二代测序技术在血液系统疾病中应用浅谈.ppt

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1、二代测序技术在血液系统疾病中应用浅谈Sequencing the Human GenomeYearprice2010199720081086422010:10K$,a few days?2007:4541M$,3 months2001:Celera100M$,3 years2001:Human Genome Project2.7G$,11 yearsTrends in Sequencing Technology2003Sanger2008:ABI SOLiD60K$,2 weeks2009:Illumina,Helicos40-50K$2012:5K$,24 hrs?2015:1K$,5%的病

2、例）的病例）NGS在AML中的应用22AML基基因因图图谱谱Blood.2016 January 7;127(1):2941.NGS在MDS中的应用738 例例 MDS,MDSMPN患者患者通过通过NGS检测了检测了111 个癌症相关基因，结果显示：个癌症相关基因，结果显示：78%的患者至少有的患者至少有1种致癌基因的突变种致癌基因的突变骨髓或外周血提取骨髓或外周血提取DNA没有系统差异没有系统差异致癌基因突变的总数越多，结果越差致癌基因突变的总数越多，结果越差髓系肿瘤突变图谱AML,MDS,MPN,MDS/MPNMatynia et al et al.2015.Archives of Pat

3、hology and Laboratory Medicine.总总生存率生存率复复发发率率Ivey et al.,N Engl J Med 2016;374:422-33MRD in Standard-Risk AML有MRD的患者预后差，复发率高Ivey et al.,N Engl J Med 2016;374:422-33MRD in Standard-Risk AML有MRD携带FLT3-ITD 的患者复发率高复复发发无 FLT3-ITD mutations复复发发有FLT3-ITD mutationsIvey et al.,N Engl J Med 2016;374:422-33MRD

4、 in Standard-Risk AML有有MRD携带携带DNMT3A的患者复发率低的患者复发率低复复发发without DNMT3A mutations复发with DNMT3A mutationsNGS在T-ALL中的应用 NGS（外显子测序，全基因组测序或转录组（外显子测序，全基因组测序或转录组测序）已经鉴定出测序）已经鉴定出T-ALL中突变的中突变的100多个多个基因。基因。只有两个基因只有两个基因NOTCH1和和CDKN2A/2B在超在超过过50的的T-ALL病例中突变，其余基因以病例中突变，其余基因以较低的频率突变较低的频率突变63个基因的靶向测序（个基因的靶向测序（TGS）相关

5、信号通路相关基因NOTCH信号通路NOTCH1、FBXW7NF-B信号通路MYD88、RIPK1、DDX3X、TRAF3、TRAF2、SAMHD1、BIRC3、BRAF、EGR2、IRF4、BCOR、BTK、NFKBIE、TNFAIP3、CD79B、ITPKB、CARD11、PLCG2Wnt信号通路MED12、FUBP1、MGA、MYCDNA损伤及细胞周期相关POT1、ATM、CHEK2、DYRK1A、BRCC3、TP53表观遗传学相关HIST1H1B、HIST1H1E、DDX3X、ZMYM3、CHD2、EZH2、KMT2C、KMT2D、BAZ2A、TET2、CREBBP、EP300、ASXL

6、1、IKZF3RNA和核糖体加工SF3B1、EWSR1、NXF1、XPO4、RPS15Others FAT1、FAT3、IGLL5、MTOR、CACNA1E、BCL6、PRDM1、BCL2、PIM1、KIT、KLHL6、CXCR4、PIK3CA、SOCS1NGS在CLL 临床诊疗中的应用不同的panel针对不同的需求IG/TCR产品名称检测方法ALL（10种）NGS检测AML-MDS-MPN（34基因）NGS检测MPN/MDS（25种）NGS检测髓系-large（58种）NGS检测AML（22种）NGS检测ABL激酶区NGS检测淋系-largeNGS检测血液肿瘤（42种）NGS检测PH-likeNGS检测噬血细胞综合征NGS检测易栓症NGS检测展展 望望 NGS正在为病理学和实验医学带来改革正在为病理学和实验医学带来改革 真正实现真正实现“个体化治疗个体化治疗”、“精准治疗精准治疗”有利于进行靶向治疗有利于进行靶向治疗 费用的快速降低，技术的持续提高费用的快速降低，技术的持续提高 仍面临的挑战仍面临的挑战 费用及医保报销政策费用及医保报销政策 数据分析数据分析 差异的干扰差异的干扰 其他检测方法的干扰（如其他检测方法的干扰（如 PCR）如今如今-基因组合（基因组合（panel）及单基因分析）及单基因分析 未来未来-常常规规全面的全基因全面的全基因组组分析分析谢谢观赏谢谢观赏