蛋白质的表征精选课件.ppt
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1、关于蛋白质的表征第一页,本课件共有34页第一节第一节 蛋白质结构的基本概念蛋白质结构的基本概念 蛋白质是一类重要的生物高分子,英文为蛋白质是一类重要的生物高分子,英文为蛋白质是一类重要的生物高分子,英文为蛋白质是一类重要的生物高分子,英文为“ProteinProtein,该词从希腊文,该词从希腊文,该词从希腊文,该词从希腊文转化而来,意思是转化而来,意思是转化而来,意思是转化而来,意思是“最原始的最原始的最原始的最原始的”,可见当时人们对蛋白质的认识已有相当,可见当时人们对蛋白质的认识已有相当,可见当时人们对蛋白质的认识已有相当,可见当时人们对蛋白质的认识已有相当的基础。的基础。的基础。的基础
2、。蛋白质有成千上万种,不同的蛋白质具有不同的生物功能。蛋白质是蛋白质有成千上万种,不同的蛋白质具有不同的生物功能。蛋白质是蛋白质有成千上万种,不同的蛋白质具有不同的生物功能。蛋白质是蛋白质有成千上万种,不同的蛋白质具有不同的生物功能。蛋白质是2020种种种种氨基酸通过酰胺键氨基酸通过酰胺键氨基酸通过酰胺键氨基酸通过酰胺键(肽键肽键肽键肽键)联成的长链分子,这种长链即所谓的联成的长链分子,这种长链即所谓的联成的长链分子,这种长链即所谓的联成的长链分子,这种长链即所谓的肽链。许多蛋白质还包含有非肽链结构的其他组成成分,这种成分称为肽链。许多蛋白质还包含有非肽链结构的其他组成成分,这种成分称为肽链。
3、许多蛋白质还包含有非肽链结构的其他组成成分,这种成分称为肽链。许多蛋白质还包含有非肽链结构的其他组成成分,这种成分称为配基或辅基。配基或辅基。配基或辅基。配基或辅基。作为蛋白质组成成分的氨基酸一共有作为蛋白质组成成分的氨基酸一共有作为蛋白质组成成分的氨基酸一共有作为蛋白质组成成分的氨基酸一共有2020种,它们的名称和结构列在表种,它们的名称和结构列在表种,它们的名称和结构列在表种,它们的名称和结构列在表1.11.1中。为了表达蛋白质和肽结构的需要,每个氨基酸都有相应的符号表中。为了表达蛋白质和肽结构的需要,每个氨基酸都有相应的符号表中。为了表达蛋白质和肽结构的需要,每个氨基酸都有相应的符号表中
4、。为了表达蛋白质和肽结构的需要,每个氨基酸都有相应的符号表示,常用符号通常由氨基酸英文名的三个字母组成。一个蛋白质由上百示,常用符号通常由氨基酸英文名的三个字母组成。一个蛋白质由上百示,常用符号通常由氨基酸英文名的三个字母组成。一个蛋白质由上百示,常用符号通常由氨基酸英文名的三个字母组成。一个蛋白质由上百个甚至上千个氨基酸组成,为了表达的方便,又设计出单字符号。个甚至上千个氨基酸组成,为了表达的方便,又设计出单字符号。个甚至上千个氨基酸组成,为了表达的方便,又设计出单字符号。个甚至上千个氨基酸组成,为了表达的方便,又设计出单字符号。第二页,本课件共有34页 除了列出的除了列出的20种基本氨基酸
5、外,实际上种基本氨基酸外,实际上还有几百种不常见的氨基酸参与某些蛋白质还有几百种不常见的氨基酸参与某些蛋白质的组分,可称为稀有氨基酸;另一些氨基酸的组分,可称为稀有氨基酸;另一些氨基酸出现频率要高些,如羟脯氨酸、甲基组氨出现频率要高些,如羟脯氨酸、甲基组氨酸和甲基赖氨酸、丁酸和甲基赖氨酸、丁羧基谷氨酸等,但它羧基谷氨酸等,但它们是在蛋白质生物合成后转变而来的,因此们是在蛋白质生物合成后转变而来的,因此不计入基本氨基酸之列。不计入基本氨基酸之列。第三页,本课件共有34页 这是一个链状的结构,经水解后,将肽键断裂,转变成一系列的氨基酸。链中相当于氨基酸的单元结构称为残基。而上述链称为肽链。肽链的氨
6、基一端称为N端或氨基端,羧基一端称为C端或羧基端。习惯上将N端列在左边,C端列在右边。第四页,本课件共有34页 从氨基酸的结构看,半胱氨酸的侧链上有巯基从氨基酸的结构看,半胱氨酸的侧链上有巯基(一一SH)SH)。巯。巯基的稳定性较差,在碱性基的稳定性较差,在碱性pHpH下易氧化成二硫键。如果一条肽下易氧化成二硫键。如果一条肽链上的两个半胱氨酸的巯基形成二硫键,肽链形成链内二硫链上的两个半胱氨酸的巯基形成二硫键,肽链形成链内二硫键。假如两条肽链间形成二硫键,就出现由两条肽链组成的键。假如两条肽链间形成二硫键,就出现由两条肽链组成的蛋白质蛋白质(如胰岛素如胰岛素)。蛋白质分子有两对以上的二硫键,或
7、者。蛋白质分子有两对以上的二硫键,或者是蛋白质分子有一对二硫键和一个半胱氨酸,二硫键可能有是蛋白质分子有一对二硫键和一个半胱氨酸,二硫键可能有不同的连接方式,于是出现了异构体。异构体的数目因半胱不同的连接方式,于是出现了异构体。异构体的数目因半胱氨酸含量不同而异,但是在天然的蛋白质分子中没有这种异氨酸含量不同而异,但是在天然的蛋白质分子中没有这种异构体,只有一种连接方式。而在重组蛋白质的复性中,可能构体,只有一种连接方式。而在重组蛋白质的复性中,可能出现二硫键的错配对。出现二硫键的错配对。第五页,本课件共有34页 一级结构是指肽链中的氨基酸排列序列,二硫键的定位也是一级结构一级结构是指肽链中的
8、氨基酸排列序列,二硫键的定位也是一级结构一级结构是指肽链中的氨基酸排列序列,二硫键的定位也是一级结构一级结构是指肽链中的氨基酸排列序列,二硫键的定位也是一级结构的重要内容。的重要内容。的重要内容。的重要内容。蛋白质的二级结构也可称为构象单元,因为它们是蛋白质复杂的空间蛋白质的二级结构也可称为构象单元,因为它们是蛋白质复杂的空间蛋白质的二级结构也可称为构象单元,因为它们是蛋白质复杂的空间蛋白质的二级结构也可称为构象单元,因为它们是蛋白质复杂的空间构象的基础。一些构象单元的结构不是不可改变的,构象的基础。一些构象单元的结构不是不可改变的,构象的基础。一些构象单元的结构不是不可改变的,构象的基础。一
9、些构象单元的结构不是不可改变的,pHpH、温度、溶剂极、温度、溶剂极、温度、溶剂极、温度、溶剂极性等环境因素可以影响单元的变化。性等环境因素可以影响单元的变化。性等环境因素可以影响单元的变化。性等环境因素可以影响单元的变化。具有二级结构的肽链在空间走向,形成具有空间三级结构的蛋白质,具有二级结构的肽链在空间走向,形成具有空间三级结构的蛋白质,具有二级结构的肽链在空间走向,形成具有空间三级结构的蛋白质,具有二级结构的肽链在空间走向,形成具有空间三级结构的蛋白质,如所谓球蛋白类,它们几乎都有生物功能和活性,其中有些还能进一步如所谓球蛋白类,它们几乎都有生物功能和活性,其中有些还能进一步如所谓球蛋白
10、类,它们几乎都有生物功能和活性,其中有些还能进一步如所谓球蛋白类,它们几乎都有生物功能和活性,其中有些还能进一步相互作用,形成更高层次的结构。蛋白质之所以有功能,是因为分子表相互作用,形成更高层次的结构。蛋白质之所以有功能,是因为分子表相互作用,形成更高层次的结构。蛋白质之所以有功能,是因为分子表相互作用,形成更高层次的结构。蛋白质之所以有功能,是因为分子表面有可以进一步作用的基团,不同的蛋白质由于分子表面结构不同,可面有可以进一步作用的基团,不同的蛋白质由于分子表面结构不同,可面有可以进一步作用的基团,不同的蛋白质由于分子表面结构不同,可面有可以进一步作用的基团,不同的蛋白质由于分子表面结构
11、不同,可作用的基团分布和组合也不同,这种特定的结构就是各种蛋白质具有不作用的基团分布和组合也不同,这种特定的结构就是各种蛋白质具有不作用的基团分布和组合也不同,这种特定的结构就是各种蛋白质具有不作用的基团分布和组合也不同,这种特定的结构就是各种蛋白质具有不同的功能和活性的分子基础。同的功能和活性的分子基础。同的功能和活性的分子基础。同的功能和活性的分子基础。四级结构可以认为是一些特定三级结构的折叠肽链通过非共价键而形四级结构可以认为是一些特定三级结构的折叠肽链通过非共价键而形四级结构可以认为是一些特定三级结构的折叠肽链通过非共价键而形四级结构可以认为是一些特定三级结构的折叠肽链通过非共价键而形
12、成的大分子体系,也可称为亚基的装配成的大分子体系,也可称为亚基的装配成的大分子体系,也可称为亚基的装配成的大分子体系,也可称为亚基的装配(assembly)(assembly)。装配是一个非常复。装配是一个非常复。装配是一个非常复。装配是一个非常复杂的过程,它能使各亚基间相互调节,使蛋白质分子的功能更完善。杂的过程,它能使各亚基间相互调节,使蛋白质分子的功能更完善。杂的过程,它能使各亚基间相互调节,使蛋白质分子的功能更完善。杂的过程,它能使各亚基间相互调节,使蛋白质分子的功能更完善。第六页,本课件共有34页 蛋白质的分离纯化是研究蛋白质的基础和起点。蛋白质的来源是多样蛋白质的分离纯化是研究蛋白
13、质的基础和起点。蛋白质的来源是多样蛋白质的分离纯化是研究蛋白质的基础和起点。蛋白质的来源是多样蛋白质的分离纯化是研究蛋白质的基础和起点。蛋白质的来源是多样的,主要来自动物、植物的各种组织和微生物,取材要采用含量丰富的的,主要来自动物、植物的各种组织和微生物,取材要采用含量丰富的的,主要来自动物、植物的各种组织和微生物,取材要采用含量丰富的的,主要来自动物、植物的各种组织和微生物,取材要采用含量丰富的器官。器官。器官。器官。抽提蛋白质的第一步是将组织粉碎,破坏细胞,以便于抽提出蛋白抽提蛋白质的第一步是将组织粉碎,破坏细胞,以便于抽提出蛋白抽提蛋白质的第一步是将组织粉碎,破坏细胞,以便于抽提出蛋白
14、抽提蛋白质的第一步是将组织粉碎,破坏细胞,以便于抽提出蛋白质;抽提液的选择也因蛋白质而异。一般用低浓度的缓冲液,有时在从质;抽提液的选择也因蛋白质而异。一般用低浓度的缓冲液,有时在从质;抽提液的选择也因蛋白质而异。一般用低浓度的缓冲液,有时在从质;抽提液的选择也因蛋白质而异。一般用低浓度的缓冲液,有时在从肌肉抽提时也用稀碱,因肌肉中含有乳酸,最后抽提液的肌肉抽提时也用稀碱,因肌肉中含有乳酸,最后抽提液的肌肉抽提时也用稀碱,因肌肉中含有乳酸,最后抽提液的肌肉抽提时也用稀碱,因肌肉中含有乳酸,最后抽提液的pHpH却是中性却是中性却是中性却是中性的。在提取膜蛋白或包含体内的蛋白质时,还加入的。在提取
15、膜蛋白或包含体内的蛋白质时,还加入的。在提取膜蛋白或包含体内的蛋白质时,还加入的。在提取膜蛋白或包含体内的蛋白质时,还加入(非离子型非离子型非离子型非离子型)表面活性表面活性表面活性表面活性剂或变性剂以增加溶解度。各种细胞中普遍存在各种蛋白水解酶,会导剂或变性剂以增加溶解度。各种细胞中普遍存在各种蛋白水解酶,会导剂或变性剂以增加溶解度。各种细胞中普遍存在各种蛋白水解酶,会导剂或变性剂以增加溶解度。各种细胞中普遍存在各种蛋白水解酶,会导致蛋白质的降解,低温操作和加一些相应蛋白酶抑制剂致蛋白质的降解,低温操作和加一些相应蛋白酶抑制剂致蛋白质的降解,低温操作和加一些相应蛋白酶抑制剂致蛋白质的降解,低
16、温操作和加一些相应蛋白酶抑制剂(如如如如DFPDFP、PCMBPCMB、PMSFPMSF等等等等)、螯合剂、螯合剂、螯合剂、螯合剂(EDTA(EDTA等等等等)是有益的。是有益的。是有益的。是有益的。将蛋白质抽提出来后,就要进一步纯化。将蛋白质抽提出来后,就要进一步纯化。将蛋白质抽提出来后,就要进一步纯化。将蛋白质抽提出来后,就要进一步纯化。纯化不外乎两方面:一是将纯化不外乎两方面:一是将纯化不外乎两方面:一是将纯化不外乎两方面:一是将大体积变成小体积;二是把多组分蛋白质只留下单一种的蛋白质。大体积变成小体积;二是把多组分蛋白质只留下单一种的蛋白质。大体积变成小体积;二是把多组分蛋白质只留下单
17、一种的蛋白质。大体积变成小体积;二是把多组分蛋白质只留下单一种的蛋白质。前者前者前者前者有吸附法、超滤法、冻干等。后者有根据蛋白质的分子形状和分子质量有吸附法、超滤法、冻干等。后者有根据蛋白质的分子形状和分子质量有吸附法、超滤法、冻干等。后者有根据蛋白质的分子形状和分子质量有吸附法、超滤法、冻干等。后者有根据蛋白质的分子形状和分子质量大小、电离性质、溶解度和疏水性、生物功能专一性等,常用有各种盐大小、电离性质、溶解度和疏水性、生物功能专一性等,常用有各种盐大小、电离性质、溶解度和疏水性、生物功能专一性等,常用有各种盐大小、电离性质、溶解度和疏水性、生物功能专一性等,常用有各种盐析法、超离心沉降
18、、结晶、电泳、凝胶过滤,离子交换色谱、亲和色谱析法、超离心沉降、结晶、电泳、凝胶过滤,离子交换色谱、亲和色谱析法、超离心沉降、结晶、电泳、凝胶过滤,离子交换色谱、亲和色谱析法、超离心沉降、结晶、电泳、凝胶过滤,离子交换色谱、亲和色谱等。近年来发展的等。近年来发展的等。近年来发展的等。近年来发展的FPLCFPLC和和和和HPLCHPLC大大促进了许多蛋白质在毫克级的纯大大促进了许多蛋白质在毫克级的纯大大促进了许多蛋白质在毫克级的纯大大促进了许多蛋白质在毫克级的纯化,其量足够用于蛋白质的化学研究。化,其量足够用于蛋白质的化学研究。化,其量足够用于蛋白质的化学研究。化,其量足够用于蛋白质的化学研究。
19、第七页,本课件共有34页第二节第二节 蛋白质的纯度蛋白质的纯度 蛋白质的纯度是一个重要的指标,尤其在重组蛋白的质量控制中。但它也是蛋白质的纯度是一个重要的指标,尤其在重组蛋白的质量控制中。但它也是蛋白质的纯度是一个重要的指标,尤其在重组蛋白的质量控制中。但它也是蛋白质的纯度是一个重要的指标,尤其在重组蛋白的质量控制中。但它也是一个相对的指标,而纯度要求一个相对的指标,而纯度要求一个相对的指标,而纯度要求一个相对的指标,而纯度要求9595、9999或或或或99.999.9需根据实际要求而制定。需根据实际要求而制定。需根据实际要求而制定。需根据实际要求而制定。蛋白质的纯度一般指是否含有其他杂蛋白,
20、而不包括盐、缓冲液离子、十二蛋白质的纯度一般指是否含有其他杂蛋白,而不包括盐、缓冲液离子、十二蛋白质的纯度一般指是否含有其他杂蛋白,而不包括盐、缓冲液离子、十二蛋白质的纯度一般指是否含有其他杂蛋白,而不包括盐、缓冲液离子、十二烷基硫酸钠烷基硫酸钠烷基硫酸钠烷基硫酸钠(SDS)(SDS)等小分子在内。一些蛋白质在硫酸铵糊中相当稳定,一些酶在等小分子在内。一些蛋白质在硫酸铵糊中相当稳定,一些酶在等小分子在内。一些蛋白质在硫酸铵糊中相当稳定,一些酶在等小分子在内。一些蛋白质在硫酸铵糊中相当稳定,一些酶在甘油中保存则很稳定。甘油中保存则很稳定。甘油中保存则很稳定。甘油中保存则很稳定。蛋白质纯度如用百分
21、数表示,有时还和检测方法、定量方法、所选用仪器的蛋白质纯度如用百分数表示,有时还和检测方法、定量方法、所选用仪器的蛋白质纯度如用百分数表示,有时还和检测方法、定量方法、所选用仪器的蛋白质纯度如用百分数表示,有时还和检测方法、定量方法、所选用仪器的参数有关。例如在参数有关。例如在参数有关。例如在参数有关。例如在HPLCHPLC分析蛋白质纯度时,一般要求以分析蛋白质纯度时,一般要求以分析蛋白质纯度时,一般要求以分析蛋白质纯度时,一般要求以280nm280nm检测,这是蛋白检测,这是蛋白检测,这是蛋白检测,这是蛋白质的吸收高峰,而很可能不是非蛋白质杂质的紫外吸收峰,甚至小分子物质在质的吸收高峰,而很
22、可能不是非蛋白质杂质的紫外吸收峰,甚至小分子物质在质的吸收高峰,而很可能不是非蛋白质杂质的紫外吸收峰,甚至小分子物质在质的吸收高峰,而很可能不是非蛋白质杂质的紫外吸收峰,甚至小分子物质在280nm280nm处没有吸收,因此都以处没有吸收,因此都以处没有吸收,因此都以处没有吸收,因此都以280nm280nm的光吸收来定量处理,检测不到非蛋白质的光吸收来定量处理,检测不到非蛋白质的光吸收来定量处理,检测不到非蛋白质的光吸收来定量处理,检测不到非蛋白质杂质和小分子物质的存在,表明所得的蛋白质纯度会偏高。杂质和小分子物质的存在,表明所得的蛋白质纯度会偏高。杂质和小分子物质的存在,表明所得的蛋白质纯度会
23、偏高。杂质和小分子物质的存在,表明所得的蛋白质纯度会偏高。在色谱中普遍采用积分面积的方法,这也不是很妥当的。而且在用计算机或在色谱中普遍采用积分面积的方法,这也不是很妥当的。而且在用计算机或在色谱中普遍采用积分面积的方法,这也不是很妥当的。而且在用计算机或在色谱中普遍采用积分面积的方法,这也不是很妥当的。而且在用计算机或积分仪在线检出时,仪器的参数设置与所得的报告很有关系,设置不妥往往导积分仪在线检出时,仪器的参数设置与所得的报告很有关系,设置不妥往往导积分仪在线检出时,仪器的参数设置与所得的报告很有关系,设置不妥往往导积分仪在线检出时,仪器的参数设置与所得的报告很有关系,设置不妥往往导致结果
24、不够准确。致结果不够准确。致结果不够准确。致结果不够准确。第八页,本课件共有34页 目前常用的鉴定蛋白质纯度方法有:目前常用的鉴定蛋白质纯度方法有:目前常用的鉴定蛋白质纯度方法有:目前常用的鉴定蛋白质纯度方法有:聚丙烯酰胺凝胶电泳和十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳和十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳和十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳和十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶聚丙烯酰胺凝胶聚丙烯酰胺凝胶聚丙烯酰胺凝胶电泳电泳电泳电泳(SDS-PAGE)(SDS-PAGE);毛细管电泳毛细管电泳毛细管电泳毛细管电泳(CE)(CE);等电聚焦等电聚焦等电聚焦等电聚焦(IEF)(IEF);高效液相色谱高效液相色谱高
25、效液相色谱高效液相色谱(HPLC)(HPLC),包括凝胶过滤、各种反相色谱、,包括凝胶过滤、各种反相色谱、,包括凝胶过滤、各种反相色谱、,包括凝胶过滤、各种反相色谱、离子色谱、疏水色谱等;离子色谱、疏水色谱等;离子色谱、疏水色谱等;离子色谱、疏水色谱等;质谱质谱质谱质谱(MS)(MS)。一些新的有效方法也在引入分析蛋白质的纯度,如质谱一些新的有效方法也在引入分析蛋白质的纯度,如质谱一些新的有效方法也在引入分析蛋白质的纯度,如质谱一些新的有效方法也在引入分析蛋白质的纯度,如质谱等。由于它测定分子质量的精确度可达万分之一,因此丢失等。由于它测定分子质量的精确度可达万分之一,因此丢失等。由于它测定分
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