第五章--蛋白质课件.ppt
《第五章--蛋白质课件.ppt》由会员分享,可在线阅读,更多相关《第五章--蛋白质课件.ppt(131页珍藏版)》请在淘文阁 - 分享文档赚钱的网站上搜索。
1、第五章第五章蛋白质(蛋白质(Protein)第一节第一节引言(引言(Introduction)n蛋白质是构成生物体的基本物质。蛋白质是构成生物体的基本物质。病病毒毒,细细菌菌,植植物物和和动动物物细细胞胞原原生生质质都都是是以蛋白质为基础的。以蛋白质为基础的。n酶是蛋白质酶是蛋白质已经发现数以千计的酶。已经发现数以千计的酶。n生生物物活活性性蛋蛋白白胰胰岛岛素素、生生长长激激素素、收收缩缩蛋蛋白、转移蛋白、白、转移蛋白、免疫蛋白、毒蛋白免疫蛋白、毒蛋白n蛋白质是由蛋白质是由20种氨基酸构成的聚合物。种氨基酸构成的聚合物。一、蛋白质的分类:一、蛋白质的分类:(一)根据组成分类根据组成分类 简简单
2、单蛋蛋白白质质(homoproteins)在在细细胞胞中中未未经经酶酶催催化改性的蛋白质。仅含有氨基酸。化改性的蛋白质。仅含有氨基酸。结结合合蛋蛋白白质质(conjugatedproteins)或或杂杂蛋蛋白白质质(heteroproteins)经经过过酶酶催催化化改改性性的的或或与与非非蛋蛋白白质质组组分复合的蛋白质。含有氨基酸和其它非蛋白质化合物。分复合的蛋白质。含有氨基酸和其它非蛋白质化合物。辅辅基基(prostheticproteins)结结合合蛋蛋白白中中的的非非蛋蛋白白质组分。质组分。(二)根据大体上的结构形式分类(二)根据大体上的结构形式分类球球蛋蛋白白(Globular Glo
3、bular proteinsproteins)以以球球状状或或椭椭圆圆状状存在的蛋白质,由多肽链自身折叠而成;存在的蛋白质,由多肽链自身折叠而成;纤纤维维状状蛋蛋白白(Fibrous Fibrous proteinsproteins)棒棒状状分分子子,含含有有相相互互缠缠绕绕的的线线状状多多肽肽链链(例例如如,原原肌肌球球蛋蛋白白、胶胶原原蛋蛋白白、角角蛋蛋白白和和弹弹性性蛋蛋白白)。纤纤维维状状蛋蛋白白也也能能由由小小的的球球状状蛋蛋白白经经线线性性聚聚集集而而成成,例例如如肌动蛋白和血纤维蛋白肌动蛋白和血纤维蛋白。大大多多数数酶酶是是球球状状蛋蛋白白,而而纤纤维维状状蛋蛋白白总总是是起着结
4、构蛋白的作用。起着结构蛋白的作用。二、蛋白质的生物功能二、蛋白质的生物功能酶酶结构蛋白结构蛋白收缩蛋白收缩蛋白(肌球蛋白、肌动蛋白、微管蛋白)(肌球蛋白、肌动蛋白、微管蛋白)激素激素(胰岛素、生长激素)(胰岛素、生长激素)传递蛋白传递蛋白(血清蛋白、铁传递蛋白、血红蛋白)(血清蛋白、铁传递蛋白、血红蛋白)抗体抗体(免疫球蛋白)(免疫球蛋白)储藏蛋白储藏蛋白(蛋清蛋白、种子蛋白)(蛋清蛋白、种子蛋白)储藏蛋白主要存在于蛋和植物种子中。储藏蛋白主要存在于蛋和植物种子中。保护蛋白保护蛋白(毒素和过敏素)。(毒素和过敏素)。食品蛋白质食品蛋白质易于消化易于消化无毒无毒富有营养富有营养显示功能特性显示功
5、能特性来源丰富来源丰富表表4-1常用食物的蛋白质含量常用食物的蛋白质含量食物食物蛋白质蛋白质食物食物蛋白质蛋白质食物食物蛋白质蛋白质(%)(%)(%)猪肉猪肉13.3-18.5鸡蛋鸡蛋13.4花生花生25.8牛肉牛肉15.8-21.5稻米稻米8.5大豆大豆39.0羊肉羊肉14.3-18.7小麦小麦12.4菠菜菠菜1.4鸡肉鸡肉21.5小米小米9.4油菜油菜1.4肝肝18-19玉米玉米8.6大白菜大白菜1.1脑脑7-9高梁高梁9.6白萝卜白萝卜0.6鲤鲤18.1小麦粉小麦粉11.0桔子桔子0.9牛乳牛乳3.5红薯红薯1.3苹果苹果0.2n组组成成蛋蛋白白质质的的氨氨基基酸酸除除了了脯脯氨氨酸酸和
6、和羟羟脯脯氨氨酸酸外外都都是是氨基酸氨基酸。n都是都是L-L-型的型的-氨基酸氨基酸。决定物化性质决定物化性质 按侧链基团的按侧链基团的极性极性可分为四类可分为四类1.非非极极性性氨氨基基酸酸或或疏疏水水性性氨氨基基酸酸。含含有有脂脂肪肪族族(AlaAla、IleIle、LeuLeu、MetMet、ProPro和和ValVal)和和芳芳香香族族侧侧链链的的氨氨基基酸酸(PhePhe,TrpTrp)是是疏水疏水的。的。2.不不带带电电荷荷的的极极性性氨氨基基酸酸,侧侧链链与与水水结结合合氢氢键键如如:SERSER,THRTHR,TYRTYR,CYSCYS,ASPASP,GLYGLY。3.在在pH
7、7时时(生生理理条条件件下下)带带正正电电荷荷的的极极性性氨氨基基酸酸(碱碱性性氨氨基酸),如基酸),如LYSLYS,ARGARG,HISHIS。4.在在pH7时时(生生理理条条件件下下)带带负负电电荷荷的的极极性性氨氨基基酸酸(酸酸性性氨氨基酸),基酸),如如ASPASP,GLUGLU。碱性和酸性氨基酸具有很强的亲水性。碱性和酸性氨基酸具有很强的亲水性。必需氨基酸必需氨基酸n有有些些氨氨基基酸酸,机机体体合合成成不不足足,必必需需从从食食物物或或饲饲料料中中供供给给,如如果果食食物物或或饲饲料料中中缺缺乏乏这这些些氨氨基基酸酸,就就会会影影响机体的正常生长和健康。响机体的正常生长和健康。n人
8、人体体必必需需氨氨基基酸酸有有LYSLYS,PHE,PHE,VAL,VAL,MET,MET,TRP,TRP,LEU,LEU,ILEILE及及THRTHR八八种种,此此外外,HISHIS对对于于婴婴儿儿的的营营养养也也是必需的是必需的。(二)氨基酸的立体化学(二)氨基酸的立体化学n除甘氨酸外都具有旋光性。除甘氨酸外都具有旋光性。n在在植植物物或或动动物物组组织织的的蛋蛋白白质质水水解解物物中中,仅仅发发现现型型异异构体。构体。ILE和和THR的的-碳原子也是不对称的,因碳原子也是不对称的,因此他们都有此他们都有4个对映体。个对映体。(三)氨基酸的酸碱性质:离子化(三)氨基酸的酸碱性质:离子化n在
9、在中中性性pHpH范范围围,-氨氨基基和和羧羧基基都都处处在在离离子子化化状状态态,此时是此时是偶极离子或两性离子偶极离子或两性离子。两性电解质。两性电解质。n偶极离子偶极离子以电中性状态存在时的以电中性状态存在时的pHpH被称为被称为等电点等电点(pIpI)。n当当COOCOO-和和COOHCOOH的浓度相等时的的浓度相等时的pHpH被称为被称为pKapKa1 1(即离解常数(即离解常数a a1 1的的负对数)。负对数)。n当当NHNH3 3+和和NHNH2 2浓度相等时的浓度相等时的pHpH被称为被称为pKapKa2 2。(四)氨基酸的疏水性(四)氨基酸的疏水性n蛋蛋白白质质在在水水中中的
10、的溶溶解解度度主主要要取取决决于于氨氨基基酸酸组组分分侧侧链链上上极极性性(带带电电或或不不带带电电)和和非非极极性性(疏疏水水)基基团的分布团的分布。n氨氨基基酸酸在在水水中中和和极极性性溶溶剂剂(例例如如乙乙醇醇)中中的的相相对对溶溶解解度度决决定定着着氨氨基基酸酸以以及及多多肽肽和和蛋蛋白白质质的的疏疏水水性性。如如果果不不考考虑虑活活度度系系数数,那那么么摩摩尔尔氨氨基基酸酸从从乙乙醇醇转转移移到到水水溶溶液液的的自自由由能能变变化化可可表表示示 氨氨基基酸酸的的疏疏水水性性。GGt t(E Et tWW)n具有大的正的具有大的正的Gt的的AA侧链侧链n疏水性强疏水性强n优先选择处在有
11、机优先选择处在有机相相n倾向于配置在蛋白倾向于配置在蛋白质分子的内部质分子的内部n具有负的具有负的Gt的的AA侧链侧链n亲水性的亲水性的n配置在蛋白质分子配置在蛋白质分子的表面的表面二、氨基酸的化学反应性二、氨基酸的化学反应性n存存在在于于游游离离氨氨基基酸酸和和蛋蛋白白质质分分子子中中的的反反应基团应基团 氨基、羧基、巯基、酚羟基、羟基、氨基、羧基、巯基、酚羟基、羟基、硫醚基(硫醚基(MetMet)、咪唑基和胍基)、咪唑基和胍基 与茚三酮反应与茚三酮反应n常用来定量游离氨基酸。常用来定量游离氨基酸。n1 1摩摩尔尔的的氨氨基基酸酸,产产生生1 1摩摩尔尔的的氨氨、醛醛、COCO2 2和和二二
12、氢氢化化茚茚亭亭。释释放放出出的的氨氨随随即即与与1 1摩摩尔尔茚茚三三酮酮和和1 1摩摩尔尔二二氢氢化化茚茚亭亭反反应应生生成成一一种种被被称称为为RuhemannRuhemanns s紫紫的的紫紫色色物物质质,后后者者在在570 570 nmnm显显示示最高吸收。最高吸收。n脯脯氨氨酸酸和和羟羟基基脯脯氨氨酸酸产产生生一一种种黄黄色色物物质质,它它在在440 440 nmnm显显示示最最高吸收。高吸收。与邻与邻-苯二甲醛反应苯二甲醛反应n当当存存在在2-2-巯巯基基乙乙醇醇时时氨氨基基酸酸与与邻邻-苯苯二二甲甲醛醛反反应应(1 1,2-2-苯苯二二甲甲醛醛)反反应应生生成成高高荧荧光光的的
13、衍衍生生物物,它它在在380 380 nmnm激激发发时时在在450 nm450 nm具有最高荧光发射。具有最高荧光发射。第三节第三节蛋白质的结构蛋白质的结构(一)一级结构一)一级结构n 一一级级结结构构 指指氨氨基基酸酸在在蛋蛋白白质质分分子子中中按按一一定定顺顺序序以以肽肽键键连连接形成多肽链接形成多肽链。n构成蛋白质的主要氨基酸有构成蛋白质的主要氨基酸有2020种。种。n蛋蛋白白质质的的一一一一级级级级结结结结构构构构(primary primary structurestructure)是是指指蛋蛋白白质质肽肽链链中中氨氨基基酸酸的的排排列列顺顺序序。而而蛋蛋白白质质的的化化学学结结构
14、构包包括括肽肽链链数数目目、端端基基组组成成、氨氨基基酸酸序序列列和和二二硫硫键键的的位位置置,又又称称共共价价结结构构。蛋蛋白白质质的的一一级级结结构构是是最最基基本本的的结结构构,它它决决定定着着蛋蛋白白质质高高级级结构。结构。一、蛋白质的结构水平一、蛋白质的结构水平CN键具有部分双键的性质键具有部分双键的性质CO键仅有键仅有60%的双键性质而的双键性质而CN键亦有键亦有40%的双键性质的双键性质.CN键不能旋转,这对蛋白质的的空间结构有很大影响。键不能旋转,这对蛋白质的的空间结构有很大影响。N-C和和C-C键键具具有有转转动动自自由由度度,分分别别被被定定义义为为和和两两面面角角,也称为
15、主链扭转角。也称为主链扭转角。理理论论上上和和具具有有360度度转转动动自自由由度度,但但实实际际转转动动自自由由度度由由于于C原子上侧链原子的立体位阻而被限制原子上侧链原子的立体位阻而被限制.多肽链主链基本上可被描述为通过多肽链主链基本上可被描述为通过C原子连结原子连结的一系列的一系列-C-CO-NH-C-平面平面 几几乎乎所所有有的的蛋蛋白白质质肽肽键键都都以以反反式式构构型型存存在在,在热力学上反式比顺式稳定在热力学上反式比顺式稳定(二)二级结构(二)二级结构蛋蛋白白质质的的二二级级结结构构多多肽肽链链的的某某些些部部分分的的氨氨基基酸酸残残基基周周期期性性的的(有有规规则则的的)空空间
16、间排排列列,即即沿沿着着肽肽链链轴轴所采取的特有的空间结构。所采取的特有的空间结构。1 1)肽肽链链中中的的酰酰胺胺平平面面绕绕C C相相继继旋旋转转一一定定角角度度形形成成-螺螺旋旋,并并盘盘绕绕前前进进。每每隔隔3.63.6个个氨氨基基酸酸残残基基,螺螺旋旋上上升升一一圈圈;每每圈圈间间距距0.54nm0.54nm,即即每每个个氨氨基基酸酸残残基基沿沿螺螺旋旋中中心心轴上升轴上升0.15nm0.15nm,旋转,旋转100100。-螺旋结构的主要特点:螺旋结构的主要特点:1.-螺旋(-helix)2 2)螺螺旋旋体体中中所所有有氨氨基基酸酸残残基基侧侧链链都都伸伸向外侧;向外侧;肽肽链链上上
17、所所有有的的肽肽键键都都参参与与氢氢键键的的形形成成,链链中中的的全全部部C=OC=O和和N-HN-H几几乎乎都都平平行行于于螺旋轴螺旋轴,氢键几乎平行于中心轴氢键几乎平行于中心轴;3 3)绝大多数天然蛋白质都是右手螺)绝大多数天然蛋白质都是右手螺旋。每个氨基酸残基的旋。每个氨基酸残基的N-HN-H都与前面都与前面第四个残基第四个残基C=OC=O形成氢键形成氢键。R为为Gly(甘氨酸)时,由于(甘氨酸)时,由于Ca上有上有2个氢,个氢,使使Ca-C、Ca-N的转动的自由度很大,即刚性的转动的自由度很大,即刚性很小,所以使螺旋的稳定性大大降低。很小,所以使螺旋的稳定性大大降低。-螺旋遇到螺旋遇到
18、Pro就会被中断而拐弯,因就会被中断而拐弯,因为脯氨酸是亚氨基酸。为脯氨酸是亚氨基酸。带相同电荷的氨基酸残基连续出现在肽带相同电荷的氨基酸残基连续出现在肽链上时,螺旋的稳定性降低。链上时,螺旋的稳定性降低。侧链在侧链在-螺旋结构中的作用:螺旋结构中的作用:2、-折叠(-pleatedsheet)-折折叠叠是是由由两两条条或或多多条条伸伸展展的的多多肽肽链链靠靠氢氢键键联联结结而成的锯齿状片状结构。而成的锯齿状片状结构。侧侧链链基基团团与与C C间间的的键键几几乎乎垂垂直直于于折折叠叠平平面面,R R基基团团交替地分布于片层平面两侧。交替地分布于片层平面两侧。-折叠分平行式和反平行式,后者更为稳
19、定折叠分平行式和反平行式,后者更为稳定。N N端在同一端。氨基酸端在同一端。氨基酸之间沿轴相距之间沿轴相距0.325nm0.325nmN N端不在同一端。氨基酸端不在同一端。氨基酸之间沿轴相距之间沿轴相距0.35nm0.35nm(a)平行式)平行式(b)反平行式)反平行式维持维持-折叠结构稳定性的折叠结构稳定性的力力 氢键氢键由一条链上的由一条链上的羰基和另一条链上的氨基之羰基和另一条链上的氨基之间形成,即氢键是在链与链间形成,即氢键是在链与链之间形成的。之间形成的。含含有有高高比比例例的的-折折叠叠片片结结构构的的蛋蛋白白质质一一般般呈呈现现高高变变性性温度。温度。当当-螺螺旋旋类类型型的的
20、蛋蛋白白质质溶溶液液经经加加热热和和冷冷却却时时,-螺螺旋旋结结构构通通常常转转变变成成-折折叠叠片片结结构构。-折折叠叠片片结结构构不不会转变成会转变成-螺旋结构。螺旋结构。3、-转角(-turn)也也称称-回回折折,存存在在于于球球状状蛋蛋白白中中。其其特特点点是是肽肽链链回回折折180180,使使得得氨氨基基酸酸残残基基的的C=OC=O和和与与第第四四个个残残基基的的N-HN-H形形成氢键。成氢键。-转角都在蛋白转角都在蛋白质分子的表面。质分子的表面。最常见于最常见于-旋转旋转结构中的氨基酸残结构中的氨基酸残基是基是AspAsp、CysCys、AsnAsn、GlyGly、TyrTyr和和
21、ProPro。4、无规则卷曲(non-regular coil)又又称称自自由由卷卷曲曲,是是指指没没有有一一定定规规律律的的松松散散肽肽链结构。酶的功能部位常常处于这种构象区域。链结构。酶的功能部位常常处于这种构象区域。无无规规卷卷曲曲常常出出现现在在a-a-螺螺旋旋与与a-a-螺螺旋旋、a-a-螺螺旋旋与与-折折叠叠、-折折叠叠与与-折折叠叠之之间间。它它是形成蛋白质三级结构所必需的是形成蛋白质三级结构所必需的。三三级级结结构构(tertiary structure):指指的的是是多多肽肽链链在在二二级级结结构构的的基基础础上上,主主链链构构象象和和侧侧链链构构象象相相互互作用,进一步盘曲
22、折叠形成球状分子结构。作用,进一步盘曲折叠形成球状分子结构。(三)三级结构(三)三级结构 具有三级结构的蛋白质分子含有多种二级结构具有三级结构的蛋白质分子含有多种二级结构单元。如具有三级结构的球状蛋白溶菌酶中含有单元。如具有三级结构的球状蛋白溶菌酶中含有 螺旋、螺旋、-折叠、折叠、-转角和无规卷曲四种二级结构转角和无规卷曲四种二级结构 溶菌酶的三级结构溶菌酶的三级结构溶菌酶的三级结构溶菌酶的三级结构 分子表面往往有一个内陷的空隙,它常常是蛋分子表面往往有一个内陷的空隙,它常常是蛋白质的活性中心白质的活性中心 大多数非极性侧链埋在分子内部,形成疏水核;大多数非极性侧链埋在分子内部,形成疏水核;而
23、极性侧链在分子表面,形成亲水面。而极性侧链在分子表面,形成亲水面。蛋白质的三级结构具有明显的折叠层次。蛋白质的三级结构具有明显的折叠层次。肌红蛋白由肌红蛋白由条多肽链和一个血红素(条多肽链和一个血红素(heme)辅)辅基构成,分子量为基构成,分子量为16700,含,含153个氨基酸残基。个氨基酸残基。抹香鲸肌红蛋抹香鲸肌红蛋抹香鲸肌红蛋抹香鲸肌红蛋白的三级结构白的三级结构白的三级结构白的三级结构 n三三级级结结构构的的形形成成包包括括在在蛋蛋白白质质中中各各种种不不同同的的基基团团之之间间相相互互作作用用(疏疏水水、静静电电和和范范德德华华力力)和和氢氢键键的的优优化化,使使得得蛋蛋白白质质分
24、分子子的的自自由由能能尽尽可可能能地地降降至至最低。最低。n一一级级结结构构决决定定着着蛋蛋白白质质分分子子的的形形状状。含含有有大大量量的的并并均均匀匀地地分分布布在在氨氨基基酸酸序序列列中中的的亲亲水水性性氨氨基基酸酸残残基基的的蛋蛋白白质质分分子子将将呈呈拉拉长长或或棒棒状状。含含有有大大量量的的疏疏水性氨基酸残基的蛋白质分子将呈球状水性氨基酸残基的蛋白质分子将呈球状。n大多数蛋白质由大多数蛋白质由1 1个以上的氨基酸残基构成。个以上的氨基酸残基构成。四级结构四级结构(quaternary structure):由两条):由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成、有或两条以上具有三级
25、结构的多肽链聚合而成、有特定三维结构的蛋白质构象。每条多肽链又称为特定三维结构的蛋白质构象。每条多肽链又称为亚基。亚基。四级结构是蛋白质亚基非共价结合的结果。稳四级结构是蛋白质亚基非共价结合的结果。稳定四级结构的键或力除了二硫键外和稳定三级结定四级结构的键或力除了二硫键外和稳定三级结构的是相同的。构的是相同的。血红蛋白由四条多肽链形成,是一种寡聚蛋血红蛋白由四条多肽链形成,是一种寡聚蛋白质。这四条链主要通过非共价键相互作用缔合白质。这四条链主要通过非共价键相互作用缔合在一起。血红蛋白分子上有四个氧的结合部位,在一起。血红蛋白分子上有四个氧的结合部位,因为每条链上含有一个血红素辅基。因为每条链上
- 配套讲稿:
如PPT文件的首页显示word图标,表示该PPT已包含配套word讲稿。双击word图标可打开word文档。
- 特殊限制:
部分文档作品中含有的国旗、国徽等图片,仅作为作品整体效果示例展示,禁止商用。设计者仅对作品中独创性部分享有著作权。
- 关 键 词:
- 第五 蛋白质 课件
限制150内