真核基因表达系统精选课件.ppt
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1、关于真核基因表达系统第一页,本课件共有97页概述概述(introduction)真核基因结构及表达调控特点真核基因结构及表达调控特点(Features of eukaryotic gene structure and regulation)真核表达系统真核表达系统(eukaryotic gene expression system)酵母表达系统酵母表达系统(yeast expression system)哺乳动物细胞表达系统哺乳动物细胞表达系统(mammalian cell expression)昆虫细胞表达系统昆虫细胞表达系统(insect cell expression)内内 容容第二页,
2、本课件共有97页第一节第一节 概述概述一、真核基因组的复杂性一、真核基因组的复杂性二、原核表达系统的局限性二、原核表达系统的局限性三、真核表达系统的必要性及优势三、真核表达系统的必要性及优势第三页,本课件共有97页一、真核基因组的复杂性一、真核基因组的复杂性 1.真核基因组巨大真核基因组巨大 大肠杆菌基因组约4106bp,哺乳类基因组在109bp数量级 大肠杆菌约有4000个基因,人则约有10万个基因2.真核生物遗传信息复杂真核生物遗传信息复杂 原核生物的基因组基本上是单倍体,而真核基因组是二倍体 真核生物主要的遗传物质与组蛋白等构成染色质,被包裹在核膜内,核外还有遗传成分(如线粒体DNA等)
3、,这就增加了基因表达调控的层次和复杂性。第四页,本课件共有97页 细菌多数基因按功能相关成串排列,组成操纵子,共同开启或关闭,转录出多顺反子(polycistron)的mRNA;真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA,即mRNA是单顺反子(monocistron),基本上没有操纵子的结构。真核细胞的许多活性蛋白是由相同和不同的多肽形成的亚基构成的,这就涉及到多个基因协调表达的问题,真核生物基因协调表达要比原核生物复杂得多。3.真核生物基因协调表达真核生物基因协调表达第五页,本课件共有97页4.真核生物基因编码复杂真核生物基因编码复杂原核基因组的大部分序列都为基因编码,而核酸杂交等实验表明
4、:哺原核基因组的大部分序列都为基因编码,而核酸杂交等实验表明:哺乳类基因组中仅约乳类基因组中仅约10%10%的序列为蛋白质、的序列为蛋白质、rRNArRNA、tRNAtRNA等编码,其余约等编码,其余约90%90%的序列功能至今还不清楚。的序列功能至今还不清楚。原核生物的基因为蛋白质编码的序列绝大多数是连续的,而真核生物为原核生物的基因为蛋白质编码的序列绝大多数是连续的,而真核生物为蛋白质编码的基因绝大多数是不连续的,即有外显子蛋白质编码的基因绝大多数是不连续的,即有外显子(exon)(exon)和内含子和内含子(intron)(intron),转录后需经剪接,转录后需经剪接(splicing
5、)(splicing)去除内含子,才能翻译获得完整去除内含子,才能翻译获得完整的蛋白质,这就增加了基因表达调控的环节。的蛋白质,这就增加了基因表达调控的环节。原核基因组中除原核基因组中除rRNArRNA、tRNAtRNA基因有多个拷贝外,重复序列不多。哺乳基因有多个拷贝外,重复序列不多。哺乳动物基因组中则存在大量重复序列动物基因组中则存在大量重复序列(repetitive sequences)(repetitive sequences)。真核生物真核生物mRNA 5mRNA 5有帽状结构,有帽状结构,33末端有末端有PolyAPolyA尾巴尾巴 第六页,本课件共有97页1、没有转录后的剪接和加
6、工系统、没有转录后的剪接和加工系统 2、缺乏翻译后加工修饰系统:、缺乏翻译后加工修饰系统:不能进行糖基不能进行糖基化、磷酸化、甲基化的修饰,影响某些蛋白化、磷酸化、甲基化的修饰,影响某些蛋白的活性。的活性。二、二、原核表达系统的局限性原核表达系统的局限性第七页,本课件共有97页3、在原核细胞中表达的真核蛋白不稳定、在原核细胞中表达的真核蛋白不稳定 易被细菌蛋白酶降解易被细菌蛋白酶降解;难实现真正的分泌出胞,其产量很低难实现真正的分泌出胞,其产量很低;而且容易出现信号肽而且容易出现信号肽不被切割,或不在特异位置上切割。不被切割,或不在特异位置上切割。表达产物常以包涵体的形式存在,后期变性、复性的
7、效率低表达产物常以包涵体的形式存在,后期变性、复性的效率低4、内毒素的污染、内毒素的污染(contamination of endotoxin)第八页,本课件共有97页1.具转录后加工系统具转录后加工系统:2.具翻译后修饰系统具翻译后修饰系统3.可实现真正的分泌表达可实现真正的分泌表达三三、真核表达系统的必要性及优势、真核表达系统的必要性及优势 (advantages of eukaryotic expression system)第九页,本课件共有97页(一)真核基因表达调控特点(一)真核基因表达调控特点 -多层次、多方面多层次、多方面(二)真核基因表达的调控模式(二)真核基因表达的调控模式
8、第二节第二节 真核基因表达调控特点真核基因表达调控特点Features of Eukaryotic gene structure and expression第十页,本课件共有97页真核基因表达的调控模式真核基因表达的调控模式(The regulating model of eukaryotic gene expression)1、转录前水平、转录前水平(基因组水平基因组水平):gene level 2、转录水平调控、转录水平调控:transcription level3、转录后调控、转录后调控:post-transcription level4、翻译水平的调控、翻译水平的调控:transla
9、tion level5、翻译后修饰、翻译后修饰:post-translation modification 第十一页,本课件共有97页1、转录前水平、转录前水平(基因组水平基因组水平):gene level 基因结构的改变、稳定持久、不可逆,组蛋基因结构的改变、稳定持久、不可逆,组蛋白修饰,白修饰,DNA甲基化等甲基化等第十二页,本课件共有97页2.转录水平调控转录水平调控 顺式调控元件顺式调控元件(cis-acting element)反式作用因子反式作用因子(trans-acting factor)第十三页,本课件共有97页(1)顺式调控元件顺式调控元件(cis-acting elemen
10、t)结构基因周围能与特异转录因子结合而启动结构基因周围能与特异转录因子结合而启动 转录转录的的DNA序列,主要包括序列,主要包括:起正性调节作用:启动子、增强子起正性调节作用:启动子、增强子起负性调节作用:沉寂子,终止子,加尾信号起负性调节作用:沉寂子,终止子,加尾信号第十四页,本课件共有97页 启动子启动子 位于基因位于基因55末端与转录起始有关的核苷酸序列。作用特点是近距离作末端与转录起始有关的核苷酸序列。作用特点是近距离作用、具有方向性、空间位置较恒定。一般包括用、具有方向性、空间位置较恒定。一般包括核心启动子元件(核心启动子元件(core promoter elements)core
11、promoter elements):指指RNARNA聚合酶起始转录所必需的最小的聚合酶起始转录所必需的最小的DNADNA序列,决定基因转录的精确序列,决定基因转录的精确起始位点产生基础水平的转录,包括:转录起始点及起始位点产生基础水平的转录,包括:转录起始点及-30-30区的区的TATA-boxTATA-box上游启动子元件(上游启动子元件(upstream promoter elementsupstream promoter elements)包括包括-70-70到到-80bp-80bp区域的区域的CAATCAAT盒及其两侧的盒及其两侧的GCGC盒,协同决定转录的基础效率盒,协同决定转录的
12、基础效率组织特异性元件组织特异性元件诱导性启动子元件诱导性启动子元件第十五页,本课件共有97页真核启动子结构模式图真核启动子结构模式图核心启动子元件核心启动子元件上游启动子元件上游启动子元件第十六页,本课件共有97页 哺乳类哺乳类RNA聚合酶聚合酶启动子中常见的元件启动子中常见的元件元件名称元件名称共同序列共同序列结合的蛋白因子结合的蛋白因子名称名称 分子量分子量 结合结合DNA长度长度TATA boxTATAAAATBP 30,000 10bpGC box GGGCGGSP-1 105,000 20bpCAAT boxGGCCAATCTCTF/NF1 60,000 22bpOctamerAT
13、TTGCATOct-1 76,000 20bpOct-2 53,000 23bpk BGGGACTTTCCNFkB 44,000 10bpATFGTGACGTAFT?20bp第十七页,本课件共有97页 增强子增强子(enhancer)是一种能够提高转录效率的顺式调控元件是一种能够提高转录效率的顺式调控元件增增强强子子要要有有启启动动子子才才能能发发挥挥作作用用,但但增增强强子子对对启启动动子子没有严格的专一性没有严格的专一性 无方向性(序列、位置)无方向性(序列、位置)远距离作用(远距离作用(1-4kB)无基因特异性无基因特异性具组织特异性具组织特异性构建载体构建载体第十八页,本课件共有97页
14、沉寂子(沉寂子(silencer)silencer)或衰减子(或衰减子(dehancer)dehancer)是一类抑制基因转录的调控因子,作用方式 与增强子相同转录终止信号:转录终止信号:控制基因转录的终止,由polyA上游的10-20bp处的加尾信号(AATAA)和poly A下游的G/T簇构成 第十九页,本课件共有97页(2)反式作用因子)反式作用因子(trans-acting factor)由位于不同或相同染色体上相距较远的由位于不同或相同染色体上相距较远的基因所编码的蛋白质因子,通过与顺式调控基因所编码的蛋白质因子,通过与顺式调控元件和元件和RNA聚合酶的聚合酶的相互作用相互作用而调节
15、基因转而调节基因转录活性。录活性。第二十页,本课件共有97页转录信号转录信号1PTrans-acting factorTrans-acting factor(DNA结合蛋白)结合蛋白)Cis-acting factorA genemRNA of AProtein AB genemRNA of BProtein BDNA第二十一页,本课件共有97页3 3、转录后的修饰、转录后的修饰内含子的剪接内含子的剪接外显子的拼接外显子的拼接mRNAmRNA的加尾和加帽的加尾和加帽mRNAmRNA的稳定性的稳定性第二十二页,本课件共有97页 4 4、翻译水平的调控、翻译水平的调控 主要是主要是microRNA
16、microRNA对对mRNAmRNA、tRNA tRNA 和和rRNArRNA的的调控调控第二十三页,本课件共有97页5 5、翻译后的调控、翻译后的调控 切除信号肽切除信号肽 糖基化糖基化 乙酰化乙酰化 磷酸化磷酸化 甲基化甲基化 蛋白质的降解蛋白质的降解第二十四页,本课件共有97页第三节第三节 真核表达系统真核表达系统组成:组成:真核表达载体真核表达载体 受体细胞受体细胞第二十五页,本课件共有97页真核表达载体真核表达载体 适用于在真核细胞中表达外源基因的载体。适用于在真核细胞中表达外源基因的载体。真核载体根据受体不同,又可分为几种:真核载体根据受体不同,又可分为几种:酵母表达载体酵母表达载
17、体 哺乳动物细胞表达载体哺乳动物细胞表达载体昆虫杆状病毒表达载体昆虫杆状病毒表达载体第二十六页,本课件共有97页受体细胞受体细胞据受体细胞及表达载体的不同分为据受体细胞及表达载体的不同分为3 3种:种:酵母表达系统酵母表达系统哺乳动物细胞表达系统哺乳动物细胞表达系统昆虫细胞表达系统昆虫细胞表达系统第二十七页,本课件共有97页发酵简单、快速、便宜发酵简单、快速、便宜真核生物,有翻译后修饰功能真核生物,有翻译后修饰功能可分泌表达,简化了纯化工艺可分泌表达,简化了纯化工艺受体细胞安全受体细胞安全一、酵母表达系统一、酵母表达系统第二十八页,本课件共有97页(一)酵母载体(一)酵母载体:1 1、概念:、
18、概念:携带外源基因在酵母细胞中复制、扩增携带外源基因在酵母细胞中复制、扩增 和表达的载体,包括克隆载体和表达载体。和表达的载体,包括克隆载体和表达载体。2 2、组成元件、组成元件:遗传标记:遗传标记 调控序列调控序列第二十九页,本课件共有97页1 1)遗传标记:用于重组子的筛选和鉴定遗传标记:用于重组子的筛选和鉴定 营养标记基因:亮氨酸(营养标记基因:亮氨酸(LeuLeu)抗生素选择标记基因:抗生素选择标记基因:ZeocinZeocin第三十页,本课件共有97页 2)调控序列)调控序列ARS:酵母复制起始区:酵母复制起始区(点点)酵母启动子:常用的有酵母启动子:常用的有:PGK(磷酸甘油激酶磷
19、酸甘油激酶)GAP(3-磷酸甘油醛脱氢酶)磷酸甘油醛脱氢酶)ADH1(醇脱氢酶醇脱氢酶)SUC(蔗糖酶蔗糖酶)Apase(碱性磷酸酶碱性磷酸酶)酵母着丝粒区段酵母着丝粒区段(CEN):增加转化子稳定性:增加转化子稳定性第三十一页,本课件共有97页 3 3、类型、类型(types)(types)酵母克隆载体酵母克隆载体(yeast clone vector):不含酵母启动子,不能在酵母中表达不含酵母启动子,不能在酵母中表达外源基因,如外源基因,如YIPYIP、YRPYRP、YEPYEP 酵母表达载体酵母表达载体(yeast expression vector):酵母克隆载体酵母克隆载体+酵母启动
20、子酵母启动子,若引入信号若引入信号肽序列,则成为分泌型载体肽序列,则成为分泌型载体 酵母人工染色体(酵母人工染色体(yeast artificial chromosome,YAC)克隆大片段克隆大片段DNADNA,2M质粒质粒:酵母核质中的小的环状酵母核质中的小的环状DNA,可,可以独立复制并转录。以独立复制并转录。第三十二页,本课件共有97页(1)酵母克隆载体的构建)酵母克隆载体的构建酵母整合型质粒酵母整合型质粒(yeast integrated plasmid.Yip)(yeast integrated plasmid.Yip)细菌质粒细菌质粒DNA+DNA+酵母遗传标记,通过同源重组整合
21、入酵母染色体,转化酵母遗传标记,通过同源重组整合入酵母染色体,转化子稳定,但转化率极低子稳定,但转化率极低。酵母复制型质粒酵母复制型质粒(Yeast replicable plasmid,YRp)(Yeast replicable plasmid,YRp)细菌质粒细菌质粒DNA+DNA+酵母遗传标记酵母遗传标记(YIp)+(YIp)+酵母复制序列酵母复制序列(ARS(ARS),),可自可自主复制,但稳定性差主复制,但稳定性差酵母附加子型质粒酵母附加子型质粒,YEp,YEp :细菌质粒:细菌质粒DNA+DNA+酵母标记基因酵母标记基因(YIp)+(YIp)+酵酵母母2 2MM质粒质粒,游离于核外
22、存在并自主复制,游离于核外存在并自主复制第三十三页,本课件共有97页酵母复酵母复制序列制序列酵母酵母2M质粒质粒第三十四页,本课件共有97页(2)酵母表达载体)酵母表达载体特点特点:含酵母启动子:含酵母启动子 穿梭载体穿梭载体(shuttle vector):既可以携带外源既可以携带外源基因在原核细胞中复制,又可以使其在真核细胞基因在原核细胞中复制,又可以使其在真核细胞中表达的载体。中表达的载体。种类种类:啤酒酵母表达载体:啤酒酵母表达载体 毕赤酵母表达载体:毕赤酵母表达载体:分泌型表达载体分泌型表达载体 非分泌型表达非分泌型表达第三十五页,本课件共有97页啤酒酵母表达载体啤酒酵母表达载体第三
23、十六页,本课件共有97页毕赤酵母表达载体毕赤酵母表达载体-整合型整合型第三十七页,本课件共有97页(3)(3)酵母人工染色体(酵母人工染色体(yeast artificial yeast artificial chromosome,YAC)-chromosome,YAC)-克隆大片段克隆大片段DNADNA 由下列元件组成由下列元件组成 酵母染色体酵母染色体 2umDNA 2umDNA的复制起始区的复制起始区 着丝粒序列(着丝粒序列(CEN)CEN)四膜虫端粒四膜虫端粒DNA(TEL)DNA(TEL)第三十八页,本课件共有97页YAC:利用酵母的着丝粒区段(利用酵母的着丝粒区段(CEN)、自动复
24、制序列()、自动复制序列(ARS)及及四膜虫端粒四膜虫端粒DNA(TEL)DNA(TEL)构建的人工染色体构建的人工染色体结构:结构:左臂:左臂:TEL、选择标记、选择标记、ARS、CEN 右臂:右臂:TEL、选择标记、选择标记特点:容量大(特点:容量大(50-1000kb),稳定性差),稳定性差作用:构建基因组文库作用:构建基因组文库第三十九页,本课件共有97页第四十页,本课件共有97页 二)受体细胞二)受体细胞 1.1.啤酒酵母:啤酒酵母:较早使用,了解清楚较早使用,了解清楚 安全性高,被安全性高,被FDAFDA确认为安全生物确认为安全生物 表达量较低表达量较低 过量糖基化过量糖基化 转化
25、子不稳定,易发生质粒丢失转化子不稳定,易发生质粒丢失第四十一页,本课件共有97页2.毕赤酵母:毕赤酵母:新发展的酵母受体细胞新发展的酵母受体细胞高表达(高表达(12g/L)高稳定高稳定-载体为整合型载体为整合型高分泌(高分泌(10g/L)第四十二页,本课件共有97页三)三)转化转化 1.原生质体法:去除厚壁原生质体法:去除厚壁 2.电穿孔法:效率较高,整合型载体转化前要酶切线性化电穿孔法:效率较高,整合型载体转化前要酶切线性化3.LiCl法:做成感受态细胞法:做成感受态细胞第四十三页,本课件共有97页四)外源基因在酵母菌中的表达四)外源基因在酵母菌中的表达1 1、胞内表达:、胞内表达:直接表达
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