断裂,水解一个或几个特定的肽键断裂,水解掉一个或几个短肽掉一个或几个短肽在特定条件下在特定条件下第29页/共127页 酶原激活的生理意义酶原激活的生理意义避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化,并使酶避免细胞产生的酶对细胞进行自身消化,并使酶在特定的部位和环境中发挥作用,保证体内代谢正常在特定的部位和环境中发挥作用,保证
16、体内代谢正常进行。进行。有的酶原可以视为酶的储存形式。在需要时,酶有的酶原可以视为酶的储存形式。在需要时,酶原适时地转变成有活性的酶,发挥其催化作用。原适时地转变成有活性的酶,发挥其催化作用。酶原激活的本质第30页/共127页酶原激活原激活胰蛋白胰蛋白酶原原肠激激酶 六六肽胰蛋白胰蛋白酶弹性蛋白性蛋白酶原原胰凝乳蛋白胰凝乳蛋白酶原原胰凝乳蛋白胰凝乳蛋白酶弹性蛋白性蛋白酶羧肽酶原原羧肽酶第31页/共127页3、共价修饰寻找必需基团的有效方法共价修饰共价修饰(covalent modification)在在其其他他酶酶的的催催化化作作用用下下,某某些些酶酶蛋蛋白白肽肽链链上上的的一一些些基基团团可
17、可与与某某种种化化学学基基团团发发生生可可逆逆的的共共价价结结合合,从从而而改改变变酶的活性,此过程称为共价修饰。酶的活性,此过程称为共价修饰。酶分子中可以被共价修饰的基团:酶分子中可以被共价修饰的基团:酶分子中可以被共价修饰的基团:酶分子中可以被共价修饰的基团:巯基、羟基、咪唑基、氨基、羧基巯基、羟基、咪唑基、氨基、羧基巯基、羟基、咪唑基、氨基、羧基巯基、羟基、咪唑基、氨基、羧基第32页/共127页二、酶的活性与其高级结构的关系(1)活性中心的概念:或称活性部位)活性中心的概念:或称活性部位(active site)酶是蛋白质,是大分子化合物,在这样一个酶是蛋白质,是大分子化合物,在这样一个
18、大分子中只有一小部分是与底物结合,并与催化大分子中只有一小部分是与底物结合,并与催化作用直接有关,这个部位就是酶的活性中心。作用直接有关,这个部位就是酶的活性中心。1、活性中心(active center)第33页/共127页组成酶活性中心的氨基酸侧链基团主要有GluGlu和ASPASP的-COOH-COOH,LysLys的-NH-NH2 2,HisHis的咪唑基,SerSer的-OH-OH,CysCys的-SH-SH,TyrTyr的侧链基团。酶活性中心 结合部位:与底物结合的部分 (特异性决定部位)催化部位:促进底物发生化学变化的部分第34页/共127页活性中心内的必需基团活性中心内的必需基
19、团结合基团结合基团(binding group)与底物相结合与底物相结合与底物相结合与底物相结合催化基团催化基团(catalytic group)催化底物转变成产物催化底物转变成产物 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。的空间构象所必需。活性中心外的必需基团活性中心外的必需基团第35页/共127页底 物 活性中心以外的必需基团结合基团催化基团 活性中心 第36页/共127页(2)活性中心是由高级结构形成单纯酶:活性中心是酶分子在三维结构上比较靠近的少数几个氨基酸残基或是这些残基上的某些基团。结合酶:活性中心主要是辅因子,以及与其紧密偶联的蛋
20、白质的结构区域。对于寡聚酶则可能有聚合在一起的几个亚基上的几个相距远的氨基酸残基组成。(3)其他部位的作用为使催化基团和结合基团聚集起来,为酶活性中心的形成提供结构基础。酶的高级结构对保证其活力来说,比一级结构更重要。第37页/共127页2、二、三级结构与酶活性的关系牛胰核糖核酸酶折合实验3、聚合与解聚四级结构与酶活性的关系静态酶调节酶:限速酶、关键酶,静态酶:调节酶:聚合:活性态解聚:是否具有活性由解聚条件决定聚合:活性态解聚:非活性 大多数 (少数情况相反)第38页/共127页4、同工酶(1)同工酶的概念:(2)同工酶的结构和功能非活性中心部分不同,或所含亚基组合情况不同,与活性有关的结构
21、部分均相同。同工酶存在于同一种属,同一个体的同一组织或不同组织中。同工酶存在于同一种属,同一个体的同一组织或不同组织中。同工酶存在于同一种属,同一个体的同一组织或不同组织中。同工酶存在于同一种属,同一个体的同一组织或不同组织中。结构、组成不同。结构、组成不同。结构、组成不同。结构、组成不同。同工酶理化性质(分子量、溶解度、电泳形式)、免疫学同工酶理化性质(分子量、溶解度、电泳形式)、免疫学同工酶理化性质(分子量、溶解度、电泳形式)、免疫学同工酶理化性质(分子量、溶解度、电泳形式)、免疫学性质不同性质不同性质不同性质不同 同工酶多数为寡聚酶。同工酶多数为寡聚酶。同工酶多数为寡聚酶。同工酶多数为寡
22、聚酶。第39页/共127页*举例:举例:举例:举例:乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶乳酸脱氢酶(LDH(LDH1 1 LDHLDH5 5)第40页/共127页H HH HH HH HH HH HH H MMH HH HMMMMH HMMMMMMMMMMMMMMLDHLDH1 1 (H(H4 4)LDHLDH2 2(H(H3 3M)M)LDH LDH3 3(H(H2 2MM2 2)LDHLDH4 4(HM(HM3 3)LDHLDH5 5 (M(M4 4)乳酸脱氢酶的同工酶乳酸脱氢酶的同工酶第41页/共127页乳酸乳酸 丙酮酸丙酮酸 LDH5骨骼肌骨骼肌:乳酸乳酸 丙酮酸丙酮酸 心肌心肌:LDH1第
23、42页/共127页血清LDH同工酶酶谱的变化规律心脏疾病 LDH1LDH1及LDH2LDH2上升,LDH3LDH3及 LDH4LDH4下降。急性肝炎 LDH5LDH5明显升高,随病情好转 而逐渐恢复正常。慢性肝炎 一般处于正常范围,部分病例可见LDH5LDH5有所升高。肝硬变 LDH5,LDH1LDH5,LDH1和LDH3LDH3均升高。节首原发性肝癌原发性肝癌 LDHLDHLDHLDH3 3 3 3,LDH,LDH,LDH,LDH4 4 4 4,LDH,LDH,LDH,LDH5 5 5 5均上升,但均上升,但LDHLDHLDHLDH5 5 5 5LDHLDHLDHLDH4 4 4 4转移性肝
24、癌转移性肝癌 LDHLDHLDHLDH3 3 3 3,LDH,LDH,LDH,LDH4 4 4 4,LDH,LDH,LDH,LDH5 5 5 5均上升,但均上升,但LDHLDHLDHLDH4 4 4 4LDHLDHLDHLDH5 5 5 5第43页/共127页第三节酶催化反应的机制一、酶促反应的本质1、酶是催化剂酶与一般催化剂的共同点2 2、加速反应的本质、加速反应的本质降低活化能降低活化能化学反应过程化学反应过程 A+B AB C +D 反应物(初态)反应物(初态)中间产物(过渡态中间产物(过渡态)产物(终态)产物(终态)从反应物(初态)转化成中间产物(过渡态)需要从反应物(初态)转化成中间
25、产物(过渡态)需要的能量即活化能,活化能越大,反应越难进行。的能量即活化能,活化能越大,反应越难进行。n加速化学反应的方法:-向反应体系提供能量 -降低活化能第44页/共127页酶促反应活化能的改变反应总能量改变反应总能量改变酶促反应活化能酶促反应活化能非催化反应活化能非催化反应活化能 一般催化剂催一般催化剂催化反应的活化能化反应的活化能能能量量反反 应应 过过 程程底物底物产物产物第45页/共127页q酶促反应具有极高的效率酶酶的的催催化化效效率率通通常常比比非非催催化化反反应应高高1081020倍倍,比一般催化剂高比一般催化剂高1071013倍。倍。酶的催化不需要较高的反应温度。酶的催化不
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