真核基因表达调控 (7)精选课件.ppt
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1、目目 录录关于真核基因表达调控(7)第一页,本课件共有75页目目 录录n1970年年,猿猿猴猴病病毒毒40(simian virus 40,SV40)的的生生命命周周期期被被确确定定为为早早、晚晚两两个个阶阶段段,使使它它们们成成为为基基因因表表达达调调控控的的典典型型模型。模型。n1975年年D.Pribonow发现发现T7启动子序列。启动子序列。n1982年年C.Benoist和和P.Chambon揭揭示示了了SV40的的早早期期启启动动子子序列。序列。n1983年年,W.S.Dynan和和R.Tjian分分离离、鉴鉴定定了了真真核核转转录录因因子子AP1。n1986年年,J.Clarke
2、和和Chambon两两个个实实验验室室同同时时报报告告了了SV40增增强子的多功能元件组成。强子的多功能元件组成。n1990年代,信号转导年代,信号转导-基因转录偶联机制成为热点课题基因转录偶联机制成为热点课题。第二页,本课件共有75页目目 录录第三页,本课件共有75页目目 录录第四页,本课件共有75页目目 录录第第 一一 节节真核基因表达调控的特征真核基因表达调控的特征Features of Eukaryotic Gene Regulation第五页,本课件共有75页目目 录录一、顺式作用元件是决定真核基因一、顺式作用元件是决定真核基因转录活性的关键因素之一转录活性的关键因素之一exon1i
3、ntron1exon nintron n上游上游下游下游转录起始点转录起始点增强子增强子沉默子沉默子启动子启动子TATA盒盒GC盒盒CAAT盒盒增强子增强子第六页,本课件共有75页目目 录录(一)(一)启动子是启动子是RNA聚合酶结合并启动聚合酶结合并启动 基因转录的特异基因转录的特异DNA序列序列 真真真真核核核核基基基基因因因因的的的的启启启启动动动动子子子子指指指指的的的的是是是是RNARNA聚聚合合酶酶(RNA RNA polymerasepolymerase,RNA Pol)识识识识别别别别、结结结结合合合合的的的的基基基基因因因因转转转转录录录录调调调调控控控控区区区区中中中中启启
4、启启动动动动基基基基因因因因转转转转录录录录的的的的一一一一段段段段特特特特异异异异DNADNA序序序序列列列列,包包包包含含含含一一一一组组组组转转转转录录录录调调调调控控控控功功功功能能能能组组组组件件件件,其其其其中中中中每每每每一一一一个个个个功功功功能能能能组组组组件件件件的的的的DNADNA序序列列约约720 bp720 bp。第七页,本课件共有75页目目 录录 TATA盒盒 CAAT盒盒 GC盒盒 增强子增强子 顺式作用元件顺式作用元件 结构基因结构基因-GCGC-CAAT-TATA转录起始转录起始真核生物启动子保守序列真核生物启动子保守序列第八页,本课件共有75页目目 录录1.
5、近起始点的近起始点的TATA盒盒/起始子及起始子及CpG岛岛 是真核生物启动子的核心序列是真核生物启动子的核心序列真真核核细细胞胞的的启启动动子子是是包包括括转转录录起起始始点点(transcription initiation site或或transcription start site)在在内内的的、有有通通用用转转录录因子及因子及RNA聚合酶组装、结合的一段聚合酶组装、结合的一段DNA序列。序列。典典型型的的启启动动子子核核心心序序列列(core sequences)是是在在转转录录起起始始位位点点上上游游2535 bp处处,有有一一保保守守的的TATA序序列列,被被称称为为TATA盒盒
6、(TATA box),真真核核细细胞胞的的TATA盒盒多多为为TATAAAA序序列列。TATA盒盒与与原原核核细细胞胞的的启启动动子子一一样样,对对RNA聚聚合合酶酶II的的转转录录起始位点起起始位点起定位定位作用。作用。第九页,本课件共有75页目目 录录n一一些些真真核核细细胞胞基基因因含含有有另另一一种种启启动动子子元元件件,称称为为起起始始子子(initiator,Inr),决定启动子的强度。决定启动子的强度。n起起始始子子共共有有序序列列为为:(5)Y-Y-A+1-N-T/A-Y-Y-Y(3);Y代代表表胞胞嘧嘧啶啶C或或胸胸腺腺嘧嘧啶啶T,N代代表表任意碱基,任意碱基,T/A代表代表
7、T或或A。第十页,本课件共有75页目目 录录n有有一一些些编编码码蛋蛋白白质质基基因因的的转转录录可可有有多多个个起起始始点点,可产生含不同可产生含不同5 末端的末端的mRNA。n它它们们不不含含TATA盒盒或或起起始始子子,多多在在起起始始位位点点上上游游约约100 bp内内含含有有20 50个个核核苷苷酸酸的的CG序序列列,被被称做称做CpG岛(岛(CpG island)。n这这些些基基因因大大多多为为低低转转录录基基因因,编编码码中中间间代代谢谢酶酶的管家基因。的管家基因。第十一页,本课件共有75页目目 录录 2.启动子中的上游元件协助真核基因调节启动子中的上游元件协助真核基因调节GC盒
8、盒(GC box)(GGGCGG)CAAT盒盒(CAAT box)(GCCAAT)n启动子上游元件(启动子上游元件(promoter-proximal elements,或或upstream promoter elements)是一些位于是一些位于TATA盒上游盒上游的的DNA序列,与调节蛋白结合,调节通用转录因子序列,与调节蛋白结合,调节通用转录因子与与TATA盒的结合、盒的结合、RNA聚合酶与启动子的结合,以聚合酶与启动子的结合,以及转录起始复合物的形成,从而决定基因的转录效率及转录起始复合物的形成,从而决定基因的转录效率与专一性。与专一性。n常见的序列是:常见的序列是:第十二页,本课件共
9、有75页目目 录录(二)增强子决定基因的时空特异性表达二)增强子决定基因的时空特异性表达增强子(增强子(enhancer)是是能能够够结结合合特特异异基基因因调调节节蛋蛋白白,促促进进邻邻近近或或远远隔隔特特定定基基因因表表达达的的DNA序序列列;在在酵酵母母中中,被被称称为为上上游游活活化序列(化序列(upstream activator sequences,UASs)。n增强子的作用通常与其所处的位置和方向无关。增强子的作用通常与其所处的位置和方向无关。第十三页,本课件共有75页目目 录录n增增强强子子距距转转录录起起始始位位点点的的距距离离变变化化很很大大,从从100 nt到到50,00
10、0nt,甚至更大。但总是作用于最近的启动子。,甚至更大。但总是作用于最近的启动子。n增强子所处位置增强子所处位置n在在所所调调控控基基因因的的上上游游或或下下游游,但但主主要要位位于于上上游游。下下游游内内含含子子当当中中,乃乃至至下下游游最最后后外外显显子子以以外外的的序序列列也也可可含含有增强子。有增强子。很多哺乳动物基因受一个以上的增强子调控。很多哺乳动物基因受一个以上的增强子调控。第十四页,本课件共有75页目目 录录(三)沉默子阻遏基因转录(三)沉默子阻遏基因转录沉默子沉默子沉默子沉默子(silencer)(silencer)是指某些真核基因转录调控区中抑是指某些真核基因转录调控区中抑
11、是指某些真核基因转录调控区中抑是指某些真核基因转录调控区中抑制或阻遏基因转录的一段(数百制或阻遏基因转录的一段(数百制或阻遏基因转录的一段(数百制或阻遏基因转录的一段(数百bpbp)DNADNA序列。沉默序序列。沉默序序列。沉默序序列。沉默序列促进局部列促进局部列促进局部列促进局部DNADNA的染色质形成致密结构,从而阻止转录的染色质形成致密结构,从而阻止转录的染色质形成致密结构,从而阻止转录的染色质形成致密结构,从而阻止转录激活因子结合激活因子结合激活因子结合激活因子结合DNADNA,是基因转录的负性调节因素。,是基因转录的负性调节因素。,是基因转录的负性调节因素。,是基因转录的负性调节因素
12、。第十五页,本课件共有75页目目 录录二、反式作用因子和顺式作用蛋白二、反式作用因子和顺式作用蛋白 是真核基因的转录调节蛋白是真核基因的转录调节蛋白n n在在在在真真真真核核核核细细细细胞胞胞胞核核核核中中中中,有有有有许许许许多多多多蛋蛋蛋蛋白白白白质质质质能能能能够够够够帮帮帮帮助助助助RNARNA聚聚聚聚合合合合酶酶酶酶 转转转转 录录录录RNARNA。这这这这 类类类类 蛋蛋蛋蛋 白白白白 质质质质 统统统统 称称称称转转转转 录录录录 因因因因 子子子子(transcription transcription factorsfactors,TFTF)或或或或转转转转 录录录录 调调调
13、调 节节节节 蛋蛋蛋蛋 白白白白(transcription regulatory proteintranscription regulatory protein)。)。n n以以以以反反反反式式式式作作作作用用用用方方方方式式式式调调调调节节节节基基基基因因因因转转转转录录录录的的的的转转转转录录录录因因因因子子子子称称称称为为为为反反反反式式式式作作作作用用用用因因因因子子子子(trans-acting trans-acting factorfactor),以以以以顺顺顺顺式式式式作作作作用用用用方方方方式式式式调调调调节节节节基基基基因因因因转转转转录录录录的的的的转转转转录录录录因因因
14、因子子子子称称称称为为为为顺顺式式作作用用蛋蛋白白(cis-acting cis-acting proteinprotein)。第十六页,本课件共有75页目目 录录cDNAaDNA反式调节反式调节C顺式调节顺式调节 mRNA C蛋白质蛋白质CBA mRNA蛋白质蛋白质AA第十七页,本课件共有75页目目 录录(一)(一)Pol转录需要基本转录因子和特异转录需要基本转录因子和特异 转录因子转录因子*基本转录因子基本转录因子(general transcription factors)是是RNA聚聚合合酶酶结结合合启启动动子子所所必必需需的的一一组组蛋蛋白白因因子子,决决定定三三种种RNA(mRNA
15、、tRNA及及rRNA)转转录录的类别。的类别。第十八页,本课件共有75页目目 录录*特异转录因子特异转录因子(special transcription factors)为为个个别别基基因因转转录录所所必必需需,决决定定该该基基因因的的时时间、空间特异性表达。间、空间特异性表达。转录激活因子转录激活因子转录抑制因子转录抑制因子第十九页,本课件共有75页目目 录录 转录调节因子结构转录调节因子结构DNA结合域结合域转录激活域转录激活域TF蛋白质蛋白质-蛋白质结合域蛋白质结合域(二聚化结构域)(二聚化结构域)谷氨酰胺富含域谷氨酰胺富含域酸性激活域酸性激活域脯氨酸富含域脯氨酸富含域第二十页,本课件
16、共有75页目目 录录(二)转录因子含有不同的(二)转录因子含有不同的DNA结合域结合域n n螺旋螺旋-转角转角转角转角-螺旋螺旋螺旋螺旋是转录因子中的常见的是转录因子中的常见的是转录因子中的常见的是转录因子中的常见的DNA结合域结合域结合域结合域 n n同源异型域结构同源异型域结构同源异型域结构同源异型域结构与与与与HTHHTH结构域类似结构域类似 n n锌指结构锌指结构锌指结构锌指结构是一类含锌离子转录因子的是一类含锌离子转录因子的是一类含锌离子转录因子的是一类含锌离子转录因子的DNADNA结合域结合域 n n亮氨酸拉链亮氨酸拉链亮氨酸拉链亮氨酸拉链结构域既可介导结合结构域既可介导结合结构域
17、既可介导结合结构域既可介导结合DNADNA又可介导蛋白质又可介导蛋白质又可介导蛋白质又可介导蛋白质二聚体化二聚体化二聚体化二聚体化 n n碱性螺旋碱性螺旋碱性螺旋碱性螺旋-环环环环-螺旋螺旋结构域也可同时介导结合结构域也可同时介导结合结构域也可同时介导结合结构域也可同时介导结合DNADNA和蛋和蛋和蛋和蛋白质二聚体化白质二聚体化白质二聚体化白质二聚体化 第二十一页,本课件共有75页目目 录录螺旋螺旋-回折回折-螺旋螺旋(helix-turn-helix,HTH)同源异型域同源异型域(homeodomain,HD)识别识别螺旋螺旋DNA大沟大沟DNA小沟小沟螺旋螺旋1N端端DNA大沟大沟螺旋螺旋
18、3第二十二页,本课件共有75页目目 录录 锌指结构是一类含锌的锌指结构是一类含锌的DNADNA结合蛋白质模体结合蛋白质模体C2H2型锌指(型锌指(Zinc finger)第二十三页,本课件共有75页目目 录录反向平行反向平行片层片层DNA大沟大沟螺旋螺旋Zn2第二十四页,本课件共有75页目目 录录 亮氨酸拉链同时调节亮氨酸拉链同时调节DNA结合与蛋白质二聚体化结合与蛋白质二聚体化LeuLeuLeuLeuLeuLeuLeuLeuDNA大沟大沟DNA大沟大沟亮氨酸拉链亮氨酸拉链(leucine zipper)第二十五页,本课件共有75页目目 录录 碱性螺旋碱性螺旋-环环-螺旋结构也可调节螺旋结构也
19、可调节DNA结合及蛋白结合及蛋白质二聚体化质二聚体化 碱性螺旋碱性螺旋-环环-螺旋螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)bHLH双体双体DNA大沟大沟螺螺旋旋螺旋螺旋环环第二十六页,本课件共有75页目目 录录(三)转录因子含有不同的转录激活域(三)转录因子含有不同的转录激活域n n富含谷氨酰胺的转录激活域富含谷氨酰胺的转录激活域 n n富含脯氨酸的转录激活域富含脯氨酸的转录激活域 n n酸性氨基酸转录激活域酸性氨基酸转录激活域 第二十七页,本课件共有75页目目 录录三、正性调节占主导的真核基因表达三、正性调节占主导的真核基因表达调控机制更加复杂调控机制更加复杂*不同的不
20、同的不同的不同的DNADNA元件组合可产生多种类型的转录调节方式;元件组合可产生多种类型的转录调节方式;元件组合可产生多种类型的转录调节方式;元件组合可产生多种类型的转录调节方式;*多种转录因子又可结合相同或不同的多种转录因子又可结合相同或不同的DNADNA元件;元件;元件;元件;*转转转转录录录录因因因因子子子子与与与与DNADNA元元元元件件件件结结结结合合合合后后后后,对对对对转转转转录录录录激激激激活活活活过过过过程程程程所所所所产产产产生生生生的效果各异,有正性调节或负性调节之分。的效果各异,有正性调节或负性调节之分。的效果各异,有正性调节或负性调节之分。的效果各异,有正性调节或负性
21、调节之分。第二十八页,本课件共有75页目目 录录第第 二二 节节真核基因表达的染色质真核基因表达的染色质水平调控水平调控Chromosomal Regulation ofEukaryotic Gene Expression第二十九页,本课件共有75页目目 录录 基因活化蛋白质改变局部染色质结构基因活化蛋白质改变局部染色质结构n异染色质(异染色质(heterochromatin)是转录非活性的。是转录非活性的。n常常染染色色质质(euchromatin)中中的的转转录录活活性性区区域域对对核核酸酸酶酶敏敏感感,特特别别是是转转录录基基因因的的5-侧侧翼翼区区1000 nt以以内内是是高高敏敏感感
22、位位点点(hypersensitive sites)。很很多多高高敏敏感感位位点点是是调调节节蛋蛋白白质质的的结结合合序序列列,而而这这些些区区域域核核小小体体的的相相对对缺缺少少也也使使得得这这些些蛋蛋白质易于与之结合。白质易于与之结合。转转录录活活化化染染色色质质与与非非活活化化染染色色质质在在结结构构上上有有很大不同。很大不同。第三十页,本课件共有75页目目 录录转转录录活活化化染染色色质质与与非非活活化化染染色色质质的的组组蛋蛋白白共共价修饰的方式也不相同。价修饰的方式也不相同。n核核小小体体的的核核心心组组蛋蛋白白(H2A,H2B,H3,H4)中中赖赖氨氨酸酸残残基基的的非非可可逆逆
23、性性甲甲基基化化,丝丝氨氨酸酸与与苏苏氨氨酸酸残残基基的的磷磷酸酸化化,乙乙酰酰化化以以及及泛泛素素化化多多是是转转录录活活性性染染色色质质的的特特点。点。n真真核核细细胞胞DNA的的CpG序序列列(CpG岛岛)中中的的胞胞嘧嘧啶啶被被甲甲基基化化为为5-甲甲基基胞胞嘧嘧啶啶是是常常见见现现象象,但但转转录录活活性性染染色色质区域胞嘧啶被甲基化的程度降低。质区域胞嘧啶被甲基化的程度降低。第三十一页,本课件共有75页目目 录录n染色质重塑(染色质重塑(chromatin remodeling)基基因因活活化化蛋蛋白白质质可可以以通通过过改改变变基基因因的的启启动动子子和和调调节节序序列列区区域域
24、的的染染色色质质结结构构来来促促进进转转录录开开始始。这这种种改改变变局局部部染染色色质质结结构构的的过过程程被称为被称为染色质重塑染色质重塑。n最主要的两种方式:最主要的两种方式:组蛋白的共价修饰组蛋白的共价修饰 核小体重塑(核小体重塑(nucleosome remodeling)第三十二页,本课件共有75页目目 录录染染色色质质重重塑塑第三十三页,本课件共有75页目目 录录n组蛋白乙酰化组蛋白乙酰化 位位 点点:组组 蛋蛋 白白 乙乙 酰酰 化化 转转 移移 酶酶(histone acetyl transferases,HATs),也也称称组组蛋蛋白白乙乙酰酰化化酶酶(histone ac
25、etylase)主主要要作作用用于于核核小小体体的的核核心心组组蛋蛋白白所所富富含含的的赖赖氨氨酸酸残残基基,降降低低整整个个核核小小体体对对DNA的的亲和性。亲和性。时间:时间:基因活化蛋白质结合在转录调节区域后。基因活化蛋白质结合在转录调节区域后。第三十四页,本课件共有75页目目 录录作作用用:使使染染色色质质进进入入转转录录活活性性状状态态乙乙;还还可可能能促促进进或防止与其他转录或调节相关蛋白的相互作用。或防止与其他转录或调节相关蛋白的相互作用。逆逆转转:组组蛋蛋白白脱脱乙乙酰酰化化酶酶(histone deacetylase)减减少少核小体的乙酰化,使染色质恢复转录非活性状态。核小体
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