SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)测定蛋白质分子量.ppt
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1、 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)测定蛋白质分子量测定蛋白质分子量授课教师:周杰授课教师:周杰 一一.实验目的实验目的学学习习SDS-PAGESDS-PAGE测测定定蛋蛋白白质质分分子子量量的的原原理。理。掌握垂直板电泳的操作方法。掌握垂直板电泳的操作方法。运运用用SDS-PAGESDS-PAGE测测定定蛋蛋白白质质分分子子量量及及染染色鉴定。色鉴定。二二 .实验原理实验原理带带带带电电电电质质质质点点点点在在在在电电电电场场场场中中中中向向向向带带带带有有有有异异异异相相相相电电电电荷荷荷荷的的的的电电电电极极极极移移移移动动动动,这这这这种现象称为电泳种现象称为电泳
2、种现象称为电泳种现象称为电泳。电泳分类:移动界面电泳、区带电泳、稳态电泳。电泳分类:移动界面电泳、区带电泳、稳态电泳。电泳分类:移动界面电泳、区带电泳、稳态电泳。电泳分类:移动界面电泳、区带电泳、稳态电泳。区区区区带带带带电电电电泳泳泳泳是是是是在在在在半半半半固固固固相相相相或或或或胶胶胶胶状状状状介介介介质质质质上上上上加加加加一一一一个个个个点点点点或或或或一一一一薄薄薄薄层层层层样样样样品品品品溶溶溶溶液液液液,然然然然后后后后加加加加电电电电场场场场,分分分分子子子子在在在在支支支支持持持持介介介介质质质质上上上上或或或或支支支支持持持持介介介介质质质质中中中中迁迁迁迁移移移移。支支
3、支支持持持持介介介介质质质质的的的的作作作作用用用用主主主主要要要要是是是是为为为为了了了了防防防防止止止止机机机机械械械械干干干干扰扰扰扰和和和和由由由由于于于于温温温温度度度度变变变变化化化化以以以以及及及及大大大大分分分分子子子子溶溶溶溶液液液液的的的的高高高高密密密密度度度度而而而而产生的对流。产生的对流。产生的对流。产生的对流。区区区区带带带带电电电电泳泳泳泳使使使使用用用用不不不不同同同同的的的的支支支支持持持持介介介介质质质质,早早早早期期期期有有有有滤滤滤滤纸纸纸纸、玻玻玻玻璃璃璃璃珠珠珠珠、淀淀淀淀粉粉粉粉粒粒粒粒、纤纤纤纤维维维维素素素素粉粉粉粉、海海海海砂砂砂砂、海海海海
4、绵绵绵绵、聚聚聚聚氯氯氯氯乙乙乙乙烯烯烯烯树树树树脂脂脂脂;以以以以后后后后有有有有淀淀淀淀粉粉粉粉凝凝凝凝胶胶胶胶、琼琼琼琼脂脂脂脂凝凝凝凝胶胶胶胶、醋醋醋醋酸酸酸酸纤纤纤纤维维维维素素素素膜膜膜膜,现在则多用聚丙烯酰胺(现在则多用聚丙烯酰胺(现在则多用聚丙烯酰胺(现在则多用聚丙烯酰胺(PAGEPAGEPAGEPAGE)和琼脂糖凝胶。和琼脂糖凝胶。和琼脂糖凝胶。和琼脂糖凝胶。二二.实验原理实验原理PAGEPAGE根根据据其其有有无无浓浓缩缩效效应应,分分为为连连续续系系统统和和不不连连续续系系统统两两大大类类,连连续续系系统统电电泳泳体体系系中中缓缓冲冲液液pHpH值值及及凝凝胶胶浓浓度度相
5、相同同,带带电电颗颗粒粒在在电电场场作作用用下下,主主要要靠靠电电荷荷和和分分子子筛筛效效应应。不不连连续续系系统统中中由由于于缓缓冲冲液液离离子子成成分分,pHpH,凝凝胶胶浓浓度度及及电电位位梯梯度度的的不不连连续续性性,带带电电颗颗粒粒在在电电场场中中泳泳动动不不仅仅有有电电荷荷效效应应,分分子子筛筛效效应应,还还具具有有浓浓缩缩效效应应,因因而而其其分分离离条条带带清晰度及分辨率均较前者佳。清晰度及分辨率均较前者佳。二二.实验原理实验原理SDS-SDS-SDS-SDS-聚聚聚聚丙丙丙丙烯烯烯烯酰酰酰酰胺胺胺胺凝凝凝凝胶胶胶胶电电电电泳泳泳泳,是是是是在在在在聚聚聚聚丙丙丙丙烯烯烯烯酰酰
6、酰酰胺胺胺胺凝凝凝凝胶胶胶胶系系系系统统统统中中中中引引引引进进进进SDSSDSSDSSDS(十十十十二二二二烷烷烷烷基基基基磺磺磺磺酸酸酸酸钠钠钠钠),SDSSDSSDSSDS能能能能断断断断裂裂裂裂分分分分子子子子内内内内和和和和分分分分子子子子间间间间氢氢氢氢键键键键,破破破破坏坏坏坏蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质的的的的二二二二级级级级和和和和三三三三级级级级结结结结构构构构,强强强强还还还还原原原原剂剂剂剂能能能能使使使使半半半半胱胱胱胱氨氨氨氨酸酸酸酸之之之之间间间间的的的的二二二二硫硫硫硫键键键键断断断断裂裂裂裂,蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质在在在在一一一一定定定定浓浓浓浓度度度度的的的的
7、含含含含有有有有强强强强还还还还原原原原剂剂剂剂的的的的SDSSDSSDSSDS溶溶溶溶液液液液中中中中,与与与与SDSSDSSDSSDS分分分分子子子子按按按按比比比比例例例例结结结结合合合合,形形形形成成成成带带带带负负负负电电电电荷荷荷荷的的的的SDS-SDS-SDS-SDS-蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质复复复复合合合合物物物物,这这这这种种种种复复复复合合合合物物物物由由由由于于于于结结结结合合合合大大大大量量量量的的的的SDSSDSSDSSDS,使使使使蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质丧丧丧丧失失失失了了了了原原原原有有有有的的的的电电电电荷荷荷荷状状状状态态态态形形形形成成成成仅仅仅仅保保保保
8、持持持持原原原原有有有有分分分分子子子子大大大大小小小小为为为为特特特特征征征征的的的的负负负负离离离离子子子子团团团团块块块块,从从从从而而而而降降降降低低低低或或或或消消消消除除除除了了了了各各各各种种种种蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质分分分分子子子子之之之之间间间间天天天天然然然然的的的的电电电电荷荷荷荷差差差差异异异异,由由由由于于于于SDSSDSSDSSDS与与与与蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质的的的的结结结结合合合合是是是是按按按按重重重重量量量量成成成成比比比比例例例例的的的的,因因因因此此此此在在在在进进进进行行行行电电电电泳泳泳泳时时时时,蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质分分分分子子子子的的的的
9、迁迁迁迁移移移移速速速速度度度度取取取取决决决决于于于于分分分分子子子子大大大大小小小小。当当当当分分分分子子子子量量量量在在在在15151515KDKDKDKD到到到到200200200200KDKDKDKD之之之之间间间间时时时时,蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质的的的的迁迁迁迁移移移移率率率率和和和和分分分分子子子子量量量量的的的的对对对对数数数数呈呈呈呈线线线线性性性性关关关关系系系系,符符符符合合合合下下下下式式式式:logMWlogMWlogMWlogMW=K-=K-=K-=K-bXbXbXbX,式式式式中中中中:MWMWMWMW为为为为分分分分子子子子量量量量,X X X X为为为为迁迁
10、迁迁移移移移率率率率,k k k k、b b b b均均均均为为为为常常常常数数数数,若若若若将将将将已已已已知知知知分分分分子子子子量量量量的的的的标标标标准准准准蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质的的的的迁迁迁迁移移移移率率率率对对对对分分分分子子子子量量量量对对对对数数数数作作作作图图图图,可可可可获获获获得得得得一一一一条条条条标标标标准准准准曲曲曲曲线线线线,未未未未知知知知蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质在在在在相相相相同同同同条条条条件件件件下下下下进进进进行行行行电电电电泳泳泳泳,根根根根据据据据它它它它的的的的电电电电泳泳泳泳迁迁迁迁移移移移率率率率即即即即可可可可在在在在标标标标准准准准曲曲
11、曲曲线线线线上上上上求求求求得分子量。得分子量。得分子量。得分子量。二二.实验原理实验原理 SDSSDSSDSSDS电泳的成功关键之一是电泳过程中电泳的成功关键之一是电泳过程中电泳的成功关键之一是电泳过程中电泳的成功关键之一是电泳过程中,待别待别待别待别是样品制备过程中蛋白质与是样品制备过程中蛋白质与是样品制备过程中蛋白质与是样品制备过程中蛋白质与SDSSDSSDSSDS的结合程度。影的结合程度。影的结合程度。影的结合程度。影响它们结合的因素主要有三个:响它们结合的因素主要有三个:响它们结合的因素主要有三个:响它们结合的因素主要有三个:1)1)溶液中溶液中溶液中溶液中SDSSDSSDSSDS单
12、体的浓度,当单体浓度大于单体的浓度,当单体浓度大于单体的浓度,当单体浓度大于单体的浓度,当单体浓度大于1 1 1 1mmolmmolmmolmmol/L/L/L/L时大多数蛋白质与时大多数蛋白质与时大多数蛋白质与时大多数蛋白质与SDSSDSSDSSDS结合的重量比结合的重量比结合的重量比结合的重量比为为为为1:1:1:1:1.41.41.41.4,如果单休浓度降到如果单休浓度降到如果单休浓度降到如果单休浓度降到0.5 0.5 0.5 0.5 mmolmmolmmolmmol/L/L/L/L以下以下以下以下时,两者的结合比仅为时,两者的结合比仅为时,两者的结合比仅为时,两者的结合比仅为1:0.4
13、1:0.41:0.41:0.4这样就不能消除蛋这样就不能消除蛋这样就不能消除蛋这样就不能消除蛋白质原有的电荷差别,为保证蛋白质与白质原有的电荷差别,为保证蛋白质与白质原有的电荷差别,为保证蛋白质与白质原有的电荷差别,为保证蛋白质与SDSSDSSDSSDS的充的充的充的充分结合,它们的重量比应该为分结合,它们的重量比应该为分结合,它们的重量比应该为分结合,它们的重量比应该为1:41:41:41:4或或或或1:31:31:31:32)2)样品缓冲液的离子强度。样品缓冲液的离子强度。样品缓冲液的离子强度。样品缓冲液的离子强度。SDSSDSSDSSDS电泳的样品缓冲液电泳的样品缓冲液电泳的样品缓冲液电
14、泳的样品缓冲液离子强度较低,通常是离子强度较低,通常是离子强度较低,通常是离子强度较低,通常是10101010100100100100mmolmmolmmolmmol/L/L/L/L3)3)二二二二硫键是否完全被还原硫键是否完全被还原硫键是否完全被还原硫键是否完全被还原二二.实验原理实验原理采采采采用用用用SDS-SDS-SDS-SDS-聚聚聚聚丙丙丙丙烯烯烯烯酰酰酰酰胺胺胺胺凝凝凝凝胶胶胶胶电电电电泳泳泳泳法法法法测测测测蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质分分分分子子子子量量量量时时时时,只只只只有有有有完完完完全全全全打打打打开开开开二二二二硫硫硫硫键键键键,蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质分分分分子子子子
15、才才才才能能能能被被被被解解解解聚聚聚聚,SDSSDSSDSSDS才才才才能能能能定定定定量量量量地地地地结结结结合合合合到到到到亚亚亚亚基基基基上上上上而而而而给给给给出出出出相相相相对对对对迁迁迁迁移移移移率率率率和和和和分分分分子子子子量量量量对对对对数数数数的的的的线线线线性性性性关关关关系系系系。因因因因此此此此在在在在用用用用SDSSDSSDSSDS处处处处理理理理样样样样品品品品同同同同时时时时往往往往往往往往用用用用巯巯巯巯基基基基乙乙乙乙醇醇醇醇处处处处理理理理,巯巯巯巯基基基基乙乙乙乙醇醇醇醇是是是是一一一一种种种种强强强强还还还还原原原原剂剂剂剂,它它它它使使使使被被被被
16、还还还还原原原原的的的的二二二二硫硫硫硫键键键键不不不不易易易易再再再再氧氧氧氧化,从而使很多不溶性蛋白质溶解而与化,从而使很多不溶性蛋白质溶解而与化,从而使很多不溶性蛋白质溶解而与化,从而使很多不溶性蛋白质溶解而与SDSSDSSDSSDS定量结合。定量结合。定量结合。定量结合。有有有有许许许许多多多多蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质是是是是由由由由亚亚亚亚基基基基(如如如如血血血血红红红红蛋蛋蛋蛋白白白白)或或或或两两两两条条条条以以以以上上上上肽肽肽肽链链链链(如如如如胰胰胰胰凝凝凝凝乳乳乳乳蛋蛋蛋蛋白白白白酶酶酶酶)组组组组成成成成的的的的,它它它它们们们们在在在在SDSSDSSDSSDS和和和
17、和巯巯巯巯基基基基乙乙乙乙醇醇醇醇作作作作用用用用下下下下,解解解解离离离离成成成成亚亚亚亚基基基基或或或或单单单单条条条条肽肽肽肽链链链链,因因因因此此此此这这这这一一一一类类类类蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质,测测测测定定定定时时时时只是它们的亚基或单条肽链的只是它们的亚基或单条肽链的只是它们的亚基或单条肽链的只是它们的亚基或单条肽链的MWMWMWMW。已已已已发发发发现现现现有有有有些些些些蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质不不不不能能能能用用用用SDS-PAGESDS-PAGESDS-PAGESDS-PAGE测测测测定定定定分分分分子子子子量量量量。如如如如电电电电荷荷荷荷异异异异常常常常或或或或构构
18、构构象象象象异异异异常常常常的的的的蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质,带带带带有有有有较较较较大大大大辅辅辅辅基基基基的的的的蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质(某某某某些糖蛋白)以及一些结构蛋白,如胶原蛋白等。些糖蛋白)以及一些结构蛋白,如胶原蛋白等。些糖蛋白)以及一些结构蛋白,如胶原蛋白等。些糖蛋白)以及一些结构蛋白,如胶原蛋白等。二二.实验原理实验原理采采采采用用用用SDS-SDS-SDS-SDS-聚聚聚聚丙丙丙丙烯烯烯烯酰酰酰酰胺胺胺胺凝凝凝凝胶胶胶胶电电电电泳泳泳泳法法法法测测测测蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质分分分分子子子子量量量量时时时时,往往往往往往往往采采采采取取取取2 2 2 2种种种种以以以以上
19、上上上测测测测定定定定方方方方法法法法结结结结合合合合使使使使用用用用。目目目目前前前前其其其其他他他他常常常常用用用用测定相对分子量的方法有:测定相对分子量的方法有:测定相对分子量的方法有:测定相对分子量的方法有:聚聚聚聚丙丙丙丙烯烯烯烯酰酰酰酰胺胺胺胺梯梯梯梯度度度度凝凝凝凝胶胶胶胶电电电电泳泳泳泳法法法法测测测测定定定定蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质的的的的相相相相对对对对分分分分子子子子量量量量(有有有有浓浓浓浓缩缩缩缩样样样样品品品品特特特特点点点点,可可可可分分分分次次次次加加加加样样样样;不不不不需需需需解解解解离离离离亚亚亚亚基基基基,适适适适宜宜宜宜测测测测定定定定球球球球蛋蛋蛋蛋
20、白白白白,而而而而对对对对纤纤纤纤维维维维蛋蛋蛋蛋白白白白有有有有误误误误差差差差。电电电电泳泳泳泳需需需需2000200020002000伏特小时)伏特小时)伏特小时)伏特小时)凝凝凝凝胶胶胶胶层层层层析析析析法法法法测测测测定定定定蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质相相相相对对对对分分分分子子子子量量量量(特特特特点点点点方方方方法法法法简简简简单单单单,样样样样品品品品用用用用量量量量少少少少,而而而而且且且且有有有有时时时时不不不不需需需需纯纯纯纯物物物物质质质质,一一一一般般般般不不不不引引引引起起起起生生生生物物物物活活活活性性性性物物物物质质质质的的的的变变变变化化化化。局局局局限限限限性
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