克隆基因的表达精选课件.ppt
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1、关于克隆基因的表达第一页,本课件共有57页第五章第五章 克隆基因的表达克隆基因的表达第一节第一节 基因表达的基本条件基因表达的基本条件第二节第二节 原核表达载体的构建原核表达载体的构建第三节第三节 克隆基因在植物细胞中的表达克隆基因在植物细胞中的表达第二页,本课件共有57页第一节第一节 基因表达的基本条件基因表达的基本条件1、基因表达的基本过程、基因表达的基本过程2、有效转录的基本条件、有效转录的基本条件3、正确翻译的基本条件、正确翻译的基本条件4、影响克隆基因表达效率的因素、影响克隆基因表达效率的因素第三页,本课件共有57页1、基因表达的基本过程、基因表达的基本过程第四页,本课件共有57页1
2、、基因表达的基本过程、基因表达的基本过程 基因的表达主要涉及到两个过程:转录和翻译。基因的表达主要涉及到两个过程:转录和翻译。首先,目的基因通过转录首先,目的基因通过转录(transcription)形成形成mRNA(信使(信使RNA,messenger RNA);然然后后,tRNA(转转运运RNA,transfer RNA)将将各各种种氨氨基基酸酸运运送送到到核核糖糖体体并并按按照照mRNA的的密密码码子子顺顺序序将将各各种种氨氨基基酸酸连连接接成成特特定定的的氨氨基基酸酸序序列列(translation)最最终终得得到到基基因因的的表表达达产产物物(蛋蛋白白质质)。第五页,本课件共有57页
3、第一节第一节 基因表达的基本条件基因表达的基本条件1、基因表达的基本过程、基因表达的基本过程2、有效转录的基本条件、有效转录的基本条件3、正确翻译的基本条件、正确翻译的基本条件4、影响克隆基因表达效率的因素、影响克隆基因表达效率的因素第六页,本课件共有57页Transcription(转录转录):making an RNA copy of a DNA sequence.RNA polymerase opens the part of the DNA to be transcribed.Only one strand of DNA(the template strand,antisense st
4、rand)is transcribed.转录的具体过程转录的具体过程第七页,本课件共有57页转录的具体过程转录的具体过程Antisense strand第八页,本课件共有57页有效转录的基本条件有效转录的基本条件Groups of genes coding for related proteins are arranged in units known as operons.An operon consists of an operator,promoter,regulator,and structural genes.The regulator gene codes for a repres
5、sor protein that binds to the operator,obstructing the promoter of the structural genes.The regulator does not have to be adjacent to other genes in the operon.If the repressor protein is removed,transcription may occur.半乳糖苷酶半乳糖苷酶渗透酶渗透酶转乙酰基酶转乙酰基酶第九页,本课件共有57页第十页,本课件共有57页Operons are either inducible o
6、r repressible according to the control mechanism.Seventy-five different operons controlling 250 structural genes have been identified for E.coli.Both repression and induction are examples of negative control since the repressor proteins turn off transcription.第十一页,本课件共有57页第十二页,本课件共有57页 启动子(启动子(promo
7、ter):在基因序列中,标志着转录起始的可被:在基因序列中,标志着转录起始的可被RNA聚合酶识别的位点聚合酶识别的位点(DNA区段区段),一般位于基因的上游。,一般位于基因的上游。终止子(终止子(terminator):位于基因的编码序列之外(一般在下游)的:位于基因的编码序列之外(一般在下游)的一段标志着转录停止的一段标志着转录停止的RNA聚合酶识别位点。聚合酶识别位点。有效转录的基本条件有效转录的基本条件Prokaryotic gene regulation differs from eukaryotic regulation,but since prokaryotes are much
8、easier to work with,we focus on prokaryotes at this point.Promoters are sequences of DNA that are the start signals for the transcription of mRNA.Terminators are the stop signals.mRNA molecules are long(500-10,000 nucleotides).第十三页,本课件共有57页第一节第一节 基因表达的基本条件基因表达的基本条件1、基因表达的基本过程、基因表达的基本过程2、有效转录的基本条件、有效
9、转录的基本条件3、正确翻译的基本条件、正确翻译的基本条件4、影响克隆基因表达效率的因素、影响克隆基因表达效率的因素第十四页,本课件共有57页The Genetic Code To code for the 20 essential amino acids a genetic code must consist of at least a 3-base set(triplet)of the 4 bases.If one considers the possibilities of arranging four things 3 at a time(4X4X4),we get 64 possibl
10、e code words,or codons(a 3-base sequence on the mRNA that codes for either a specific amino acid or a control word).The genetic code was broken by Marshall Nirenberg and Heinrich Matthaei,a decade after Watson and Cricks work.The genetic code consists of 61 amino-acid coding codons and three termina
11、tion codons,which stop the process of translation.The genetic code is thus redundant(degenerate in the sense of having multiple states amounting to the same thing),with,for example,glycine coded for by GGU,GGC,GGA,and GGG codons.正确翻译的基本条件正确翻译的基本条件第十五页,本课件共有57页The genetic code第十六页,本课件共有57页Messenger R
12、NA(mRNA)is the blueprint for construction of a protein.Transfer RNA(tRNA)is the truck delivering the proper amino acid to the site at the right time.tRNA will form a cloverleaf structure due to complementary base pairing.At the top of the large loop are three bases,the anticodon,which is the complem
13、ent of the codon.There are 61 different tRNAs,each having a different binding site for the amino acid and a different anticodon.第十七页,本课件共有57页Ribosomes are the organelle(in all cells)where proteins are synthesized.They consist of two-thirds rRNA and one-third protein.Ribosomes consist of a small(in E
14、.coli,30S)and larger(50S)subunits.The length of rRNAdiffers in each.The 30S unit has 16S rRNA and 21 different proteins.The 50S subunit consists of 5S and 23S rRNA and 34 different proteins.The smaller subunit has a binding site for the mRNA.The larger subunit has two binding sites for tRNA第十八页,本课件共
15、有57页Translation is the process of converting the mRNA codon sequences into an amino acid sequence.The initiator codon(AUG)codes for the amino acid N-formylmethionine(f-Met).No translation occurs without the AUG codon.f-Met is always the first amino acid in a polypeptide chain,although frequently it
16、is removed after translation.The intitator tRNA/mRNA/small ribosomal unit is called the initiation complex.The larger subunit attaches to the initiation complex.After the initiation phase the message gets longer during the elongation phase.第十九页,本课件共有57页New tRNAs bring their amino acids to the open b
17、inding site on the ribosome/mRNA complex,forming a peptide bond between the amino acids.The complex then shifts along the mRNA to the next triplet,opening the A site.The new tRNA enters at the A site.When the codon in the A site is a termination codon,a releasing factor binds to the site,stopping tr
18、anslation and releasing the ribosomal complex and mRNA.Often many ribosomes will read the same message,a structure known as a polysome forms.In this way a cell may rapidly make many proteins.第二十页,本课件共有57页正确翻译的基本条件正确翻译的基本条件1 1、具备起始密码子、具备起始密码子2 2、具备终止密码子、具备终止密码子3 3、具有正确的阅读框、具有正确的阅读框第二十一页,本课件共有57页基基因因表
19、表达达的的基基本本过过程程第二十二页,本课件共有57页第一节第一节 基因表达的基本条件基因表达的基本条件1、基因表达的基本过程、基因表达的基本过程2、有效转录的基本条件、有效转录的基本条件3、正确翻译的基本条件、正确翻译的基本条件4、影响克隆基因表达效率的因素、影响克隆基因表达效率的因素第二十三页,本课件共有57页4、影响克隆基因表达效率的因素、影响克隆基因表达效率的因素 一般而言,所用启动子的强度、一般而言,所用启动子的强度、DNA的转录其始序列、的转录其始序列、密码子的选择、密码子的选择、mRNA的二级结构、转录的终止、基因的拷贝的二级结构、转录的终止、基因的拷贝数等都会在一定程度上影响到
20、转基因的表达。数等都会在一定程度上影响到转基因的表达。a.启动子的结构对表达效率的影响启动子的结构对表达效率的影响 大多数大肠杆菌启动子都含有两种保守区大多数大肠杆菌启动子都含有两种保守区,即即-10区区(位于转位于转录其始位点上游录其始位点上游5-10bp,故称为,故称为-10区,序列为区,序列为5-TTGACA)和和-35区区(位于转录起始位点上游位于转录起始位点上游25bp处,一般有处,一般有10bp组成,故组成,故称为称为-35区,区,5-TATAAT)。当然,实际的启动子中很少具备与。当然,实际的启动子中很少具备与上述序列完全一致的区域,但是研究表明,启动子的这两个区上述序列完全一致
21、的区域,但是研究表明,启动子的这两个区域与上述保守序列的相似程度越高,该启动子的表达能力也就域与上述保守序列的相似程度越高,该启动子的表达能力也就越强。另外,这两个保守区间的距离也是影响启动子强度的重越强。另外,这两个保守区间的距离也是影响启动子强度的重要因素,即这个间距越是接近于要因素,即这个间距越是接近于17bp,启动子的活性就越强。,启动子的活性就越强。第二十四页,本课件共有57页b.翻译起始序列对表达效率的影响翻译起始序列对表达效率的影响 mRNA的有效翻译依赖于核糖体和其的稳定结合,的有效翻译依赖于核糖体和其的稳定结合,大肠杆菌的大肠杆菌的mRNA序列中,核糖体的结合位点是起始密码序
22、列中,核糖体的结合位点是起始密码子子AUG和其上游的和其上游的SD序列。所谓序列。所谓SD序列序列就是由就是由Shine-Dalgarno首先提出的一种位于位于起始密码子上游的一段首先提出的一种位于位于起始密码子上游的一段保守序列,为细菌核糖体有效结合和翻译起始所必需。一保守序列,为细菌核糖体有效结合和翻译起始所必需。一般般SD序列的长度约为序列的长度约为3-9bp,位于起始密码子上游,位于起始密码子上游3-11碱碱基的位置,它与基的位置,它与16S核糖体核糖体RNA的的3端互补,控制了翻译端互补,控制了翻译的起始。的起始。-AGGAGGUXXXAUG-AGGAGGUXXXAUG-mRNAAU
23、UCCUCCACUAG-AUUCCUCCACUAG-16S rRNA3 末端末端第二十五页,本课件共有57页c.启动子与克隆基因间的距离对基因表达的影响启动子与克隆基因间的距离对基因表达的影响 研究表明启动子和目的基因间的距离对基因的表达研究表明启动子和目的基因间的距离对基因的表达效率影响很大,所以在构建新的表达载体时要考虑到这仪效率影响很大,所以在构建新的表达载体时要考虑到这仪因素的影响。另外,在克隆基因的末端要就近插入有效的因素的影响。另外,在克隆基因的末端要就近插入有效的终止子序列,否则会导致细胞能量的大量消耗,或是形成终止子序列,否则会导致细胞能量的大量消耗,或是形成不应有的二级结构,
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