生物化学酶化学.pptx
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1、会计学1生物化学生物化学(shn w hu xu)酶化学酶化学第一页,共155页。研究历史1.1833年佩延(Payen)和Persoz从麦芽中抽提出(t ch)一种对热敏感的物质,这种物质能将淀粉水解成可溶性糖,被称为淀粉糖化酶(diastase)2.巴斯德提出(t ch)“酵素”一词,认为只有活的酵母细胞才能进行发酵。现在日本还经常使用“酵素”一词(ferment)。第1页/共155页第二页,共155页。n n3.1878年德国人库恩(Kuhne)提出“Enzyme”一词,意为“在酵母中”。n n4.1896年德国人巴克纳(Buchner)兄弟用石英砂磨碎酵母细胞,得到了能催化发酵的无细胞
2、滤液,证明发酵是一种化学反应(huxu fnyng),与细胞的活力无关。第2页/共155页第三页,共155页。n n5.1913年米凯利斯(Michaelis)和门顿(Menten)利用物理化学方法提出了酶促反应的动力学原理米氏学说,使酶学可以定量研究。n n6.1926年美国人J.B.Sumner从刀豆中结晶出脲酶(第一个酶结晶),并提出酶是蛋白质的观点。后来陆续得到多种酶的结晶,证明了这种观点,萨姆纳因而(yn r)获得1947年诺贝尔奖。第3页/共155页第四页,共155页。7.进入80年代后,核糖酶(ribozyme)、抗体酶、模拟酶等相继出现,酶的传统概念受到挑战。1982年Cech
3、等发现四膜虫26S rRNA前体具有自我剪接功能,并于1986年证明其内含子L-19 IVS具有多种催化功能。此后(c hu)陆续发现多种具有催化功能的RNA,底物也扩大到DNA、糖类、氨基酸酯。第4页/共155页第五页,共155页。第一节第一节第一节第一节 通论通论通论通论(tngln)(tngln)(General IntroductionGeneral Introduction)一一一一 酶是生物催化剂酶是生物催化剂酶是生物催化剂酶是生物催化剂1 1 酶的概念:酶是活细胞产生酶的概念:酶是活细胞产生酶的概念:酶是活细胞产生酶的概念:酶是活细胞产生(ch(ch nshng)nshng)的具
4、有催化作用的蛋白质。的具有催化作用的蛋白质。的具有催化作用的蛋白质。的具有催化作用的蛋白质。它具有高度的专一性、高效的催化性、活性的可调性和代谢性等催它具有高度的专一性、高效的催化性、活性的可调性和代谢性等催它具有高度的专一性、高效的催化性、活性的可调性和代谢性等催它具有高度的专一性、高效的催化性、活性的可调性和代谢性等催化特点。化特点。化特点。化特点。2 2 酶概念的提出及目前的内涵问题(酶概念的提出及目前的内涵问题(酶概念的提出及目前的内涵问题(酶概念的提出及目前的内涵问题(Enzyme/RibozymeEnzyme/Ribozyme)1982 1982年,年,年,年,CechCech首先
5、发现首先发现首先发现首先发现RNARNA也具有酶的催化活性,并提出核酶也具有酶的催化活性,并提出核酶也具有酶的催化活性,并提出核酶也具有酶的催化活性,并提出核酶(ribozymeribozyme)的概念。)的概念。)的概念。)的概念。1995 1995年年年年CuenoudCuenoud等发现等发现等发现等发现DNADNA也有酶的活性。也有酶的活性。也有酶的活性。也有酶的活性。3 3 酶是蛋白质的证据(酶的化学本质)酶是蛋白质的证据(酶的化学本质)酶是蛋白质的证据(酶的化学本质)酶是蛋白质的证据(酶的化学本质)遇热、两性、变性、胶体性质、蛋白酶降解、测序、合成遇热、两性、变性、胶体性质、蛋白酶
6、降解、测序、合成遇热、两性、变性、胶体性质、蛋白酶降解、测序、合成遇热、两性、变性、胶体性质、蛋白酶降解、测序、合成第5页/共155页第六页,共155页。二二二二 酶的催化特征酶的催化特征酶的催化特征酶的催化特征1 1 1 1 与一般催化剂的相同点与一般催化剂的相同点与一般催化剂的相同点与一般催化剂的相同点 反应前后不变;热力学上允许的反应;缩短到达平衡点的时间反应前后不变;热力学上允许的反应;缩短到达平衡点的时间反应前后不变;热力学上允许的反应;缩短到达平衡点的时间反应前后不变;热力学上允许的反应;缩短到达平衡点的时间;降低降低降低降低分子活化能。分子活化能。分子活化能。分子活化能。2 2
7、2 2 催化特征(与一般催化剂的相同点)催化特征(与一般催化剂的相同点)催化特征(与一般催化剂的相同点)催化特征(与一般催化剂的相同点)高效的催化性高效的催化性高效的催化性高效的催化性(108-1012/103)(108-1012/103)(108-1012/103)(108-1012/103);高度;高度;高度;高度(god)(god)(god)(god)的专一性;活性的可的专一性;活性的可的专一性;活性的可的专一性;活性的可调性;代谢性;对环境非常敏感。调性;代谢性;对环境非常敏感。调性;代谢性;对环境非常敏感。调性;代谢性;对环境非常敏感。3 3 3 3专一性特点专一性特点专一性特点专一
8、性特点 专一性:对底物的选择性要求。专一性:对底物的选择性要求。专一性:对底物的选择性要求。专一性:对底物的选择性要求。类型类型类型类型 结构专一(键专一、基团专一、底物专一)结构专一(键专一、基团专一、底物专一)结构专一(键专一、基团专一、底物专一)结构专一(键专一、基团专一、底物专一)立体异构的专一(几何异构;旋光异构)立体异构的专一(几何异构;旋光异构)立体异构的专一(几何异构;旋光异构)立体异构的专一(几何异构;旋光异构)第6页/共155页第七页,共155页。催化剂催化剂每摩尔需活化能每摩尔需活化能无无18 000J18 000J胶态钯胶态钯11 700J11 700J过氧化氢酶过氧化
9、氢酶2 000J2 000J过氧化氢分解过氧化氢分解(fnji)反应所需活化能反应所需活化能第7页/共155页第八页,共155页。锁钥(suyu)学说(Lock and key model)Fisher 首次首次(shu c)提出提出(1894,德国)德国)第8页/共155页第九页,共155页。三点(sn din)附着学说(Three point attachment theory)A.Ogster首次首次(shu c)提出提出第9页/共155页第十页,共155页。酶与底物酶与底物(d w)结合的诱导契合学说示意图结合的诱导契合学说示意图诱导诱导(yudo)契合学说契合学说(Induced f
10、it theory)Koshland 首次首次(shu c)提出(提出(1958)第10页/共155页第十一页,共155页。第二节第二节 酶的分类酶的分类(fn li)和命名和命名一一一一 酶的命名酶的命名酶的命名酶的命名-ase-ase-ase-aseECECECEC:Enzyme commissionEnzyme commissionEnzyme commissionEnzyme commission1 1 1 1 习惯名(习惯名(习惯名(习惯名(Recommended nameRecommended nameRecommended nameRecommended name)1961196
11、119611961年以前年以前年以前年以前 底物(淀粉酶);催化性质(脱氢酶);来源(胃蛋白酶)底物(淀粉酶);催化性质(脱氢酶);来源(胃蛋白酶)底物(淀粉酶);催化性质(脱氢酶);来源(胃蛋白酶)底物(淀粉酶);催化性质(脱氢酶);来源(胃蛋白酶)2 2 2 2 系统系统系统系统(xtng)(xtng)(xtng)(xtng)名(名(名(名(Systematic nameSystematic nameSystematic nameSystematic name)底物:底物底物:底物底物:底物底物:底物 性质性质性质性质 酶酶酶酶 例子:谷丙转氨酶例子:谷丙转氨酶例子:谷丙转氨酶例子:谷丙转
12、氨酶=L-=L-=L-=L-丙氨酸:丙氨酸:丙氨酸:丙氨酸:-同戊二酸氨基转移酶同戊二酸氨基转移酶同戊二酸氨基转移酶同戊二酸氨基转移酶 蛋白(:水)水解酶蛋白(:水)水解酶蛋白(:水)水解酶蛋白(:水)水解酶3 3 3 3 编号编号编号编号乳酸脱氢酶;乳酸:乳酸脱氢酶;乳酸:乳酸脱氢酶;乳酸:乳酸脱氢酶;乳酸:NAD+NAD+NAD+NAD+脱氢酶脱氢酶脱氢酶脱氢酶;EC;EC;EC;EC:1.1.1.271.1.1.271.1.1.271.1.1.27第11页/共155页第十二页,共155页。二二二二 酶的国际酶的国际酶的国际酶的国际(guj)(guj)系统分类法系统分类法系统分类法系统分类
13、法1 1 原则原则原则原则 大类大类大类大类-亚类亚类亚类亚类-亚亚类亚亚类亚亚类亚亚类-序号序号序号序号 第12页/共155页第十三页,共155页。分类按反应(fnyng)的类型(1)氧化还原酶(2)转移酶(3)水解酶(4)裂合酶(5)异构酶(6)合成酶按酶的结构(jigu)按酶的组成(z chn)单体酶寡聚酶多酶体系多酶融合(复合)体单纯酶结合酶第13页/共155页第十四页,共155页。1.氧化还原酶催化(cu hu)氧化还原反应,量最大的一类酶,具氧化、产能、解毒功能。通式:AH2+BBH2+A系统命名可分为19亚类,习惯上可分为4个亚类:(1)脱氢酶:受体为NAD或NADP,不需氧。(
14、2)氧化酶:以分子氧为受体,产物可为水或H2O2,常需黄素辅基。(3)过氧化物酶:以H2O2为受体,常以黄素、血红素为辅基。(4)氧合酶(加氧酶):催化(cu hu)氧原子掺入有机分子,又称羟化酶。按掺入氧原子个数可分为单加氧酶和双加氧酶。第14页/共155页第十五页,共155页。2.移换酶类 催化功能基团的转移反应(fnyng),也叫转移酶 通式:AR+BBR+A 按转移基团性质,可分为8个亚类,较重要(zhngyo)的有:(1)一碳基转移酶:转移一碳单位,与核酸、蛋白质甲基化有关(2)磷酸基转移酶:常称为激酶,多以ATP为供体。少数蛋白酶也称为激酶(如肠激酶)(3)糖苷转移酶:与多糖代谢密
15、切相关,如糖原磷酸化酶。(4)氨基转移酶:转移氨基,如AST ALT第15页/共155页第十六页,共155页。3、水解酶类 催化(cu hu)底物的水解反应,如蛋白酶、脂肪酶等。通式:AB+H2OAH+BOH 起降解作用,多位于胞外或溶酶体中。有些蛋白酶也称为激酶。可分为(fn wi)水解酯键、糖苷键、肽键、碳氮键等11亚类。第16页/共155页第十七页,共155页。n n4、裂合酶类n n 催化(cu hu)从底物上移去一个小分子而留下双键的反应或其逆反应。通式:ABA+Bn n包括醛缩酶、水化酶、脱羧酶等。共7个亚类。第17页/共155页第十八页,共155页。n n5、异构酶类n n 催化
16、同分异构(tn fn y u)体之间的相互转化。通式:AB 其中:A、B为同分异构(tn fn y u)n n包括消旋酶、异构酶、变位酶等。共6个亚类。第18页/共155页第十九页,共155页。6、合成酶类 催化(cu hu)由两种物质合成一种物质,必须与ATP分解相偶联。也叫连接酶,如DNA连接酶。通式:A+B+ATPAB+ADP+Pi 或 A+BAB+AMP+PPi共5个亚类。第19页/共155页第二十页,共155页。第20页/共155页第二十一页,共155页。第21页/共155页第二十二页,共155页。第22页/共155页第二十三页,共155页。第23页/共155页第二十四页,共155页
17、。归纳归纳(gun):氧:氧 转转 水水 裂裂 异异 合合第24页/共155页第二十五页,共155页。(二)按酶的结构分类1.单体酶 由一条肽链构成的酶称为单体酶2.寡聚酶:由多条肽链以非共价键结合而成的酶3.多酶体系:一些功能相关的酶组织在一起,形成一个(y)酶系4.多酶融合(复合)体:一条肽链上有多种酶活性,称为多酶复合体第25页/共155页第二十六页,共155页。(三)按化学组成单纯酶及结合酶单纯酶:完全(wnqun)由蛋白质(氨基酸)组成,无辅助因子。属简单蛋白质,如水解酶第26页/共155页第二十七页,共155页。结合酶:属结合蛋白,除蛋白质外,结合酶:属结合蛋白,除蛋白质外,还有非
18、蛋白部分还有非蛋白部分辅助因子:金属离子或有机小分子辅助因子:金属离子或有机小分子酶蛋白决定酶的专一性;辅助因子酶蛋白决定酶的专一性;辅助因子决定催化反决定催化反应性质和基团应性质和基团(j tun)电子等传递电子等传递第27页/共155页第二十八页,共155页。辅助因子分类辅助因子分类(按其与酶蛋白结合(按其与酶蛋白结合(jih)(jih)的紧密程度)的紧密程度)辅酶辅酶(f mi)(coenzyme):与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方与酶蛋白结合疏松,可用透析或超滤的方法除去。法除去。辅基辅基(prosthetic group):与酶蛋白结合与酶蛋白结合(jih)紧密,不能用透析或紧密
19、,不能用透析或超滤的方法除去。超滤的方法除去。第28页/共155页第二十九页,共155页。第三节第三节 酶催化作用的结酶催化作用的结构构(jigu)基础基础一一一一 酶分子结构的特征酶分子结构的特征酶分子结构的特征酶分子结构的特征(tzhng)(tzhng)1 1 酶的活性部位酶的活性部位酶的活性部位酶的活性部位 活性部位(中心):与底物结合并与酶的催化作用直接相活性部位(中心):与底物结合并与酶的催化作用直接相活性部位(中心):与底物结合并与酶的催化作用直接相活性部位(中心):与底物结合并与酶的催化作用直接相 关的部位称为酶的活性部位(中心)。关的部位称为酶的活性部位(中心)。关的部位称为酶
20、的活性部位(中心)。关的部位称为酶的活性部位(中心)。必需基团:利用化学修饰将其改变能破坏酶活性的相关基必需基团:利用化学修饰将其改变能破坏酶活性的相关基必需基团:利用化学修饰将其改变能破坏酶活性的相关基必需基团:利用化学修饰将其改变能破坏酶活性的相关基 团称为必需基团团称为必需基团团称为必需基团团称为必需基团第29页/共155页第三十页,共155页。酶分子结构酶分子结构(fn z ji u)特征特征酶蛋白酶蛋白酶蛋白酶蛋白(dn(dnbi)bi)非必需非必需(bx)基团基团必需基团必需基团活性中心活性中心活性中心活性中心以外基团以外基团结合基团结合基团催化基团催化基团第30页/共155页第三
21、十一页,共155页。酶活性中心的示意图第31页/共155页第三十二页,共155页。酶酶的的活活性性中中心心酶的活性中心酶的活性中心第32页/共155页第三十三页,共155页。活性中心的氨基酸按功能可分为:活性中心的氨基酸按功能可分为:结合部位:结合部位:负责识别特定的底物并与之结合。负责识别特定的底物并与之结合。它们它们(t men)(t men)决定了酶的底物专一决定了酶的底物专一性。性。第33页/共155页第三十四页,共155页。催化部位:催化部位:起催化作用起催化作用的,底物的的,底物的敏感键在此敏感键在此被切断被切断(qi dun)或形或形成新键,并成新键,并生成产物。生成产物。第34
22、页/共155页第三十五页,共155页。AspHisSer胰胰胰胰凝凝凝凝乳乳乳乳(n n n n r r)蛋蛋蛋蛋白白白白酶酶酶酶的的的的活活活活性性性性中中中中心心心心活性中心重要活性中心重要(zhngyo)基团基团:His57,Asp102,Ser195第35页/共155页第三十六页,共155页。3 活性中心的研究方法1.酶分子侧链基团修饰(xish)法(1)非共价特异修饰(xish)法:(2)特异性共价修饰(xish)法(3)亲和标记法第36页/共155页第三十七页,共155页。2.动力学参数(cnsh)测定方法3.X射线晶体结构分析法4.定点诱变法第37页/共155页第三十八页,共15
23、5页。二二二二 酶原及酶原的激活酶原及酶原的激活酶原及酶原的激活酶原及酶原的激活没有催化活性的酶的前体称为酶原(没有催化活性的酶的前体称为酶原(没有催化活性的酶的前体称为酶原(没有催化活性的酶的前体称为酶原(zymogenzymogen)。)。)。)。由酶原转变成具有由酶原转变成具有由酶原转变成具有由酶原转变成具有(jy(jy u)u)催化作用的酶的过程称为酶原的激活催化作用的酶的过程称为酶原的激活催化作用的酶的过程称为酶原的激活催化作用的酶的过程称为酶原的激活(activationactivation)。)。)。)。这是一个化学变化过程,实质是形成活性中心的过程。这是一个化学变化过程,实质是
24、形成活性中心的过程。这是一个化学变化过程,实质是形成活性中心的过程。这是一个化学变化过程,实质是形成活性中心的过程。第38页/共155页第三十九页,共155页。第四节第四节 酶催化作用机理酶催化作用机理(j l)一一一一 酶催化作用机理酶催化作用机理酶催化作用机理酶催化作用机理(j l(j l)降低分子的活化能。降低分子的活化能。降低分子的活化能。降低分子的活化能。有效碰撞有效碰撞有效碰撞有效碰撞-活化分子活化分子活化分子活化分子-活化能活化能活化能活化能 中间产物学说中间产物学说中间产物学说中间产物学说中间产物中间产物中间产物中间产物-过渡态过渡态过渡态过渡态 E+S=ES=EP P+S过渡
25、态过渡态第39页/共155页第四十页,共155页。中间产物(chnw)学说及活化能1903年Henri Wurtz提出第40页/共155页第四十一页,共155页。第41页/共155页第四十二页,共155页。如何降低活化能?高效催化的因素如何降低活化能?高效催化的因素邻近定位邻近定位(dngwi)效应效应张力与形变张力与形变一般酸碱催化一般酸碱催化共价催化共价催化金属离子催化金属离子催化第42页/共155页第四十三页,共155页。底物与酶的邻近效应及定向效应邻近效应:指酶与底物形成中间(zhngjin)复合物(ES)后,使催化基团与底物结合成同一个分子而使有效浓度得到极大的提高。定向效应:指酶的
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